فهرست مطالب مهرداد نوروزی نیا
-
سابقه و هدف
کاردیومیوپاتی هیپرتروفیک بیماری قلبی شایعی است. این بیماری در بزرگ سالان جوان تشخیص داده می شود و به ندرت در دوران کودکی قابل تشخیص است. کاردیومیوپاتی هیپرتروفیک تنوع درخور توجهی را در ویژگی های بالینی و ژنتیکی خود نشان می دهد. تاکنون، جهش در ژن های متعدد مرتبط با این بیماری کشف شده است که ژن های شایع آن MYBPC3 و MYH7 هستند. هدف از این مطالعه استفاده از توالی یابی کل اگزوم برای انجام آنالیز ژنتیکی کاردیومیوپاتی هیپرتروفیک در چهار کودک متعلق به خانواده های ایرانی است.
مواد و روش هابیماران ارزیابی پزشکی، از جمله ارزیابی بالینی و اکوکاردیوگرافی شدند و نوار قلب آن ها بررسی شد. آزمایش ژنتیکی پس از استخراج DNA با استفاده از توالی یابی کل اگزوم برای شناسایی تغییرات ژنتیکی ای انجام شد که ممکن است باعث این بیماری شده باشند. علاوه بر این، بررسی بیوانفورماتیکی تغییرات ژنتیکی با نرم افزارهای مطابقت سازی، فراخوانی کننده و تفسیرکننده واریانت صورت پذیرفت و درنهایت، روش توالی یابی سنگر برای تایید تغییر ژنتیکی بر روی افراد خانواده بیمار انجام شد.
یافته هابیماران، کودکانی با علایم اولیه ای نظیر سنکوپ و تپش قلب بودند که برای آنها تشخیص کاردیومیوپاتی هیپرتروفیک نوع 3 و 4 براساس نتایج نوار قلب و اکوکاردیوگرافی داده شد. نتایج حاصل از آزمایش ژنتیکی تغییری نوپدید(De novo) و بدمعنی (c.1208G>A, p.Arg403Gln) را در ژن MYH7 نشان داد. همچنین، تغییر ژنتیکی هموزیگوت بی معنی (c.3811C>T, p.Arg1271Ter) دیگری که ایجادکننده بیماری است، در ژن MYBPC3 شناسایی شد که باعث تولید یک پروتیین زودرس می شود.
نتیجه گیریمطالعه ی حاضر نه تنها طیف تغییرات ژنی مرتبط با بیماری کاردیومیوپاتی هیپرتروفیک را گسترش می دهد و به مشاوره ژنتیکی خانواده های مبتلا به این بیماری کمک می کند، بلکه اولین گونه های ژن سارکومر را در کودکان ایرانی ارایه می دهد.
کلید واژگان: هایپرتروفیک کاردیومیوپاتی, کودکان, توالی یابی کل اگزوم, MYH3, MYBPC3}Background and ObjectivesHypertrophic cardiomyopathy is a common cardiac disease diagnosed in young adults and rarely detectable in childhood. Hypertrophic cardiomyopathy exhibits considerable diversity in its clinical and genetic characteristics. To date, mutations in multiple genes associated with HCM have been discovered, with the most common ones being MYBPC3 and MYH7 genes. The present study aimed to utilize whole exome sequencing for conducting a genetic analysis of Hypertrophic cardiomyopathy in four children belonging to Iranian families.
Materials and MethodsPatients underwent medical evaluation, including clinical assessment, electrocardiography, and echocardiography. Genetic testing was performed after DNA extraction using whole exome sequencing to identify genetic alterations that may be responsible for this disease. In addition, bioinformatic analysis of the genetic changes was carried out using software tools for alignment, variant calling, and interpretation. Finally, the Sanger sequencing method was employed to confirm the genetic variations in the affected individual's family members.
ResultsThe patients were children presenting with initial symptoms, such as syncope and palpitations. They were diagnosed with Hypertrophic cardiomyopathy type 3 and 4 based on the results of electrocardiography and echocardiography. The genetic testing results revealed a pathogenic de novo mutation (c.1208G>A, p.Arg403Gln) in the MYH7 gene. In addition, another disease-causing homozygous nonsense genetic variation (c.3811C>T, p.Arg1271Ter) was identified in the MYBPC3 gene, resulting in the production of a premature protein.
ConclusionThis study not only expanded the spectrum of genetic variations associated with Hypertrophic cardiomyopathy disease and aided in genetic counseling for families affected by it but also presented the first variations of the sarcomere gene in Iranian children.
Keywords: Hypertrophic Cardiomyopathy, Children, Whole Exome Sequencing, MYH7, MYBPC3} -
زمینه و هدف
فرآیندهای کنترلی در تمایز استیوبلاستی سلول های بنیادی مزانشیمی هنوز به طور کامل شناخته نشده است. مکانیسم های اپی ژنتیک مخصوصا متیلاسیون جزایر CpG در پروموتر ژن ها به عنوان یکی از مهم ترین مکانیسم های کنترلی در تمایز سلول های بنیادی مطرح است. این که در فرآیند تمایز تنها متیلاسیون برخی از ژن های خاص تغییر می یابد یا متیلاسیون تام ژنوم دست خوش تغییرات می گردد، مورد بحث است. لذا در این تحقیق وضعیت متیلاسیون تام ژنوم در طول تمایز استیوبلاستیک سلول های بنیادی مزانشیمی با محیط تمایزی و هم چنین در تیمار با داروی زولدرونیک اسید مورد ارزیابی قرار گرفت.
مواد و روش هادر این پژوهش آزمایشگاهی پس از کشت و تکثیر سلول های بنیادی مزانشیمی، القاء تمایز استیوبلاستی با استفاده از محیط تمایزی و داروی زولدرونیک اسید صورت گرفت. استخراج DNA در هفته اول، دوم و سوم تمایز و هم چنین از سلول های بنیادی مزانشیمی تمایز نیافته صورت گرفت. وضعیت متیلاسیون تام ژنوم با استفاده از آنتی بادی بر علیه 5-متیل سیتوزین ارزیابی شد. برای تحلیل داده از آزمون طرح اندازه گیری مکرر استفاده شد.
یافته هادر طول تمایز استیوبلاستیک سلول های بنیادی مزانشیمی وضعیت متیلاسیون تام ژنوم تغییر پیدا نکرد (093/0=p). هم چنین تیمار با داروی زولدرونیک اسید بر روی متیلاسیون تام ژنوم تاثیر نداشت (057/0=p).
نتیجه گیریتمایز استیوبلاستی سلول های بنیادی مزانشیمی با استفاده از محیط تمایزی و نیز در تیمار با داروی زولدرونیک اسید، با تغییر متیلاسیون تام ژنوم همراه نیست. بنابراین فرآیند تمایز سلول های بنیادی مزانشیمی به استیوبلاست ها یک مسیر منحصر به فرد بوده و احتمالا سایر مکانیسم های ژنتیکی و اپی ژنتیکی در کنترل آن ایفای نقش می نماید.
کلید واژگان: استئوبلاست, سلول های بنیادی مزانشیمی, تمایز, متیلاسیون تام ژنوم, زولدرونیک اسید}Background and ObjectivesControl processes in osteoblastic differentiation of mesenchymal stem cells are not yet fully understood. Epigenetic mechanisms, especially the methylation of CpG Islands in the promoter of genes, are considered as one of the most important control mechanisms in stem cell differentiation. In the process of differentiation, it is debated whether only the methylation of specific genes changes or the methylation of global DNA. Therefore, in the present study, the state of global DNA methylation was evaluated during osteoblastic differentiation of mesenchymal stem cells by differentiation medium and also in treatment by zoledronic acid.
Materials and MethodsIn this laboratory study, after isolation and proliferation of mesenchymal stem cells, induction of osteoblastic differentiation was done using differentiating medium and zoledronic acid. DNA extraction was performed at differentiation weeks 1, 2, and 3 as well as from undifferentiated mesenchymal stem cells. Global DNA methylation status was assessed by antibodies against 5-methyl cytosine. Repeated measurement design test was used to analyze the data.
ResultsGlobal DNA methylation status of the genome did not change during osteoblastic differentiation of mesenchymal stem cells (p=0.093). Also, treatment with zoledronic acid had no effect on global DNA methylation (p=0.057).
ConclusionOsteoblastic differentiation of mesenchymal stem cells by differentiation medium and also in treatment with zoledronic acid is not associated with altered global methylation of the genome. Therefore, the differentiation process of mesenchymal stem cells to osteoblasts is a unique pathway, and possibly other genetic and epigenetic mechanisms play a role in controlling it.
