فهرست مطالب مرتضی تقی زاده طرنابی
-
مقدمه
ویروس آنفلوانزا، عامل بیماری آنفلوانزا است که به علت ایجاد اپیدمیهای سالانه در بین طیف وسیعی از میزبان حیوانی و انسانی مورد توجه بوده است. هدف از انجام این مطالعه، بیان موثر و قوی پروتئین نوترکیب هماگلوتینین سویهی ایرانی ویروس آنفلوانزا (H1N1)A خوکی در ردهی سلولی حشرهی Sf9 به کمک سیستم بیانی باکولوویروس بود.
روشها:
ژن هماگلوتینین ویروس آنفلوانزا H1N1 خوکی با پرایمر اختصاصی حاوی توالی آنزیمهای برشی تکثیر و کلون گردید و سپس به منظور تولید یک بکمید نوترکیب با استفاده از سیستم Bac-to-Bac به سلول DH10Bac انتقال داده شد. بیان و فعالیت پروتئین نوترکیب در سلول با استفاده از تکنیکهای مولکولی مورد سنجش قرار گرفت.
یافتهها:
تولید ژن هماگلوتینین به طول 1701 جفتباز تایید و سلول حشره بعد از دریافت بکمید نوترکیب، پروتئینی به وزن تقریبی 66 کیلودالتون را بیان نمود. اندازهی سلولهای آلوده شده و هسته آنها افزایش یافت و با ایجاد ظاهر گرانولار، از سطح فلاسک کشت سلول جدا شدند. پس از گذشت 48 ساعت از عفونت، سلولهای آلوده، با جذب گلبولهای قرمز جوجه، به شکل تجمعات سلولی ظاهر شدند. عدم تشکیل کلامپ سلولی، نشان از صحت آزمون و مهار فعالیت همادسورپشن بود. مقدار پروتئین حاصل معادل 76/10 میکروگرم بر 100 میکرولیتر معادل 1/0 میلیگرم/میلیلیتر گزارش شد.
نتیجهگیری:
طبق نتایج سیستم بیانی باکولوویروس، قادر به بیان پروتئین نوترکیب در سلول حشره بود و بنابراین، راه حل مناسبی برای جایگزین کردن آن به عنوان نسل جدید واکسن به جای واکسنهای مبتنی بر تخم مرغ و یا کشت سلول میباشد.
کلید واژگان: ویروس آنفلوانزا H1N1, هماگلوتینین, حشره, باکولوویروس, واکسن}BackgroundInfluenza virus, which is a decisive agent of influenza, attracted interest because of the event of the annual epidemic among a wide range of animal and human hosts. This study aimed to express the hemagglutinin protein of Iranian swine Influenza A (H1N1) through a baculovirus system in SF9 cells to produce a new recombinant vaccine.
MethodsHemagglutinin gene of Swine H1N1 virus was amplified with specific primers containing restriction enzymes site, and then cloned. Afterward, the vector was transformed to DH10Bac using Bac-to-Bac system in order to produce a recombinant bacmid. Hemagglutinin expression and its biological activity were assessed using molecular and immunization tests.
FindingsThe target rHA in length, 1710 bp, was produced and expressed in transfected SF9 cells with a size of ~66 kDa. The infected cells expanded in size and their nucleus, and desiccated from the surface of the cell culture as a granular. They could absorb chick red blood cells (RBCs), and appear as cell aggregates forty-eight postinfection. The fact that infected cells were unable to form cell clamp showed the test's accuracy and inhibition of hemodesorption activity. The amount of protein obtained was 10.76 µg/100 µl, equal to 0.1 mg/ml.
ConclusionThe baculovirus expression system could express the recombinant protein in the insect cell. Therefore, it may be a well-suited alternative to produce a new generation of the vaccine instead of egg-based and cell-culturebased generation vaccines.
Keywords: Influenza A virus, H1N1 subtype, Hemagglutinin, Insecta, Baculoviridae, Vaccines} -
مقدمه
درسال های اخیر و با توجه به پیشرفت های انجام شده درحوزه بیوانفورماتیک، طراحی واکسن آنفولانزا دستخوش پیشرفت های قابل ملاحظه ای شده است. هدف از این مطالعه طراحی یک پروتئین نوترکیب چندظرفیتی برمبنای اپی توپ بسیار محافظت شده پروتئین هماگلوتینین سویه های H1N1 و H5N1 است که در طی زمان دچار تغییر و موتاسیون نمی شوند.
