به جمع مشترکان مگیران بپیوندید!

تنها با پرداخت 70 هزارتومان حق اشتراک سالانه به متن مقالات دسترسی داشته باشید و 100 مقاله را بدون هزینه دیگری دریافت کنید.

برای پرداخت حق اشتراک اگر عضو هستید وارد شوید در غیر این صورت حساب کاربری جدید ایجاد کنید

عضویت

فهرست مطالب نجات بادبرین

  • رضا سید شریفی*، نجات بادبرین
    DNA میتوکندریایی یکی از گسترده ترین نشانگرهای مولکولی برای مطالعات فیلوژنتیک در حیوانات به علت ساختار ژنوم ساده آن است.این مطالعه ویژگی های ژنتیکی بزهای بومی را با استفاده از تجزیه و تحلیل توالی ( DNA Cytocrome oxidase I (COXI  برای شناسایی و تمایز بین سه نژاد (نجدی، عدنی و مرخز) ایران بررسی می کند. استخراج DNA با استفاده از روش بهینه شده نمکی انجام شد و ژن سیتوکروم اکسیداز I به روش PCR با یک جفت پرایمر، تکثیر گردید. درخت فیلوژنتیکی با استفاده از نرم افزار 6 Mega به دست آمد. توالی  COXI از 60 بز دارای تنوع هاپلوتیپی 0/47 و تنوع نوکلئوتیدی 0/0005 بود. تجزیه و تحلیل ها به کمک رویه Composition برنامه BioEdit نشان داد این توالی برای ناحیه COXI شامل 28/97 درصد نوکلئوتید A و 25/52 درصد نوکلئوتید C و 15/86 درصد نوکلئوتید G و 66/29 درصد نوکلئوتید T می باشد که نسبت C+G، چهل و دو درصد و A+T، پنجاه و هشت درصد است. ارتباط تکاملی به وسیله درخت فیلوژنتیک نمایش داده شد.درخت فیلوژنی نشان داد که بزهای ایرانی در یک شاخه جداگانه خوشه بندی شده است. این نتیجه به طور گسترده از توزیع جغرافیایی این نژاد ها در ایران پیروی می کند و می تواند در طراحی برنامه های حفاظت و مدیریت نژادهای بز ایرانی مورد استفاده قرار گیرد.
    کلید واژگان: COXI, تنوع ژنتیکی, آنالیز فیلو ژنتیکی, بز ایران}
    Reza Seyedsharifi *, Nejat Badbarin
    Mitochondrial DNA has been one of the most widely used molecular markers for phylogenetic studies in animals because of its simple genomic structure. This study examines the genetic characteristic of domestic goat using sequence analysis of mitochondrial DNACytochrome oxidase subunit I (COI) to identify and differentiate among three common breeds (Adani, Najdi and Markhoz) of Iran. The genomic DNA was isolated by salting out method and amplified cytochrome oxidase I gene using PCR method with a pair of primer. Phylogenetic trees and pairwise calculations were obtained by using Mega 6 software. The COXI sequence from 60 individuals with haplotype diversity was 0.47 and a nucleotide diversity was 0.0500. The analyzes with the BioEdit Composition procedure indicated that the sequence for COXI was 28.87% nucleotide A, 25.25% nucleotide C, 15.86% nucleotide G and 29.66% nucleotide T, which had a C + G ratio of 42% and A + T is 58%. Phylogenetic analysis of haplotype in the combination with the goat from Gen Bank showed that Iranian goat clustered in a separate lineage. This study was found informative for establishing relationships between breeds from different parts of the world. This study may facilitate the future researchers and breeders for better understanding the genetic interactions and breed differentiation for devising future breeding and conservation strategies to preserve the rich animal genetic reservoir of the country.
    Keywords: Cytochrome Oxidase I gene_genetic diversity_phylogenetic analysis_Iranian goat}
  • R. Seyedsharifi*, N. Badbarin, A. Bahmani, A. Mojtahedin
    Inroduction &
    Objective
    One of the most important economic traits in sheep is twining. Genetic studies have identified a set of genes that affect twining with major effects called fertility genes. One of them is GDF9 gene that have been identifying on sheep chromosome 5. This study conducted to investigate the GDF9 gene polymorphism and its relationship with prolificacy trait in Karakul sheep breed.
    Material and
    Methods
    Blood samples and birth data collected from 100 Karakul sheep at the Karakul breeding station of Sarakhs-Iran. After DNA extraction one pair of specific primer selected to amplify a 1503 bp fragment of the gene and Rsa I enzyme was used to digest the amplified fragment. The results showed a mutation at GDF9 locus in Karakul sheep. The relationship between genotypes and twining rate investigated using SAS 9.1 software.
