فهرست مطالب نویسنده:
aref doozandeh-juibari
-
مقدمهامروزه، مهندسی ژنتیک و بیوانفورماتیک، تولید انبوه پروتئین های نوترکیب دارویی در باکتری Escherichia coli را که دارای ویژگی های منحصر به فرد بیانی است، به امری معمول و اقتصادی تبدیل کرده است. در این ارزیابی بیوانفورماتیکی، تولید پری پلاسمیک هورمون رشد انسانی بررسی گردید. هدف از انجام این تحقیق، ارزیابی جامع بیوانفورماتیکی 48 توالی راهنمای انسانی توسط پایگاه های داده ی معتبر به منظور بررسی بیان پروتئین نوترکیب هورمون رشد انسانی در میزبان Escherichia coli بود.روش هابا استفاده از پایگاه داده ی قدرتمند SignalP نسخه ی 1/4، صحت و دقت جایگاه برش تعداد 48 توالی راهنما ارزیابی و گزینش شدند. خصوصیات فیزیکوشیمیایی توالی راهنمای باقی مانده، توسط پایگاه های داده ی Genescript و Protparam مورد بررسی قرار گرفتند. قابلیت حل شدن پروتئین، فعالیت ترشحی پس از بیان و ساز و کار انتقال توالی های راهنما توسط پایگاه های داده ی Solpro، ProtCompB و PRED-TAT، بررسی شدند.یافته هابر اساس نتایج به دست آمده به صورت تئوری، توالی های راهنمای مناسب برای اتصال به پروتئین هورمون رشد انسانی به ترتیب فسفوپروتئین بزاقی غنی شده با پرولین (Proline rich protein HaeIII subfamily 1 یا PRH1)، پروتئین ترشح شده ی C10orf99 و پپتید رها کننده ی پرولاکتین (Prolactin-releasing hormone یا PRLH) پیش بینی شد.نتیجه گیریبیان ترشحی، مزایایی را در مقابل بیان سیتوپلاسمیک ایجاد می کند. نتایج این تحقیق، نشان داد که با بررسی توالی های راهنمای مختلف در اتصال با پروتئین هورمون رشد انسانی، دستیابی به توالی های دارای پتانسیل و قابلیت بیان ترشحی بهتر امکان پذیر شده است. لازم است در مطالعات آتی صحت این نتایج بررسی گردد.کلید واژگان: Escherichia coli, هورمون رشد انسانی, پری پلاسم, بیوانفورماتیکBackgroundNowadays, by genetic engineering and bioinformatics, large scale production of pharmacological recombinant proteins in Escherichia coli (E. coli) bacteria, which has unique expression properties, becomes a routine and economic imperative. In this study, periplasmic production of human growth hormone was investigated using bioinformatics methods.MethodsThe aim of this study was bioinformatic evaluation of 48 human signal peptides by reliable servers for expression analysis of human growth hormone in Escherichia coli. Accuracy and precision of 48 signal peptides were evaluated via powerful SignalP server. Physicochemical properties of remaining signal peptides were investigated using Genescript and Protparam servers. Solubility of protein, secretory activity of signal peptides after expression, and transmission mechanism of signal peptides were investigated using Solpro, ProtCompB and PRED-TAT, respectively.
Findings: Theoretically, proline rich protein HaeIII subfamily 1 (PRH1), C10orf99, and prolactin-releasing hormone (PRLH) signal peptides were predicted as the most proper signal peptides in fusion of human growth hormone protein, respectively.ConclusionSecretory expression instead of cytoplasmic expression provides benefits. This study results indicated that by examining different signal peptide sequences in fusion with human growth hormone protein, achieving signal peptides with potential and capability for high expression is possible. The accuracy of these results can be verified in future studies and experiments.Keywords: Escherichia coli, Human growth hormone, Periplasm, Bioinformatics
بدانید!
- در این صفحه نام مورد نظر در اسامی نویسندگان مقالات جستجو میشود. ممکن است نتایج شامل مطالب نویسندگان هم نام و حتی در رشتههای مختلف باشد.
- همه مقالات ترجمه فارسی یا انگلیسی ندارند پس ممکن است مقالاتی باشند که نام نویسنده مورد نظر شما به صورت معادل فارسی یا انگلیسی آن درج شده باشد. در صفحه جستجوی پیشرفته میتوانید همزمان نام فارسی و انگلیسی نویسنده را درج نمایید.
- در صورتی که میخواهید جستجو را با شرایط متفاوت تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مطالب نشریات مراجعه کنید.