به جمع مشترکان مگیران بپیوندید!

تنها با پرداخت 70 هزارتومان حق اشتراک سالانه به متن مقالات دسترسی داشته باشید و 100 مقاله را بدون هزینه دیگری دریافت کنید.

برای پرداخت حق اشتراک اگر عضو هستید وارد شوید در غیر این صورت حساب کاربری جدید ایجاد کنید

عضویت
مقالات رزومه:

دکتر محمد خلج کندری

  • Amin Moqadami, Alireza Ahmadi, Mohammad Khalaj-Kondori *
    Background

    Colorectal cancer (CRC) is the third mostcommoncancer that frequently spreads to other parts of thebody, with a low chance of recovery and a high mortality rate. Long non-coding RNAsare considered significant prognostic and diagnostic indicators because they are dysregulated in various cancers and have distinctive expression patterns and high tissue- and cell-specificity. VLDLR-AS1 lncRNA deregulation has been associated with several malignancies.

    Objectives

    This study aimed to evaluate the expression levels of VLDLR-AS1 in CRC. It was the first time this assessment was conducted.

    Methods

    We studied 188 samples, including 94 tumor samples and 94 paired adjacent non-tumor tissues. Total RNA was extracted, and its quantity and purity were assessed. TaKaRa PrimeScript 1st Strand cDNA Synthesis Kit (Kusatsu, Japan) was used for the reaction. The StepOnePlus Real-Time PCR System (Applied Biosystems) was set up to assess the relative expression of VLDLR-AS1.

    Results

    According to the qRT-PCR data, the VLDLR-AS1 expression levels in CRC tissues were significantly lower than in tumor margins (P < 0.0001). In addition, receiver operating characteristic curve analysis demonstrated that VLDLR-AS1 expression can discriminate between tumor and non-tumor samples with the sensitivity and specificity of 72.34% and 51.06%, respectively (P = 0.03, AUC = 0.6274). However, no significant association was found between the expression levels of VLDLR-AS1 and clinicopathological features in CRC patients.

    Conclusions

    The results of this study indicated that VLDLR-AS1 lncRNA is significantly downregulated in the tumor tissues of CRC patients compared to healthy tumor margin tissues. This evidence shows the potential of this gene as a promising biomarker for the early detection of CRC development.

    Keywords: Colorectal Cancer, LncRNA, VLDLR-AS1, Biomarker
  • بهارک ابراهیمی بهنام، محمد خلج کندری*، محمدعلی حسینپور فیضی
    زمینه و هدف

    سقط مکرر (RSA) شایع ترین عارضه بارداری است که به وقوع دو یا بیش از دو مورد سقط قبل از هفته بیستم بارداری اطلاق می گردد. یکی از عوامل مهم دفع جنین مولکول ایمونوتولرانسHLA-G است که نقش مهمی در حفاظت از جنین در قبال سیستم ایمنی مادر دارد. هدف از این مطالعه بررسی ارتباط پلی مورفیسم های rs1632943 و rs1736932 ناحیه پروموتر ژن HLA-G با سقط مکرر در زنان شمال غرب ایران است.

    مواد و روش ها

     در این مطالعه مورد- شاهدی، 100 زن با سابقه سقط مکرر به عنوان گروه مورد و 80 زن سالم با یک یا بیشتر از یک کودک به عنوان گروه کنترل انتخاب شدند. DNA ژنومی از نمونه خون محیطی آن ها استخراج و ژنوتیپ های آن ها با استفاده از روش تعیین توالی مشخص شد. بررسی آماری نتایج حاصل، توسط آزمون مربع کای و نرم افزار SPSS ورژن 16 انجام شد.

    یافته ها

    در پلی مورفیسم rs1632943 فراوانی ژنوتیپ های CC، CA و AA در گروه بیمار به ترتیب 8 ٪، 33 ٪و 59 ٪و در گروه شاهد 25/16٪، 75/43٪ و40٪ بود. تجزیه و تحلیل آماری نشان داد که ژنوتیپ AA با سقط مکرر خود به خود همراه است (p=0.005) و در پلی مورفیسم rs1736932 فراوانی ژنو تیپ هایCC، CG و GG به ترتیب 8٪، 32٪و 60٪ در گروه بیمار و 5/17٪، 25/41٪ و 25/41٪ در گروه شاهد بود. تجزیه وتحلیل آماری نشان داد که ژنوتیپ GG با سقط مکرر همراه است (005/0 P=). همچنین بررسی هاپلوتایپی نشان داد که هاپلوتایپ H1 (GA) با بیماری همراهی نشان می دهد.

    نتیجه گیری

    نتایج مطالعه حاضر حاکی از آن است که پلی مورفیسم های rs1632943 و rs1736932 می توانند به عنوان یک عامل خطر برای RSA در زنان شمال غربی ایران در نظر گرفته شود.