Keywords: Osteoblast, Mesenchymal stem cells, Differentiation, Global DNA methylation, Zoledronic acid} -
Journal of Advances in Medical and Biomedical Research، پیاپی 108 (فروردین و اردیبهشت 1396)، صص 56 -67زمینه و هدفشدت فنوتیپ بیماری آتروفی عضلانی نخاعی دارای ارتباطی معکوس با سطح بیان ژن SMN2 است ولی این رابطه مطلق نیست، به همین دلیل در حال حاضر هیچ درمان موثری برای این بیماری وجود ندارد. بنابراین به جز بیان ژن SMN2، دخالت برخی عوامل تعدیل کننده اضافی در شدت این بیماری پیشنهاد شده است. در این تحقیق، اثر والپروئیک اسید به عنوان یک داروی فعال کننده STAT5 نه تنها بر روی وضعیت بیان SMN2 بلکه بر روی بیان ژن STAT5A و همچنین نرخ آپوپتوز مورد بررسی قرار گرفت.روش بررسیسطح بیان ژن های SMN2 و STAT5A به روش Real-time PCR و همچنین نرخ آپوپتوز به روش فلوسایتومتری طی پاسخ به والپروئیک اسید در سه رده سلول لنفوسیتی مبتلا و دو کنترل نرمال مورد بررسی قرار گرفت.یافته هاپس از تیمار با والپروئیک اسید و القای بیان ژن STAT5A ، افزایش سطح رونوشت SMN2 با طول کامل و کاهش نرخ آپوپتوز در رده های لنفوسیتی مشاهده شد (05/0P<).نتیجه گیریاز آنجاکه القای بیان ژن STAT5A با افزایش سطح رونویسی SMN2 همراه می باشد، پس نتایج این تحقیق دخالت ژن STAT5A را هم به عنوان عضوی از مسیر STAT5 و هم به عنوان یک ژن هدف در پاسخ به درمان مطرح می سازد.کلید واژگان: آتروفی عضلانی نخاعی, والپروئیک اسید, Real, time PCR, آپوپتوز}Background And ObjectiveThe severity of the spinal muscular atrophy phenotype is inversely associated with the expression levels of the SMN2 gene; this correlation is not absolute, for this reason there is currently no effective treatment. The interference of other severity modifying factors, apart from SMN2 gene expression has been suggested. Here we investigate the effects of valproic acid as a STAT5 inducer not only on SMN2 expression but on STAT5A gene expression as well as on the rate of apoptosis.Materials And MethodsExpression levels of the SMN2 and STAT5A genes were determined using Real-time PCR while apoptotic rates were determined using flow cytometry in lymphocyte cell lines derived from three patients and two normal controls in response to valproic acid.ResultsSTAT5A gene induction, enhanced FL-SMN2 expression and reduced apoptotic rate were seen in lymphocyte cell lines after valproic acid treatment (pConclusionSince STAT5A gene induction was accompanied with SMN2 transcriptional upregulation, these findings propose the involvement of STAT5A gene both as a component of the STAT5 pathway and as a target gene in drug responsiveness.Keywords: Spinal Muscular Atrophy, Valproic acid, Real, time PCR, Apoptotic rate}
-
شرایط بهینه برای آنزیم آلکالاز جهت تولید پروتئین هیدرولیزشده ازعضله ماهی مرکب ببری خلیج فارس با استفاده از فاکتورهای دما، نسبت آنزیم به سوبسترا، زمان و pH در 5 سطح و در قالب طرح مرکب مرکزی با آلفا برابر 2 در روش پاسخ سطح، بررسی شد. مدل دو جمله ای به دست آمده درسطح 99/99 درصد معنی دار بود و ضریب تعیین برابر 95/0، نسبت سیگنال به اختلال برابر 16/14 وعدم معنی داری فقدان تناسب نشان از کارائی خوب مدل برای پیشبینی بود. در نهایت شرایط بهینه با استفاده از نرم افزار Design Expert به صورت 19/8pH=، دمای 23/50، زمان 62/129 و درصد آنزیم 15/2 به دست آمد.کلید واژگان: پروتئین هیدرولیزشده, ماهی مرکب ببری, آلکالاز, روش سطح پاسخ, طرح مرکب مرکزی}The response surface methodology was employed to optimize the effects of pH, temperature (˚C), time (min) and the ratio of enzyme to substrate (% of substrate) on the hydrolysis process of cuttlefish muscle by alcalase. Central composite rotatable design with 5 levels and 4 factors and α=2 was used for the optimization of the process to gain the highest degree of hydrolysis. pH, temperature, time, enzyme concentration, interaction of temperature-enzyme concentration, square of pH, temperature, time and enzyme concentration had significant effects on the process. The R2 = 0.95, lack of fitKeywords: Cuttlefish, Hydrolysate, RSM, Alcalase}
-
زمینه و هدف
فرایندهای مختلفی روی تمایز سلول های بنیادی مزانشیمی(MSC) به سلول های استئوبلاستی تاثیر می گذارند که در این میان، مسیر پیام رسان Wnt حائز اهمیت ویژه ای است. در این مسیر پیام رسان، مولکول APC به عنوان کنترل کننده منفی Wnt عمل می کند که با اتصال به β-catenin سبب تجزیه این مولکول می گردد. لذا در این تحقیق به تخمین ارتباط متیلاسیون DNA با بیان ژن(APC یا Adenomatous Polyposis Coli) طی تمایز استئوبلاستی پرداخته شد.
روش بررسیدر این مطالعه ی تجربی، پس از جدا سازی و تکثیر MSCs، القای تمایز استئوبلاستی صورت گرفت. به منظور تایید تمایز استئوبلاستی از رنگ آمیزی آلیزارین رد و بیان شاخص های تمایزی شامل آلکالین فسفاتاز(ALP) و استئوکلسین استفاده گردید. وضعیت متیلاسیون ژنAPC با روش(MSP یا Methylation-Specific PCR)، وضعیت بیان ژن APC با استفاده از Real time PCR در روزهای مختلف تمایزی ارزیابی شد.
یافته هانتایج به دست آمده از رنگ آمیزی آلیزارین رد و بیان شاخص های ALP و استئوکلسین تایید کننده تمایز استئوبلاستی بود. نتایج حاکی از کاهش معنی دار بیان ژن APC در روز 7 تمایز استئوبلاستی بود(0/05P<). همچنین نتایج نشان دهنده ی هایپرمتیلاسیون پروموتر ژن APC طی تمایز استئوبلاستی بود.
نتیجه گیریکاهش بیان ژن APC می تواند در کنترل مسیر سیگنالی Wnt طی تمایز MSC مشتق از مغز استخوان به رده استئوبلاستی در مراحل مختلف نقش موثری ایفا کند. همچنین با توجه به نتایج به دست آمده، متیلاسیون پروموتر ژن APC نقش مهمی در کنترل بیان این ژن به عهده دارد.
کلید واژگان: تمایز استئوبلاستی, ژن APC, متیلاسیون}Background And AimDifferent regulation processes have an effect on osteoblastic differentiation of mesenchymal stem cells (MSCs), and among them Wnt signaling pathway is particularly desirable. In Wnt signaling pathway, Adenomatous Polyposis Coli (APC) bind to β-catenin and induce its degradation, thereby acting as a negative regulator of canonical Wnt pathway. In this study, gene expression and DNA methylation of APC gene during osteoblastic differentiation were determined.
Materials And MethodsIn this experimental study, after the isolation of MSCs, the induction of osteoblastic differentiation was done. To confirm osteoblastic differentiation, alizarin red staining together with the expression of Alkaline Phosphatase (ALP) and osteocalcin as specific osteoblastic markers was performed. APC gene methylation status by MSP (Methylation Specific PCR) and gene expression status of APC gene using Real-Time PCR technique during different times were evaluated.
ResultsThe results of alizarin red staining and the expression of ALP and osteocalcin confirmed osteoblastic differentiation. In addition, the results showed a significant decrease in the expression of APC gene on the 7th day of osteoblastic differentiation (P
ConclusionIt seems that the decreased expression APC gene will play an important role in Wnt signaling pathway regulation in different stages during osteoblastic differentiation of bone marrow-derived MSC. Also, according to the results, APC gene promoter methylation will play an important role in controlling gene expression.
Keywords: Osteoblastic Differentiation, APC Gene, Methylation} -
زمینه و هدف
اخیرا، چاقی به عنوان عامل خطر تهدید کننده برای بیماری های شناخته شده ای از جمله بیماری های قلبی _ عروقی، دیابت غیر وابسته به انسولین و سرطان های شایع به حساب می آید. بنابراین درک فرایندهای تمایز ادیپوست و بیان ژن های دخیل در این روند حیاتی است.
روش بررسیدر این مطالعه، سلول های بنیادی مزانشیمی مغز استخوان انسانی(H-MSCs) به وسیله شیب غلظتی فایکول جدا شده، مارکرهای سطحی این سلول ها به وسیله فلوسیتومتری تایید گردیده و تمایز به چربی و استخوان به وسیله دستورالعمل دگزامتازون انجام گرفت و به وسیله رنگ آمیزی تایید شد. سپس بیان کمی و کیفی ژن γ PPAR به عنوان مهمترین عامل نسخه برداری در تمایز چربی قبل و بعد از تمایز به ادیپوسیت به وسیله RT-PCR و qPCR بررسی و تحلیل آماری به وسیله paired t test و با کمک نرم افزارهای Pfaffle و graph pad انجام شد.
یافته هابیان این ژن بعد از تمایز سلول های بنیادی مزانشیمی مغز استخوان انسانی به سلول چربی افزایش قابل ملاحظه ای را نشان داد(0/05>p).
نتیجه گیریژن PPARγ به عنوان یکی از عوامل با اهمیت در تمایز سلول های MSCs به آدیپوسیت عمل می کند و مهار بیان این ژن برای جلوگیری از چاقی به عنوان یک ایده برای درمان در آینده پیشنهاد می شود.
کلید واژگان: سلول های بنیادی مزانشیمی, تمایز, سلول های چربی, ژن PPAR gamma}Background And AimObesity is now considered as one of the main risk factors of certain known diseases such as cardio-vascular diseases، non- insulin-dependent diabetes، and common cancers. Moreover، the increase of white fat tissue is known as a main factor in the obesity process، in terms of physiology and pathology. Therefore، the understanding of adipocytes differentiation processes is crucial.
Materials And MethodsIn this study، mesenchymal stem cells (MSCs) were isolated from human bone marrow by ficol-gradient، and then، their surface markers were confirmed by flow cytometry. Osteoblastic and adipocytes differentiation were done by dexamethasone protocol and confirmed by staining. Then qualitative and quantitative expressions of PPARgamma (PPAR-γ) gene as an important transcription factor in the differentiation of fat were studied by RT-PCR and REAL TIME PCR before and after differentiation into adipocytes. For statistical analysis، paired t-test was performed، using pfaffl and graph pad software.
ResultsPPAR-gamma gene expression showed a significant increase after differentiation of human bone marrow mesenchymal stem cells into adipocytes (p<0/05).
ConclusionAccording to the results، the PPAR-γ gene acts as one of the important factors in the differentiation of MSCs into adipocytes. In brief، the inhibition of this gene''s expression to prevent obesity is suggested as an idea for treatment in the future.