    Results
    The results showed a significant relationship (P
    Conclusion
    Therefore, the mutation in GDF9 gene is a useful mutation and fix it will increase twining rate and will ultimately increase revenue.
    Keywords: Karakul sheep, GDF9 Polymorphism, PCR-RFLP}
  • رضا سیدشریفی *، نجات بادبرین، نعمت هدایت
    این تحقیق به منظور مکان یابی QTLهای صفات وزن بدن با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره کروموزوم دو بز مرخز انجام شد. برای این منظور 8 خانواده ناتنی پدری بز مرخز که در مجموع 255 فرزند (شامل 129 فرزند نر و 126 فرزند ماده) برای 6 نشانگر ریزماهواره روی کروموزوم دو تعیین ژنوتیپ شد. صفات کمی مورد نظر شامل وزن بدن در زمان تولد چهار، شش، نه و 12 ماهگی بود. معنی دار بودن اثر QTL با استفاده از نرم افزار GridQTL (نسخه 3.3.0) و به روش مکان یابی فاصله ای آزمون شد. در تحقیق حاضر، اثر یک QTL در موقعیت 153 سانتی مورگان روی کروموزوم دو بر وزن شیرگیری معنی دار شد (0/1 >P). اثر جایگزینی آن 4/99 در واحد انحراف استاندارد فنوتیپی برآورد گردید. مکان این QTL در بین نشانگرهای IDVGA64 و OarFCB011 و در فاصله 10 سانتی مورگان از نشانگر IDVGA64 تعیین گردید. در پژوهش حاضر، اثر پلیوتروپی بین QTL مکان یابی شده با دیگر صفات مورد بررسی شناسایی نشد. انتظار می رود که اسکن ژنومی گسترده با استفاده از تعداد فرزندان بیشتر در درون هر خانواده امکان شناسایی اثرات پلیوتروپی و QTLهای بیشتری در ارتباط با این صفات فراهم نماید و نشانگرهای مفیدی برای انتخاب به کمک نشانگر برای این صفات تامین نماید. باتوجه به فاصله اطمینان زیاد (CI = 25 cM) پیشنهاد ژن کاندیدا برای QTL تعیین شده چندان صحیح نمی باشد و توصیه می شود به منظور تعیین دقیق تر این QTL در تحقیقات آینده از تعداد فرزندان بیشتر در درون خانواده ها استفاده شود.
    کلید واژگان: بز مرخز, کروموزوم دو, مکان ژن های کمی, نشانگرهای ریزماهواره, وزن بدن}
    Nejat Badbarin, Nymat Hydaeat, Reza Seyedsharifi *
    The aim of this study was to map body weight QTLs with some microsatellite markers on chromosome 2 of Markhoz goats. For this purpose a total of 255 offspring including 129 male and 126 female from 8 half-sib sire families were genotyped for 6 microsatellite markers on chromosomes 2. Quantitative traits were included weights at birth, 4 months, 6 months, 9 months and 12 months of age. Significant QTL effect was tested using the least squared regression approach using GridQTL (V3.3.0) software. In this study, one putative QTL were detected for weaning weight at 153 cM on chromosome 2 (P
    Keywords: Body Weight, Chromosome 2, Markhoz Goats, Microsatellite Markers, QTL}
  • نجات بادبرین، سید ضیاء الدین میرحسینی، بابک ربیعی، نوید قوی حسین زاده
    وزن بدن یکی از صفات مهم در پرورش دام ها است که دارای توارث کمی است. نقشه یابی QTL علاوه بر اطلاعات بسیار مفیدی که در زمینه نواحی ژنومی کنترل کننده صفات کمی فراهم می کند، می تواند اصلاحگران را در انتخاب به کمک نشانگر کمک نماید. با توجه به تحقیقات پیشین و همپوشانی نسبی نقشه ژنتیکی گوسفند و بز، مطالعه حاضر با هدف شناسایی QTL های موثر بر وزن بدن روی کروموزوم-های 1 و 5 بز مرخز با استفاده از 11 نشانگر ریزماهواره صورت گرفت. جمعیت مورد مطالعه شامل 248 دام متعلق به 8 خانواده ناتنی پدری بود که برای 11 جایگاه ریزماهواره مربوط به کروموزوم های 1و 5 تعیین ژنوتیپ شدند. داده های فنوتیپی شامل صفات اوزان تولد، 4 ماهگی، 6 ماهگی، 9 ماهگی و 12 ماهگی بودند که برای اثرات ثابت سال تولد، جنس و نوع تولد تصحیح شدند. آنالیز QTL به روش مکان-یابی درون فاصله ای مبتنی بر رگرسیون انجام گرفت. در این پژوهش روی کروموزوم 1 در سطح آماری مورد نظر، QTL معنی داری یافت نشد. در حالیکه روی کروموزوم 5 یک ناحیه ژنومی با اثر معنی دار (P<0.05) روی صفات وزن بدن در 4 ماهگی و 6 ماهگی در فاصله 2 تا 8 سانتی مورگان از نشانگر OarFCB005 یافت شد، لذا به نظر می رسد این مکان حاوی ژن های موثر بر اوزان بدن پس از تولد باشد. با توجه به اینکه مکان QTL تعیین شده در نزدیکی نشانگر OarFCB005 قرار داشت، بنابراین در صورت تایید آن توسط تحقیقات بیشتر، از این نشانگر می توان در انتخاب به کمک نشانگر استفاده نمود.
