فهرست مطالب gholamreza shokohi
-
مقدمهآسپرژیلوس ها جنس متنوعی از قارچ های رشته ای شامل گروه ها و گونه های متعدد هستند. شناسایی این قارچ ها از جنبه های مختلف مانند بیماری زایی، توکسین زایی و صنعتی حایز اهمیت است. روش های معمول آزمایشگاهی برای افتراق گونه های آسپرژیلوس شامل بررسی خصوصیات ظاهری و میکرو سکوپی کلنی می باشد. روش های فوق وقت گیر بوده و احتیاج به پرسنل مجرب دارد. هدف مطالعه ی حاضر، استفاده از تعیین توالی ژن بتا توبولین همراه با داده های مورفولوژیک برای شناسایی گونه های آسپرژیلوس جدا شده از برخی محیط ها در ایران بود.روش هادر این مطالعه حدود 200 سویه ی آسپرژیلوس جدا شده از خاک و هوای محیط های مختلف، اعم از بیمارستان و اماکن طبیعی و عمومی مورد استفاده قرار گرفتند. تمام ایزوله ها روی محیط های چاپکس آگار و سابورو کشت مجدد شدند و پس از کشت روی لام مورد شناسایی اولیه قرار گرفتند. DNAی ژنومی تمام ایزوله ها به روش خرد کردن با گریندر استخراج گردید و به دنبال آن ژن بتا توبولین (β-tubulin) هر یک از نمونه ها از طریق واکنش زنجیره ای پلی مراز (Polymeraze chain reaction یا PCR) تقویت گردید و از بین آن ها 21 ایزوله به عنوان نمایندگان خصوصیات ماکروسکوپی و میکروسکوپی تعیین توالی گردیدند و داده های حاصل از طریق مقایسه با اطلاعات بانک ژن مورد بررسی و آنالیز قرار گرفت.یافته هااز بین 21 ایزوله ی آسپرژیلوس که تعیین توالی شدند، 7 جدایه به عنوان آسپرژیلوس فلاووس (Aspergillus flavus)، 3 جدایه آسپرژیلوس فومیگاتوس (A. fumigates)، 3 جدایه آسپرژیلوس چوالیری (A. chevalieri)، 2 جدایه آسپرژیلوس توبینژنسیس (A. tubingensis)، 2 جدایه آسپرژیلوس نیوئوگلاکوس (A. niveoglacus)، 2 جدایه به عنوان آسپرژیلوس روبر (A. ruber)، یک جدایه آسپرژیلوس نایجر (A. niger) و یک جدایه نیز به عنوان آسپرژیلوس ورسیکالر (A. versicolor) شناسایی شدند. یافته های مورفولوژی با نتایج ژنوتیپی تایید گردید.نتیجه گیرییافته های این مطالعه نشان داد که تعیین توالی ژن بتا توبولین برای شناسایی جدایه های محیطی آسپرژیلوس در سطح گونه بسیار با ارزش است و این روش، اعتبار بیشتری در مقایسه با بررسی ریخت شناسی جدایه ها دارد. استفاده از دیگر اهداف ژنتیکی و روش های مولکولی مبتنی بر DNA برای مطالعه ی بیشتر گونه های آسپرژیلوس توصیه می شود.
کلید واژگان: آسپرژیلوس, بتا توبولین, شناسایی}BackgroundThe genus Aspergillus is a mold consisting of various groups and species. Species identification of these fungi is important from pathogenic, toxigenic and industrial points of view. Conventional laboratory methods for delineation of Aspergillus species are based on macro- and microscopic characteristics of the colonies. These methods are time consuming and need expert technicians. The present study aimed to use beta tubulin (BT2) gene sequencing, in conjunction with morphological data, for species identification of Aspergillus strains isolated from some environments in Iran.MethodsTotally, about 200 Aspergillus strains, isolated from soils and air samples of different environments including hospitals, public and natural places, were used. All isolates were subcultured on Sabouraud dextrose agar and Czapec Dox agar. They were preliminarily identified based on micro slide-culture. Genomic DNA was extracted from all strains by a conical grinder and BT2 gene was amplified by polymerase chain reaction (PCR) from each sample. Among them, nucleotide sequences of 21 isolates, as representatives of morphologic features, were determined. The obtained data was analyzed via comparison with sequences existed in GenBank database.FindingsAmong the 21 Aspergillus sequenced isolates, seven isolates were identified as Aspergillus flavus, 3 as Aspergillus fumigatus, 3 as Aspergillus chevalieri, 2 as Aspergillus tubingensis, 2 as Aspergillus niveoglacus, 2 as Aspergillus rubber, one as Aspergillus niger and one as Aspergillus versicolor. Morphological results were confirmed by genotypic data.ConclusionThe findings of this study indicated that sequencing beta tubulin gene is a valuable tool for species identification of Aspergillus environmental isolates. This method was found to be more valid in comparison with morphological analysis. Further studies with application of other genetic markers and molecular DNA-based procedures on discrimination of Aspergillus species are recommended.
بدانید!
- در این صفحه نام مورد نظر در اسامی نویسندگان مقالات جستجو میشود. ممکن است نتایج شامل مطالب نویسندگان هم نام و حتی در رشتههای مختلف باشد.
- همه مقالات ترجمه فارسی یا انگلیسی ندارند پس ممکن است مقالاتی باشند که نام نویسنده مورد نظر شما به صورت معادل فارسی یا انگلیسی آن درج شده باشد. در صفحه جستجوی پیشرفته میتوانید همزمان نام فارسی و انگلیسی نویسنده را درج نمایید.
- در صورتی که میخواهید جستجو را با شرایط متفاوت تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مطالب نشریات مراجعه کنید.