Keywords: Msenchymal Stem Cells, Differentiation, Adipocyte Cells, PPAR, gamma} -
زمینه و هدفشناخت مکانیسم مولکولی دخیل در افزایش سطح هموگلوبین جنینی (HbF) در استفاده از داروهای القاکننده می تواند به القای موثر آن کمک وافری نماید. هدف از انجام این تحقیق، تعیین اثر دو داروی تالیدوماید و سدیم بوتیرات به عنوان داروهای القاکننده ی بیان HbF، جهت شناخت مکانیسم مولکولی مرتبط با اثر دارویی در سلول های + 133 CD خون بند ناف حامل جهش هتروزیگوت β -تالاسمی می باشد.روش بررسیدر این مطالعه ی تجربی، سلول های + 133 CD پس از جداسازی، در محیط کشت تمایز اریتروئیدی قرار گرفتند. پس از تیمار دارویی در روز 6 از تمایز اریتروئیدی، بررسی بیان ژن های مارکرهای رده ی اریتروئیدی یعنی 71 CD و a 235 CD انجام گرفت. برای این منظور پس از استخراج RNA از پیش سازهای اریتروئیدی در روزهای 6 و 12 تمایز اریتروئیدی و سنتز cDNA، بیان کمی این دو ژن با استفاده از تکنیک Real-time PCR انجام شد.یافته هانتایج حاصل از این مطالعه نشان داد تالیدوماید سبب افزایش قابل توجهی در تکثیر پیش سازهای اریتروئیدی در مقایسه با سدیم بوتیرات و گروه کنترل، می گردد. همچنین تالیدوماید سبب افزایش و کاهش قابل توجهی به ترتیب در بیان ژن های 71 CD و a 235 CD در مقایسه با سدیم بوتیرات و گروه کنترل، گردید.نتیجه گیریبا توجه به پتانسیل بالای تالیدوماید در القای بیان HbF، به نظر می رسد مکانیسم های مولکولی دخیل در تکثیر پیش سازهای اولیه اریتروئیدی نقش موثری در القای بیان HbF داشته باشند.
کلید واژگان: تالیدوماید, سدیم بوتیرات, پیش ساز اریتروئیدی, 71CD, a235 CD}Background And AimUnderstanding the molecular mechanisms involved in the increased levels of HbF inducing drugs should be advised for effective induction. The aim of this study was to investigate the molecular effects of the drugs thalidomide and sodium butyrate considered as HbF inducer agents.Materials And MethodsIn this experimental study, CD133+ cord blood stem cells carrying mutations of heterozygous β-thalassemia were isolated and differentiated into erythroid lineage. In order to evaluate the expression of the erythroid markers, CD71 and CD235a, was analysed. For this purpose, the RNA extracted from erythroid precursors at days 6 and 12 of erythroid differentiation and cDNA synthesized, and then the expression of these genes was performed by quantitative Real-time PCR technique.ResultsThe results of this study showed the significant effect of thalidomide on erythroid proliferation as compared to sodium butyrate and control group (P<0.05). Also, thalidomide significantly increased CD71expression and decreased CD235a expression as compared to sodium butyrate and control groups (P<0.05).ConclusionThalidomide may play its role on HbF induction by increasing the proliferation of early erythroid precursors.Keywords: Background, Aim: Understanding the molecular mechanisms involved in the increased levels of HbF inducing drugs should be advised for effective induction. The aim of this study was to investigate the molecular effects of the drugs thalidomide, sodium} -
هدفاختلال دوقطبی 1 یک اختلال روانی شایع با عوامل پیچیده ایجاد کننده است. محور ژنتیک در بررسی این اختلال دارای اهمیت روزافزون است. ژن دیسبیندین که در موقعیت 6p22.3 واقع شده از عوامل موثر در اسکیزوفرنیا در نظر گرفته می شود و همچنین برخی پلی مورفیسم ها یا هاپلوتیپ های آن داری ارتباط با برخی اختلالات سایکوتیک از جمله اختلال دوقطبی است. بررسی مورد- شاهدی ژنوتیپ بیماران ایرانی از نظر ژنوتیپ ها و هاپلوتیپ هایی از ژن دیسبیندین که در جمعیت های مختلف با این بیماری مرتبط شناخته شده است، هدف مطالعه حاضر است.مواد و روش هادر این پژوهش اثر چهار پلی مورفیسم rs2619538، rs2743852، rs1018381 و rs2619522 که در مطالعات پیشین گزارش شده است و هاپلوتیپ های آن ها در جمعیتی 124 نفری متشکل از 44 بیمار دوقطبی 1 و 80 کنترل همخوان به روش واکنش چندگانه پلیمریزاسیون زنجیره مختص آلل بررسی شد. تایید روش با توالی سنجی مستقیم صورت پذیرفت.نتایجیافته های بررسی حاضر تقریبا همخوان با مطالعات پیشین در جمعیت های دیگر، ارتباطی بین ژنوتیپ پلی مورفیسم ها و اختلال دوقطبی 1 نشان نداد. همچنین آنالیز آلل ها رابطه معنی دار آماری با ابتلا به اختلال نشان نداد. در نهایت برخلاف نتایج مطالعات قبلی، هیچ یک از هاپلوتیپ ها در مطالعه حاضر رابطه آماری معنی داری با اختلال دوقطبی 1 نشان نداد.نتیجه گیریبا توجه به یافته های مطالعات قبلی در مورد اثر این ژن در اختلال دوقطبی 1، احتمالا ناهمگونی آللی یا عدم شناسایی آلل های سببی علت ناهمخوانی های مشاهده شده بین نتایج مطالعه حاضر و مطالعات قبلی است. همچنین با توجه به قوم های مورد مطالعه در بررسی های پیشین احتمال می رود تنوع جمعیتی نیز از عوامل ناهمخوانی نتایج باشد.
کلید واژگان: اختلال دوقطبی, دیسبیندین, پلی مورفیسم, هاپلوتیپ, ارتباط}ObjectiveBipolar I disorder is a common disorder with a complex etiology. A genetic approach is gaining increasing importance in this disorder. The dysbindin gene، located at 6p22. 3 is considered a susceptibility gene for schizophrenia. Certain genotypes of dysbindin are thought to be associated with other psychoses such as bipolar disorders. This study intends to assess the association in previously implicated dysbindin genotypes and haplotypes with bipolar I disorder in an Iranian population.MethodsWe genotyped four previously reported SNPs: rs2619522، rs1018381، 2743852 and rs2619538. Their haplotypes were analyzed in a population of 124 patients that consisted of 44 confirmed bipolar I disorder patients and 80 control subjects. We used multiple allele-specific PCR method for genotyping، which was verified by direct sequencing.ResultsIn concordance with previous reports in other populations our findings showed no association between the single SNPs and bipolar I disorder. Furthermore، none of the alleles showed a significant association with the disorder. In contrast to previous reports، haplotype analysis did not reveal any statistically significant associations with bipolar I disorder.ConclusionConsidering reports of previous studies regarding the implication of these dysbindin genotypes in bipolar I disorder، it is probable that allelic heterogeneity along with lack of an established causal variant in the dysbindin gene can be main factors for this discordance. With regards to ethnicities in other studies، population variation can also be considered an important factor in the observed variation.Keywords: Bipolar disorder, DTNBP1, Polymorphism, Haplotype, Association} -
زمینهتبدیل اپی ژنتیکی سلول های سوماتیک مختص بیمار به سلول های رویانی به دلیل اهمیت آن در پیوند سلول های بنیادی و سازگاری با گیرنده ازارزش بسیاری برخوردار است. با این حال، به کارگیری درمانی سلول های به دست آمده به دلیل مشکلات فنی و موضوعات اخلاقی امکان پذیر نیست. اخیرا روش های جدیدی مطرح شده که با بیان اکتوپیک فاکتورهای رونویسی دوره رویانی سلول سوماتیک را به سلول شبه رویانی تبدیل کرده اند. محدودیت این روش به کارگیری ویروس های جهش زای آسیب رسان به ژنوم مانند رتروویروس یالنتی ویروس می باشد. هدف اصلی این بررسی تولید سلول های بنیادی هماتوپوئتیک انسانی از سلول های فیبروبلاست القا شده با وکتورهای بی خطر آدنوویروسی حامل ژن های فعال دوره رویانی بود.مواد و روش هافیبروبلاست های جدا شده از پوست ختنه گاه تکثیر و آدنو ویروس های نو ترکیب حامل ژن های cMyc، Klf4، Oct4، Sox2 انسانی به محیط کشت اضافه گردید. پس از تشکیل کلون های شبه جنینی و تکثیر سلولی به محیط کشت جنینی بدون bFGF منتقل و اجسام شبه رویانی در محیط تمایزی با و بدون استروما به مدت 14 روز کشت داده شدند.یافته هابیان ژن CD34 و شاخص های آنتی ژنی CD38، CD34، CD133 در محیط تمایزی استرومایی اختلاف معنی داری با محیط غیرتمایزی و بدون استروماداشتند.نتیجه گیریاین یافته ها نشان می دهند میزان تمایز هماتوپوئتیک سلول های Adeno-iPS در محیط استرومایی زیاد است و نیازی به استفاده از فاکتور رشد نیست، در حالی که در تمایز هماتوپوئتیک در محیط غیر تمایزی و تمایزی بدون استروما هیچ تفاوتی دیده نمی شود.