    کلید واژگان: آنتی ژنهای HLA-G, سقط مکرر, پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی, مطالعات همراهی ژنتیکی
    Baharak Ebrahimi Behnam, Mohammad Khalaj Kondori*, Mohammad Ali Hoseinpour Feizi
    Background and Aim

    Recurrent spontaneous abortion (RSA) is the most common complication of pregnancy that refers to two or more miscarriages before the 20th week of pregnancy. HLA-G immunoglobulin molecule plays an important role in protecting the fetus against mother's immune system. The aim of this study was to investigate the association between rs1632943 and rs1736932 polymorphisms with recurrent spontaneous abortion in Northwest of Iran.

    Materials and Methods

    This case-control study included 100 women with history of RSA as our case group and 80 healthy women with one or more than one children as the control group. Genomic DNA was purified from their peripheral blood samples and their genotypes were determined by PCR-sequencing method. Using SPSS 16, statistical analysis was performed by chi-square test.

    Results

    In rs1632943 polymorphism the frequency of CC, CA and AA genotypes were 8%, 33% and 59% in the patient group and 16.25%, 43.75% and % 40 in the control group, respectively. Statistical analysis showed that AA genotype was associated with the recurrent spontaneous abortion (P = 0.005). In the rs1736932 polymorphism, the frequency of CC, CG and GG genotypes were 8%, 32% and 60% in the patient group and 17.5%, 41.25% and 41.25% in the control group, respectively. Statistical analysis showed that GG genotype was associated with the recurrent miscarriage (P = 0.005). Also, haplotype analysis showed that H1 haplotype (GA) is associated with the disorder.

    Conclusion

    Results of the study showed that rs1632943 and ra1736932 polymorphisms

    Keywords: HLA-G antigens, recurrent miscarriage, Single nucleotide polymorphism, Genetic association studies
  • Seyedeh Nahid Fotuhi, Mohammad Khalaj-Kondori *, Hadis Karimi

    Patients with ovarian cancer are mostly diagnosed at advanced stages which leads to poor prognosis and high mortality rate. Deregulation of lncRNA HOXD-AS1 expression associates with cancer development and metastasis. However, the expression level of this lncRNA in ovarian cancer is not determined.50paired ovarian tumors and their adjusted normal tissues were included in the study. Total RNA was extracted by TRIzol® Reagent and reverse-transcribed to cDNA using PrimeScript II cDNA synthesis kit. The expression levels of HOXD-AS1 were quantified by qRT-PCR and compared. The Roc curve analysis was used to evaluate the capacity of HOXD-AS1 as a biomarker for ovarian cancer. We observed that lncRNA HOXD-AS1 was significantly upregulated in ovarian tumors compared to their adjusted normal tissues (p <0.003). Moreover, the ROC curve analysis revealed that the lncRNA HOXD-AS1 expression level could discriminate tumoral and non-tumoral tissues with 85% sensitivity and 88% specificity. The lncRNA HOXD-AS1 expression level might be considered as a potential biomarker for ovarian cancer development.

    Keywords: ovarian cancer, Biomarker, lncRNA, HOXD-AS1, Gene expression
  • یاسمن همپانژاد، محمد خلج کندری*، مجید خدایی، مهناز طالبی
    زمینه و هدف

    بیماری آلزایمر شایع ترین عامل زوال عقلی در افراد مسن است؛ و یک بیماری پیش رونده و برگشت ناپذیر مغزی است. گیرنده سرتیلین در نقل و انتقالات سلولی پروتئین پیش ساز آمیلوئید بتا درگیر است و نیز نقش مهمی در تولید پپتید آمیلوئید بتا در آلزایمر دارد. هدف این پژوهش مطالعه ی همراهی پلی مورفیسم rs2282649 و rs12285364 با بیماری آلزایمر در جمعیت آذری شمال غرب ایران بود.

    روش بررسی

    افراد مورد مطالعه در این پروژه؛ مورد - شاهدی در دو گروه شامل 100 نفر بیمار و 83 نفر سالم به عنوان کنترل وارد شدند جهت تعیین ژنوتیپ ها از تکنیک (PCR-RFLP) استفاده شد.

    یافته ها

    در اسنیپ rs2282649 فراوانی ژنوتیپ CC در گروه بیمار 36٪ و در گروه شاهد 38/55٪ با 0/70= Pبوده و فراوانی ژنوتیپ TT در گروه بیمار 12٪ و در بین گروه شاهد 7/23٪ بود (0/25 =P). فراوانی ژنوتیپ CT در گروه بیمار 52٪ و در گروه شاهد 54/22٪ بود (0/75 =P) و همچنین در rs12285364 فراوانی ژنوتیپ CC در گروه بیمار 93٪ و در گروه شاهد 90/36٪ با 0/5= P بوده و فراوانی ژنوتیپTT  در گروه بیمار و در بین گروه شاهد صفر درصد بود و فراوانی ژنوتیپCT در گروه بیمار 7٪ و در گروه شاهد 9/46٪ (0/49 =P) بود.

