به جمع مشترکان مگیران بپیوندید!

تنها با پرداخت 70 هزارتومان حق اشتراک سالانه به متن مقالات دسترسی داشته باشید و 100 مقاله را بدون هزینه دیگری دریافت کنید.

برای پرداخت حق اشتراک اگر عضو هستید وارد شوید در غیر این صورت حساب کاربری جدید ایجاد کنید

عضویت

فهرست مطالب hamid farahmand

  • فرشته زراعت پیشه، حمید فرحمند*، علیرضا میرواقفی، مرضیه حیدریه، سمیرا شهبازی
    طی سال های متمادی با افزایش جمعیت، تقاضای روزافزون بشر برای مصرف مواد غذایی و اهمیت حفظ امنیت محیط زیست باعث گردیده تا محققین به استفاده از ریزجانداران برای افزایش میزان محصول در واحد سطح بیش از گذشته توجه نمایند. برخی سویه های قارچ تریکودرما  (Trichoderma sp.) به عنوان محرک رشد در گیاهان شناخته شده اند. حساسیت سویه های مختلف ماهی به مواد سمی متفاوت است، از این رو آزمایش های سم شناسی بر روی ماهیان مختلف صورت می گیرند. در این آزمایش 120 قطعه ماهی قزل آلای رنگین کمان (Oncorhynchus mykiss) با 3 گونه قارچ تریکودرما (Trichoderma  afroharzianum، Trichoderma ghanens و Trichoderma lixii)، تیمار 1 (TC-1)، تیمار 2 (TC-3)، تیمار 3 (TC-4) و تیمار شاهد (CL) به صورت کاملا تصادفی تغذیه شدند. فاکتورهای رشد (میزان رشد روزانه، درصد افزایش وزن، ضریب رشد ویژه و ضریب تبدیل غذایی)، آنالیز تقریبی لاشه (پروتئین، چربی، خاکستر و رطوبت) و خون شناسی (هموگلوبین، هماتوکریت، گلبول سفید و قرمز، نوتروفیل، مونوسیت، لنفوسیت، میانگین هموگلوبین گلبول های قرمز (MCHC)، اندازه گلبول های قرمز (MCV)، متوسط هموگلوبین در گلبول های قرمز (MCH)) بررسی شدند. بهبود فاکتورهای رشد در تیمار (TC-3) اختلاف معنی داری با سایر تیمارها و گروه شاهد داشت. ارزیابی پارامترهای خونی در این تحقیق بیانگر آن بود که به صورت معنی داری قارچ تریکودرما منجر به کاهش سطح این فاکتورها در بچه ماهیان قزل آلای رنگین کمان می گردد. آنالیز لاشه بچه ماهیان قزل آلای رنگین کمان در تیمارهای تغذیه شده توسط سویه های مختلف تریکودرما نشان داد که میزان پروتئین، چربی و میزان رطوبت در گروه های شاهد و تیمارهای تغذیه شده با قارچ تریکودرما تفاوت معنی داری نداشتند، اما کمترین میزان کلسترول و تری گلیسیرید در شاهد مشاهده شد. با توجه به تغییر فاکتورهای هماتولوژی ماهی های تحت تیمار تغذیه شده با قارچ تریکودرما، سنجش این فاکتورها می تواند به عنوان یک شاخص زیستی، ابزار پایش و ارزیابی سلامت اکوسیستم های آبی بهره گرفت. با توجه به ضرورت استفاده از سموم شیمیایی کنترل آفات و سمیت آن ها حتی در غلظت های بسیار اندک بر ماهی، بررسی پیامدهای نامطلوب سموم شیمیایی بر سلامت آبزیان، از دیدگاه شیلاتی و محیط زیستی حائز اهمیت است.
    کلید واژگان: اسپور قارچ تریکودرما, فاکتورهای رشد, فاکتورهای خونی, بچه ماهی قزل آلای رنگین کمان}
    Fereshteh Zeraatpisheh, Hamid Farahmand *, Alireza Mirvaghefi, Marzieh Heidarieh, Samira Shahbazi
    Over many years, with the increase in population, the increasing human demand for food consumption and the importance of maintaining environmental security, researchers have paid attention to the use of microorganisms to increase the amount of product per unit area more than in the past. Some species of Trichoderma fungus are known as growth promoters in plants. The sensitivity of different species of fish to toxic substances is different, so toxicology tests are done on different fish. In this experiment, 120 pieces of rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) with 3 types of Trichoderma fungi (Trichoderma afroharzianum, Trichoderma ghanens, Trichoderma lixii), treatment 1 (TC-1), treatment 2 (TC-3), treatment 3 (TC-4) and control treatment (CL) were fed completely randomly. Finally, growth factors (daily growth rate, weight gain percentage, specific growth factor, food conversion factor), approximate carcass analysis (protein, fat, ash, and moisture), and hematology (hemoglobin, hematocrit, white and red blood cells, neutrophils, Monocyte, lymphocyte, mean hemoglobin red blood cells (MCHC), size red blood cells (MCV), mean hemoglobin red blood cells (MCH)) were evaluated. The investigation growth factors showed that the treatment (TC-3) had significant difference with other treatments and the control group. Also, the evaluation of blood parameters in this research showed that Trichoderma significantly reduces the level of these factors in rainbow trout. The analysis of the rainbow trout carcasses in the treatments fed by different strains of Trichoderma showed that the amount of protein, fat and moisture in the control groups and the treatments were not significantly different; but the lowest amount of cholesterol and triglyceride was observed in the control. Considering the changes in the hematological factors of fish treated with Trichodema, the measurement of these factors can be used as biological index, a tool for monitoring and evaluating the health of aquatic ecosystems. Since it is necessary to use chemical pesticides and their toxicity even in very small concentrations on fish, it is important to investigate the adverse effects of chemical pesticides on aquatic health from the perspective of fisheries and environment.
    Keywords: fungus, Toxicity, Blood count, Hypothermia, Carcass Composition}
  • Behzad Nematdoost Haghi, Alireza Mirvaghefi, Hamid Farahmand

    This study aims to evaluate the effect of nano titanium dioxide and microplastics, alone and in combination, on immune system function and oxidative stress of juvenile Nile tilapia, Oreochromis niloticus.For this purpose, fish were randomly divided into 27 100L tanks using a 3×3 factorial design, including three concentrations of Nano titanium dioxide (0, 1, and 5 mg/l) and three concentrations of microplastic (0, 0.5, and 1 mg/l) separately and together each in triplicate. The results showed that immunoglobulin, malondialdehyde(MDA), and glutathione reductase (GR) had significant effects in all groups (P<0.05). Lysozyme, total antioxidant capacity (TAC), and glutathione peroxidase (GPx) showed significant differences between the combined groups and the control (P<0.05). No significant differences were observed in C3 and C4 between groups exposed to MPs and Nano-TiO2 and the control (P>0.05). Superoxide dismutase (SOD) showed significant differences between the group exposed to MPs and Nano-TiO2 alone and the control group (P<0.05). In conclusion, the results showed that MPs could have a synergistic effect on the toxicity of Nano-TiO2.

    Keywords: Oxidative stress, Immunity, Environmental contaminant, Oreochromis niloticus}
  • میثم باورصاد، امیر عابد علم دوست*، رضا تابنده، حمید فرحمند، علیرضا میرواقفی، مجتبی علیشاهی

    هرپس ویروس نوع 3 کپورماهیان (CyHV-3) یا کوی هرپس ویروس (KHV)، یک ویروس نوظهور به شدت مسری و با حدت بالا است که سبب ایجاد تلفات سنگین و ناگهانی در ماهی کپور معمولی و کوی و هیبریدهای آنها می شود. روش LAMP یک تکنیک مولکولی مبتنی بر تکثیر بسیار اختصاصی اسید نوکلییک اجرام پاتوژن در شرایط همدما و بدون نیاز به تجهیزات گران قیمت می باشد که در سال های اخیر به منظور تشخیص پاتوژن های انسان و حیوانات توسعه یافته است. با توجه به اهمیت تشخیص سریع بیماری کوی هرپس ویروس در مزارع مشکوک به آلودگی و پایش دایمی مزارع پرورش کپورماهیان کشور، این مطالعه با هدف ارزیابی روش تلفیقی LAMP با پروب های نانوطلا در تشخیص سریع این ویروس صورت گرفت. در این مطالعه با استفاده از 6 آغازگر اختصاصی، بخشی از ژن تیمیدین کیناز (TK) کوی هرپس ویروس با روش بهینه شده LAMP، تکثیر و برای تشخیص رقت های مختلف DNA ژنومیک و DNA در نمونه های بافتی کپور معمولی، آزمایش اختصاصیت و حساسیت مورد بررسی قرار گرفت و آزمایش سرعت و حساسیت نسبت به روش PCR معمولی نیز مقایسه گردید. نتایج بیانگر اختصاصی بودن صد درصدی و حساسیت تشخیص بر اساس رقت استوک 8-10 معادل 25/1 فمتوگرم در میکرولیتر برای DNA ژنومیک ویروس و 7-10 معادل 2/8 فمتوگرم در میکرولیتر برای DNA ویروسی آمیخته شده در نمونه بافتی بود. همچنین بر اساس نتایج حاصله، روش LAMP پیشنهادی در مقایسه با PCR معمولی سه برابر سریعتر و 8000 برابر دقیق تر بود. با توجه به کارایی بالا، روش LAMP می تواند به عنوان یک ابزار قدرتمند و دقیق و سریع جهت شناسایی مولکولی کوی هرپس ویروس در آزمایشگاه های تشخیصی با تجهیزات اندک مورد استفاده قرار گیرد.

    کلید واژگان: هرپس ویروس نوع 3 کپورماهیان, LAMP, PCR, تشخیص سریع, تکثیر هم دما, تیمیدین کیناز}
    Meisam Bavarsad, Amirreza ABED-ELMDOUST *, Reza Tabandeh, Hamid Farahmand, Alireza Mirvaghefi, Mojtaba Alishahi

    Koi Herpes Virus (KHV or Cyprinid Herpesvirus 3, CyHV-3) is an etiological agent of an emerging and notifiable disease and one of the mostrisky factors affecting common carp and koi worldwide production with high mortality rates. Molecular methods have been developed and routinely used for the detection of KHV infections. These diagnostic tools are sensitive but still have some drawbacks: they require expensive and bulky apparatus, a large sample volume, and long sample preparation/detection times. Therefore, it is desirable to develop simpler, faster, cheaper and more portable detection methods. Loop-mediated isothermal amplification (LAMP) technique is a novel and next-generation tool which can amplify nucleic acids with high specificity, sensitivity and rapidity under isothermal conditions. In this study, a fragment of the CyHV-3 TK gene was amplified at 65°C in the presence of Bst DNA polymerase and a set of six specially designed primer mixture. The reliability, sensitivity and specificity of this assay for rapid detection of CyHV-3 was investigated and compared to conventional PCR. LAMP assay was successfully developed with the detection of KHV- generated product, and showed 100% specificity and sensitivity of 1.25 fg/µL, that is comparable to the most sensitive method reported to date. The assay was 8000 fold more sensitive and three times faster than conventional PCR. The LAMP assay described in this study revealed a highly sensitive, rapid and reliable diagnostic protocol for detection of CyHV-3..