کلید واژگان: آدنوویروس, iPS, تمایز, هماتوپوئتیک}BackgroundEpigenetic reprogramming of somatic cells into embryonic stem cells has attracted much attention, because of the potential for stem cell transplantation and compatibility with recipient. However, the therapeutic application of either nuclear transfer or nuclear fusion of somatic cell has been hindered by technical complications as well as ethical objections. Recently, a new method is reported whereby ectopic expression of embryonic specific transcription factors was shown to induce fibroblasts to become embryonic like SCs (induced pluripotent stem cells). A major limitation of this method is the use of potentially harmful genome integrating viruses such as reto- or lentivirus. The main aim of this investigation was generation of human hematopoietic stem cells from induced fibroblasts by safe adenovectors carrying embryonically active genes.Material And MethodsIsolated fibroblasts from foreskin were expanded and recombinant adenoviruses carrying human Sox2, Oct4, Klf4, cMyc genes were added to culture. After formation of embryonic like colonies and cell expansion, they were transferred to embryonic media without bFGF, and embryoid bodies were cultured on stromal and non-stromal differentiation media for 14 days.ResultsExpression of CD34 gene and antigenic markers, CD34, CD38 & CD133 in stromal culture showed significant difference with non-differentiation and non-stromal media.ConclusionThese findings show high hematopoietic differentiation rate of Adeno-iPS cells in stromal culture and no need to use growth factors. While, there was no difference between non-differentiation and non-stromal media.Keywords: adenovirus, iPS, differentiation, hematopoietic} -
زمینهسلول های بنیادی اسپرماتوگونی پایه اسپرم-زایی انسان می باشند. با توجه به شمار اندک و نبود شاخص اختصاصی، مطالعه پیرامون ویژگی ها و عملکرد این سلول ها در شرایط داخل آزمایشگاهی می تواند در درک بیولوژی باروری مردان کمک کننده باشد. بررسی کنونی به منظور ارزیابی تاثیر هم کشتی با سلول های سرتولی بر میزان کلونی زایی و بیان تعدادی از ژن های اختصاصی سلول های جنسی مردان در شرایط داخل آزمایشگاهی انجام گرفت.مواد و روش هاسلول های بیضه ای با استفاده از روند هضم آنزیمی دو مرحله ای و استفاده از صفحات تمایزی،از بیوپسی های بیضه جداسازی شدند. دو سیستم کشت به صورت هم کشتی با سلول های سرتولی خود فرد و کشت سلول های اسپرماتوگونی بدون هم کشتی (به عنوان گروه کنترل) طراحی شد. طی سه هفته کشت تعداد و قطر کلونی های حاصل ارزیابی شد. بیان اینتگرین آلفا 6، اینتگرین بتا 1 و PLZF به عنوان شاخص های اختصاصی سلول های جنسی با استفاده از Real time PCR مورد بررسی قرار گرفت. تجزیه و تحلیل آماری با استفاده از روش آنالیز واریانس یک طرفه در نرم افزار SPSS ویرایش 16 و بامحدوده اطمینان 95 درصد مورد بررسی قرار گرفتند.یافته هانتایج نشان داد هم کشتی با سرتولی به طور معنادار منجر به افزایش تعداد و قطر کلونی های حاصل از سلول های اسپرماتوگونی طی دوره کشت نسبت به گروه کنترل شد (05/0>P). همچنین میزان بیان مارکرهای سلول های بنیادی جنسی تحت بررسی در طی هفته های دوم و سوم، در گروه هم کشتی نسبت به گروه کنترل به طور معنادار بالاتر بود (05/0>P).نتیجه گیریبا توجه به اثرات بهینه سلول های سرتولی بر روی سلول های بنیادی اسپرماتوگونی، به نظر می رسد بهره مندی از سیستم هم کشتی با سلول های سرتولی می تواند به عنوان روش مناسبی به منظور غنی سازی سلول های اسپرماتوگونی انسانی مورد استفاده قرار گیرد.
کلید واژگان: سلول های بنیادی اسپرماتوگونی انسان, کلونی زایی, کشت, بیان ژن}BackgroundHuman spermatogonial stem cells (SSCs)، are the foundation of spermatogenesis. Because of low number and lack of significant marker in human SSCs، studying their characteristics، could provide better understanding about the biology of male fertility. This study was designed to examine the effects of in vitro co-culture with sertoli cells on SSC colonization and germ cells specific gene expression of human spermatogonial stem cells.Material And MethodsTesticular cells were isolated from testis biopsies by using two step enzymatic digestion and differential plating. two culture system were designed: co-culture with patient Sertoli cells and culture of SSC without co-culture (as control group). The number and diameter of colonies were evaluated during 3 weeks of culture. The expression of alpha 6 integrin، beta1 integrin and PLZF، as germ stem cell specific markers، was assessed using quantitative RT-PCR. Statistical analysis was performed using one way ANOVA in SPSS vesion 16 software with 95% Confidence interval.ResultOur results were showed that the number and diameter of colonies increased significantly in co-culture with sertoli cells (P<0. 05). The expression profile of genes in 2nd and 3rd weeks of culture revealed that there is significant higher expression of germ stem cell markers in our co-culture group versus control group.ConclusionBased on the optimal effects of sertoli cells on spermatogonial stem cells، co culture of the human SSCs with the feeder layer sertoli may be used as a suitable method for the enrichment of human spermatogonial stem cells.Keywords: human Spermatogonial Stem Cells, Colony Formation, Culture, gene expression} -
هدفیکی از حوزه های مهم در اپی ژنتیک، متیلاسیون DNA است که دی نوکلئوتیدهای CpG در ژنوم را تحت تاثیر قرار داده و رونویسی بیان ژن های مورد نظر را کنترل می کند. در ژنوم ویروس هپاتیت B، سه جزیره غنی از دی نوکلئوتید CpG وجود دارد که تمایل شدیدی به متیله شدن دارد. هدف از این مطالعه تعیین الگوی متیلاسیون ژن x ویروس هپاتیت B در بیماران مبتلا به این ویروس است.مواد و روش هاجمعیت هدف بررسی در این مطالعه 45 بیمار مبتلا به ویروس هپاتیت B بود. ابتدا DNA ژنومی ویروس برای تعیین میزان متیلاسیون با بی سولفیت سدیم تیمار شد. سپس با دو گروه آغازگر متیله و غیر متیله توسط روش MSP تجزیه و تحلیل شد.نتایجمیزان متیلاسیون در نمونه های سرمی مبتلا به ویروس به طور کلی 5/35 درصد بود و این نرخ در بیماران HBeAg مثبت 8/20 درصد و در مبتلایان HBeAg منفی 3/52 بود. به این ترتیب میزان متیلاسیون در نمونه سرمی افراد مبتلابه هپاتیت B مزمن HBeAg منفی به طور معنی داری بیشتر از میزان متیلاسیون DNA ویروس در افراد مبتلا HBeAg مثبت است که این فرضیه با Student T-test با 02/0=P تایید شد.نتیجه گیریمتیلاسیون ژنوم هپاتیت B می تواند به عنوان یک مکانیسم جدید برای کنترل پیشرفت عفونت ویروسی و همچنین تعیین مرحله بالینی بیماری مبتلا در نظر گرفته شود، بنابراین دانستن الگو های مختلف متیلاسیون DNA از اهمیت ویژه ای برخوردار است. در این مطالعه میزان متیلاسیون در بیماران HBeAg منفی به طور معنی داری بالاتر از افراد HBeAg مثبت تعیین شد (02/0=P).
کلید واژگان: بررسی الگوی متیلاسیون ژن x ویروس هپاتیت B}ObjectiveA recent field of research in epigenetics is DNA methylation which involves the CpG island in the genome that subsequently controls transcription and translation of targeted genes. In the hepatitis B virus (HBV) genome، there are three CpG islands which tend to be methylated. The aim of the current study is to determine the methylation pattern of the HBV X gene in chronically infected HBV patients.MethodsStudy participants comprised 45 chronically infected HBV patients. According to the presence of the HBeAg، patients were divided into two groups، HBeAg positive (n=24) and HBeAg negative (n=21). Initially، viral DNA was treated with natrium bisulfate. Then، analysis was performed with two sets of methylated and non-methylated primers by the MSP method.ResultsThe overall methylation rate in serum samples of hepatitis B infected patients was 35. 5%; the rate in the HBeAg positive patients was 20. 8%، whereas it was 52. 3% in HBeAg negative patients. There was a significantly higher rate of methylation in serum samples of HBeAg negative patients compared to HBeAg positive patients (student''s t-test; P=0. 02).ConclusionMethylation of HBV can be used as a new mechanism to control the progression of viral infection. This methodology can be useful for determining the characteristics of clinical stages of this infection.Keywords: Hepatitis B, DNA methylation, Epigenetic} -
سابقه و هدف
ژن های سرطانی- بیضه ایی (Cancer-Testis genes) فقط در بافت نرمال بیضه بیان می شوند، ولی برخی از آنها در بعضی از انواع سرطان ها بیان می شوند. هدف از این مطالعه بررسی کیفی بیان چند ژن سرطانی- بیضه ایی در بافت توموری بیماران مبتلا به سرطان پستان بود.
روش بررسیپس از تهیه 32 نمونه سرطان پستان و استخراج RNA، با روش Multiplex RT-PCR، بیان رونوشت ژن های سرطانی- بیضه ایی NY-ESO-1 1a،NY-ESO-11b، MAGE3،SSX2 و SCP1 و ژن GAPDH (کنترل داخلی) مورد بررسی قرار گرفتند.
یافته ها3 نمونه (9%) رونوشت NY-ESO-1 ایزوفرم 1a و 6 نمونه (19%) رونوشت NY-ESO-1 ایزوفرم 1b و در مجموع 9 نمونه (28%) ژن NY-ESO-1 را بیان کردند. 7 نمونه (22%) رونوشت SCP1و 2 نمونه (6%) رونوشت MAGE3 را بیان کردند. 13 نمونه (41%) حداقل یکی از ژن های سرطانی- بیضه ایی بررسی شده را بیان کردند.
نتیجه گیریدو ژن NY-ESO-1وSCP1 به ترتیب دارای بالاترین فراوانی بیان mRNA در نمونه های سرطان پستان بودند. در ادامه پیشنهاد میگردد با بررسی تعداد بیشتری از نمونه های سرطان پستان و همچنین بررسی بیان این ژن ها در مرحله پروتئین و ایمونوژن بودن آنها، بتوان از این آنتی ژن های سرطانی – بیضه ای در جهت پیشبرد ایمونوتراپی سرطان پستان استفاده نمود.
کلید واژگان: سرطان پستان, RT, PCR, بررسی بیان, ژن های سرطانی, بیضه ای, تومور مارکر}Medical Science Journal of Islamic Azad Univesity Tehran Medical Branch, Volume:23 Issue: 3, 2013, PP 179 -184Backgroundcancer/testis genes (CT-genes) are a family gene which only express in normal testis tissue; some of them are randomly expressed in some types of cancers. The aim of this study was to evaluate the frequency of expression of CT-genes in the patients with breast cancer.
Materials And MethodsThirty two breast cancer tissue samples were prepared. Expression of NY-ESO-1 1a، NY-ESO-1 1b، SCP1، SSX-2 and MAGE-3 genes، as well as GAPDH (internal control)، were studied by multiplex RT-PCR method.
ResultsThree (9%) of 32 tumor samples expressed mRNA of NY-ESO-1 1a، while six (19%) of 32 tumor samples expressed mRNA of NY-ESO-1 1b. Seven (22%) and two (6%) of 32 tumor samples expressed mRNA of SCP1 and mRNA of MAGE3، rtepectively. Overall، Thirteen (41%) samples expressed one of the studied genes.
ConclusionNY-ESO-1 and SCP1 genes had the highest frequency of expression of mRNA. It is suggested that more number of breast cancer tumor samples should be examined to evaluate expression of CT-genes. SCP1 and NY-ESO-1 proteins may promote future breast cancer immunotherapy.
