فهرست مطالب مجید پهلوان کاخکی

انتخاب همه

استخراج RNA با استفاده از ترایزول: روشی با استاندارد بالا برای مطالعه بررسی بیان ژن ها

معصومه حیدری، مجید پهلوان کاخکی

فصلنامه علوم دانشگاه تهران، سال بیست و پنجم شماره 1 (Winter 2014)، صص 13 -17

مشاهده متن زبان: انگلیسی

TRIzol-based RNA Extraction: A Reliable Method for Gene Expression Studies

M. Heidary, M. Pahlevan Kakhki

Journal of Sciences, Islamic Republic of Iran, Volume:25 Issue: 1, Winter 2014, PP 13 -17

RNA extraction is a prerequisite technique for gene expression studies, analyzing the etiology and disease progression, treatment effects, as well as designing the diagnostic methods. Although many RNA extraction kits have been commercialized, but these kits are expensive and are not accessible in some countries. Many studies have shown that TRIzol is an applicable material for the RNA extraction from various biological samples. In this study, evaluation of the initial TRIzol volume and -20˚C temperature on the purity and solubility of RNA, which followed by measurement of IL-1B expression shows that TRIzol based RNA extraction is a “reliable” method for gene expression studies.

Keywords: RNA, TRIzol volume, Purity, Gene expression, IL, 1B}

Abstract View Paper Original: English
پیش بینی و بررسی نقش پلی مورفیسم ژن SOCS1 در بیماریزایی مالتیپل اسکلروزیس با تغییر محل اتصال میکرو RNA ها

مجید پهلوان کاخکی، معصومه حیدری، ناهید رخشی، مهرداد بهمنش، عباس نیک روش*

نشریه دانشگاه علوم پزشکی خراسان شمالی، سال پنجم شماره 4 (زمستان 1392)، صص 707 -713

زمینه و هدف
بیماری مالتیپل اسکلروزیس (ام اس) یک بیماری تخریب کننده میلین در سیستم عصبی مرکزی می باشد که سبب شناسی ناشناخته ای دارد. شیوع ام اس در جهان و از جمله ایران افزایش یافته است. ارتباط ژن SOCS1 (Suppressor of Cytokine Signaling) با بیماری ام اس بواسطه اسنیپ 243324 rs در چندین مطالعه بررسی و مورد تایید قرار گرفته است. با ورود میکرو RNA ها (miRNAs) به دنیای یافته های ژنتیکی، نقش آنها در بیماری ام اس مورد ارزیابی واقع شده است.از آنجا که miRNA ها واحدهای عملکردی کوچکی هستند، تغییرات تک نوکلئوتیدی در توالی پیش سازها، فرم بالغ و همچنین در توالی هدف آنها ممکن است باعث تغییر در عملکرد بیولوژیک آنها شود.
مواد و روش کار
در این مطالعه، توالی اسنیپ 243324 rs از پایگاه اینترنتی NCBI دریافت گردید. با کمک پایگاه اینترنتی miRBase همولوژی موجود در توالی جایگاه اسنیپ در دو حالت وجود و عدم وجود آلل خطر با miRNA های مختلف مورد آنالیز واقع گردید.
یافته ها
بررسی های انجام شده نشان می دهند که توالی شامل اسنیپ 243324 rs در ناحیه 5’-UTR ژن SOCS1 با توالی میکرو RNA های hsa-miR-4732-5p، hsa-miR-3976، hsa-miR-4727-3p و hsa-miR-4793-5p همولوژی دارد و این همولوژی با تغییر آلل C به T در محل اسنیپ تحت تاثیر قرار می گیرد.
نتیجه گیری
تغییر ایجاد شده بواسطه اسنیپ 243324 rs می تواند تغییری بالقوه در جایگاه اتصال چند میکروRNA ایجاد کند و پیش بینی می شود با تغییر در میزان بیان ژن SOCS1 در بیماریزایی ام اس موثر باشد که بررسی آن پیشنهاد می گردد. در صورت تایید نقش miRNA های ذکر شده بر بیان ژن SOCS1، این ژن می تواند در کنار داروهای در دسترس برای ام اس، هدفی برای توسعه روش های جدید درمانی باشد.

کلید واژگان: مالتیپل اسکلروزیس, میکروRNA ها, ژن SOCS1}

چکیده مشاهده متن زبان: فارسی

The prediction and analysis of SOCS1 SNPs in the pathogenesis of Multiple Sclerosis with the alternation of some MicroRNAs binding sites

Kakhki M., Heidary M., Rakhshi N., Behmanesh M., Nikravesh A.*

Journal of North Khorasan University of Medical Sciences, Volume:5 Issue: 4, 2014, PP 707 -713

Background and Objectives
Multiple Sclerosis (MS) is a neurodegenerative disease in the central nervous system with an unknown etiology. The prevalence of MS increased worldwide including Iran. The association of rs243324 SNP of SOCS1 gene with MS was evaluated by Vandenbroeck. Also many studies evaluated the role of miRNAs in the pathogenesis of MS. Since miRNAs are small functional units، single base changes in the precursor elements، the mature miRNA sequence and their target gene sequences may drive alteration in their biological function.
Material and Methods
In this study، the sequence of rs243324 SNP obtained from NCBI database. The analysis of the sequence of SNP in the presence and absence of the risk allele evaluated via miRBase algorithm.
Results
Our results revealed that، the sequence of rs243324 SNP is homologous with the sequence of some miRNAs including: hsamiR- 4732-5p، hsa-miR-3976، hsa-miR-4727-3p and hsa-miR- 4793-5p and can change their binding sites and this homology affected by alternation of C to T allele of SNP
Conclusion
miRNAs regulate the gene expression at the posttranscriptional level by repression or degradation of their mRNA targets. rs243324 SNP can change the binding sites of some miRNAs and may be effective in the pathogenesis of MS through the change of SOCS1 expression. After demonstration in expression level، SOCS1 can be proposed as a new potential therapeutic target for MS.