    Keywords: KHV, CyHV-3, LAMP, PCR, Rapid detection, Isothermal amplification, Thymidine kinase}
  • بهزاد نعمت دوست حقی، علیرضا میر واقفی*، حمید فرحمند
    قرار گرفتن موجودات در معرض چندین  آلاینده محیطی می تواند اثرات متفاوتی نسبت به زمانی که تنها در معرض یک آلاینده باشند بر آن ها داشته باشد. هدف از این مطالعه بررسی اثرات دو آلاینده نانو دی اکسید تیتانیوم و ریزپلاستیک به تنهایی و به صورت توام بر ماهی تیلاپیای نیل بود. 270 قطعه ماهی (با میانگین وزنی 0/6±23/5 گرم) به مدت یک ماه در قالب طرح فاکتوریل (شامل غلظت های 0، 1 و 5 میلی گرم بر لیتر نانوتیتانیوم و غلظت های 0، 0/5 و 1 میلی گرم بر لیتر ریزپلاستیک) با 3 تکرار تحت آزمایش قرار گرفتند. نتایج نشان داد میزان پروتیین در همه گروه ها نسبت به کنترل کاهش معنی دار نشان دادند (0.05>P). میزان آلبومین و گلبولین نیز در همه گروه ها کاهش نشان دادند که در مورد گروه هایی که تنها در معرض ریزپلاستیک قرارداشتند معنی دار نبود (0.05<P). فعالیت کراتیتین فسفوکیناز (CPK) و آلانین آمینوترانسفراز (ALT) و همچنین میزان تری گلیسرید در تمامی گروه ها به جز گروه های در معرض ریزپلاستیک به تنهایی، افزایش معنی دار را نشان دادند (0.05>P). افزایش معنی دار فعالیت گاماگلوتامیل ترانسفراز (GGT) نیز در همه گروه ها نسبت به کنترل مشاهده شد  (0.05>P). فعالیت لاکتات دهیدروژناز (LDH) و میزان گلوکز تنها در گروه های در معرض آلاینده ها به صورت توام، افزایش معنی دار از خود نشان دادند (0.05>P) و میزان کلسترول نیز در هیچ یک از گروه ها تغییر معنی داری را از خود نشان نداد (0.05<P). به طور کلی نتایج نشان داد آلاینده های مورد بررسی حتی در غلظت های پایین نیز سبب ایجاد تغییرات در فراسنجه های مورد بررسی شدند که میزان این تغییرات درگروه های در معرض مواجهه توام آلاینده ها بیشتر بود که می تواند نشان دهنده هم افزایی آن ها در ایجاد این تغییرات باشد.
    کلید واژگان: آلاینده های محیطی, فراسنجه های بیوشیمیایی, تیلاپیای نیل}
    Behzad Nematdoost Haghi, Alireza Mirvaghefi *, Hamid Farahmand
    Organisms Exposure to multiple contaminants in the environment can have different effects on them than when exposed to only one pollutant. Investigation of the impacts of nano titaniumdioxide and microplastic, on Nile tilapia was the aim of this study. 270 fish (average weight of 23.5±0.6 g) in factorial design (including concentrations of 0, 1 and 5 mg/l nanotitanium and concentrations of 0.5 0 and 1mg/l microplastic) were treated for 30 days in triplicate. The results indicated that the amount of protein in all groups showed a significant decrease compare with control (P<0.05). The amount of albumin and globulin in all groups showed a decrease that was not significant in the microplastic groups alone (P>0.05). Creatinine phosphokinase (CPK) and alanine aminotransferase (ALT) activities as well as triglyceride levels showed a significant increase in all groups except the microplastic group alone (P<0.05). Gammaglutamyl transferase (GGT) activity in all groups showed a significant increase compared to controls (P<0.05). Lactate dehydrogenase (LDH) activity and glucose levels showed a significant increase only in the groups exposed to pollutants (P<0.05) and cholesterol levels did not show a significant change in any of the groups (P>0.05). In general, the results of the recent study showed that the combined groups had more effects on fish. Also, in comparison with the effects of the two pollutants, titanium dioxide had more effects than microplastics and caused more changes in blood parameters.
    Keywords: Environmental contaminant, biochemical parameters, Nile tilapia}
  • آرش جولاده رودبار، حمید فرهمند*، امیر عابدعلم دوست، باقز مجازی امیری، سهیل ایگدری

    اخیرا زردپر سرمخروطی Luciobarbus conocephalus از رودخانه هریرود برای اولین بار گزارش شده است اما در مورد اعتبار این گونه در بین محققان شک و تردید وجود دارد. برخی آن را به عنوان زیرگونه و برخی دیگر آن را به عنوان مترادف زردپر سر بزرگ L. capito می دانند. بنابراین مطالعه حاضر به منظور بررسی جایگاه تبارشناسی و اعتبارسنجی این گونه انجام شد. بدین منظور نمونه های منتسب به این گونه از رودخانه هریرود (حدفاصل پایین دست سد دوستی و پل خاتون) صید شدند. ژن سیتوکروم بی Cytb برای دو نمونه توالی یابی شد. با استفاده از توالی های حاصله و دیگر توالی های موجود در بانک ژن NCBI از اعضای این جنس، درخت های تبارشناسی به روش inference Bayesian و تخمین Maximum likelihood ترسیم شد. با توجه به نتایج به دست آمده، زردپر سرمخروطی گونه مجزا و معتبر از L. capito است. زردپر سرمخروطی در درخت های تبارشناسی ترسیم شده در خوشه مجزا از L. capito با پشتیبانی بالا قرار گرفت، همچنین نتایج همردیفی ژن Cytb این گونه نیز، در 11 جایگاه منحصر به فرد باL. capito  تفاوت نشان داد. علاوه بر این میانگین فاصله ژنتیکی K2P برای دو گونه زردپر سرمخروطی و زردپر سربزرگ در حدود 3/1 درصد به دست آمد که به نظر می رسد برای گونه های معتبر در جنس Luciobarbus فاصله ای پذیرفته شده است.

    کلید واژگان: تبارشناسی, تمایز ژنتیکی, سس ماهی, کپورماهیان}
    Hamid Farahmand*

    Recently, Luciobarbus conocephalus from the Hari River was reported for the first time, but there is doubt about the validity of this species between authors, because some of them placed it as a subspecies or synonym of L. capito. Therefore, the present study was conducted to investigate the status of phylogeny and the validity of this species. For this purpose, specimens captured from Hari River (between the lower of Dosti dam and Khatoun bridge) using an electrofishing device. After DNA extraction from the fins, Cytb gene was amplified and sequenced. Using sequences, the phylogeny tree was plotted by Bayesian inference and Maximum likelihood estimation. According to the results, Hari barbel is a valid species and differs from Bulatmai barbel. Colonial jaundice was found in genealogical trees depicted in a separate cluster of L. capito with high support. Hari barbel was found in phylogenetic trees depicted in a separate cluster of L. capito with high support, and the Alignments results of Cytb gene of this species also differed in 11 unique loci with L. capito. In addition, the mean genetic distance of K2P for the two species of Hari and Bulatmai barbels was about 1.3%, which seems to be an acceptable distance for the valid species of the genus Luciobarbus.

    Keywords: Barbel, Phylogeny, Genetic differentiation, Iran}
  • مریم سلیمانپور، باقر مجازی امیری*، حمید فرحمند، علیرضا میرواقفی، یاسین دستار
    دترژنت های آنیونی به دلیل پر مصرف بودن، بخش زیادی از فاضلاب های خانگی را تشکیل می دهند. با ورود فاضلاب ها به منابع آبی، این مواد وارد محیط زیست آبزیان شده و با کاهش اکسیژن محلول آب و ایجاد استرس باعث آسیب های جدی به آبزیان از جمله ماهی ها می شوند. هدف از این مطالعه، دست یافتن به شاخصه هایی جهت تعیین میزان اثر گذاری این مواد بر روند رشد جنین ماهی قزل آلای رنگین کمان بود. برای این منظور تخم و جنین ماهی قزل آلای رنگین کمان در مراحل مختلف از زمان لقاح تا زمان چشم زدگی در معرض دوزهای 1 میلی گرم بر لیتر پودر لباسشویی، 5/0میلی گرم بر لیتر مایع ظرفشویی، 25/0 میلی گرم بر لیتر آب ژاول قرار گرفت و در طول این دوره نمونه برداری انجام شد. تیمارها از نظر دامنه زمانی رشد جنینی، درصد چشم زدگی، درصد تلفات، شکل ظاهری جنین و میزان هورمون کورتیزول تخمها و جنین مورد آزمایش قرار گرفتند. نتایج به دست آمده نشان داد که دترژنت ها باعث تسریع زمانی در مراحل رشد جنینی، افزایش درصد تلفات، کاهش درصد چشم زدگی، القاء استرس و افزایش هورمون کورتیزول و ایجاد ناهنجاری های جنینی می گردند. به طور کلی می توان اینطور نتیجه گرفت که ورود فاضلاب های خانگی و صنعتی و متعاقب آن ورود دترژنت ها به منابع آبی می تواند باعث اثرات سمی و آسیب های جبران ناپذیری روی گونه های آبزیان شود.
    کلید واژگان: قزل آلای رنگین کمان, شوینده, دوره جنینی, سورفکتانت, ناهنجاری, کورتیزول}
    Maryam Soleimanpour, Bagher Mojazi Amiri *, Hamid Farahmand, Alireza Mirvaghefi, Yasin Dastar
    Anionic detergents make up a large portion of domestic wastewater due to their high consumption. With the entry of wastewater into water sources, these substances enter the aquatic environment and cause serious damage to aquatic animals, including fish, by reducing dissolved oxygen in water and causing stress. The aim of this study was to obtain evidence to determine the effect of these substances on the embryonic growth of rainbow trout. For this purpose, rainbow trout eggs and embryos were exposed to doses of 1 mg / l of washing powder, 0.5 mg / l of dishwashing liquid, 0.25 mg of bleach in different stages from fertilization to hatching and sampling was done during this period. The treatments were tested for embryonic growth time, percentage of eyeing, percentage of mortality, appearance and cortisol levels of eggs and embryos. The results showed that detergents accelerate the stages of embryonic development, increase the mortality rate, reduce the percentage of eyeing, induce stress and increase cortisol and cause fetal abnormalities. In general, it can be concluded that the entry of domestic and industrial wastewater and subsequently entry of detergents into water sources can cause toxic effects and irreparable damage to aquatic species
    Keywords: Rainbow trout, detergent, Embryogenesis, Surfactant, abnormality, Cortisol}
  • آرش جولاده رودبار*، حمید فرحمند، امیررضا عابد علم دوست، باقر مجازی امیری، سهیل ایگدری
    زردپرماهیان Luciobarbus یکی از جنس های مهم و اقتصادی خانواده کپورماهیان (Cyprinidae) است که اغلب گونه های آن از لحاظ ریخت ظاهری شبیه به یکدیگر هستند و این امر باعث دشواری شناسایی گونه های این جنس شده است. در پژوهش حاضر نمونه برداری در طی سال های 1398-1390 از هفت حوضه آبریز کاسپین، نمک، ارومیه، هریرود، تیگریس، پرسیس و هرمز با استفاده از تور، الکتروفیشر و قلاب به عمل آمد. در مجموع حضور نه گونه L. barbulus، L. brachycephalus،L. capito ، L. conocephalus، L. esocinus ،L. kersin ، L. mursa، L. subquincunciatus وL. xanthopterus  از 519 ایستگاه در آب های داخلی ایران تایید شد. همچنین برای اعضای قابل تایید این جنس در ایران، کلید شناسایی ارایه و نقشه پراکنش آن ها تهیه شد. همچنین پس از بررسی وضعیت حفاظتی اعضای این جنس، پیشنهاد گردید یک برنامه مدون، اصولی و علمی برای شناسایی جمعیت ها، مکان های مناسب جهت تکثیر و رهاسازی لاروهای حاصل از تکثیر در اسارت در نظر گرفته شود.
    کلید واژگان: ایران, حفاظت, حوضه آبریز, سس ماهیان, ویژگی های ریختی}
    Arash Jouladeh Roudbar *, Hamid Farahmand, Amirreza Abed Elmdoust, Bagher Mojazi Amiri, Soheil Eagderi
    Luciobarbus is one of the most important and economical genus of the Cyprinidae family, most of them are similar in appearance, making it difficult to identify species. In the present study, 519 stations in seven basins, including: Caspian, Namak, Urmia, Hari, Tigris, Persis and Hormuz basins were sampled using nets, electro fisher and jigging, during the years 2011-2011. In total, the presence of nine species including L. barbulus, L. brachycephalus, L. capito, L. conocephalus, L. esocinus, L. kersin, L. mursa, L. subquincunciatus and L. xanthopterus was confirmed in Iran's inland waters. For the approved members of this genus in Iran, the identification key were presented and their distribution map were prepared. Also, after examining the conservation status of the members of this genus, it was suggested that a well-codified, principled and scientific program be considered to identify populations, suitable places for reproduction and release of larvae from reproduction in captivity.
    Keywords: Barbels, Basin, Conservation, Iran, ‎Morphological characters}
  • سهیلا فیض بخش کوفلی، حمید فرحمند*، امیررضا عابد علم دوست، رضا خمیرانی