    نتیجه گیری

     با توجه به اینکه هر دو گروه در فراوانی ژنوتیپ ها تفاوت معنی داری را نشان ندادند. مشاهده گردید؛ که این پلی مور فیسم ها با بیماری آلزایمر در جمعیت شمال غرب ایران ارتباطی ندارند.

    کلید واژگان: بیماری آلزایمر, پلی مورفیسم, گیرنده سرتیلینSORL1, شمال غرب ایران
    Yasaman Hampanezhad, Mohammad Khalaj Kondori*, Majid Khodayi, Mahnaz Talebi
    Background and Aim

    Alzheimer’s disease is the most common cause of dementia in old people. AD is a progressive and irreversible neurodegenerative brain disorder. Sortilin receptor 1 (SORL1) is involved in cellular trafficking of amyloid precursor protein and plays an essential role in amyloid-beta peptide generation in the AD. The purpose of the present study was to evaluate the association of SORL1 rs2282649 and rs12285364 polymorphism with AD in Azeri population in the northwest of Iran.

    Materials and Methods

    This case- control study included 100 Alzheimer’s disease patients as our case and 83 healthy subjects as our control group. Genotypes were determined by (PCR- RFLP) technique.

    Results

    In rs2282649 SNP the frequency of homozygous CC genotype was 36% in the case and 38.55% % in the control groups (P= 0.70). The frequencies of TT genotype were 12% and 7.23% in the case and control groups respectively (P = 0.25). The frequency of heterozygote CT genotype was 52% in the cases and 54.22% in the control group (P = 0.75). Also, in rs12285364 polymorphism the frequencies of homozygous CC genotype in the cases and the control groups were 93% and 90.36 % respectively (P= 0.5). The frequency of TT genotype was 0% in both case and control groups (P = 0.00). The frequencies of heterozygote CT genotype were 7% in the case and 9.64% in the control groups (P = 0.49).            

    Conclusion

    No statistically significant difference was observed between the case and control groups in regard to the frequencies of the genotypes. Therefore we can conclude that these polymorphisms are not associated with Alzheimer’s disease among the people in the northwest of Iran.

