به جمع مشترکان مگیران بپیوندید!

تنها با پرداخت 70 هزارتومان حق اشتراک سالانه به متن مقالات دسترسی داشته باشید و 100 مقاله را بدون هزینه دیگری دریافت کنید.

برای پرداخت حق اشتراک اگر عضو هستید وارد شوید در غیر این صورت حساب کاربری جدید ایجاد کنید

عضویت

فهرست مطالب a. ameri

  • A. Ameri *

    This work proposes a deep learning model for skin cancer detection from skin lesion images. In this analytic study, from HAM10000 dermoscopy image database, 3400 images were employed including melanoma and non-melanoma lesions. The images comprised 860 melanoma, 327 actinic keratoses and intraepithelial carcinoma (AKIEC), 513 basal cell carcinoma (BCC), 795 melanocytic nevi, 790 benign keratosis, and 115 dermatofibroma cases. A deep convolutional neural network was developed to classify the images into benign and malignant classes. A transfer learning method was leveraged with AlexNet as the pre-trained model. The proposed model takes the raw image as the input and automatically learns useful features from the image for classification. Therefore, it eliminates complex procedures of lesion segmentation and feature extraction. The proposed model achieved an area under the receiver operating characteristic (ROC) curve of 0.91. Using a confidence score threshold of 0.5, a classification accuracy of 84%, the sensitivity of 81%, and specificity of 88% was obtained. The user can change the confidence threshold to adjust sensitivity and specificity if desired. The results indicate the high potential of deep learning for the detection of skin cancer including melanoma and non-melanoma malignancies. The proposed approach can be deployed to assist dermatologists in skin cancer detection. Moreover, it can be applied in smartphones for self-diagnosis of malignant skin lesions. Hence, it may expedite cancer detection that is critical for effective treatment.

    Keywords: Skin Cancer, Deep Learning, Melanoma, Transfer Learning, Dermoscopy}
  • A Ameri *

    Pattern recognition has shown remarkable success in decoding motor information from electromyogram (EMG) signals. To decrease the computational complexity in EMG pattern recognition, it may be useful to reduce the dimensionality of the model input. This paper investigates the effect of reducing the dimensionality of EMG features in a regression-based motion intent estimation model. Ten able-bodied subjects participated in this analytic study. EMG signals from the right forearm and angle of the left wrist in three degrees of freedom (DoF) were measured, concurrently. The TD features were extracted from eight EMG channels, resulting in a total of 32 features. Three dimensionality reduction methods including principal component analysis (PCA), non-negative matrix factorization (NNMF), and canonical correlation analysis (CCA) were applied to the EMG features. Reducing the dimension of the EMG features below a certain threshold degraded the performance of the EMG pattern recognition model. Otherwise, dimensionality reduction did not change the performance. These thresholds for the PCA, NNMF, and CCA methods were 25, 26, and 13, respectively. Based on the results, CCA substantially outperformed PCA and NNMF, as it allowed a significant reduction of the EMG features size, from 32 to 13, with no adverse impact on the performance.

    Keywords: Electromyography, dimensionality reduction, pattern recognition, Wrist, Principal Component Analysis}
  • N. Amini, A .Ameri *
    Background

    Arcus Senilis (AS) appears as a white, grey or blue ring or arc in front of the periphery of the iris, and is a symptom of abnormally high cholesterol in patients under 50 years old.

    Objective

    This work proposes a deep learning approach to automatic recognition of AS in eye images.

    Material and Methods

    In this analytical study, a dataset of 191 eye images (130 normal, 61 with AS) was employed where ¾ of the data were used for training the proposed model and ¼ of the data were used for test, using a 4-fold cross-validation. Due to the limited amount of training data, transfer learning was conducted with AlexNet as the pretrained network.

    Results

    The proposed model achieved an accuracy of 100% in classifying the eye images into normal and AS categories.

    Conclusion

    The excellent performance of the proposed model despite limited training set, demonstrate the efficacy of deep transfer learning in AS recognition in eye images. The proposed approach is preferred to previous methods for AS recognition, as it eliminates cumbersome segmentation and feature engineering processes.