    ماهی سفید (Rutilus frisii kutum) یکی از گونه های مهم اقتصادی شمال ایران است. این آزمایش به منظور شناسایی QTLهای مرتبط با صفات رشد (وزن لاشه و طول کل) با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره کپور معمولی (Cyprinus carpio) صورت گرفت. مولدین آماده تکثیر از یک جمعیت وحشی وارد شده به رودخانه سفید رود انتخاب شدند. یازده خانواده خویشاوند تنی از تکثیر 22 جفت مولد نر و ماده ماهی سفید به دست آمد. نتاج حاصل پس از طی یک دوره سه ماهه پرورشی برداشت و در الکل 96 ٪ ذخیره شدند. از مجموع نتاج به دست آمده 75 نمونه انتخاب شدند. DNA مولدین و نتاج استخراج طبق پروتکل شد. از کاربرد چهار نشانگر ریزماهواره (HLJ2225، HLJ3366، HLJ3988 و HLJ2316) مرتبط با صفات رشد (طول کل و وزن کل) در مجموع ده لوکوس (13 ژنوتیپ) شامل لوکوس های HL1، HL2، HL3، HL4، HL5، HL6، HL7، HL8، HL9 و HL10 با استفاده از نرم افزار AlphaEaseFC انتخاب و نمره دهی شدند. تعداد الل های هر لوکوس (N_A)، تعداد الل های موثر هر لوکوس (N_E)، هتروزیگوسیتی مورد انتظار (H_e)، هتروزیگوسیتی مشاهده شده (H_o)، شاخص تثبیت (F)، تعادل هاردی-واینبرگ، PIC، F_st، R_st، عدم تعادل پیوستگی (LD)، ضریب همبستگی پیرسون و رگرسیون در جمعیت مولدین و نتاج با استفاده از نرم افزار های GenAlEx 6.1، Arlequin ver. 3.5.2 و Excel 2013 بررسی شدند. نتیجه بررسی ها نشان داد همه لوکوس های فوق الذکر برای کاربرد در برنامه به گزینی به کمک نشانگر (MAS) مناسب هستند. وراثت پذیری لوکوس ها برای طول و وزن کل محاسبه شد. بر اساس LD پنج گروه اتصال وراثت پذیر برای طول کل (شاملLG1 ، LG2، LG3، LG4 و LG5) ساخته شد. گروه اتصال LG4 متشکل از هشت لوکوس (HL3، HL4، HL5، HL6، HL7، HL8، HL9 و HL10) جهت گزینش خانواده ها انتخاب شد. در مجموع شش خانواده بر مبنای گروه اتصال LG4 انتخاب شدند. این تحقیق نشان داد که کاربرد نشانگرهای مولکولی ریزماهواره مرتبط با صفات رشد گونه های نزدیک به ماهی سفید (R. frisii kutum) می تواند به ردیابی QTLهای صفات رشد در این گونه با اهمیت تجاری کمک کند.

    کلید واژگان: به گزینی به کمک نشانگر (MAS), وراثت پذیری, عدم تعادل پیوستگی(LD), گزینش بر مبنای گروه اتصال(LGS), QTL}
    Soheila Feyzbakhsh Kofeli, Hamid Farahmand *, Amirreza ABED ELMDOUST, Reza Khomeirani

    Southern Caspian Kutum, Rutilus frisii kutum (Kamensky, 1901) is an important economic species in north of Iran. This study was conducted in order to identifying QTLs associated with growth traits, body weight and total length, in Caspian Kutum (R. frisii kutum) using microsatellites from close species, Common Carp (cyprinus carpio). The eleven full-sibs family were produced by mating between eleven male and eleven female that were collected from Sefid Rood river. Sampling was accomplished from broodstock caudal fin. Three month after hatch the offspring were collected and stored in alcohol 96%. Altogether 75 offspring were sampled. Genomic DNA was isolated from broodstock and offspring according to the protocol. With applying four microsatellite markers (HLJ2225, HLJ3366, HLJ3988, and HLJ2316) related to growth traits, altogether 10 loci, 13 genotype, were selected for performing statistical analyses. Genotyping was accomplished using AlphaEaseFC software. Statistical analyses were performed by GenAlEx 6.1, Arlequin ver. 3.5.2 and Excel 2013 softwares. Investigating the number of alleles per locus, effective number of alleles per locus, expected heterozygosity, observed heterozygosity, fixation index, polymorphic information content, R and F statistics, Hardy-Weinberg equilibrium showed that these loci, HL1, HL2, HL3, HL4, HL5, HL6, HL7, HL8, HL9 and HL10, were suitable for applying in marker-assisted-selection (MAS) program for Caspian Kutum (R. frisii kutum). The heritability was calculated for each locus, for total length and total weight. Then based on linkage disequilibrium five heritable linkage group, LG1, LG2, LG3, LG4 and LG5, were constructed for total length in Caspian Kutum (R. frisii kutum). The LG4 with eight loci (nine genotype), including loci HL3, HL4, HL5, HL6, HL7, HL8, HL9 and HL10, was selected for family linkage group selection (LGS). The LG4 had a relatively average heritability ( = 0/432). Altogether, six family based on LG4 were selected to use in R. frisii kutum selective breeding program. This study showed that using microsatellite markers related to growth traits in close species to Caspian Kutum (R. frisii kutum) can aid to identifying QTLs associated with growth traits in Caspian Kutum, an important commercial species.

    Keywords: Marker assisted selection (MAS), heritability, Linkage disequilibrium (LD), Linkage group selection (LGS), QTL}
  • ندا داستانپور، سهیل ایگدری*، حمید فرحمند، حامد موسوی ثابت

    در این مطالعه، تنوع ریختی 162 قطعه ماهی نازک (Chondrostoma regium) جمع آوری شده از رودخانه های بهشت آباد، شلمزار، کارون، گندمان و شیخ علی خان (چهارمحال بختیاری)، توف سفید و سمیره (اصفهان)، خرسان و بشار (کهگیلویه و بویر احمد)، دینورآب و الوند (کرمانشاه)، حمیل (ایلام)، دوآب و کفراج (لرستان) و زاب (کردستان) بررسی شد. تعداد 27 صفت اندازشی و 11 صفت شمارشی اندازه گیری و شمارش شد. برای بررسی تنوع ریختی بین جمعیت های مطالعه شده، ویژگی های اندازشی و شمارشی با استفاده از آنالیز واریانس یک طرفه، آنالیز کروسکال - والیس، تحلیل مولفه های اصلی (PCA) و تحلیل همبستگی کانونی (MANOVA/CVA) تجزیه و تحلیل شد. براساس نتایج تجزیه و تحلیل واریانس یک طرفه، 20 ویژگی اندازشی اصلاح شده و 10 ویژگی شمارشی دارای تفاوت معنی دار بود (05/0p <). در صفات اندازشی، دو مولفه اول نشان دهنده 02/55 درصد تنوع صفات بین افراد بود. آنالیز CVA صفات اندازشی نشان داد جمعیت ها هم پوشانی زیادی دارند و تنها جمعیت رودخانه زاب از سایر جمعیت ها جدا شد؛ ولی در صفات شمارشی بیشتر جمعیت ها از یکدیگرتفکیک شد. براساس نتایج، بین جمعیت های مختلف ماهی نازک تفاوت های ریختی معنی داری وجود دارد و در اعضای این گونه صفات شمارشی، قابلیت تفکیک کنندگی بیشتری نسبت به صفات اندازشی دارند.

    کلید واژگان: تجزیه به مولفه های اصلی, حوضه تیگریس, ریخت سنجی, نازک ماهی}
    Neda Dastanpoor, Soheil Eagderi *, Hamid Farahmand, Hamed Mousavi-Sabet

    In the present study, the morphological variations of 162 specimens of Chondrostoma regium (Heckel, 1843) collected from the Beheshtabad, Shalmzar, Karoun, Gandman, Sheikh Ali Khan (Chaharmahal-e Bakhtiari Province), Tof Sefid and Seimareh (Isfahan Province), Khersan, Beshar (Kohgoluyeh and Boyer-Ahmad Province), Dinevarab, Alvand (Kermanshah Province), Homeil (Ilam Province), Doab, Kafraj (Lorestan Province) and Zab (Kurdistan Province) were analyzed. A total of 27 morphometric and 11 meristic characteristics were assessed. To investigate the morphological variations between the studied populations, morphometric and meristic characteristics were analyzed using one-way analysis of variance, Kruskal-Wallis analysis, Principal Component Analysis (PCA), Multivariate Analysis of Variance (MANOVA), and Canonical Variates Analysis (CVA). The results of the study showed that 20 morphometric and 10 meristic characteristics had significant differences (p < 0.05). Among the morphometric characteristics, the first two components showed 55.2% of the variation between the individuals. CVA analysis of morphometric characteristics showed that the populations had a great overlap and only the Zab population was separated from the others, whereas in the meristic characteristics, most of the populations were separated from each other. Based on the results, the studied populations of Brond-snout fish showed significant morphological differences and in this species. Meristic characteristics had a higher discriminability than morphometric characteristics.