    Badbarin N., Mirhoseini S.Z., Rabiei B., Ghavi Hossein, Zadeh N
    Body weight is one of the most important traits which has quantitative traits inheritance. QTL mapping not only provides useful information regarding the status and number of genes controlling quantitative traits. It can also help the breeders in marker assisted selection. This study aimed to identify QTL affecting body weight on chromosomes 1 and 5 in Markhoz goats using microsatellite markers. The studied population consisted of 248 animals from 8 half sib families genotyped for eleven microsatellites on chromosomes 1 and 5. Phenotypic data including body weight at birth, 4 months, 6 months, 9 months and 1 months of age that were corrected for fixed effects including year of birth, sex and type of birth. QTL analysis was performed based on regression analysis. In this research significant QTL was not found on chromosome 1 while one chromosomal regions associated with weight at 4 and 6 months of age was found on chromosome 5. The location of the detected QTL was 2 to 8 cM near the OarFCB005 marker. Maybe this region of chromosome 5 contain genes that affect growth trait. Considering that the locations of this QTL was near the location of OarFCB005 marker, if further investigation were performed, this marker could be used in marker-assisted selection.
    Keywords: Markhoz goats, Microsatellite markers, Body weights, QTL}
  • سید ضیاءالدین میر حسینی*، نجات بادبرین، بابک ربیعی، نوید قوی حسین زاده
    صفت چندقلوزایی از جمله صفات آستانه ای می باشد که به وسیله ژن های زیادی کنترل می شود. به دلیل وراثت پذیری پایین این صفت (حدود 0/10) استفاده از روش های کلاسیک اصلاح نژاد، پیشرفت کندی دارد. بنابراین، نیاز به استفاده از فناوری های جدید در بهبود این صفت می باشد. طول کروموزوم 1 بز حدود 186 سانتی مورگان می باشد. با توجه به تحقیقات پیشین و همولوژی بالای نقشه ژنومی گاو و بز، در این تحقیق منطقه بین 16 تا 169 سانتی مورگان از کروموزوم 1 برای مکان یابی جایگاه ژنتیکی صفت چندقلوزایی بز مرخز انتخاب شد. جمعیت مورد مطالعه شامل 8 خانواده ناتنی پدری غیرخویشاوند بود. تعداد فرزندان به ازای هر پدر در دامنه 30 تا 40 فرزند قرار داشتند. همه افراد برای 6 نشانگر ریزماهواره مربوط به کروموزوم 1 تعیین ژنوتیپ شدند. مکان یابی QTLهای کنترل کننده صفت چندقلوزایی در خانواده های ناتنی پدری با استفاده از نرم افزار GridQTL انجام گرفت. نتایج این تحقیق بیانگر تفرق یک QTL موثر بر چندقلوزایی در موقعیت 165 سانتی مورگان کروموزوم 1 بز مرخز بود. مکان QTL تعیین شده در نزدیکی نشانگر CSSM19 قرار داشت و توانست 2/20 درصد تغییرات ژنتیکی صفت چندقلوزایی را توصیف کند. QTL مکان یابی شده در این پژوهش می تواند در ارتباط با ژن POU1F1 باشد. بنابراین این ژن می تواند یک ژن کاندید برای اثرات مشاهده شده QTL بر صفت چند قلوزایی در بز مرخز باشد.