Keywords: Breast cancer, RT, PCR, Immunotherapy, Cancer, testis genes expression, Tumor marker} -
سندرم Raine یک دیسپلازی اسکلتی شدید است که معمولا سبب مرگ بیمار در سنین نوزادی میشود. گزارش هائی وجود دارد که مبتلایان به نوع خفیف تر بیماری عمر طولانی تری داشته و به سن کودکی هم رسیده اند. بررسی های رادیولوژیک افزایش دانسیته استخوانی ژنرالیزه و اوستئواسکلروز را نشان می دهند. تراکم استخوانی بیشتر در قاعده جمجمه سبب بروز تغییراتی در استخوانهای سر و صورت شده و منجر به علائم دیس مورفیک خاص در چهره می گردد. نشانه های بیماری عبارتند از: پیشانی برجسته، پروپتوزیس، ریشه بینی فرو رفته، هیپوپلازی بخش میانی صورت، بینی هیپوپلاستیک، دهان مثلثی شکل، آترزی کوآن و کلسیفیکاسیون درون جمجمه. تراکم استخوان ها در این بیماری به حدی است که با بیماری اوستئوپتروزیس اشتباه می شود. سندرم Raine یک بیماری ارثی مغلوب اتوزومی است، و علت آن جهش در ژن FAM20C است. این ژن پروتئینی را کد می کند که خاصیت فسفریلاز-کینازی دارد و در بیومینرالیزاسیون (biomineralization) استخوانها نقش دارد. در این مقاله یک بیمار مبتلا به سندرم Raine از ایران معرفی می شود. بر اساس اطلاعات موجود بیمار اولین مورد شناخته شده در ایران است که گزارش می شود. در بررسی مولکولی از بیمار اخیریک جهش هوموزیگوت جدید شناسائی گردید. بیمار حاضر هفدهمین مورد شناخته شده در جهان می باشد.
کلید واژگان: سندرم Raine, دیسپلازی اوستئواسکلروتیک کشنده, ژن FAM20C, جهش جدید از ایران}syndrome is a very rare hereditary lethal skeletal dysplasia. There are few reports of milder phenotypes that patients were survived till late childhood. Radiologic investigations showed increased bone density and osteosclerosis. The increased density of bones in head and face causes a characteristic dysmorphic features that includes: prominent and narrow forehead، proptosis، small hypoplstic nose with depressed nasal bridge، mid-face hypoplasia، triangular moth، coanal atresia، and intracranial cerebral calsification. Osteosclerosis is severe enough that would be mistaken with osteopetrosis. Raine syndrome is a hereditary autosomal recessive disease. The cause of it is a homozygous or compound heterozygous mutation in the FAM20C gene. The gene encodes a phosphorylase-kinase which is responsible for biomineralization of skeleton. Here we report a typical patient of this syndrome from Iran، and to our knowledge this is the first confirmed one in our population. Molecular analysis showed a homozygous novel mutation in the FAM20C gene. This patient is the 17th reported case in the relevant literature.Keywords: Raine syndrome, Lethal Osteosclerotic Dysplasia, FAM20C gene, Novel mutation, Iran} -
زمینه و هدففرایندهای تمایزی ویژه به رده های گوناگون سلولی، با فاکتورهایی نظیر فاکتورهای نسخه برداری، عناصر سرکوبگر تومور و عناصر سیگنالینگ داخل سلول دارای ارتباط تنگاتنگ است که گروهی از این فاکتورها شامل vHL، Ecad و Runx3می باشند. مکانیسم های کنترلی تاثیرگذار توسط این فاکتورها نیز اپی ژنتیک است که دارای مکانیسم های متعددی از جمله متیلاسیون و استیلاسیون می باشد. در واقع هدف اصلی مطالعه ی ذیل، بررسی وضعیت بیان ژن های vHL، Ecad و Runx3 در سلول های بنیادی CD34+ خون بند ناف و آشکار ساختن الگوی متیلاسیون ژن های موردنظر در این مرحله بود.روش بررسیپس از جداسازی سلول های بنیادی از خون بند ناف و کشت سلول های موردنظر در محیط مخصوص و نیز تخلیص ژنوم از سلول ها، در مرحله ی اول از RNA مورد نظر، cDNA ساخته شد و واکنش PCR نیز برای ژن های مورد مطالعه انجام گرفت. در مراحل بعدی نیز از DNA پردازش شده مراحل قبل، برای انجام واکنش های MSP استفاده شد.یافته هاپس از انجام واکنش PCR با پرایمرهای طراحی شده برای استفاده در Real Time PCR و cDNA مربوط به RNA سلول های بنیادی، این نتایج به دست آمد که همه ی ژن های مورد مطالعه، در سلول های بنیادی CD34+ بیان می شوند. با انجام MSPدر مرحله ی دیگری از مطالعه نیز مشخص شد که ژن های Ecad و Runx3 دارای متیلاسیون و بیان نسبی و ژن vHL نیز فاقد متیلاسیون و بیان کامل تحت این شرایط بودند.نتیجه گیریهمخوانی قابل توجهی بین بیان یک ژن و تغییرات اپی ژنتیک وجود دارد و بیان هر سه ژن مورد مطالعه، نشان دهنده ی نقش موثر آن ها در بیولوژی و عملکرد سلول های بنیادی خونساز دارد.
کلید واژگان: متیلاسیون, سلول های بنیادی خونساز, خون بند ناف, vHL, Runx3 - Ecad}Background And ObjectiveSpecific differentiation processes to various cell lineages are closely associated with factors such as transcription factors، tumor suppressor elements and internal signaling pathways including vHL، Ecad، and Runx3. Epigenetics is an effective control mechanism of these factors، including several mechanisms such as methylation and acetylation. The main objective of this study was discovering the expression status of vHL، Runx3 and Ecad genes and determining the methylation patterns in the respective genes in hematopoietic cord blood stem cells.Materials And MethodsAfter isolating the stem cells from cord blood، expansion of the desired cells and DNA purification from the cells، in the first stage cDNA was constructed from the RNA، and PCR was performed for the genes under study. In later stages، the processed DNA from the previous stages was used for MSP reaction.ResultsAfter PCR using designed primers to be used in Real-Time PCR and RNA derived cDNA of stem cells، it was found that all the genes under study were expressed in CD34+ stem cells. MSP in another stage of the study showed that Ecad and Runx3 genes are partially methylated and partially expressed، and vHL gene is not methylated and is completely expressed in this stage.ConclusionThere is substantial agreement between gene expression and epigenetic alterations، and study of all the three genes indicates their effective role in biology and function of these stem cells in Hematopoietic stem cells.Keywords: Methylation – hematopoietic stem cells – Cord blood – vHL – Runx3 – Ecad} -
سابقه و هدفعناصر پیامدهی داخل سلول نظیر P15 و P16، نقش به سزایی در تمایز سلول های اولیه به گونه های سلولی متنوع، ایفا می کنند. فاکتورهای مذکور توسط مکانیسم های مختلفی در کنترل بیان ژن دخیلند که در بین آن ها، اپی ژنتیک به خصوص متیلاسیون قابل ذکر است. اهداف اصلی در این مطالعه، پی بردن به وضعیت بیان ژن های مورد نظر در سلول های بنیادی CD34+ بند ناف و تعیین تغییرات متیلاسیون ژن های مورد نظر در همین مرحله بود.
مواد و روش هامطالعه انجام شده از نوع تجربی بود. پس از جمع آوری کیسه های خون بند ناف و تخلیص و ازدیاد سلول های بنیادی، ژنوم سلولی جدا شد. در مراحل بعد به ترتیب از RNA و DNA سلول های اولیه، cDNA و Bisulfite treated DNA ساخته شد. در ادامه نیز برای هر دو ژن، واکنش های PCR و Methylation Specific PCR انجام گرفت.
یافته هاپس از انجام MSP، مشخص شد که P15 دارای متیلاسیون و بیان نسبی در سلول های بنیادی CD34+ بوده و ژن دیگر یعنی P16 نیز فاقد متیلاسیون در این مرحله و دارای بیان کامل است. نتایج PCR، نشان دهنده بیان هر دو ژن انتخاب شده، در سلول های بنیادی CD34+ می باشد.نتیجه گیریهمواره، الگوی بیان ژن توسط هر بافت یا هر سلول، متناسب با عملکردهای آن می باشد. بیان مشخص P15 و P16 نیز، می تواند بیانگر نقش آن ها در بیولوژی سلول های بنیادی CD34+ خون بند ناف باشد. همواره هم خوانی قابل توجهی میان بیان یک ژن و تغییرات اپی ژنتیک وجود دارد.