    Keywords: Principal Component Analysis (PCA), Tigris basin, Morphometrics, Brond-snout}
  • سارا صفاری، هادی پورباقر*، سهیل ایگدری، حمید فرحمند

    شگ ماهیان جنس Alosa از لحاظ ظاهری بسیار شبیه به هم بوده و به راحتی نمی توان گونه‌های آن ها را به لحاظ ریختی از هم تفکیک کرد. در این مطالعه به منظور بررسی امکان به کارگیری روش ریخت سنجی هندسی خط سیر پیرامونی روی فلس ماهیان به عنوان روشی آسان در شناسایی سریع گونه های جنس Alosa، نمونه گیری از پره های سواحل پره سر، انزلی، رودسر و تنکابن صورت گرفت. سه گونه A .braschnikowi، A. caspiaو A. kessleri در میان نمونه ها شناسایی شدند. از ماهیان هر گونه، تعدادی فلس از قسمت کیل شکمی آن ها جدا و عکس برداری صورت گرفت. روش آنالیز موجک به وسیله بسته ShapeR در نرم افزار R انجام شد و آنالیز کانونی مختصات اصلی روی ضرایب حاصل از موجک اعمال گردید. همچنین روش آنالیز فوریه نیز انجام شد و نتایج با آزمون تی دو هتلینگ مورد مقایسه قرار گرفت. در هر دو روش بین اشکال فلس بین هر سه گونه اختلاف نشان داده شد که این اختلاف در میان دو گونه A. braschnikowi و A. caspia از نظر آماری معنی دار بود.

    کلید واژگان: Alosa, فلس, آنالیز موجک, آنالیز فوریه, دریای خزر}
    Sara Saffari, Hadi Poorbagher*, Soheil Eagderi, Hamid Farahmand

    The species of the genus Alosa are very similar to each other in terms of morphology and cannot be identified easily. The present study used geometric morphometric techniques based on outline techniques on scales of the genus Alosa in the southern Caspian Sea, as the simple methods to identify fishes, on the specimens collected in the Southern Caspian Sea, i.e. Parehsar, Anzali, Roodsar and Tonekabon. Three species were found among the samples, i.e. A. braschnikowi, A. caspia and A. kessleri. Some scales from the ventral part of the body (keel) were removed and photographed. The wavelet analysis was performed using shapeR in the software R and canonical principal coordinate analysis were then applied on the scores produced by the wavelet analysis. Also, a Fourier analysis was performed on the outline of the scales followed by pairwise T2 Hotelling tests on the coefficients of the Fourier analysis. Our results indicated that there was a significant difference between A. braschnikowi and A. caspia in shape of the scales.

    Keywords: Alosa, Scale, wavelet analysis, Fourier analysis, Caspian Sea}
  • اسفندیار نجفی حاجیپور*، سید ولی حسینی، حمید فرحمند، باقر مجازی امیری، مهدی سلطانی

    ماهیان قزل آلای رنگین کمان در قالب طرح کاملا تصادفی (شش تیمار و سه تکرار) توسط خوراک حاوی روغن تازه ی ماهی کیلکا و 50 میلی گرم ویتامین E در کیلوگرم 1)بدون (تیمار شاهد A، FO50) یا 2)با پروتئین هیدرولیز (4 درصد جایگزین پودر ماهی) (تیمار B، FO50HP)، 50 میلی گرم ویتامین E در کیلوگرم و روغن اکسید شده 3)بدون (تیمار C، OO50) و 4)با پروتئین هیدرولیز (تیمار D، OO50HP)، 250 میلی گرم ویتامین E در کیلوگرم و روغن اکسید شده 5)بدون (تیمار E، OO250) یا 6)با پروتئین هیدرولیز (تیمار F، OO250HP) به مدت هشت هفته تغذیه شدند. پایین ترین و بالاترین FCR در تیمارهای B و E حاصل شد (05/0 >P). مقادیر دیگر شاخص های رشد در تیمارهای A و B  بیش از دیگر تیمارها بودند (05/0 >P). بالا ترین و پایین ترین میزان آلانین آمینو ترانسفراز (ALT) به ترتیب در تیمار C و تیمارهای A و B (05/0 >P)، بالاترین و پایین ترین میزان آسپارتات آمینو ترانسفراز (AST) به ترتیب در تیمارهای C و D و تیمار B (05/0 >P) مشاهده شد. بیشترین درصد نوتروفیل ها (Nut) و کمترین درصد لنفوسیت ها (Lym) در تیمار E و عکس آن در تیمار C حاصل شد (05/0 >P). بالاترین میزان فاگوسیتوز در تیمارهای C و D و پایین ترین آن در تیمار A ایجاد شد (05/0 >P). بیشترین مقداراسید چرب غیر اشباع 9-n1 :14 (5- سیس- اسید تترادسنوییک) فیله در تیمار F و کمترین مقدار در تیمار B بود (05/0 >P). بالاترین میزان 18:0 (اسید استیاریک) فیله در تیمار A و پایین ترین میزان در تیمار D بود(05/0 >P). بیشترین مقدار 6-n4 :20 فیله (اسید آراشیدونیک) در تیمار D و کمترین مقدار در تیمار F بود (05/0 >P). طبق نتایج این پژوهش، ویتامین E (50 میلی گرم در کیلوگرم) همراه با پروتئین هیدرولیز (4 درصد جایگزین پودر ماهی) می تواند از آسیب های استرس اکسیداتیو ماهی قزل آلای رنگین کمان پرواری جلوگیری نماید.

    کلید واژگان: ماهی قزل آلای رنگین کمان, ویتامین E, پروتئین هیدرولیز, روغن اکسید شده, استرس اکسیداتیو}
    Esfandyar Najafi *, Seyed Vali Hosseini, Hamid Farahmand, Bagher Mojazi Amiri, Mahdi Soltani

    Rainbow trout fish fed one of the diets containing fresh kilka oil with 50 mg kg-1 of vitamin E 1)without (control A, FO50) or 2)with hydrolyzed protein (4% replacement for fishmeal) (treatment B, FO50HP), 50 mg kg-1 vitamin E with oxidized oil 3)without (treatment C, OO50) or 4)with hydrolyzed protein (treatment D, OO50Hp), 250 mg kg-1 vitamin E with oxidized oil 5)without (treatment E, OO250) or 6)with hydrolyzed protein (treatment F, OO250HP) in a completely randomized design (six treatments and three replications) for eight weeks. The lowest FCR was in treatment B and the highest was in treatment E (P< 0.05). The amount of other growth indices were higher (P< 0.05) in treatments A and B than other treatments. The highest and lowest concentrations of alanin amino transferase (ALT) occurred respectively in treatment C and treatments A and B (P< 0.05), the highest and lowest concentrations of aspartate amino transferase (AST) occurred in treatments C and D and treatment B (P< 0.05), respectively. The highest neutrophil (Nut) and the lowest lymphosit (Lym) percentages were in treatment E while the vise versa were observed in treatment C (P< 0.05). The phagocytosis amount was highest in treatments C and D while it was the lowest in treatment A (P< 0.05). The fillet 14: 1n-9 concentration was the highest in treatment F while it was the lowest in treatment B (P< 0.05). The fillet 18: 0 content was the highest in treatment A and the lowest in treatment D (P< 0.05). Treatment D showed the highest fillet 20: 4n- 6 content while treatment F had the lowest content (P< 0.05). Accordingly, vitamin E (50 mg kg-1 diet) with hydrolyzed protein (as a substitute for fish meal by 4%) would be able to prohibit the damages resulting from oxidative stress in growing rainbow trout.

    Keywords: Rainbow trout, vitamin E, hydrolyzed protein, oxidized oil, oxidative stress}
  • حمید فرحمند*، احمد بهمنی نژاد، امیرعابد علم دوست

    میکروآر.ان.ای توالی های کوتاه غیر کد شونده ای هستند که تنظیم بیان ژنها را در مرحله بعد از رونویسی انجام می دهند، این نوع از آر.ان.ای غیر کد شونده در تنظیم بیان 60 درصد از ژنها دخالت دارند که درآزاد ماهیان تعداد بسیار محدودی از میکرو آر.ان.ای ها شناسایی شده است. لذا در این تحقیق به منظور شناسایی ایزوفرم های مختلف میکروآر.ان.ای Let-7 در آزاد ماهیان، داده های بیوانفورماتیک موجود در NCBI مورد استفاده قرار گرفت. 43 میلیون خوانش با طول حدود 22 باز مورد بازبینی قرار گرفت که از این مقدار 8/17 میلیون با Let-7 همخوانی داشتند، 9 ایزوفرم مختلف از خانواده Let-7 شناسایی شد که 8 عدد از آنها با ایزوفرم های شناسایی شده در سایر رده های جانوری تطبق داشته است و یک ایزوفرم جدید که دارای یک باز اختلاف با ایزوفرم Let-7f در آزاد ماهی اقیانوس اطلس (Salmo salar) است نیز شناسایی شد. ایزوفرم Let-7a نیز در میان 9 ایزوفرم دارای بیشترین فراوانی بوده است. برای 9 ایزوفرم شناسایی شده تعداد 20 لوکوس بر روی کروموزوم های ژنوم مرجع (Otsh.V1) در مرکز داده های NCBI شناسایی شد و بدین طریق مشخص گردید که تعداد 7 لوکوس بر روی ژنوم به صورت خوشه های ژنی از Let-7 می باشند، 2 لوکوس دیگر نیز برای ایزوفرم Let-7c بر روی قطعاتی از ژنوم مرجع که در کروموزوم ها مکان یابی نشده بودند شناسایی شد.

    کلید واژگان: آزاد ماهیان, میکرو آر.ان.ای, بیوانفورماتیک, ایزوفرم, میکرو آر.ان.ای بالغ}
    Hamid Farahmand *, Ahmad Bahmaninejad, Amirabed Elmdoust

    MicroRNAs are short noncoding RNAs that control gene expression in post-transcriptionally manner, estimated about 60% of all genes controlled by these RNAs. Among vertebrates in Salmonids this type of RNA poorly investigated. In this study for profiling isoforms of Let-7 MicroRNA of Salmonids, the data from NCBI database was extracted and analyzed. About 43 million reads with 22 nucleotides span were analyzed. Among them, 17.8 million reads were matched to to Let-7a isomer of this MicroRNA family. 9 Isoforms of this family detected in which 8 of them were detected before in other animals. One of detected isoforms was novel and not reported in other species. The novel isolated isoform in this study contains one nucleotide difference with Let-7f in Atlantic salmon (salmo salar). let-7a isomer abundantly expressed comparing with others. 20 loci for all isomers were on reference genome (Otsh.V1) in NCBI, and 7 of these loci organized as MicroRNA gene clusters in genome. The other 2 loci for Let-7c were detected on unplaced fragments of reference genome as well.