    Keywords: Arcus Senilis, Deep Learning, Transfer Learning, Classification}
  • احسان فقیه میرزایی، عالیه عامری*، حمید فروتن فر، حسنیه سادات روح الامینی، محدثه شمس الدینی پور، ماندانا جعفری
    زمینه و هدف

    سرطان به عنوان یکی از معضلات عمده سلامت، یکی از علت های اصلی مرگ و میر در سطح جهان می باشد. مشتقات گزانتین از جمله تیوبرومین، یک دسته از ترکیبات موثر در کنترل سرطان می باشند. در این مطالعه یک سری مشتقات جدید فنوکسی اتیل تیوبرمین با استخلاف در موقعیت N1 طراحی و فعالیت سمیت سلولی آن ها ارزیابی شد. هم چنین، مطالعات داکینگ مولکولی جهت پیش بینی مکانیسم احتمالی آن ها انجام شد.

    مواد و روش ها

     در این مطالعه آزمایشگاهی،  ابتدا، ترکیبات 2، 3 و a-l5 سنتز شدند. سمیت سلولی تمام ترکیبات جدید سنتز شده با روش رنگ سنجی بر پایه MTT (Methylthiazolyldiphenyl-tetrazolium bromide)، علیه 4 رده سلولی سرطانی انسان مورد مطالعه قرار گرفتند. نرم افزار Autodock برای تعیین انرژی های اتصال این ساختارها بر روی آنزیم های تتراهیدروفولات ردوکتاز انسانی، اکتو-'5-نوکلیوتیداز انسانی (e5NT) و فسفودی استراز انسانی استفاده شد. داده ها با استفاده از آنالیز واریانس یک طرفه تجزیه و تحلیل شدند.

    یافته ها

    نتایج حاصل از مطالعات داکینگ، انرژی اتصال پذیری قابل قبولی (kcal/mol 42/8-) را در برابر e5NT نشان داد. نتایج حاصل از بررسی سمیت سلولی نشان داد که بیش ترین اثر سمیت سلولی علیه سلول A549 و MCF-7 رخ داده است (ترکیب e5 به ترتیب با IC50 برابر با 65/86 و 09/161 میکرومولار).

    نتیجه گیری

    نتایج مطالعات داکینگ مولکولی، انرژی اتصال قابل قبولی در برابر آنزیم اکتو-5'-نوکلیوتیداز نشان داد. در میان مشتقات سنتز شده، ترکیب a5 با پایین ترین سطح ΔG (kcal/mol 42/8-) به عنوان بهترین مهارکننده این آنزیم انتخاب شد. اثرات مناسب سمیت سلولی در غلظت های مختلف ترکیبات سنتز شده بر روی رده های سلولی MCF7 و A549  مشاهده شد.

    کلید واژگان: سمیت سلولی, مدل سازی مولکولی, مشتقات تئوبرومین, سنتز}
    E. Faghih-Mirzaei, A. Ameri*, H. Forootanfar, H.S. Rouholamini, M. Shamsadini-Pour, M. Jafari
    Background and Objectives

    Cancer, one of the global health problems, has been introduced as one of the main death causes worldwide. Xanthine derivatives have been identified as effective compounds for prevention and treatment of cancer. In this study, a series of novel phenoxy ethyl theobromine derivatives were designed with N1 positioning and their cytotoxic activity was evaluated. Also, molecular docking studies were performed to predict the possible action mechanism of these compounds.

    Materials and Methods

    In the present laboratory investigation, compounds 2, 3, and 5a-l were initially synthesized. The cytotoxicity of all new synthesized compounds was studied by MTT (methylthiazolyldiphenyl-tetrazolium bromide) -based colorimetric assay against 4 human cancer cell lines. Autodock software was used to determine the binding energies of these structures on human tetrahydrofolate reductase, human octo-5'-nucleotidase (e5NT) and human phosphodiesterase enzymes. The obtained data were analyzed using one-way analysis of variance.

    Results

    The results of docking studies showed acceptable binding energy (-8.42 kcal/mol) against e5NT. The results of cytotoxicity analysis showed that the greatest effect of cytotoxicity was against A549 and MCF-7 cells (compound 5e with IC50 values of 86.65 μM and 161.09 μM, respectively).

    Conclusion

    The results of molecular docking studies showed acceptable binding energy against the octo-5'-nucleotidase enzyme. Among the synthesized derivatives, compound 5a with the lowest ΔG level (-8.42 kcal/mol) was selected as the best inhibitor of this enzyme. Appropriate effects of cytotoxicity were observed at different concentrations of the synthesized compounds on MCF7 and A549 cell lines.