کلید واژگان: متیلاسیون, سلول های بنیادی, بند ناف}Background And ObjectivesCell signaling elements such as P15 and P16 play an important role in differentiation of primitive cells into various cell types. These factors are involved in controlling gene expression by different mechanisms, of which epigenetics especially methylation is noteworthy. The main objectives of this study were discovering the expression status of target genes in CD34+ cord blood stem cells and determining the methylation changes in the respective genes is this same stage.Materials And MethodsAfter collection of cord blood bags and purification and proliferation of stem cells, cellular DNA was isolated. In later stages, cDNA and Bisulfite treated DNAs were synthesized from RNA and DNA of primary cells, respectively. Polymerase Chain Reaction and Methylation Specific PCR were later performed for both genes.ResultsAfter MSP, it was found that the P15 has partial methylation and expression in CD34+ stem cells, and P16 lacks methylation in this stage and is completely expressed. The results of PCR indicated expression of both genes in CD34+ stem cells.ConclusionsGene expression profile of each tissue or cell is in accordance with its functions; the specific expression of P15 and P16 can indicate a possible role of these genes in biology of CD34+ stem cells in umbilical cord blood. There is always substantial agreement between expression of a gene and its epigenetic changes.Keywords: Methylation, Stem Cells, Cord Blood} -
زمینه و هدفRUNX2 اختصاصی ترین فاکتور نسخه برداری در تمایز سلول های بنیادی مزانشیمی به استئوبلاست می باشد. در این تحقیق، میزان بیان کمی این فاکتور در طول تمایز سلول های بنیادی مزانشیمی به استئوبلاست با استفاده از محیط تمایزی استئوبلاستی و داروی زولدرونیک اسید مورد ارزیابی قرار گرفت.مواد و روش هادر این مطالعه تجربی، سلول های بنیادی مزانشیمی انسانی تحت تیمار با محیط تمایزی استئوبلاستی و داروی زولدرونیک اسید قرار گرفتند. استخراج RNA در هفته های اول، دوم و سوم تمایز استئوبلاستیک و از سلول های بنیادی مزانشیمی تمایز نیافته صورت گرفت. بیان کمی RUNX2 با روش quantitative Real Time-PCR سنجیده شد.یافته هابیان ژن RUNX2 تحت تاثیر محیط تمایزی در هفته های اول، دوم و سوم تمایز در مقایسه با سلول های بنیادی مزانشیمی تمایز نیافته، به ترتیب 09/0±76/1، 25/0±54/3 و 17/0±40/3 برابر و تحت تیمار با داروی زولدرونیک اسید به ترتیب 13/0±91/2، 30/0±25/3 و 23/0±36/3 برابر بود. مقایسه میزان افزایش بیان ژن RUNX2 در هفته اول تمایز با محیط تمایزی و داروی زولدرونیک اسید اختلاف معنی دار از نظر آماری نشان می دهد (05/0 p<). در حالی که میزان بیان RUNX2 در هفته دوم و سوم تمایز با محیط تمایزی و داروی زولدرونیک اسید تقریبا یکسان بود.نتیجه گیریبیان ژن RUNX2 در طول تمایز سلول های بنیادی مزانشیمی به استئوبلاست تحت تاثیر محیط تمایزی و داروی زولدرونیک اسید افزایش پیدا می کند. افزایش بیان RUNX2 در هفته اول تیمار با زولدرونیک اسید بیانگر تاثیر تسریع تمایز استئوبلاستی با داروی زولدرونیک اسید می باشد.
کلید واژگان: سلول های بنیادی مزانشیمی, محیط تمایزی, زولدرونیک اسید, فاکتور نسخه برداری RUNX2}Background And ObjectivesRUNX2 is the most specific transcription factor in osteoblastic differentiation of MSCs. In this research، RUNX2 expression was quantified in MSCs differentiated by osteogenic differentiation medium (ODM) and zoledronic acid (ZA).Materials And MethodsIn this experimental study، hMSCs were treated by osteogenic differentiation medium and ZA. RNA extraction was carried out from both osteoblastic differentiated cells in the first، second and third weeks of differentiation، and also from undifferentiated MSCs. RUNX2 expression was quantified by quantitative Real Time-PCR.ResultsGene expression of RUNX2 in the first، second and third weeks of osteogenic differentiation by ODM compared to undifferentiated MSCs showed 1. 76±0. 09-fold، 3. 54±0. 25-fold and 3. 40±0. 17-fold increase in expression، respectively. Zoledronic acid increased the expression of RUNX2 2. 91±0. 13-fold، 3. 25±0. 3-fold and 3. 36±0. 23-fold at the same time points، respectively. Comparison of RUNX2 expression by ODM (1. 76±0. 09-fold) and ZA (2. 91±0. 13-fold) in the first week of differentiation showed statistical differences (P<0. 05). Whereas، RUNX2 expression by both ODM and ZA in the second and third weeks of differentiation were approximately equal.ConclusionRUNX2 expression was increased in osteoblastic differentiation by both ODM and ZA. However، it seems that ZA can cause more expression of RUNX2 in the first week of osteoblastic differentiation.Keywords: Mesenchymal Stem Cells, Differentiation Medium, Zoledronic Acid, RUNX2 Transcription Factor} -
استفاده از داروهای القاکننده هموگلوبین جنینی در رویکرد نوین درمانی در بیماران مبتلا به β-تالاسمی و بیماری داسی شکل حائز اهمیت می باشد. این داروها با مکانیسم های مختلف از جمله افزایش تکثیر و تمایز پیش سازهای اریتروئیدی سبب تولید هموگلوبین جنینی می گردند. تالیدوماید و سدیم بوتیرات دو داروی موثر در القای بیان هموگلوبین جنینی می باشند که به صورت تیمار تک دارویی و ترکیبی مورد استفاده قرار گرفتند. این تحقیق بر روی سلول های پیش ساز اریتروئیدی مشتق از سلول های بنیادی CD133+ جدا شده از خون بند ناف انجام شد. از تکنیک فلوسیتومتری جهت ارزیابی هموژن بودن سلول های CD133+ جداشده استفاده شد. سپس با استفاده از آزمون سنجش کلونی هماتوپوئتیک، قدرت کلونی زایی در گروه های تیمار دارویی تعریف شده مورد ارزیابی قرار گرفت. نتایج بدست آمده از فلوسیتومتری حاکی از هموژن بودن سلول های بنیادی CD133+ جداشده از خون بندناف به میزان بیش از %95 می باشد. همچنین نتایج بدست آمده از آزمون سنجش کلونی بیانگر تاثیر تالیدوماید در افزایش تعداد کلونی های هماتوپوئتیک و کلونی های اریتروئیدی (به ترتیب افزایش 3/1 و 5/1 برابری) در مقایسه با گروه کنترل می باشد(05/0p<). نتایج بدست آمده حاکی از توان بالای تالیدوماید در افزایش کلون زایی و عدم وجود تاثیرات سیتوتوکسیک در استفاده از این دارو در مقایسه با سدیم بوتیرات و ترکیب دارویی می باشد(05/0p<).
کلید واژگان: β, تالاسمی, بیماری داسی شکل, سلول های بنیادی CD133+, هموگلوبین جنینی, تالیدوماید, سدیم بوتیرات}Utilization of fetal hemoglobin inducing drugs is of crucial importance in novel therapeutic approach of β-thalassemia and sickle cell disease. These drugs induce fetal hemoglobin production by several mechanisms such as increasing the proliferation and differentiation of erythroid progenitors. Thalidomide and sodium butyrate are two fetal hemoglobin inducers used as single and combination treatments.This research performed on erythroid progenitors derived from CD133+ cord blood stem cells. Flow cytometry was used for evaluation of the homogeneity of isolated CD133+ cells. Then, the colony formation potential of defined treated groups was evaluated using colony formation assay. Flow cytometry analysis showed the homogeneity of isolated CD133+ cord blood stem cells more than 95%. Also, the results of colony formation assay showed the potential of thalidomide in increasing the hematopoietic and erythroid colony count (1.3- and 1.5- fold increase, respectively) as compared to the control (p<0.05). The results of this study showed that thalidomide has a high potential in colony formation without cytotoxic effects on erythroid progenitors as compared to sodium butyrate and combination treatment (p<0.05). -
سابقه و هدف موتاسیون های FLT3 با پیامد ضعیفی در بیماران مبتلا به لوسمی میلوبلاستیک حاد(APL) همراه هستند. هدف این مطالعه، بررسی فراوانی و تاثیر موتاسیون های FLT3 بر روی ویژگی های کلینیکی و پاسخ به درمان در بیماران APL درمان شده با آرسنیک تری اکساید (As2O3) بود.
مواد و روش ها در یک مطالعه گذشته نگر، نمونه خون 115 بیمار APL درمان نشده جمع آوری و DNA ژنومی به روش نمک اشباع استخراج شد. موتاسیون های FLT3-ITD و FLT3-D835 با روش PCR و RFLP بررسی شد. آزمون من ویتنی و کای دو و نیز 18 SPSS برای تجزیه و تحلیل اطلاعات استفاده شد.
یافته ها موتاسیون های FLT3-ITD و FLT3-D835 به ترتیب در 16(14%) و 13(11%) بیمار، شناسایی شد. در 2 بیمار هر دو موتاسیون وجود داشت بنابراین فراوانی کلی موتاسیون های FLT3، 5/23% به دست آمد. در بیماران دارای موتاسیون FLT3-ITD، شمارش گلبول های سفید بالاتر(005/0 p=) و ایزوفرم bcr3 شایع تر بود(04/0 p=). ارتباط معناداری بین موتاسیون FLT3-D835 و هیچ کدام از ویژگی های کلینیکی بیماران شناسایی نشد. از نظر پاسخ به درمان، تفاوت معناداری بین بیماران دارای موتاسیون های FLT3 و فاقد آن وجود نداشت.
نتیجه گیری بر اساس نتایج این مطالعه، القای بهبود کلینیکی کامل با As2O3، ممکن است ارتباطی با وضعیت موتاسیون های FLT3 نداشته باشد بنابراین As2O3 می تواند به ویژه به عنوان درمان انتخابی اول در بیماران APL دارای موتاسیون های FLT3 مطرح باشد. هر چند مطالعه های بیشتر بر روی گروه بزرگتری از بیماران برای تایید این نتایج ضروری است.کلید واژگان: لوسمی پرومیلوسیتی حاد, ژن ها, پروتئین انسانی FLT3, PML, RAR α}Background and ObjectivesFLT3 mutations are associated with poor outcome in acute myeloblastic leukemia(AML) patients. Only limited information is available about effects of FLT3 mutation on Acute Promyelocytic Leukemia (APL). We investigated the prevalence and impact of FLT3 mutations on the clinical characteristics and the response to treatment in APL patients treated with arsenic trioxide (As2O3).Materials and MethodsBlood samples were collected from 115 untreated APL patients and genomic DNA was extracted by the salting-out method. FLT3-ITD and FLT3-D835 mutations were investigated by PCR-RFLP. Mann-Whitney U test and Chi-square were used for data analysis. ResultsFLT3-ITD and FLT3-D835 mutations were detected in 16 (14%) and 13(11%) of the patients, respectively. Both mutations were identified in two patients, so overall frequency of FLT3 mutations was estimated to be 23.5%. Patients positive for FLT3–ITD mutation had a higher rate of white cell counts (p= 0.005) and more frequent bcr3 type of PML/RARA fusion (p=0.04). We have not found any significant association between FLT3-D835 mutation and the clinical characteristics of patients. Between the group with FLT3 Mutations and the group without, there was no significant difference in response to therapy. ConclusionsComplete remission induction with As2O3 may be independent of FLT3 mutation status, so As2O3 may be the first choice of APL especially in patients with FLT3 mutations. However, further studies on a large group of patients are necessary to confirm our findings.