    Keywords: Salmonids, MicroRNA, Bioinformatics, let-7, isoform}
  • علیرضا نیسی، غلامرضا رفیعی*، حمید فرحمند، شادی رحیمی، ایوان میاکوویچ
    باکتری های تجزیه کننده آمونیاک و نیتریت می توانند منجر به افزایش کارایی سیستم مدار بسته پرورش ماهی گردند. باکتری های هتروترف تجزیه کننده آمونیاک و نیتریت در کنار گونه های اتوتروف از اهمیت زیادی برخوردارند. هدف از انجام این پژوهش، بررسی استفاده از دو سویه باکتری تجزیه کننده آمونیاک  Dyadobacter sp .(no. 68) و نیتریت Janthinobacterium sp.(no. 100) در سیستم پرورش قزل آلای رنگین کمان بود. این دو نوع باکتری با رقت  109×8cfu  (A) در میلی لیتر به میزان 1000 میلی لیتر به مخازن 400 لیتری حاوی 50 قطعه قزل آلای رنگین کمان 3/89±50/65 گرمی منتقل شدند، یک تیمار نیز به عنوان گروه شاهد (C) درنظر گرفته شد (تعداد=3). پس از 10 روز شاخص های خون شناسی و کیفی آب در سیستم پرورشی ماهی قزل آلای رنگین کمان مورد بررسی قرار گرفت. نتایج نشان داد میزان غلظت آمونیاک غیریونیزه در گروه آزمایشی حاوی این دو نوع باکتری کم تر و نیتریت و نیترات در این گروه بیش تر از گروه شاهد بود. هم چنین شاخص های خون   شناسی در گروه A نسبت به شروع آزمایش، تغییرات زیادی نداشت، این درحالی بود که در گروه شاهد شاخص های خون شناسی کاهش یافت. با توجه به آزمایش های اخیر نتیجه گیری می شود می توان از باکتری Dyadobacter sp. (no. 68) و  Janthinobacterium sp. (no.100)جهت کاهش آمونیاک غیریونیزه و نیتریت در سیستم پرورش قزل آلای رنگین کمان استفاده کرد. هم چنین این سویه ها با توجه به کاهش آمونیاک غیریونیزه و نیتریت در محیط پرورشی قزل آلای رنگین کمان می تواند منجر به افزایش بازده پرورشی با بهبود کیفیت محیط پرورشی با تاثیر روی شرایط فیزیولوژیک ماهی قزل آلای رنگین کمان شوند.
    کلید واژگان: قزل آلای رنگین کمان (Oncorhynchus mykiss), شاخص های خون شناسی, Dyadobacter sp. (no. 68), آمونیاک غیریونیزه, Janthinobacterium sp. (no. 100), نیتریت}
    Alireza Neissi, Gholamreza Rafiee *, Hamid Farahmand, Shadi Rahimi, Ivan Mijakovic
    Targeted use of ammonia and nitrite degrading bacteria could increase the efficiency of the closed recirculating fish culture systems. Ammonia and nitrite assimilation by heterotrophic bacteria are important along with autotrophic species. The purpose of this study was to investigate the use of two strains of nitrifying bacteria Dyadobacter sp. (no. 68) and of Janthinobacterium sp. (no. 100) in the rainbow trout breeding system. These two types of bacteria with a dilution of 8×109 cfu (A) in a 1000 ml container transferred into 400 liter fish or experimental tanks containing 50 pieces Trout 50.65±3.89 g, also one treatment was considered as control group [n=3] (C). After 10 days, hematological and qualitative indices of water in rainbow trout were investigated. The results showed that the concentration of ammonia in the experimental group containing these two types of bacteria was lower and the nitrite and nitrate in this group were higher than the control group. The hematological indices in the control group did not show any significant changes from baseline, whereas in the control group hematological indices decreased. It was concluded that Dyadobacter sp. (no. 68), Janthinobacterium sp. (No. 100) were usable to assimilate ammonia and nitrite in the rainbow trout system. Finally, it can be concluded that the use of these two strains could have a positive effect on improving the quality of the environment and consequently on physiological conditions in the rainbow trout system.
    Keywords: Rainbow Trout (Oncorhynchus Mykiss), Dyadobacter sp. (no. 68), Janthinobacterium sp. (no. 100), Hematological indicators, ammonium, nitrite}
  • نسرین نیک مهر، سهیل ایگدری*، هادی پورباقر، حمید فرحمند

    مطالعه حاضر با هدف بررسی وضعیت آرایه شناختی جمعیت جنس Turcinoemacheilus رودخانه گاوه ر ود از حوضه تیگریس براساس ژن زیر واحد 1 سیتوکروم اکسیداز (COI) و ریخت شناسی آن در سال 1395 به اجرا درآمد، چراکه ویژگی های ریختی شامل ریخت سنجی و الگوی رنگی این جمعیت کاملا متفاوت از سایر جمعیت های گزارش شده این جنس در حوضه تیگریس بود. برای این منظور پس از نمونه برداری، DNA نمونه ها به روش فنل-کلروفرم استخراج و ژن سیتوکروم COI طی فرآیند PCR تکثیر و پس از خالص سازی توالی یابی شد. بر اساس نتایج نمونه های رودخانه گاوه رود در درخت تبارزایی ترسیم شده با سایر جمعیت های گونه Turcinoemacheilus kosswigi با فاصله ژنتیکی 61/0 درصد در یک کلاد قرار گرفتند. به علاوه این جمعیت T. kosswigi  تفاوت ریختی مشهودی را با سایر جمعیت های آن نشان داد و به واسطه داشتن باله دمی بریده و صاف (در مقابل کمی فرورفته بودن)، فقدان لکه سیاه پررنگ در قاعده باله پشتی و تجمع وجود لکه های ملانوفور در محل اتصال باله دمی قابل تشخیص می باشد.

    کلید واژگان: تبارشناسی, تیگریس, تنوع ریختی, جویبارماهی, توالی میتوکندریایی}
    Nasrin Nikmehr, Soheil Eagderi*, Hadi Poorbagher, Hamid Farahmand

    This conducted to study the taxonomic status of the Turcinoemacheilus populations from the Gaveh River drainage, a part of the Tigris River basin, sampled in 2016, using the COI gene and morphometric characters, since provided morphological and colouration feature could not resolve its identification. For this purpose, after sampling DNA of specimens were extracted using phenol-chloroform method, their COI gene were amplified by thermal cycler and sequenced after purifications. Based on the results, the members of the Turcinoemacheilus populations from the Gaveh River clustered with T. kosswigi with 0.61% genetic divergance. In addition, this population revealed remarkable morphological differences with other populations of this species and can be distinguished by having almost truncate (versus little emarginate), absence of black spot on the base of the dorsal fin and accumulation of melanophore spots at the base of caudal fin.

    Keywords: Phylogeny, Tigris, Morphological diversity, Loach, Mitochondrial sequencing}
  • سمیرا ناظم رعایا، محمدعلی نعمت اللهی*، راضیه یزدانپرست، حمید فرحمند، آناهیتا رضایی

    هدف این مطالعه، بررسی فعالیت پروتیازهای مهم (پپسین، تریپسین)، بیان نسبی ژن پپسینوژن و همچنین تکامل بافتی لوله گوارش در لارو ماهی صبیتی از زمان تفریخ تا ابتدای دوره نوجوانی (40 روز پس از تفریخ) بود. نتایج نشان داد که بخش برون ریز لوزالمعده حاوی گرانول های آنزیم ساز در خلال جذب کیسه زرده مشخص است و در روز 14 پس از تخم گشایی بسیار توسعه می یابد. پیدایش زودهنگام فعالیت تریپسین پیش از باز شدن دهان، به فرآیندی با برنامه ریزی ژنتیکی نسبت داده شد. فعالیت تریپسین الگویی نوسانی (با دو پیک در روزهای 16 و 30 پس از تفریخ) نشان داد که این نوسان همزمان با بلع غذا و در پاسخ به تغییر جیره در خلال تغذیه لارو بود. قابل توجه ترین تمایز در لوله گوارش تشکیل معده اولیه احاطه شده با سلول های عضلانی مخطط و ایجاد غدد معدی در روز 12 پس از تخم گشایی بود. معده در روز 25 به شکل کامل با تبدیل سلول های ماهیچه ای مخطط به صاف تکوین یافته بود. بیان نسبی ژن پپسینوژن تا پیش از روز 12 پس از تفریخ قابل تشخیص نبود و به شکل معنی داری از روز 14 پس از تفریخ مشخص گردید. فعالیت آنزیم پپسین همراستا با بیان ژن پپسینوژن بود و دو روز پس از آغاز بیان ژن پپسینوژن، مشخص گردید و پس از جایگزینی غذای زنده با غذای خشک (بین روزهای 25 تا 30 پس از تفریخ) تا انتهای دوره آزمایش به شدت افزایش داشت. نتایج نشان داد که با پیدایش معده اولیه از روز 12 ام پس از تخم گشایی، با بیان زودهنگام ژن پپسینوژن و نیز تکامل آنتوژنتیک زودهنگام پپسین و تریپسین، می توان در لارو ماهی صبیتی پیش از روز 25 ام پس از تخم گشایی، لارو ها را با غذای خشک تغذیه کرد و بدین طریق امکان کاهش مصرف غذای زنده با بکار گیری غذای خشک وجود دارد.

    کلید واژگان: فعالیت آنزیم, بیان ژن, بافت شناسی, تکامل لاروی, شانک ماهیان}
    Samira Nazemroaya, MohammadAli Nematollahi *, Razieh Yazdanparast, Hamid Farahmand, Annahita Rezaie

    This study aims to assay the main protease (pepsin and trypsin) activity and pepsinogen relative gene expression, as well as histological development of digestive tract in Sobaity from hatching up to 40 days post- hatch (DPH). The results showed that exocrine pancreas, including zymogen granules, differentiated during yolk sac absorption and further developed at 14 DPH. The early appearance of trypsin before mouth opening is attributed to a genetically programmed process. The trypsin activity showed fluctuated pattern (with two peaks at 16 and 30 DPH), coincident with food intake, and related to diet shifting during larval feeding. The most obvious differentiation in the digestive tract was the formation of an incipient stomach surrounded by striated muscle fibers and the development of the gastric glands at 12 DPH. The stomach fully developed at 25 DPH with the transition from striated to smooth muscle cells. The pepsinogen relative gene expression was not detectable before 12 DPH and meaningfully detected at 14 DPH. The pepsinogen expression augmented exponentially coinciding with shifting diet from live to microdiet. Pepsin activity trend was considerably parallel to pepsinogen and started two days after pepsinogen, subsequently increased sharply during the weaning period (25-30 DPH) up to the end of the study. The study concluded that the appearance of the incipient stomach at 12 DPH, early pepsinogen expression, and ontogenetic development of pepsin and trypsin, make it possible to feed Sobaity larvae by inert diet before 25 DPH to reduce the live food consumption and improve the weaning efficiency.

