فهرست مطالب hatef ajoudanifar
-
مقدمه
عفونت های بیمارستانی معضلی جهانی است که از دهه 80 به چالش و معضلی درمانی در بیمارستان های سراسر جهان مبدل شده است. یکی از منابع اصلی عفونت های بیمارستانی پرسنل هستند. هدف از مطالعه حاضر بررسی فراوانی و مقایسه میزان کلنیزاسیون استافیلوکوکوس اورئوس، مقاومت های آنتی بیوتیکی و نهایتا تایپ های مولکولی آن در پرسنل بخش های کلیدی بیمارستانی شامل اورژانس، عفونی، CCU و ICU است.
روش کارنمونه های سوآپ بینی از پرسنل بخش های اورژانس، عفونی، CCU و ICU بیمارستان امام حسن (ع) بجنورد در پاییز 1400 جمع آوری شد و کشت آن ها صورت گرفت. تایید سویه های استافیلوکوکوس اورئوس توسط تست های بیوشیمیایی انجام شد و برای تایید حساسیت دارویی از روش دیسک دیفیوژن و تست آگار اسکرین استفاده شد. استخراج DNA ژنومیک انجام شد و واکنشPCR برای بررسی حضور ژن های مقاومت صورت گرفت. تعیین گروه agr، تعیین تیپ SCCmec و بررسی حضور ژن توکسین های pvl، tsst و etc انجام شد.
یافته هادر بررسی ها، از 214 نمونه سوآپ بینی پرسنل، 75 نمونه حاوی استافیلوکوکوس اورئوس بود. میزان شیوع MRSA 3/65 درصد بود. در بررسی تایپ های SCCmec در سویه های MRSA، شایع ترین تایپ SCCmecIII بود. از گروه های agr، شایع ترین تایپ I بود و از نظر میزان فراوانی ژن های توکسین های pvl، tsst و etc شیوع بالایی داشتند.
نتیجه گیریبا توجه به افزایش سطح بهداشت عمومی و محیطی در بیمارستان ها استافیلوکوکوس اورئوس های کلنیزه کننده بینی پرسنل در اثر فشار انتخابی، مقاومت آنتی بیوتیکی و پاتوژنیسیتی بالاتر دارند، لذا در صورت انتقال به بیماران، بیماری های سخت تری می توانند ایجاد کنند.
کلید واژگان: استافیلوکوکوس اورئوس, کادر درمان, کووید-19, مقاومت آنتی بیوتیکی, تایپینگ مولکولی}IntroductionNosocomial infections are a global problem that has become a challenge in hospitals around the world since the 80s. One of the main sources of hospital infections is personnel. In this regard, the present study aimed to investigate the frequency, colonization rate, antibiotic resistance, and molecular types of Staphylococcus aureus in the personnel of key hospital departments, including emergency, infectious, Coronary Care Unit, and Intensive Care Unit Departments.
MethodNasal swab samples were collected from the personnel of the Emergency, Infectious, Coronary Care Unit, and Intensive Care Units Departments in the fall of 2021 and subsequently cultured. Confirmation of S. aureus strains was performed by biochemical tests, disk diffusion method, and agar screen test. Moreover, polymerase chain reaction for the evaluation of resistance genes was performed. Determination of agr group, determination of SCCmec type, and checking the presence of pvl, tst, and etc genes were also performed.
ResultsIn total, 75 out of 214 staff nasal swab samples contained S. aureus. Prevalence of methicillin-resistant S. aureus was 65.3% confirmed by PCR test results. Based on the study of SCCmec types in MRSA strains, the most common type was SCCmecIII. Among the agr groups, type I was the most common, and in terms of the abundance of pvl, tsst, and etc genes, a relatively high prevalence was observed.
ConclusionDue to the increased level of personal and environmental health in hospitals, s. aureus colonizing the noses of personnel are more pathogenic and resistant due to the natural selection of strains. Therefore, they can cause more severe diseases following transmission to the patients.
Keywords: Antimicrobial Resistance, Healthcare Workers, Molecular Typing, Staphylococcus Aureus, SARS-Cov-2} -
The present study aimed to investigate secondary bacterial infections among patients infected with severe acute respiratory syndrome coronavirus-2 (SARS-CoV-2). Coagulase-negative Staphylococci can infect immunocompromised patients. Linezolid resistance among Staphylococcus epidermidis is one of the most critical issues. In 2019, 185 SARS-CoV-2-positive patients who were admitted to North Khorasan Province Hospital (Bojnurd, Iran), were investigated. Patients having positive SARS-CoV-2 reverse transcriptase real-time polymerase chain reaction (RT-PCR) test results, who had a history of intubation, mechanical ventilation, and were hospitalized for more than 48 hours were included. After microbiological evaluation of pulmonary samples, taken from intubated patients with clinical manifestation of pneumonia, co-infections were found in 11/185 patients (5.94%) with S. epidermidis, Staphylococcus aureus, and Acinetobacter baumani, respectively. Remarkably, seven out of nine S. epidermidis isolates were linezolid resistant. Selected isolates were characterized using antimicrobial resistance patterns and molecular methods, such as Staphylococcal cassette chromosome mec (SCCmec) typing, and gene detection for ica, methicillin resistance (mecA), vancomycin resistance (vanA), and chloramphenicol–florfenicol resistance (cfr) genes. All of the isolates were resistant to methicillin, and seven isolates were resistant to linezolid. Nine out of 11 isolated belonged to the SCCmec I, while two belonged to the SCCmec IV. It should be noted that all patients had the underlying disease, and six patients had already passed away.The increasing linezolid resistance in bacterial strains becomes a real threat to patients, and monitoring such infections, in conjunction with surveillance and infection prevention programs, is very critical for reducing the number of linezolid-resistant Staphylococcal strains.