-
هدفپروتئین گیرنده استروژن آلفا در حال حاضر با روش ایمینوهیستوشیمی در تمام تومورهای بدخیم پستان اندازه گیری می شود. این روش دارای محدودیت هایی است. روش های مبتنی بر سنجش RNA مکمل بالقوه ای برای این روش هستند چرا که خاموش شدن یک ژن می تواند در مراحل مختلف بیان ژن از RNA تا پروتئین رخ داده باشد. هدف از این مطالعه مقایسه نتایج حاصل از این دو روش به منظور شناسایی ویژگی های هیستوپاتولوژیک و بالینی زیرگروهی از تومورهای بدخیم است که در آن ها با وجود بیان ژن در سطح RNA، پروتئین مربوط وجود نداشته باشد.مواد و روش ها92 تومور بدخیم اولیه پستان پیش از شروع درمان همراه با اطلاعات بالینی، هیستوپاتولوژیک و نتایج ایمینوهیستوشیمی آن ها گردآوری شد. بررسی بیان ژن گیرنده استروژن روی RNA استخراج شده از این تومور بدخیم ها با روش RT-PCR انجام شد. ژن مرجع در این روش گلیسر آلدئید فسفات دهیدروژناز بود.نتایج7/36 درصد از تومورهای فاقد پروتئین گیرنده استروژن، دارای بیان ژن در سطح RNA بود. در این زیرگروه، اکثر بیماران بالای 50 سال و در مرحله 3 و 4 بیماری و دارای شاخص پیش آگهی دهنده ناتینگهام ضعیف بودند. بیشترین میزان تهاجم تومور بدخیم به غلاف عصب در این زیرگروه دیده شد.نتیجه گیریبه نظر می رسد روش RT-PCR ما را قادر به شناسایی زیرگروهی از تومورهای بدخیم پستان دارای بیان ژن در سطح RNA و فاقد پروتئین مربوطه می نماید که پیش آگهی آن ها ضعیف تر از سایر تومورهاست.
کلید واژگان: گیرنده استروژن آلفا, ایمینوهیستوشیمی, سرطان پستان}ObjectiveEstrogen receptor alpha protein status is determined by routine immunohistochemistry analysis in all malignant breast tumors. This assay has its limitations. RNA based techniques are potential complements for immunohistochemistry but it must be noticed that gene silencing may occur at different levels from RNA to protein. The aim of this study was the comparison of the results from these two assays and characterizing the tumors subgroup in which gene expression occurs at RNA level but the target protein is absent.Materials And Methods92 primary breast tumors including their clinical and IHC results were collected before treatment. Estrogen receptor gene expression of tumors was studied by Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction (RT PCR). In this assay, GAPDH was used as a reference gene.Results36.6 % of tumors with negative estrogen receptor protein showed gene expression at mRNA level. In this subgroup most of the patient were older than 50 years and in stages 3 or 4 of breast cancer and had poor prognosis according to Nottingham prognostic index. Most cases of the perineural invasion have been seen in this subgroup.ConclusionIt seems that RT-PCR assay would enable us to recognize a subgroup of breast tumors with poor prognosis which expresses RNA but not protein. -
هدفپروتئین مرتبط با گیرنده لیپوپروتئین با چگالی پایین (LRP) مهم ترین گیرنده کلسترول درون نورون هاست و نقش گیرنده برای آپولیپوپروتئین E که مهم ترین فاکتور خطر بیماری آلزایمر است را بر عهده دارد. همچنین در اتصال لیپوپروتئین ها به آپولیپوپروتئین E در نورون ها نیز شرکت می کند. در این مطالعه وجود پیوستگی بین چندریختی LRP C766T و بیماری آلزایمر در بیماران ایرانی مبتلا به آلزایمر دیررس بررسی شد.مواد و روش ها100 بیمار که براساس معیارهای تشخیصی DSM-IV-TR و NINCDS-ADRDA مبتلا به بیماری آلزایمر در سن بالا بودند و 100 فرد به عنوان گروه شاهد که سابقه شخصی و خانوادگی از بیماری آلزایمر یا جنون نداشتند وارد این مطالعه مورد- شاهدی شدند. گروه شاهد از نظر سن و جنس با گروه بیمار هماهنگ بودند. برای بررسی وجود چندریختی از روش PCR-RFLP استفاده شد.نتایجفراوانی ژنوتیپ C/C و همچنین فراوانی آلل C در بیماران مبتلا به آلزایمر نسبت به گروه کنترل بیشتر بود. البته این اختلاف به سطح معنی دار از نظر آماری نرسیده است. به علاوه هنگامی که این پیوستگی بر حسب جنس محاسبه شد، در هیچ کدام از دو گروه مرد و زن نیز، بین بیماران و افراد سالم اختلاف معنی داری در فراوانی ها وجود نداشت.نتیجه گیریاین مطالعه نشان داد که در بیماران ایرانی مبتلا به آلزایمر در سن بالا، چندریختی C766T ژن LRP موجب افزایش خطر توسعه بیماری نمی شود. بررسی های علل شناسی و شناخت فاکتورهای خطر می باید روی فاکتور های ژنتیکی دیگر یا فاکتور های محیطی متمرکز شود.
کلید واژگان: بیماری آلزایمر, ژنتیک چندریختی, پیوستگی}ObjectiveLow density Lipo-protein Receptor- related Protein (LRP) is the most important cholesterol receptor in neurons. It serves as a receptor for APOE protein which is the most important risk factor for Alzheimer’s Disease. LRP also contributes to the ligation of lipoproteins with APOE in neurons. Association between LRP C766T and Alzheimer’s disease in Iranian patients with late onset Alzheimer’s disease (LOAD) was investigated in this research.Materials And Methods100 patients with LOAD were selected based on DSM-IV-TR and NINCDS-ADRDA diagnostic criteria and 100 normal controls without any personal and family history of Alzheimer’s disease or dementia were included in this case- control study. AD patients and control subjects were matched for age and sex. PCR-RFLP was set up to detect LRP C766T polymorphism.ResultsLRP C/C genotype and C allele distribution were more frequent in AD patients than in control subjects. However, this difference was not statistically significant. When association between LRP C/C genotype and AD was categorized by the gender, in both genders, there was not any significant correlation.ConclusionOur findings indicate that 766C allele of LRP gene could not significantly alter the risk of developing late-onset Alzheimer's disease in Iranian patients. Analysis of other genetic factors and environmental factors are promoted in Iranian population. -
القاء هموگلوبین جنینی (HbF)به علت پایدار بودن اثرات بالینی در درمان علائم بیماران مبتلا به تالاسمی، امیدوار کننده ترین روش برای درمان این اختلالات ژنتیکی می باشد عوامل فارماکولوژیک متعددی می توانند بیان ژن گاما را القاء نموده و سبب افزایش میزان هموگلوبین در بیماران بتا تالاسمی شوند. در این بین سدیم بوتیرات و تالیدوماید شناخته شده می باشند. این مطالعه بر روی سلول های اریتروئیدی تمایز داده شده از سلولهای CD133+ جدا شده از خون بند ناف نوزادان سالم صورت گرفت. برای انجام این مطالعه 4 گروه طراحی شد که به منظور القاء ژن گاما از داروهای تالیدوماید و سدیم بوتیرات در غلظت های M μ 100 بکار برده شد. نتایج افزایش بیان ژن گاما با استفاده از تکنیک کمی Real Time PCR مورد ارزیابی قرار گرفت. در میان گروه های تیمار شده با تالیدوماید و سدیم بوتیرات نشان داده شد که این دو دارو اثر القا کنندگی بر روی ژن گاما و بتا داشته، و توان تالیدوماید در القاء ژنهای دسته بتا بیشتر از سدیم بوتیرات بود. نتایج ما نشان داد که ترکیب دارویی تالیدوماید و سدیم بوتیرات به دلیل القاء ژنهای دسته بتامی توانند کمک کننده مفیدی در درمان بیماران تالاسمی و کم خونی داسی شکل باشد.
کلید واژگان: هموگلوبین جنینی, تالیدوماید, سدیم بوتیرات, بتا تالاسمی}Induction of fetal hemoglobin (HbF) is one of the most promising therapies of β-thalassemia and sickle cell disease, as HbF permanent induction can substantially ameliorate the clinical symptoms of these genetic disorders. Several classes of therapeutics have been implemented to induce γ-globin expression in beta-thalassemia patients and subsequently to raise total hemoglobin levels. Sodium butyrate and Talidomide are two of the known agents. This study was conducted on erythroid cells differentiated from cord blood CD133 + stem cells. Four groups were designed and gamma globin was induced by thalidomide and sodium butyrate treatment (100 μM concentrations). Gamma gene expression was evaluated using Quantitative Real Time PCR techniques. Among the treated groups with sodium butyrate and thalidomide, it was shown that although these two agents both affected the induction of gamma and beta genes, thalidomide had a greater potency on beta cluster genes than sodium butyrate. Our results showed that the pharmaceutical regime of thalidomide and sodium butyrate could be useful for the treatment of β-Thalassemia and sickle cell patients because of the induction of the beta gene cluster. -
زمینه و هدفدر ایجاد تومورها علاوه بر تغییرات ژنتیکی، تغییرات اپی ژنتیک نیز دخیل هستند. فرآیندهای اپی ژنتیک در ایجاد و توسعه بدخیمی های خونی اهمیت خاصی دارند. مهمترین تغییرات اپی ژنتیک شامل تغییر در متیلاسیون DNA، تغییرات پس از ترجمه هیستون ها، تغییر وضعیت کروماتین و الگوی میکروRNAها بوده که تماما با تومورزایی مرتبط می باشند. بسیاری از مسیرهای مختلف سلولی سهیم در فنوتیپ نئوپلاستیک توسط مکانیسم های اپی ژنتیکی در سرطان تحت تاثیر قرار می گیرند.مواد و روش کارمقالات مرتبط با تغییرات اپی ژنتیکی و نقش آن ها در بروز بدخیمی های خونی از منبع PUBMED طی سال های 1985 الی 2008 با استفاده از کلمات کلیدی اپی ژنتیک، بدخیمی های خونی، متیلاسیون استخراج شدند.یافته هادر لوسمی های لنفوسیتیک مزمن هیپرمتیلاسیون منطقه ای در پروموتر ژن ها منجر به خاموشی آن ها شده است. بسیاری از این ژن ها سرکوب کننده تومور هستند. در سندرم های میلودیسپلاستیک نشان داده شده که CDKN2B (یا P15) که یک مهارکننده کیناز وابسته به سایکلین بوده و بر چرخه سلولی اثر منفی دارد در سلول های بنیادی هماتوپوئیتیک مغزاستخوان (CD34+) هیپرمتیله می باشد. درحال حاضر ویدازا و دسیتابین (مهارکننده های DNAمتیل-ترانسفراز) جهت درمان MDS مورد تایید قرار گرفته اند. این داروها وضعیت متیلاسیون ژن ها را تغییر داده و آن ها را در وضعیت دمتیلاسیون قرار می دهند.نتیجه گیریتغییرات اپی ژنتیک همانند هیپرمتیلاسیون DNA و داستیلاسیون هیستون ها به علت قابلیت تغییر در مقایسه با فاکتورهای ژنتیکی همانند جهش و حذف ژن ها هدف های مناسبی در ایجاد درمان های جدید می باشند. در این مقاله مکانیسم های ملکولی اپی ژنتیک، تغییرات اپی ژنتیک در بدخیمی های خونی و درمان های مبتنی بر اپی ژنتیک مورد بررسی قرار می گیرد.