    Keywords: Enzyme activity, gene expression, Histology, larval development, Sparidae}
  • زهره سعیدی، علیرضا میرواقفی*، امیررضا عابد علم دوست، حمید فرحمند، رقیه صفری

    به منظور افزایش شناخت اثرات پروبیوتیک ها بر شاخص های تولیدمثلی ماهی زبرا (Danio rerio)، این تحقیق به بررسی تاثیرات سطوح متفاوت پروبیوتیک Lactobacillus plantarum بر روند تکامل گناد و رسیدگی جنسی در ماهی زبرا پرداخته است. بدین منظور، تعداد720 ماهی زبرا در چهار تیمار با جیره های آزمایشی (0%، 5/0%، 5/1% و 3% پروبیوتیک) به مدت 40 روز تغذیه شدند. براساس اندازه گیری شاخص های تولیدمثلی در این گونه، بالاترین میزان هماوری مطلق در تیمار تغذیه شده با جیره حاوی 3% پروبیوتیک مشاهده شد که این میزان دارای تفاوت معنی داری را نسبت به تیمار شاهد و نیز تیمار تغذیه شده با جیره حاوی 5/0% پروبیوتیک بود. بر مبنای شاخص هماوری نسبی، تیمار شاهد پایین ترین میزان هماوری را نسبت به سایر تیمارها نشان داد. داده های حاصل از شاخص گنادوسوماتیک در بین تیمارها نشان دهنده بالاترین میزان شاخص گنادی در تیمار تغذیه شده با جیره حاوی 3% پروبیوتیک نسبت به سایر تیمارها بود که نسبت به تیمار شاهد و تیمار تغذیه شده با جیره حاوی 5/0% پروبیوتیک معنی دار بود اما نسبت به تیمار تغذیه شده با جیره حاوی 5/1% پروبیوتیک تفاوت معنی داری نشان نداد. همچنین بررسی های هیستولوژیک گناد در جنس نر و ماده نشان دهنده تکامل گنادها و رسیدگی کامل جنسی در تیمارهای تغذیه شده با سطوح 3% و 5/1% پروبیوتیک بود. تحقیق حاضر نشان دهنده این امر می باشد که استفاده از پروبیوتیک Lactobacillus plantarum در سطح 3 درصد بهترین تاثیرگذاری را بر شاخص های تولیدمثلی و تکامل گنادی در مولدین ماهی زبرا دارد.

    کلید واژگان: پروبیوتیک, لاکتوباسیلوس پلانتاروم, هماوری, شاخص گنادوسوماتیک, ماهی زبرا}
    Zohreh Saeidi, Alireza Mirvaghefi*, Amirreza Elmdoust, Hamid Farahmand, Roghayeh Safari

    In order to increase the knowledge of the probiotic effects on reproductive indices of fish, this study was conducted to investigate the effects of different levels of probiotic Lactobacillus plantarum on gonadal development and sexual maturation in zebrafish (Danio rerio). Some 720 zebrafish were fed the experimental diets in four treatments such as: 0%, 0.5%, 1.5% and 3% probiotic diets for 40 days. Based on the measurement of reproductive indices in this species, the maximum absolute fecundity was observed in the diet containing 3% probiotic, which was significantly different from the control treatment and the diet containing 0.5% probiotic. Based on relative fecundity index, the control treatment showed the lowest fecundity rate compared to the other treatments. The gonadosomatic index data showed the utmost gonadal index in the diet containing 3% probiotic compared to the other treatments, which was significantly higher than the control and 0.5% probiotic treated diets, but it did not show any significant difference with the diet fed 1.5% probiotic. Histological examination of gonads in males and females showed gonads development and complete sexual maturity in treatments fed 3% and 1.5% probiotic levels. The present study indicates that probiotic Lactobacillus plantarum at 3% level will have the best effect on reproductive and gonadal development parameters in zebrafish.

    Keywords: Probiotic, Lactobacillus plantarum, Fecundity, Gonadosomatic index, Danio rerio}
  • احمد سبحانی نجف آبادی، محمدرضا نقوی*، حمید فرحمند، علیرضا عباسی

    گیاه باریجه با نام علمی Ferula gummosa Boiss، از تیره چتریان بومی مناطق شرق و غرب ایران است. گیاه باریجه به دلیل داشتن قابلیت استحصال شیرابه ای با ارزش دارویی و صنعتی، بسیار مورد توجه است. اگر چه این شیرابه از حیث صادرات گیاهان دارویی مرتعی ایران در رتبه اول قرار دارد و خواص دارویی و کاربردهای صنعتی فراوانی دارد اما اطلاعات اندکی در زمینه مکانیسمهای بیوشیمیایی و ژنتیکی تولید این ترکیبات وجود دارد. در حال حاضر تکنیک RNA-Seq جزو پرکاربردترین و دقیقترین روش های ترانسکریپتومیکس به شمار می رود. در تحقیق حاضر جهت ارزیابی ترانسکریپتوم باریجه از روش RNA-seq برای دو اندام ریشه و گل استفاده گردید. خوانشهای بدست آمده از دستگاه Illumina HiSeq2000 پس از تعیین کیفیت، با نرم افزار Trinity مونتاژ و سپس از نظر عملکرد مورد ارزیابی قرار گرفتند. ترانسکریپتوم حاصله دارای 158436 ترانسکریپت با N50 برابر با 1348 نوکلیوتید بود که پس از بلاست با دیتابیسهای مختلف 100275 ترانسکریپت از نظر عملکردی تفسیر شدند. ارزیابی نتایج بلاست nr از نظر هستی شناسی ژنها منجر به شناسایی 73678 ترانسکریپت دارای حداقل یک GO گردید که از بین آنها از نظر فرایندهای زیستی، فرایندهای سلولی و متابولیکی بیشترین GOها را به خود اختصاص دادند که این حالت نشان دهنده وضعیت فعال متابولیکی گیاه میباشد. ارزیابی ترانسکریپتوم از نظر ژنهای ارتولوگ منجر به شناسایی 42452 ژن از 3925 خانواده عملکردی در 26 کلاس کلی گردید. کلاس متابولیت های ثانویه، انتقال و کاتابولیسم با فراوانی 25/4 درصد از جمله فعالترین کلاسهای عملکردی در گل و ریشه باریجه میباشند.

    کلید واژگان: گیاهان دارویی, توالی یابی, متابولیتهای ثانویه, فرایندهای زیستی}
    Ahmad Sobhani Najafabadi, Mohammadreza Naghavi *, Hamid Farahmand, Ali Reza Abbasi

    Ferula gummosa Boiss from the Apiaceae family is native to East and West of Iran. Galbanum is an oleo-gum-resin with high pharmaceutical and industrial values, which is exuded from F. gummosa in response to wounds. Although galbanum ranks first in terms of Iranian export of pasture medicinal plants, but little information on the genetic and biochemical mechanisms of these compounds are existed. RNA-Seq techniques are now one of the most used and most accurate methods in transcriptomics. In the present study, RNA-Seq was used to evaluate the root and flower of F. gummosa transcriptome. Short reads obtained from Illumina HiSeq2000 were assembled by Trinity. The assembled transcriptome with 158,436 transcripts and N50 1,348 bp was annotated using different databases. In total, 100,275 transcripts were annotated using BLASTX with an E-value cut-off of 10-5. Gene ontology (GO) classification of annotated transcripts was done by Blast2Go and Trinotate pipeline and in total 73,678 transcripts with at least one GO were identified. In terms of biological processes, cellular and metabolic processes are the most GO terms indicated that the plant is in a metabolically active status. Transcriptome assessment of orthologous genes by NCBI-KOG database led to the identification of 42,452 genes from 3,925 families and 26 functional classes. The largest class of orthologous genes was associated with signal transduction mechanisms , followed by other classes such as secondary metabolites-transport and catabolism with a frequency of 4.25 % indicating an active status of F. gummosa roots and flowers for secondary metabolite production and transportation.

    Keywords: medicinal plants, sequencing, secondary metabolites, Biological processes}
  • نسرین نیک مهر، سهیل ایگدری*، هادی پورباقر، حمید فرحمند

    این پژوهش به منظور بررسی تبارزایی اعضای جنس Turcinoemacheilus براساس صفات استخوان شناسی در ایران انجام شد. درمجموع 25 قطعه ماهی از چهار گونه جنس Turcinoemacheilus در دو حوضه تیگریس و اصفهان در جایگاه درون گروه و گونه Cobitis linea در جایگاه برون گروه در نظر گرفته شد. اجزای اسکلتی نمونه ها پس از شفاف سازی و رنگ آمیزی بررسی شد. درمجموع 19 حالت صفت نشان دهنده تغییرات درون آرایه های مطالعه شده، توصیف شد. آنالیز تبارزایی با استفاده از صفات استخوانی برپایه روش بیشینه پارسیمونی انجام شد. طبق نتایج، پارسیمونی ترین درخت با طول درخت معادل 29، شاخص ثبات یک (1=CI) و شاخص بقای یک (1=RI) به دست آمد. گونه های T. hafezi و T. bahaii با پشتیبانی 76 درصد در یک گروه خواهری و دو گونه T. kosswigi و T. saadii با پشتیبانی 97 درصد در کلاد دیگر قرار گرفتند. وجود ملاج جانبی در T. hafezi، هم پوشانی دیواره جانبی داخلی خودکامی با دیواره جانبی خلفی استخوان ومر، تقارن در بخش خلفی استخوان خودکامی و واگرایی زایده های عصبی خونی نسبت به هم در T. kosswigi، نسبت برابر طول زایده بالارونده به زایده افقی در استخوان پیش فکی و رسیدن اولین پتریگیوفور باله پشتی به مهره 17 در T. bahaii ازجمله صفات استخوانی متمایزکننده در بین گونه های مطالعه شده است.

    کلید واژگان: تیگریس, روابط تبارزایی, صفات استخوان شناسی, Turcinoemacheilus}
    Nasrin Nikmehr, Soheil Eagderi *, Hadi Poorbagher, Hamid Farahmand

     This study was conducted to examine the phylogenetic relationship of the genus Turcinoemacheilus in Iran based on osteological characteristics. A total of 25 fish specimens of four species belonging to the genus Turcinoemacheilus from Tigris and Isfahan basins were considered as in-group and Cobitis linea as out-group. The skeletal elements were examined after clearing and staining. A total of 19 character-states were described that showed differences between the studied taxa. Phylogenetic analysis was performed using osteological characters with the maximum parsimony method. Based on the results, the most parsimonious tree with a length of 29, the consistency index of 1, and a retention index of 1 was obtained. Turcinoemacheilus hafezi and T. bahaii with 76% support were in a sister group and the two species of T. kosswigi and T. saadii with 97% support were in another clad. The presence of the lateral fontanel in T. hafezi, the overlap of the internal lateral-wall of autoplatinii with posterior lateral-wall of the ethmoid, symmetry of the posterior part of the autoplatinii and divergence of the hemal spin’s process in T. kosswigi, ratio of the ascending process to the horizontal process of the maxillary, and beginning of the first dorsal-fin petrigiophore to vertebra 17 in T. bahaii were distinguishing osteological characters of the studied species.