    Keywords: Alzheimer’s disease_polymorphism_Sortilin receptor 1 (SORL1)_Northwest of Iran
  • آسیه جبلی، محمد خلج کندری*، الهام طالبی نژاد چاوشی، سید یونس میربیگی
    مقدمه
    خواص درمانی کندر از دیرباز در طب سنتی مورد توجه قرار گرفته است. مطالعات جدید نشان دهنده تاثیر کندر در تقویت حافظه و پیشگیری/درمان آلزایمر می باشد. FMRP، محصول ژن FMR1، با توسعه ارتباطات بین سلول های عصبی به تشکیل حافظه کمک می کند. MAP1B از mRNA های هدف  FMRPبوده و ترجمه آن با تاثیر  FMRPمهار می شود. نقص در بیان FMR1 باعث ابتلا به نشانگان X شکننده می شود. بر این اساس، هدف از این تحقیق بررسی تاثیر عصاره آبی کندر در بیان ژن های FMR1 و MAP1B در نمونه های بافت هیپوکامپ موش های صحرایی بود.
    مواد و روش ها
    18 راس موش صحرایی به سه گروه شش تایی شامل یک گروه کنترل و دو گروه تیمار با غلظت های 75 و 150 میلی گرم/کیلوگرم عصاره آبی کندر تقسیم شدند. پس از هشت هفته تیمار با عصاره کندر، هیپوکامپ موش ها جداسازی شدRNA . تام از آن استخراج شده و cDNA سنتز شد. سپس بیان ژن های FMR1 و MAP1B توسط real-time PCR بررسی شد.
    یافته های پژوهش
     غلظت 75 میلی گرم/کیلوگرم عصاره آبی کندر باعث افزایش بیان FMR1 شد. بیان MAP1B نیز در یک الگوی وابسته به غلظت پس از تیمار با عصاره کندر کاهش نشان داد. با این وجود، این تغییرات از نظر آماری معنادار نمی باشد(P>0.05).
    بحث و نتیجه گیری
    FMRP یک تنظیم کننده منفی ترجمه می باشد که با مهار ترجمه mRNA هدف MAP1B انتقال پیام سیناپسی را در نورون ها هدایت می کند. احتمالا کندر از طریق افزایش بیان FMR1 در سلول های نورونی باعث افزایش انعطاف پذیری سیناپسی و تقویت حافظه می شود. این مطالعه می تواند چشم اندازهای درمانی جدیدی برای استفاده از کندر در درمان مبتلایان به نشانگان X شکننده در آینده بگشاید.
    کلید واژگان: کندر, حافظه, FMR1, MAP1B
    Asiyeh Jebelli, Mohammad Khalaj, Kondori*, Elham Talebinejad Chavoshi, Seyed Younes Mirbeygi
    Introduction
    The therapeutic properties of Olibanum have been considered in traditional medicine since ages past. Recent studies indicated the effect of Olibanum on memory enhancement and prevention/treatment of Alzheimer's disease. Fragile X mental retardation protein is the product of the FMR1 gene that mediates memory formation through the development of communications between nerve cells. MAP1B is the FMRP target mRNA and its translation is inhibited by the effect of FMRP. Disturbance in the expression of FMR1 causes fragile X syndrome. Therefore, the aim of this study was to investigate the effect of aqueous extract of Olibanum on the expression of FMR1 and MAP1B genes in hippocampal tissue samples of rats.
    Materials & Methods
    This study was conducted on 18 rats which were divided into groups of control (n=6) and two treatment groups with 75 (n=6) and 150 mg/kg (n=6) concentrations of aqueous extract of Olibanum. The hippocampus of rats was isolated after eight weeks of treatment by Olibanum extract.  Total RNA was extracted and cDNA was synthesized in this study. Subsequently, the expression of FMR1 and MAP1B genes was evaluated by a real-time polymerase chain reaction. Ethics code:IR.TBZMED.REC.1396.1000
    Findings
    According to the results, the aqueous extract of Olibanum at a concentration of 75 mg/kg increased the expression of FMR1. In addition, MAP1B gene expression decreased in a dose-dependent manner following treatment with Olibanum extract. However, these changes are not statistically significant (P>0.05).
    Discussion & Conclusions
    The FMRP is a negative translation regulator that mediates synaptic neuronal transmission through inhibition translation of target mRNA, such as MAP1B. Olibanum probably leads to synaptic flexibility and memory improvement through increasing the expression of FMR1 in neuronal cells. This study could pave the way on the use of Olibanum in the treatment of patients with fragile X syndrome in the future.
    Keywords: FMR1, MAP1B, Memory, Olibanum
  • Asiyeh Jebelli, Mohammad Khalaj Kondori *, Mortaza Bonyadi, Mohammad Ali Hosseinpour Feizi, Mohammad Rahmati Yamchi
    Physiological studies confirm improvement of memory by Olibanum, a resin from Boswellia species, while little is known about the molecular mechanism by which it affects memory performance. Two master transcription factors, CREB-1 and CREB-2, regulate downstream memory-related genes expression, leading to the long-term memory potentiation. This study addresses the effects of Beta-boswellic acid (β-BA), the main ingredient of Olibanum, and ethanolic extract of the resin from Boswellia serrata on the expression of CREB-1 and CREB-2 genes in B65 cell line. B65 cells were treated with β-BA) or ethanolic extract of Olibanum in different dose and time intervals and the cell viability/toxicity was measured by MTT assay. Total RNA was extracted from the treated and untreated control cells and cDNA was synthesized. The expression levels of CREB-1 and CREB-2 genes were quantified by Real-time PCR. MTT assays revealed 50% inhibitory concentrations of 42.05, 29.63 and 21.78 μg/ml for ethanolic extract of Olibanum and 89.54, 44.05 and 21.12 µM for β-BA at 24, 48 and 72h time intervals respectively. Both β-BA and ethanolic extract of Olibanum altered CREB-1 and CREB-2 genes expression levels in time-dependent but not in dose-dependent way. However, β-BA showed stronger and more stable effects. The expression levels of the both genes followed an alternate upregulation and downregulation pattern, but in opposite directions, in response to the both solutions with the progress of time. These results suggest that Olibanum possibly improves memory performance, at least partially, by regulating the levels of CREB-1 and CREB-2 transcription factors via positive/negative-feedback loops.
    Keywords: memory, Olibanum, Beta-boswellic acid, CREB-1, CREB-2
فهرست مطالب این نویسنده: 6 عنوان
  • دکتر محمد خلج کندری
    دکتر محمد خلج کندری
بدانید!
  • این فهرست شامل مطالبی از ایشان است که در سایت مگیران نمایه شده و توسط نویسنده تایید شده‌است.
  • مگیران تنها مقالات مجلات ایرانی عضو خود را نمایه می‌کند. بدیهی است مقالات منتشر شده نگارنده/پژوهشگر در مجلات خارجی، همایش‌ها و مجلاتی که با مگیران همکاری ندارند در این فهرست نیامده‌است.
  • اسامی نویسندگان همکار در صورت عضویت در مگیران و تایید مقالات نمایش داده می شود.
درخواست پشتیبانی - گزارش اشکال