    کلید واژگان: بز مرخز, نشانگرهای ریزماهواره, نرخ چندقلوزایی, QTL}
    N. Badbarin, S. Z. Mirhoseini*, B. Rabiei, N. Ghavi Hossein, Zadeh
    The litter size is a threshold trait that is controlled by many genes. Due to the low heritability (0.10), of litter size, classical breeding methods lead to slow genetic progress. Hence it is essential to use new technology to improve this trait. Length of chromosome 1 in goat is approximately 186 cM. Based on previously published data in addition to a high genetic homology between goat and cattle choromosome 1, a region between 16 to 169 cM of chromosome 1 was selected for QTL detection of litter size in the Markhoz goat breed. Sample population included 8 paternal half-sib families. The numbers of half-sib offspring per buck ranged from 30 to 40. All individuals were genotyped by six microsatellites specific to chromosome 1. QTL analyses were performedusing multiple regression method under a half-sib model. Our study indicated that a QTL in position 165 cM on chromosome 1 affect litter size rate in Markhoz goats. Its location was near to CSSM19 marker and was able to explaining 2.20 percent of the genetic variance of litter size. The QTL detected in this research could be related with POU1F1 gene. Hence this gene could be a candidate for the associated QTL on goat chromosomes 1.
    Keywords: Markhoz goats, Microsatellite markers, Twinning rate, QTL}
  • رضا سیدشریفی، مراد پاشا اسکندری نسب، جمال سیف دواتی، نجات بادبرین
    در این تحقیق به منظور مقایسه همبستگی ارزش ارثی دوره های ناقص و کامل شیردهی در صفات تولید شیر و تداوم شیردهی، تعداد 13699 رکورد روزآزمون تولید شیر مربوط به 2716 راس گاو هلشتاین زایش اول که دختران 167 راس گاو نر بودند، بر اساس مدل تابعیت تصادفی (Random Regression) و روش حداکثر درست نمایی محدود شده (REML) تجزیه و تحلیل شد. همبستگی دوره ناقص شیردهی 5 تا 90 روز صفت تولید شیر نسبت به دوره کامل شیردهی (305 روز) 67/0 و برای دوره ناقص شیردهی 5 تا 120 روز 72/0 بود. با پیشرفت مرحله شیردهی میزان همبستگی ها افزایش یافت و در دوره ناقص شیردهی 5 تا 240 روز به 91/0 رسید. برای صفت تداوم شیردهی و دوره ناقص شیردهی 5 تا 150 روز این همبستگی 68/0 بود و با پیشرفت مرحله شیردهی مقدار آن برای دوره ناقص 5 تا 240 روز، معادل 91/0 برآورد شد. این همبستگی برای رکوردگیری دو ماه در میان (رکوردگیری 3 ماهه) صفت تولید شیر 88/0 و در مورد صفت تداوم شیردهی 59/0 بود. همچنین این همبستگی برای رکوردگیری یک ماه در میان (رکوردگیری 2 ماهه) صفات تولید شیر و تداوم شیردهی به بالاتر از 90/0 رسید.
    R. Seyedsharifi, M. Pasha Eskandari Nasab, J. Seifdavat, N. Badbarin
    In this investigation 13699 data related to milk production from 2716 Holstein first calving and daughter from 167 sire cows were analyzed based on random regression model (RR/CF) and REML Method incomplete lactating (5-90 days) and (5-120 days) in correlations to complete lactating were 0.67 and 0.72, respectively with progress in complete 5-240 day was 0.91 the correlation value for lactating persistency trait for incomplete lactating period (5-150 days) were 0.68 and as increase in milk production period this value reaches to 0.91 for incomplete period (5-240 days). Also this correlation for two months milk production and lactating persistency were 0.88 and 0.59, respectively, and for one month milk production and lactating persistency reached higher than 0.90.
    Keywords: Breeding value correlation, Milk production, persistency, Random Regression Model}
بدانید!
  • در این صفحه نام مورد نظر در اسامی نویسندگان مقالات جستجو می‌شود. ممکن است نتایج شامل مطالب نویسندگان هم نام و حتی در رشته‌های مختلف باشد.
  • همه مقالات ترجمه فارسی یا انگلیسی ندارند پس ممکن است مقالاتی باشند که نام نویسنده مورد نظر شما به صورت معادل فارسی یا انگلیسی آن درج شده باشد. در صفحه جستجوی پیشرفته می‌توانید همزمان نام فارسی و انگلیسی نویسنده را درج نمایید.
  • در صورتی که می‌خواهید جستجو را با شرایط متفاوت تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مطالب نشریات مراجعه کنید.
درخواست پشتیبانی - گزارش اشکال