    Keywords: Tigris, Phylogenetic Relationships, Osteological Traits, Turcinoemacheilus}
  • کبری رحیمی، حمید فرحمند*، علیرضا میرواقفی، باقر مجازی امیری، امیر رضا علبد علم دوست
    تی ال آر5 ام (TLR5m) یکی از اعضای خانواده پروتئین های گیرنده های تول شکل است که در سیستم ایمنی، فلاژلین موجود در ساختار اندام تحرکی بسیاری از پاتوژن ها را تشخیص داده و منجر به فعالسازی ایمنی اولیه و اکتسابی می شود. وجود چندشکلی تک نوکلئوتیدی (SNP) در این ژن در افراد مختلف می تواند منجر به تفاوت در نحوه پاسخ دهی ایمنی به پاتوژن ها گردد. در این مطالعه بخشی از ژن تی ال آر 5 ام ماهی قزل آلای رنگین کمان (Oncorhynchus mykiss) با استفاده از روش واکنش زنجیره ایی پلیمراز و توالی یابی و انطباق توالی ها مورد بررسی قرار گرفت و شش چند شکلی شامل سه تفاوت تک نوکلئوتیدی (2412 T/A)، (2415 T/A)، (2385 G/A) و سه چندشکلی حذف و اضافه (حذف/اضافه C،C/T 2091)، (حذف/اضافه T 2566)، (حذف/اضافه C 2102) در توالی این ژن شناسایی شد. برای بررسی ارتباط بین این چندشکلی ها با نحوه پاسخ دهی ایمنی در ماهی قزل آلای رنگین کمان، چالش با باکتریAeromonas  هیدروفیلا (Aeromonas hydrophila)  بصورت درون صفاقی ترتیب داده شد و پارامترهای خونی شامل میزان فعالیت جزء سی سیستم کمپلمان، میزان لیزوزیم، میزان هماتوکریت، هموگلوبین، ام سی اچ سی (MCHC)، ام سی وی (MCV) و ام سی اچ سی (MCHC) مورد اندازه گیری قرار گرفت. نتایج حاصل از بررسی ارتباط بین پارامترهای خونی و چندشکلی های شناسایی شده نشان دادکه وجود دو چندشکلی (حذف/اضافه C،C/T 2091) و (حذف/اضافه T 2566) با میزان بالاتر فعالیت جزء سی کمپلمان در افراد مورد آزمون، همبستگی معنادار نشان می دهد. با توجه به نتایج بدست آمده می توان پیشنهاد داد که چندشکلی (حذف/اضافه C،C/T 2091) و نیزحذف/اضافه T 2566 می توانند بعنوان نشانگر های ژنتیکی در انتخاب مولدین مقاوم در برابر باکتری Aeromonas، در برنامه های به گزینی مولدین، بکار روند .
    کلید واژگان: قزل آلای رنگین کمان, Aeromonas hydrophila, چندشکلی تک نوکلئوتیدی, گیرنده های تول شکل}
    Kobra Rahimi, Hamid Farahmand *, Alireza Mirvaghefi, Bagher Mojazi Amiri, Amir Reza Abed Elmdost
    Toll-like receptors (TLRs) generally are involved in host immune responses against microbial invasions. Mono meric felagellin, the structure component of bacterial felagella is the agonist of TLR5m. After binding to felagellin, TLR5m initiates specific signal transduction pathways and triggers immune responses. Single nucleotide polymorphisms (SNPs) in this gene regulate inflammatory pathways and are associated with susceptibility/resistance to infection. In this study using polymerase chain reaction, sequencing and aligning the sequences, we investigated TLR5m gene of Rainbow Trout (Oncorhynchus mykiss) and identified 6 polymorphisms consist in 3 SNPs: (2412, T/A), (2415,T/A) and (2385, G/A) and 3 insert/deletion: (inser/dele. C, C/T, 2091), (inser/dele. T, 2566) and (inser/dele. C, 2102). A bacterial challenge was performed to explore their association with humoral immune responses such as lysozym content and complement activity levels in serum. The results show that polymorphisms (inser/dele. C, C/T, 2091) and (inserldele. T, 2566) were significantly correlated with higher complement activity levels (p<0.05).These results suggested that these 2 polymorphisms could be potential markers applied in future selection of Rainbow Trout with enhanced resistance to Aeromonas hydrophila.
    Keywords: single nucleotide polymorphism (SNP), Toll-like receptor (TLR), Oncorhynchus mykiss, Aeromonas hydrophila, Complement, Lysozyme}
  • لیما طیبی *، هادی پورباقر، حمید فرحمند
    این مطالعه با هدف بررسی تنوع ژنتیکی جنس Epeorus در طول رودخانه گاماسیاب انجام شد. نمونه برداری از Epeorusها از چهار ایستگاه به ترتیب از سرچشمه رودخانه به سمت پایین با فاصله حدود 500 متر از یکدیگر، در چهار فصل سال و با سه تکرار از قسمت های جانبی و وسط رودخانه توسط نمونه بردار سوربر صورت گرفت. پس از جداسازی و فیکس Epeorusها، مراحل استخراج DNA انجام و کیفیت آن ها روی ژل الکتروفورز بررسی شد. سپس تکثیر ژن مورد مطالعه (سیتوکروم اکسیداز-1) با استفاده از آغازگرهای مشخص انجام شد و محصولات PCR توالی یابی شد. هم ردیف سازی، بررسی و مقایسه توالی ها با نرم افزار MEGA 6 صورت گرفت. بررسی های مولکولی حاکی از آن بود که کاهش تنوع ژنتیکی در ایستگاه شماره 2 که در معرض آلودگی پساب کارگاه تکثیر و پرورش ماهی قرار داشت به ویژه در فصولی که رودخانه با کاهش دبی آب مواجه شده بود، مشهود است.
    کلید واژگان: تنوع ژنتیکی, توالی یابی, رودخانه گاماسیاب, Epeorus, سیتوکروم اکسیداز-1}
    Lima Tayebi*, Hadi Poorbagher, Hamid Farahmand
    This study was conducted to determine the profile of Epeorus genetic diversity along the Gamasiab River. The sampling was done from four stations ranged source of the river downward, about 500 meters from each other, in four seasons with three replications from the middle and riverside of the river by the Surber sampler. After isolation and fixation of the Epeorus, the DNA extraction steps were performed and the quality of DNA was investigated on the electrophoresis gel. After gene amplification using specific cytochrome oxidase subunit I (COI) primers, PCR products were sequenced. Sequencing was performed with MEGA 6 software. Molecular investigations indicated that the reduction of genetic diversity at station 2 exposed to wastewater and trout farm effluents, especially in the seasons which are associated with decreasing water charge.
    Keywords: Geneti diversity, Epeourus sp, Sequensing, Gamasiab River, Effluents}
  • منوچهر نصری، سهیل ایگدری*، حمید فرحمند، حسن نژادحیدری
    تغییرات ریختی در بین گونه های جنس Cyprinion ایران با استفاده از روش ریخت سنجی هندسی لندمارک پایه مورد مطالعه قرار گرفت. نمونه های مورد مطالعه طی شهریور 1392 تا شهریور 1394 از پنج حوضه آبریز ایران صید شدند. تعداد 15 لندمارک بر روی تصاویر دوبعدی ماهی ها تعریف و رقومی شد. علاوه بر تفاوت های ریختی درون گونه ای، آزمون CVA تمامی جمعیت های مورد مطالعه را در سه گروه اصلی دسته بندی کرد شامل: C. macrostomum ، C. kais و C. tenuiradius (گروه X ،) C. watsoni و C. microphthalmum (گروه Y ) و C. milesi (گروه Z ). بر اساس نتایج، گروه C. macrostomum را میتوان بر اساس داشتن عمق بدن بیشتر، کمترین طول و ارتفاع سر، بیشترین طول قاعده باله پشتی و کمترین طول ساقه دمی از دو گروه دیگر تشخیص داد. C. milesi دارای بیشترین طول قاعده باله مخرجی، کمترین ارتفاع بدن، بیشترین ارتفاع ساقه دمی و بیشترین طول سر است. Cyprinion watsoni دارای بیشترین طول ساقه دمی و کمترین طول قاعده باله پشتی است و C. microphthalmum را می توان بر اساس کمترین طول و ارتفاع ساقه دمی از سایرین متمایز کرد. مهمترین علت وجود تفاوت های ریختی درون گونه ای را می توان انعطاف پذیری ریختی مرتبط با عوامل جغرافیای جانوری و اقلیمی دانست. نتایج پیشنهاد می کنند که محتمل ترین عامل موثر بر تنوع ریختی در بین گونه های Cyprinion ایران، تفاوت های مرتبط با خصوصیات زیستگاهی است.
    کلید واژگان: کپورماهیان, پراکنش ماهیان, آب شیرین, انعطاف پذیری ریختی, جغرافیای جانوری}
    Manoochehr NASRI, Soheil EAGDERI *, Hamid FARAHMAND, Hasan NEZHADHEYDARI
    Morphological variation among Cyprinion species in Iran was studied using landmark-based geometric morphometrics. A total of 848 specimens were caught from five basins throughout Iran during 2013-2015. A total number of 15 landmark-points were defined and digitized on 2D pictures. Despite of intraspecific differences among Cyprinion fishes, CVA divided all populations into three major groups viz. C. macrostomum, C. kais and C. tenuiradius (group X), C. watsoni and C. microphthalmum (group Y) and C. milesi (group Z). According to the results, C. macrostomum group can be distinguished from other groups by having deeper body, least head length and depth, the longest dorsal-fin base and least caudal peduncle length. Cyprinion milesi has the longest anal-fin base, least body depth, deepest caudal peduncle and longest head. Cyprinion watsoni has the longest caudal peduncle and least dorsal-fin base and C. microphthalmum is distinguished by having the least caudal peduncle length and depth. The main reasons of observed intraspecies morphological diversity among the fishes is proposed to be some phenotypic plasticity related to climatic and zoogeographical factors. The results suggest that the most possible factor influencing morphological variations among Iranian Cyprinion species is habitat related differences.
    Keywords: Cyprinidae, Fish distribution, Freshwater, Phenotypic plasticity, Zoogeography}
  • احمد بهمنی نژاد، حمید فرحمند*، سهیل ایگدری، امیررضا عابدعلم دوست
    مارماهی دهان گرد خزری (Caspiomyzon wagneri) گونه ی بومی دریای خزر، به دلیل تخریب زیستگاه ها در معرض تهدید قرار گرفته است. مطالعه حاضر به منظور بررسی امکان تفکیک جمعیتی دو گروه مهاجران مارماهی دهان گرد خزری پاییزه و بهاره به رودخانه شیرود به واسطه فاصله ی زمانی با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره به اجرا درآمد. برای این منظور از مارماهی دهان گرد خزری در حال مهاجرت تولیدمثلی در دو فصل پاییز و بهار در محل پایه ی پل رودخانه ی شیرود انجام شد. پس از استخراج DNA از 46 قطعه ماهی، از 4 جفت آغازگر در واکنش زنجیره ای پلیمراز برای تکثیر انتخابی استفاده شد. در این مطالعه در مجموع 3 آلل اختصاصی شناسایی شد که یک عدد مربوط به جمعیت پاییزه در لوکوس Lun3 و دو عدد متعلق به جمعیت بهاره در لوکوس Lun5 بود. نتایج نشان داد که اختلاف ژنتیکی معنی داری بین دو جمعیت مهاجران بهاره و پاییزه وجود ندارد و شاخص های فاصله ژنتیکی Fst (0/076) و نای (0/206) نشان می دهد که این دو گروه مهاجر زمانی به یک جمعیت واحد تعلق دارند. از این رو می توان نتیجه گرفت که نرخ وفاداری به زیستگاه در دهان گرد خزری بسیار پایین است و این موضوع مانع از تشکیل شدن جمعیت ها می شود.