    Keywords: Cytotoxicity, Molecular modeling, Theobromine derivatives, Synthesis}
  • روشنک رضایی کلانتری، احمد جنیدی جعفری، بابک کاکاوندی*، سیمین ناصری، احمد عامری، علی اسرافیلی، ندا رشادتیان
    زمینه و هدف

    امروزه استفاده از جاذب های مغناطیسی و به دنبال آن جداسازی مغناطیسی آلاینده ها از فاضلاب های صنایع، به دلیل سادگی، هزینه کم و سرعت بالا بسیار مورد توجه محققان قرار گرفته است. از این رو هدف از انجام مطالعه حاضر، سنتز کامپوزیت مغناطیسی کربن فعال/نانوذرات Fe3O4 (Fe3O4/PAC) و استفاده از آن به عنوان یک جاذب مغناطیسی برای حذف همزمان سرب و آنیلین از فاضلاب سنتتیک بود.

    روش بررسی

    خصوصیات فیزیکی، سطحی و مورفولوژی جاذب و همچنین عملکرد فرآیند جذب با بررسی تغییرات پارامترهایی همچون pH، زمان تماس، غلظت جاذب و جذب شونده و دما در یک سیستم ناپیوسته مورد مطالعه قرار گرفت. برای توصیف داده های حاصل از آزمایشات جذب از ایزوترم های تعادلی فروندلیچ و لانگمیر و همچنین معادلات سینتیکی لاگرگرن، هو و ایلوویچ استفاده شد.

    یافته ها

    نتایج مطالعه حاضر نشان داد که 90% سرب و 94% آنیلین با استفاده از جاذب سنتز شده تحت شرایط بهینه (6=pH، زمان min 60 و مقدار g/L 2 جاذب) قابل حذف بوده است. داده های حاصل از آزمایشات تجربی جذب با دو مدل ایزوترم لانگمیر و فروندلیچ و مدل سینتیکی شبه درجه دوم همبستگی بهتری داشتند.

    نتیجه گیری

    با توجه به نتایج تحقیق حاضر، می‌توان اظهار داشت که Fe3O4/PAC ظرفیت جذب موثری را برای حذف همزمان سرب و آنیلین داشته و بنابراین استفاده‌ی بهینه از آن به عنوان یک جاذب کارامد در تصفیه پساب های صنعتی حاوی این آلاینده ها پیشنهاد می‌گردد.

    کلید واژگان: جذب سطحی, سرب, کربن فعال, آنیلین, فاضلاب صنعتی, کامپوزیت مغناطیسی}
    R Rezaei Kalantary, A Jonidi Jafari, B Kakavandi*, S Nasseri, A Ameri, A Esrafili, N Reshadatian
    Background and aims

    Today, using magnetic adsorbents and the subsequent magnetically separation of pollutants is highly considered by researchers due to it’s ease of use, low cost and rapid results. Therefore the aim of this study was the synthesis of a magnetic composite of activated carbon/Fe3O4 nanoparticles (Fe3O4/PAC), and its application as a magnetic adsorbent for simultaneous removal of lead and aniline from industrial wastewater.

    Methods

    Physical, surface and morphological features of the adsorbent, as well as, the performance of adsorption process were studied in a batch system by investigating the changes in parameters such as pH, contact time, adsorbent and adsorbate concentrations, and temperature. In order to explain experimental data, Freundlich and Langmuir equilibrium isotherms, in addition to Lagergren, Ho and Elovich kinetic equations were applied.

    Results

    Results of this study demonstrated that 90 % of lead and 94 % of aniline were removable by the synthesized adsorbent under the optimal conditions (pH 6, a contact time 60 min and adsorbent dose of 2 g/L). Experimental data from adsorption were better described by both Langmuir and Freundlich isotherm models, and the pseudo-second-order kinetic model.

    Conclusion

    According to these results, it can be claimed that Fe3O4/PAC had an effective adsorption capacity for simultaneous adsorption of lead and aniline, and thus, it is recommended

    Keywords: Adsorption, Lead, Aniline, Activated Carbon, Industrial wastewater, Magnetic Nanocomposite}
  • امین الله کمالی، علی عامری، هادی پیروج*، احمد جهانگیری، بهروز محمود صالحی