Keywords: Multiple Sclerosis, microRNAs, SOCS1 gene}

Abstract View Paper Original: Persian
میکروRNA ها در بیماری مالتیپل اسکلروزیس

مجید پهلوان کاخکی، ناهید رخشی، معصومه حیدری، عباس نیک روش

نشریه دانشگاه علوم پزشکی خراسان شمالی، سال پنجم شماره 1 (بهار 1392)، صص 185 -193

زمینه و هدف
بیماری مالتیپل اسکلروزیس (ام اس) یک بیماری خود ایمنی تخریب کننده غلاف میلین در دستگاه عصبی مرکزی می باشد که عامل ایجاد کننده آن هنوز ناشناخته باقی مانده است. مطالعات فراوان اپیدمیولوژیکی و ژنتیکی بر نقش دو عامل ژنتیک و محیط در ایجاد بیماری ام اس تاکید دارند. با ورود میکرو RNA ها به دنیای یافته های ژنتیکی این مولکولهای قدرتمند به زودی توانستند جای خود را در مطالعات انجام شده در حوزه ژنتیک بیماری ها باز کنند. میکرو RNA ها مولکولهای کوچک RNA با طول 20-22 نوکلئوتید می باشند. این مطالعه تلاش دارد تا در راستای معرفی میکرو RNA ها، پتانسیل های بالقوه آنها را بعنوان بیومارکر هایی قدرتمند در بیماری ام اس مورد بحث قرار دهد.
مواد و روش کار
در این مطالعه ی مروری با بررسی منابع کتابخانه ای و مقالات مختلف در یک بازه زمانی 10 ساله در زمینه نقش میکروRNA ها در بیماری ام اس، کلیدواژه های مورد نظر مشخص و مهمترین و جدیدترین اطلاعات در این زمینه گرداوری و استفاده گردید.
یافته ها
نتایج نشان می دهد که از زمان کشف میکروRNA ها تا کنون، در جنبه های مختلفی نقش آنها در بیماری ام اس مورد ارزیابی واقع شده است. میکروRNA ها می توانند در بیماریزایی ام اس نقش داشته و نیز پتانسیل درمانی جدیدی را برای این بیماری از طریق تنظیم بیان ژن های درگیر در مسیر بیماریزایی آن فراهم کنند.
نتیجه گیری
تحقیقات نشان می دهند که میکروRNA ها می توانند علاوه بر اینکه خود عاملی برای ایجاد بیماری باشند، راه درمانی برای بیماری و نیز بیومارکری برای ارزیابی تلاشهای درمانی و سیر پیشرفت بیماری ارائه دهند.

کلید واژگان: میکرو RNA, مالتیپل اسکلروزیس, بیومارکر}

چکیده مشاهده متن زبان: فارسی

MicroRNAs in Multiple Sclerosis

Journal of North Khorasan University of Medical Sciences, Volume:5 Issue: 1, 2013, PP 185 -193

Background and Objectives
Multiple Sclerosis (MS) is a potentially devastating disease in the central nervous system with an unknown etiology. Many epidemiologic and genetic studies are revealed that both genetic and environment can influence the susceptibility of MS. When microRNAs are introduced to molecular genetic world، they could establish their position in genetic studies. MiRNAs are small (19-24 nucleotides) non-coding RNAs. Here، we are trying to introduce the role of miRNAs in MS and their potentials to serve as biomarkers.
Material and Methods
In this study we reviewed some different articles in a 10-years period about the role of miRNAs in MS. Then we selected the specific keywords and the most recent data were collected in this field.
Results
The results show that many studies are performed on the role of miRNAs in various aspects of miRNAs in MS. In addition، miRNAs can be involved in the pathogenesis of MS، as well as they have some new therapeutic potential for MS through the gene expression regulation.
Conclusion
Our results suggest that beside the role of miRNAs in MS pathogenesis، they have some therapeutic potential for MS. As well as، they can serve as biomarkers to evaluate disease progression and therapeutic efforts.

Keywords: MicroRNAs, Multiple Sclerosis, Biomarker}

Abstract View Paper Original: Persian

بدانید!

در این صفحه نام مورد نظر در اسامی نویسندگان مقالات جستجو می‌شود. ممکن است نتایج شامل مطالب نویسندگان هم نام و حتی در رشته‌های مختلف باشد.
همه مقالات ترجمه فارسی یا انگلیسی ندارند پس ممکن است مقالاتی باشند که نام نویسنده مورد نظر شما به صورت معادل فارسی یا انگلیسی آن درج شده باشد. در صفحه جستجوی پیشرفته می‌توانید همزمان نام فارسی و انگلیسی نویسنده را درج نمایید.
در صورتی که می‌خواهید جستجو را با شرایط متفاوت تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مطالب نشریات مراجعه کنید.

به جمع مشترکان مگیران بپیوندید!

فهرست مطالب مجید پهلوان کاخکی