روش کاربرای این منظور و با توجه به مطالعات میدانی قبلی توالی سویه های مورد نظر بررسی شد و اپی توپ هایی از این سویه ها انتخاب شدند.پس از بررسی خصوصیات ایمنی زایی و شیمیایی اپی توپ های انتخاب شده توسط سرور های مناسب، ساختاراولیه پروتئین نوترکیب تعیین شد و متعاقب ترجمه معکوس توالی فوق ، بهینه سازی کدون انجام شد و در نهایت توالی بهینه شده در درون وکتور PET32a+ و دربین دو ناحیه آنزیمی BamHI/XhoI قرارداده شد.
نتایجنتایج بدست آمده نشان داد که پروتئین نوترکیب حاصله دراین مطالعه دارای وزن ملکولی 22451.72 g/mol با 214 اسید آمینه می باشد. pH ایزوالکتریک پروتئین فوق 25/7 و میزان حلالیت آن درسیستم پروکاریوتی 100 درصد است. ضریب خاموشی ساختار فوق نیز به میزان M-1cm-1 60170 تعیین شد. در نهایت و پس ازبهینه سازی کدون، شاخص انطباق کدون (CAI) پروتئین نیز به میزان 95/0محاسبه گردید.
نتیجه گیریدر نهایت وباتوجه به داده های فوق پیش بینی می شود که ساختار چند اپی توپی طراحی شده دراین مطالعه که دارای خصوصیات ایمونولوژیکی منحصر بفرد و قابل قبولی است را می توان با موفقیت و به میزان قابل قبولی درسیستم پروکاریوتی بیان نمود و جهت مطالعات ایمنی زایی برعلیه ویروس آنفولانزای A مورداستفاده قرار داد.
کلید واژگان: ویروس آنفولانزا, ایمونوانفورماتیک, هماگلوتینین, مولتی اپی توپ}IntroductionAccording to marked advances in bioinformatics studies, development of influenza vaccines has been greatly modified in many studies. In this study, we have designed a multi-epitope recombinant protein, consisting of several conserved epitopes from Hemagglutinin protein of the H1N1 and H5N1 strains of Influenza virus by immunoinformatics approaches.
Materials and MethodsThe registered sequences of hemagglutinin proteins from H1N1 and H5N1 strains have been analyzed and selected epitopes have been chosen and directed for further analysis. After investigation of immunological and physicochemical parameters, the selected regions were fused together by linkers and sequence of target constructs was determined following codon optimization. The target construct has been integrated into BamHI/XhoI cleavage sites of PET32a+ expression vector.
ResultsA physicochemical analysis revealed that the designed recombinant protein has 214 amino acid with molecular weight of 22.451 kDa. The isoelectric point was determined as 7.25 , solubility of 100% and Extinction coefficient of 60170 M-1cm-1.finally, after codon optimization, the Codon Adaptation Index (CAI) was calculated as 0.95.
DiscussionAccording to these results, it has been predicted that designed multiepitop recombinant protein has reasonable and unique immunological properties. The expressed protein could be used for future immunological studies against type A influenza virus
Keywords: Influenza Virus, Immunoinformatics, Hemagglutinin, Multi-epitope}
- در این صفحه نام مورد نظر در اسامی نویسندگان مقالات جستجو میشود. ممکن است نتایج شامل مطالب نویسندگان هم نام و حتی در رشتههای مختلف باشد.
- همه مقالات ترجمه فارسی یا انگلیسی ندارند پس ممکن است مقالاتی باشند که نام نویسنده مورد نظر شما به صورت معادل فارسی یا انگلیسی آن درج شده باشد. در صفحه جستجوی پیشرفته میتوانید همزمان نام فارسی و انگلیسی نویسنده را درج نمایید.
- در صورتی که میخواهید جستجو را با شرایط متفاوت تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مطالب نشریات مراجعه کنید.