کلید واژگان: اپی ژنتیک, بدخیمی های خونی, متیلاسیون, هیستون}BackgroundCancer development is not restricted to the genetic changes, but also to epigenetic changes. Epigenetic processes are very important in the development of hematological malignancies. The main epigenetic alterations are aberrations in DNA methylation, post-translational modifications of histones, chromatin remodeling and microRNAs patterns, and these are associated with tumor genesis. All the various cellular pathways contributing to the neoplastic phenotype are affected by epigenetic genes in cancer. These pathways can be explored as biomarkers in clinical use for early detection of disease, malignancy classification and response to treatment with classical chemotherapy agents and epigenetic drugs.Materials And MethodA literature review was performed using PUBMED from 1985 to 2008. Cross referencing of discovered articles was also reviewed.ResultsIn chronic lymphocytic leukemia, regional hypermethylation of gene promoters leads to gene silencing. Many of these genes have tumor suppressor phenotypes. In myelodysplastic syndrome (MDS), CDKN2B (alias, P15), a cyclin-dependent kinase inhibitor that negatively regulates the cell cycle, has been shown to be hypermethylated in marrow stem (CD34+) cells in patients with MDS. At present both Vidaza and Decitabine (DNA methyltransferase inhibitors) are approved for the treatment of MDS.ConclusionUnlike mutations or deletions, DNA hypermethylation and histone deacetylation are potentially reversible by pharmacological inhibition, therefore those epigenetic changes have been recognized as promising novel therapeutic targets in hematopoietic malignances. In this review, we discussed molecular mechanisms of epigenetics, epigenetic changes in hematological malignancies and epigenetic based treatments. -
زمینه و هدفسیالو پروتئین استخوانی(BSP) شاخص اختصاصی تمایز استئوبلاستیک می باشد. در این تحقیق تاثیر زولدرونیک اسید بر بیان BSP مورد ارزیابی قرار گرفته و همچنین به منظور درک مکانیسم های کنترلی بیان ژن، وضعیت متیلاسیون پروموتر BSP مورد بررسی قرار گرفت.روش بررسیدر این مطالعه تجربی جداسازی سلول های بنیادی مزانشیمی(MSCs) از مغز استخوان انسانی صورت گرفت. MSCs پس از تکثیر، تحت تیمار با زولدرونیک اسید قرار گرفتند و سپس به مدت 3 هفته در محیط تمایزی کشت داده شدند. استخراج DNA و RNA از MSCs و سلول های تمایز یافته استئوبلاستی صورت گرفت. بیان BSP با استفاده از RT-PCR مورد ارزیابی قرار گرفت. وضعیت متیلاسیون پروموتر ژن BSP، پس از تیمار DNA با سدیم بی سولفیت(SBS)، با استفاده از پرایمرهای متیله(M) و غیرمتیله(U) در آزمون MSP مشخص شد.یافته هابیان BSP در سلول های تمایز یافته استئوبلاستی بواسطه تیمار با زولدرونیک اسید قابل مشاهده بود ولی در سلول های بنیادی مزانشیمی قابل مشاهده نبود. بررسی با روش MSP نشان داد که ژن BSP در طول تمایز در وضعیت دمتیلاسیون کامل قرار داشت.نتیجه گیریبیان BSP از هفته اول تمایز به خوبی قابل ارزیابی بوده و این نشان دهنده تسریع تمایز استئوبلاستی بواسطه تیمار با زولدرونیک اسید می باشد. وضعیت دمتیلBackground And AimBone sialoprotein (BSP) is a specific marker of osteoblastic differentiation. In this research, the effect of Zoledronic Acid on BSP expression and methylation status during osteoblastic differentiation of mesenchymal stem cells (MSCs) was evaluated.Materials And MethodsIn this experimental study, MSCs were isolated from human bone marrow. For osteogenic differentiation, hMSCs were pulse treated with zoledronic acid, and were incubated in osteogenic differentiation medium for 3 weeks. The DNA and RNA were extracted after the first, second and third weeks of culture and also from undifferentiated MSCs. After Sodium bisulfate (SBS) treatment, gene specific methylation analysis for BSP was carried out using Methylation Specific PCR technique.ResultsBSP expression was observed in osteoblastic differentiated cells whereas it was not seen in MSCs. MSP showed that BSP was unmethylated during osteoblastic differentiation.ConclusionBSP was expressed from the first week of differentiation. This confirms that zoledronic acid accelerates osteoblastic differentiation. Unmethylation status of BSP indicates that zoledronic acid does not have any effect on BSP methylation status. Other genetic or epigenetic mechanisms may control BSP expression during osteoblastic differentiation induction by zoledronic acid.
-
هدفمطالعه اریتروپوئز نیاز به توسعه روش های کشت سلول های پیش ساز اریتروئیدی با استفاده از توان سلول های بنیادی، برای تمایز به رده های مختلف سلول های خونی دارد. در این مطالعه، تمایز سلول های بنیادی خون بند ناف به سلول های پیش ساز اریتروئیدی در یک محیط کشت نیمه جامد انجام شد.مواد و روش هاسلول های تک هسته ای از خون بند ناف استخراج شده و در محیط کشت مایع حاوی فاکتورهای تمایز دهنده اریتروئیدی کشت شدند (مرحله اول کشت). سلول های غیر چسبنده در محیط نیمه جامد حاوی فاکتورهای رشد سلول بنیادی، اینترلوکین 3، اینترلوکین 6، اریتروپویتین کشت شدند (مرحله دوم کشت). پس از گذشت یک هفته، کلونی های اریتروئیدی ظاهر شده از محیط کشت نیمه جامد برداشته شدند. برای تعیین هویت سلول های تمایز یافته، تجزیه و تحلیل فلوسیتومتری برای سنجش CD235a و CD36، ارزیابی سیتولوژی توسط رنگ آمیزی گیمسا و بررسی بیان ژن های GATA-1، EKLF و آلفا-گلوبین توسط RT-PCR انجام گرفت.نتایجتجزیه و تحلیل فلوسیتومتری نشان داد که تمایز یافته، شاخص های سلولی ویژه اریتروئیدی CD36 و CD235a را به ترتیب در حد 3/94 درصد و 5/95 درصد دارا هستند. ریخت شناسی این سلول ها در گستره های رنگ آمیزی شده با رنگ گیمسا، طیف سلول های پیش ساز اریتروئیدی از پرواریتروبلاست تا ارتوکروماتیک اریتروبلاست را اثبات نمود. نتایج RT-PCR تایید نمود که سلول های تمایز یافته پیش سازهای رده اریتروئیدی هستند و ژن های GATA-1، EKLF و آلفا گلوبین را بیان می کنند.نتیجه گیریسلول های بنیادی خون بند ناف قابلیت بالایی برای تمایز به سلول های پیش سازهای اریتروییدی با روش شرح داده شده دارند که می توان از آن برای مطالعات آزمایشگاهی بهره گرفت.
کلید واژگان: سلول های پیش ساز اریتروییدی, سلول های بنیادی خون بند ناف, اریتروپوئز}ObjectivesThe study of erythropoiesis needs to develop the methods for erythroid progenitor cells (EPCs) culture using stem cell potency to differentiate into variety of hematopoietic cells lineages. In this study, we induced differentiation of cord blood stem cells into erythroid progenitor cells in a semisolid culture media.Materials And MethodsCord blood mononuclear cells were isolated and cultured in liquid culture media consist of erythroid differentiation factors (phase I). Non-adherent cells were cultured in semisolid media containing SCF, IL-3, IL-6 and EPO (phase II). After one week, the appeared erythroid colonies were picked up. Characterization of differentiated cells was performed by assessment of CD235a and CD36 using flowcytometry, giemsa cytological staining and gene expression analysis of GATA-1, EKLF, α-globin genes by RT-PCR.ResultsFlowcytometry analysis to detect CD235a and CD36 positive cells showed that 94.3% and 95.5% of differentiated cells have erythroid specific cell markers, respectively. Morphology of the cells in giemsa stained slides demonstrated erythroid progenitor cells, ranged from proerythroblast to orthochromatic erythroblast. The RT-PCR results, confirmed the precursor state of erythroid differentiated cells by expression of GATA-1, EKLF, α-globin genes.ConclusionsCord blood stem cells have high potency to differentiate into erythroid progenitor cells using described method that can be utilized in the experimental studies.
- در این صفحه نام مورد نظر در اسامی نویسندگان مقالات جستجو میشود. ممکن است نتایج شامل مطالب نویسندگان هم نام و حتی در رشتههای مختلف باشد.
- همه مقالات ترجمه فارسی یا انگلیسی ندارند پس ممکن است مقالاتی باشند که نام نویسنده مورد نظر شما به صورت معادل فارسی یا انگلیسی آن درج شده باشد. در صفحه جستجوی پیشرفته میتوانید همزمان نام فارسی و انگلیسی نویسنده را درج نمایید.
- در صورتی که میخواهید جستجو را با شرایط متفاوت تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مطالب نشریات مراجعه کنید.