Keywords: Staphylococcus Epidermidis, COVID-19, Drug Resistance, Microbial, Linezolid, Vancomycin} -
Background
In the COVID-19 era, co-infections can lead to an increase in morbidity and mortality. Normal flora bacteria can transfer to the pulmonary tract and create bacterial co-infections. The nasal cavity is one of the main areas housing normal flora in the human body.
ObjectivesIn this study, we evaluated the prevalence and antibiotic resistance of gram-positive cocci in the pre– and post–COVID-19 eras among health care workers.
MethodsWe assessed 376 nasal swabs from the pre–COVID-19 era and 376 from the post–COVID-19 era. Conventional and molecular methods were used to identify bacterial types and evaluate antimicrobial resistance.
ResultsThe most common gram-positive cocci in the pre–COVID-19 samples were Staphylococcus aureus, S. epidermidis, S. capitis, S. hominis, S. haemolyticus, Streptococcus pneumoniae, and Enterococcus faecalis. In the post–COVID-19 samples, the most common gram-positive cocci were S. aureus, S. epidermidis, S. warneri, S. hominis, and E. faecalis. We observed higher resistance rates in post–COVID-19 samples, as well as resistance to linezolid and vancomycin in S. aureus, S. epidermidis, and S. hominis. Additionally, our isolates showed a high resistance rate to antiseptics.
ConclusionsIt seems that after the beginning of the COVID-19 pandemic, due to the change in the protective procedures in hospitals, the prevalence and variety of bacteria have decreased, but instead, they have been replaced by more pathogenic bacteria with higher antibiotic resistance.
Keywords: COVID-19, Co-infection, Gram-positive Cocci} -
مجله دانشکده پزشکی دانشگاه علوم پزشکی مشهد، سال شصت و پنجم شماره 5 (پیاپی 185، آذر و دی 1401)، صص 2188 -2198مقدمه
بیشترین نوع سرطان مربوط به سرطان پوست بخصوص در مردان است. Lacticin 3147، باکتریوسینی از خانواده لانتی بیوتیک هاست. هرچند هنوز شواهدی برای اثرات ضدسرطانی آن گزارش نشده است، به دلیل مشابهت به نایسین برای بررسی این اثر درنظر گرفته شد. هدف بررسی اثر Lacticin 3147 بود.
روش کارابتدا سلول های A431 کشت داده شدند و سنجش بقای سلولی و میزان سمیت سلولی Lacticin 3147 بر سلول های کارسینومای اپیدرمویید انسانی A431 پس از 24 و 48 ساعت تیمار توسط روش رنگ سنجی MTT Assay بررسی شد. آپوپتوز سلولی با سنجش فعالیت کاسپازهای 8 و 9 در سلول های سرطانی A431 تیمار شده با غلظت IC50 Lacticin 3147 پس از 24، 48 و 72 ساعت بررسی شد. از روش Boyden Chamber جهت ارزیابی توانایی تهاجم سلول های سرطانی A431 تیمار شده با دوز زیرکشنده Lacticin 3147 استفاده شد. آغازگرهای اختصاصی برای ژن های پروآپوپتوتیک Bax، آنتی آپوپتوتیک Bcl-2 و ژن مرجع ꞵ-actin طراحی و میزان بیان آن ها درسلول های A431 تیمار شده با غلظت IC50 Lacticin 3147 با استفاده از روش Real Time PCR کمی، مورد بررسی قرار گرفت. تجزیه و تحلیل داده ها توسط نرم افزار SPSS 16 و آزمون آماری ANOVA انجام گردید (05/0<p).
نتایجبررسی آماری داده های به دست آمده از آزمون MTTنشان داد که رشد سلول های تیمار شده با غلظت های مختلف Lacticin 3147 به طور معنی داری کاهش پیدا کرده است (001/ 0p<). تاثیر مهاری Lacticin 3147 بر زنده مانی سلول های A431 وابسته به غلظت و زمان تیمار است. به طوری که بیشترین تاثیر درغلظت µM 3/0 و مدت 72 ساعت مشاهده شد. غلظت IC50 Lacticin 3147 برابر باµM 8/0 به دست آمد. فعالیت کاسپازهای 8 و 9 در سلول های سرطانی A431 تیمار شده به صورت وابسته به زمان افزایش یافت و پس از 72 ساعت نسبت به کنترل به ترتیب 36/2 و 72/2 برابر شد (001/ 0<p). توان تهاجم سلول های سرطانی A431 تیمار شده با دوز زیرکشنده Lacticin 3147 به طور وابسته به دوز کاهش یافت و در غلظتµM 5/0 با حداقل اثر کشندگی، کمترین توان تهاجم را نشان داد (001/0>p).