    کلید واژگان: دهان گرد خزری, تولیدمثل, نشانگرهای ریزماهواره, مهاجرت}
    Ahmad Bahmaninejad, Hamid Farahmand *, Soheil Eagderi, Amirreza Abed Elmdoust
    Caspian lamprey (Caspiomyzon wagneri), a native species of the Caspian Sea, is under threatened by destruction of its habitats. The present study was carried out to investigate the possibility of separation between fall and spring run populations of Caspian lamprey in Shirud River due to different migration time using microsatellite markers. For this purpose, Caspian lampreys were sampled in fall and spring during their reproductive migrations at the Shirud River Bridge. After extraction of DNA from 46 fish, 4 primer pairs were used for polymerase chain reaction for selective proliferation. In this study, a total of 3 specific alleles were identified, one for fall autumn population in Locus Lun3 and two others for spring population in Lun5. The results showed no significant difference between the fall and spring immigrant populations, and the genetic distances of Fst (0.76) and Nei (0.206) indicated they belong to one population Units. Therefore, it can be concluded that the rate of homing behavior in the Caspian lamprey is very low preventing the formation of a separate populations.
    Keywords: Caspian Lamprey, Reproduction, Microsatellite markers, migration}
  • فاطمه پیشه ورزاد، سید ولی حسینی*، حمید فرحمند، ماریانو لاسترا، سونیا لوپز
    پیری پوست با افزایش تنظیم بیان ماتریکس متالوپروتئیناز (MMP) و کاهش تنظیم سنتز کلاژن همراه است. استرول های استخراج شده از جلبک های دریایی، به عنوان مواد ضد سرطان و ضدکسیدان گزارش شده اند که این خواص می تواند نشان از  پتانسیل مناسبی جهت خواص ضد چروک در پوست انسان باشد. در این تحقیق، جهت بررسی سنتز پروکلاژن در سلول های پوست انسان، استرول های استخراج شده از جلبک قرمز خلیج فارسGracilaria salicornia در غلظت های 7/1، 5/3، 7، 14، 28، 56 و 112میکروگرم بر میلی لیتر مورد سنجش قرار گرفت، همچنین برای تعیین دز قابل استفاده از این پیش ماده دارویی، تست سمیت سلولی بر رده فیبروبلاست پوست انسان در غلظت های 3/2، 6/4، 3/9، 18، 5/37، 75، 150 و 300 میکروگرم بر میلی لیتر از عصاره استرولی جلبک گراسیلاریا سالیکورنیا آزمایش شد. نتایج حاکی از افزایش سنتز پروکلاژن در سلول های پوست با افزایش غلظت استرول ها و نیز عدم سمیت این ماده در دزهای مورد نیاز درمانی بوده است. IC50 عصاره ها برای سلول های فیبروبلاست پوست انسان غلظت 111 میکروگرم بر میلی لیتر را نشان داد، همچنین اثرگذاری عصاره ها در افزایش کلاژن پوست با سطح معنی داری در غلظت های 75/1 تا 112 میکروگرم بر میلی لیتر قابل مشاهده بود (0001/0>P). بنابراین استرول های استخراج شده بدلیل تاثیر بر سنتز پروکلاژن سلول های پوست، می توانند نقش موثری بر کاهش فرایند پیری پوست بازی کنند. تحقیقات بیشتری برای سایر کاربردهای ترکیبات استرولی جلبک ها در جهت استفاده از محصولات آرایشی- بهداشتی مورد نیاز است.
    کلید واژگان: پروکلاژن, سمیت سلولی, استرول, جلبک قرمز خلیج فارس, ترمیم پوستی, Gracilaria salicornia}
    Fatemeh Pishehvarzad, Seid Vali Hosseini *, Hamid Farahmand, Mariano Lastra, Sonia Lopez
    Skin aging is accompanied by up regulation of the matrix metalloproteinase (MMP) expression and down regulation of collagen synthesis. Extracted sterols of marine algaes have been reported as anti-cancer agents and antioxidants, which can indicate the potential for anti-wrinkle properties in the human skin. In this study, the sterols extracted from Persian Gulf red algae Gracilaria salicornia were evaluated at concentrations 1.7, 3.5, 7, 14, 28, 56 and 112 μg / ml for determination of procollagen synthesis in human skin cells. To determine the acceptable dose of this precursor, the cytotoxicity test of G. salicornia sterols on the human skin fibroblast cells was tested at levels 2.3, 4.6, 9.3, 18.75, 37.5, 75, 150 and 300 μg/ml. The results indicate increased procollagen synthesis in the skin cells by increasing the concentration of sterols, and the lack of toxicity of this substance in the required dosage of the treatment. The extracts IC50 for human skin fibroblasts was 111 μg / ml. The effect of extracts on increasing of skin procollagen showed significant differences at concentrations 1.75 to 112 μg / ml (P<0.0001). Therefore, extracted sterols can play an important role on reducing the skin aging process due to the synthesis of skin cells procollagen. More research is needed for other uses of algae sterols for the use of cosmetic products.
    Keywords: Procollagen, Cytotoxicity, Sterol, Persian Gulf red algae, Skin healing, Gracilaria salicornia}
  • مهرنوش شیرانی*، نصرالله محبوبی صوفیانی، حمید فرح مند، سید امیر حسین جلالی
    به منظور مقایسه اثر دو نوع مکمل غذایی تجاری پربیوتیکی (اگریموس) و پروبیوتیکی (باکتوسل) بر مقاومت به استرس های دما، شوری و تغییرات جمعیت باکتری های اسید لاکتیکی روده در ماهی زبرا دانیو (D. rerio) ، این تحقیق انجام شد. لذا 630 قطعه ماهی در 21 آکواریوم تقسیم شده و طی دوره آزمایش، جیره غذایی پایه به عنوان تیمار شاهد (T0) و سه جیره غذایی T1، T2 و T3 به ترتیب با سطوح 2، 4 و 8 گرم پربیوتیک اگریموس در هر کیلوگرم غذا و نیز سه جیره T4، T5 و T6 به ترتیب با 0/1، 0/2 و 0/4 گرم پروبیوتیک باکتوسل در هر کیلوگرم جیره با 3 تکرار به عنوان تیمارهای آزمایش در نظر گرفته شدند. بچه ماهیان 15 روزه به مدت 90 روز با جیره های آزمایشی تغذیه شدند. نتایج نشان داد ماهیان تغذیه شده با جیره های پروبیوتیکی به طور معنی داری مقاومت بیشتری نسبت به استرس دارا هستند. درصد بازماندگی و مقاومت نسبت به استرس دمایی بین تمامی تیمارها با تیمار شاهد اختلاف معنی دار داشت (P<0. 05). بر اساس نتایج تعداد باکتری های اسید لاکتیکی در تیمارهای تغذیه شده با سطوح مختلف اگریموس و باکتوسل پس از 90 روز نسبت به تیمار شاهد افزایش معنی دار نشان دادند. اما از نظر تعداد کل باکتری ها تمامی سطوح تغذیه ای با پروبیوتیک باکتوسل دارای اختلاف معنی داری با تیمار شاهد و تیمارهای پربیوتیک اگریموس بوده و تیمار T6 با کلیه تیمارها اختلاف معنی دار نشان داد. همچنین مشاهده شد تمامی تیمارهای پربیوتیکی و پروبیوتیکی پس از تغذیه 90 روزه افزایش معنی دار وزن را نشان دادند. از نظر افزایش شاخص طول کلیه تیمارهای پروبیوتیکی نسبت به شاهد افزایش معنی دار نشان دادند. نتایج حاصل از این آزمایش استفاده از جیره غذایی حاوی مکمل های غذایی تجاری فوق را در بهبود عملکرد پاسخ به استرس و فلور روده تایید نموده و کاربرد آن ها را پیشنهاد می دهد.
    کلید واژگان: استرس دما و شوری, فلور باکتریایی روده, اگریموس, باکتوسل}
    Mehrnoosh Shirani, Nasrollah Mahboobi Soofiani, Hamid Farahmand, Seyyed Amir Hossein Jalali*
    Present study investigates the effects of two commercial dietary prebiotic and probiotic supplements on thermal and salinity stress resistance and intestinal Lactic Acid Bacteria (LAB) population in zebrafish. A total of 630 healthy 15 days old zebrafish were distributed in 21 aquariums and assigned to 7 groups fed control (T0) or diet supplemented by 2, 4 and 8 g kg-1Agrimos® (T1, T2& T3) and 0.1, 0.2 and 0.4 g kg-1Bactocell® (T4, T5& T6) for 90 days. At the end of the experiment, the results of prebiotic treatment showed significant (P<0.05) increase in salinity stress resistance treated fish to the control group during the experimental period. In thermal stress resistance, all groups showed positive results compared to control one. Lactic acid bacteria (LAB) count in Prebiotic and probiotic treatments was significantly higher than control group (T0), but in total bacterial count, probiotic treated fish showed significant difference with other groups. The result demonstrated that these commercial dietary supplements have beneficial effect on the assayed parameters and can improve stress resistance and modulated intestinal microbiota of zebrafish.
    Keywords: Thermal, Salinity stress, intestinal microbiota, Agrimos®, Bactocell®}
  • Manoochehr Nasri, Soheil Eagderi, Yazdan Keivany, Hamid Farahmand, Salar Dorafshan, Hassan Nezhadheydari
    This work aimed to study some meristic and morphometric variations among Cyprinion of Iran to find new morphological differences and phenotype plasticity among them. Specimens of six reported species were collected from five Iranian inland water basins. 10 meristics were counted, 12 morphometric were measured and 17 ratios were calculated. The multivariate analysis of variance/canonical variate analysis was used for group comparisons. The meristic and morphometric characters of C. microphthalmum and C. watsoni were widely overlapping and could not distinguish the species. In case of C. kais, it is distinguished from others by having the least head depth, the largest body depth at dorsal fin origin, the most dorsal fin base length/SL, the most pectoral fin length/SL and the most dorsal fin height/SL ratios. Cyprinion milesi is a very distinct species from other congeners based on having the largest head height/body depth, the least body depth/SL, the least dorsal fin base length/SL, the least pectoral fin length/SL and the least dorsal fin height/SL ratios.
    Keywords: Biodiversity, Cyprinidae, Ichthyology, Inlandwater fishes, Morphology}
نمایش عناوین بیشتر...
بدانید!
  • در این صفحه نام مورد نظر در اسامی نویسندگان مقالات جستجو می‌شود. ممکن است نتایج شامل مطالب نویسندگان هم نام و حتی در رشته‌های مختلف باشد.
  • همه مقالات ترجمه فارسی یا انگلیسی ندارند پس ممکن است مقالاتی باشند که نام نویسنده مورد نظر شما به صورت معادل فارسی یا انگلیسی آن درج شده باشد. در صفحه جستجوی پیشرفته می‌توانید همزمان نام فارسی و انگلیسی نویسنده را درج نمایید.
  • در صورتی که می‌خواهید جستجو را با شرایط متفاوت تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مطالب نشریات مراجعه کنید.
درخواست پشتیبانی - گزارش اشکال