    سنگ های آتشفشانی مورد بررسی در جنوب سراب، و در شمال کوه بزقوش واقع شده اند، که شامل روانه های آندزیت های پورفیری، گدازه های تراکی آندزیتی همراه با توف می شوند و در شمال منطقه با رسوب های جوان کواترنر پوشیده شده اند. این سنگ ها دارای درشت بلور هایی از آنالسیم، الیوین، پیروکسن و پلاژیوکلازند. بافت اصلی این سنگ ها، پورفیری با زمینه ی اینترسرتال است. با توجه به آنالیزهای شیمیایی، سنگ های منطقه ی مورد بررسی، در گستره ی تراکی آندزیت و فنولیت تفریتی قرار می گیرند. همچنین این سنگ ها دارای ماهیت پتاسیم قلیایی بالا تا شوشونیتی با ویژگی های پرآلومینیوم هستند. بر اساس بررسی های انجام شده آنالسیم این سنگ ها اولیه بوده و به طور مستقیم از تبلور ماگما حاصل شده اند. سنگ های شمال غربی بزقوش به طور مشخصی، غنی شدگی از عناصر LILE (مثلا U، Tb، Ba، Rb K،) را نشان می دهند. غنی شدگی عناصر ناسازگار Kو Rb و بیهنجاری منفی Ti و Nb در این سنگ ها بیشتر با گدازه های حاصل از پوسته ی زیرین سازگار است. نمودارهای عنکبوتی و الگوی عناصر REE نشان می دهد که سنگ های این منطقه از یک خاستگاه یکسان به وجود آمده اند. غنی شدگی این عناصر می تواند به دگرنهادی گوشته یا آلایش پوسته-ی قاره ای وابسته باشد. با این وجود بی هنجاری منفی (TNT) Nb، Ta و Tb و نیز با در نظر گرفتن احتمالی فرورانش نئوتتیس در منطقه، به احتمال زیاد غنی شدگی عناصر ناسازگار می تواند نتیجه ی تاثیر فرورانش بر منابع گوشته ای باشد. بر اساس بررسی عناصر REE، ماگماهای مادر سنگ های مورد بررسی احتمالا از یک خاستگاه گارنت لرزولیتی فلوگوپیت دار با درجه ی ذوب بخشی کم 4 تا 6 درصد، تحت فشار 30 تا 35 کیلوبار و در عمق 90 تا 100 کیلومتری ریشه گرفته است.

    کلید واژگان: برقوش, تراکی آندزیت, آنالیسم, شوشونیتی, گارنت لرزولیت}
    A.A. Kamali, A. Ameri, H. Pirooj, A. Jahangiri, B. Mahmoud Salehi

    The studied volcanic rocks are located in south of Sarab at the northern part of the Bozghoush mountaion. The rocks are megaporphyry andesite flows and trachy andesite basalt lavas associated with tuff. In the northern part of the study area these rocks are covered with younger sediments of Quarternary age. These rocks are containing phenocrysts of analcime, olivine, pyroxene and plagioclase. The major textures of these rocks are porphyry with intersertal matrix. According to whole rock analysis of the study area, rocks they are trachy andesite and tephro-phenolite. Also these rocks are high potassic to shoshonitic nature with peralluminous character. Based on textural evidence analcime seems to be primary and formed directly from magma. The rocks of north Bozghoush shows a pronounced enrichment in LILE (Rb, Ba, Tb, U, k). Enrichment of incompatible elements of k and Rb and negative anomaly of Ti and Nb in these rocks are comparable with melts of lower crust. The spider diagrams and REE patterns show that the rocks of the study area are formed from the same source. Enrichment of incompatible elements can be related to mantle metasomatism or contamination of continental crust. In this regards negative anomaly of Ta, Nb and Tb (T N T) and also with respect of eventual Neo-Thetys subduction in this area and most probably enrichment of incompatible elements indicates effects of subduction on mantle sources. According to REE investigation most probably the main source of these rocks were phologopite-bearing garnet lherzolite, with partial melting rate of 4-6 percent, at a pressure of 30-35 Kb and the depth of 90-100 Km.

سامانه نویسندگان
  • علی عامری سیاهویی
    عامری سیاهویی، علی
    عضو هیات علمی موسسه تحقیقات گیاه پزشکی ایران
اطلاعات نویسنده(گان) توسط ایشان ثبت و تکمیل شده‌است. برای مشاهده مشخصات و فهرست همه مطالب، صفحه رزومه ایشان را ببینید.
بدانید!
  • در این صفحه نام مورد نظر در اسامی نویسندگان مقالات جستجو می‌شود. ممکن است نتایج شامل مطالب نویسندگان هم نام و حتی در رشته‌های مختلف باشد.
  • همه مقالات ترجمه فارسی یا انگلیسی ندارند پس ممکن است مقالاتی باشند که نام نویسنده مورد نظر شما به صورت معادل فارسی یا انگلیسی آن درج شده باشد. در صفحه جستجوی پیشرفته می‌توانید همزمان نام فارسی و انگلیسی نویسنده را درج نمایید.
  • در صورتی که می‌خواهید جستجو را با شرایط متفاوت تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مطالب نشریات مراجعه کنید.
درخواست پشتیبانی - گزارش اشکال