نتیجه گیریبیان ژن پروآپوپتوتیک Bax در سلول هایA431 تیمار شده با غلظت IC50 Lacticin 3147 به طور قابل ملاحظه ای (001/0>p) افزایش یافت. همچنین کاهش بیان ژن آنتی آپوپتوتیک Bcl-2 در همان شرایط معنی دار بود. درنتیجه، استفاده از Lacticin 3147 در آینده ممکن است به یک استراتژی جدید برای درمان سرطان پوست منجر شود.
کلید واژگان: 3147 Lacticin, کارسینومای اپیدرموئید}The most common type of cancer is skin cancer, especially in men. Lacticin 3147 is a bacteriocin from the lantibiotic family. Since it is similar to nisin, Lacticin was considered for its anticancer properties’ investigation. The aim was to investigate the effect of Lacticin 3147. The MTT Assay helped assess A431 cell survival and cytotoxicity following treatment with Lacticin 3147 after 24 and 48 hours. The cell apoptosis amounts were investigated by measuring the activity of caspases 8 and 9 in A431 cancer cells treated with the IC50 concentration of Lacticin 3147 after 24, 48, and 72 hours. The Boyden Chamber method evaluated the invasion ability of A431 cancer cells treated with a sublethal dose of Lacticin 3147. Specific primers were designed for proapoptotic genes bax, antiapoptotic bcl-2, and the reference gene ꞵ-actin. The expression level in A431 cells treated with IC50 concentration of Lacticin 3147 was investigated using the quantitative Real-Time PCR method. Data were analyzed by SPSS 16 software and ANOVA statistical test (P<0.05). Statistical analysis of the data obtained from the MTT test showed that the growth of cells treated with different concentrations of Lacticin 3147 decreased significantly (p<0.001). The inhibitory effect of Lacticin 3147 on the viability of A431 cells depends on the concentration and treatment time. As a result, a 0.3 µM concentration and 72-hour duration were the most consequential effects. Lacticin IC50 concentration was equal to 0.8 µM. The activity of caspases 8 and 9 in the treated A431 cancer cells increased in a time-dependent manner, and after 72 hours, it was 2.36 and 2.72 times compared to the control, respectively (p<0.001). The invasion activity of A431 cancer cells treated with the sublethal dose of Lacticin 3147 decreased in a dose-dependent manner. The lowest invasion activity was at concentration of 0.5 µM with minimal lethal effect (p<0.001). The expression of the bax proapoptotic gene in A431 cells treated with IC50 concentration of Lacticin 3147 increased significantly (p<0.001). Also, the antiapoptotic bcl-2 gene expression reduction was significant in the same conditions. As a result, the use of Lacticin 3147 in the future may lead to a new strategy for the treatment of skin cancer.
Keywords: Lacticin 3147, epidermoid carcinoma, antimetastasis, apoptosis} -
مجله دانشکده پزشکی دانشگاه علوم پزشکی مشهد، سال شصت و پنجم شماره 3 (پیاپی 183، امرداد و شهریور 1401)، صص 2114 -2124
شیمی درمانی سرطان به دلیل اثرات نامطلوب داروهای ضدسرطانی یک چالش بزرگ است. لذا تلاش بر آن است تا از محصولات طبیعی با پتانسیل درمانی و بی خطر برای درمان انواع بیماریها استفاده شود. هدف این پژوهش کشف پتانسیل ضدسرطانی پری بیوتیک Bovicin HC5 است.روش کارسنجش بقای سلول های کارسینوم هپاتوسلولار انسانی Huh-7 پس از تیمار با غلظت های مختلف Bovicin HC5 به روشMTT بررسی شد. آپوپتوز سلولی با سنجش فعالیت کاسپازهای 3، 8 و 9 در سلول های سرطانی Huh-7 تیمار شده با غلظتIC50 Bovicin HC5 بررسی شد. جهت ارزیابی توانایی تهاجم سلول های سرطانی Huh-7 تیمار شده با دوزهای زیرکشنده Bovicin HC5 از روش Boyden Chamber استفاده شد. میزان بیان ژن های پروآپوپتوتیک bax، آنتی آپوپتوتیک bcl-2 و ژن مرجع ꞵ-actin درسلول های Huh-7 تیمار شده با غلظتIC50 Bovicin HC5 با استفاده از پرایمرهای اختصاصی و روشReal Time PCR، مورد بررسی کمی قرار گرفت. برای تجزیه و تحلیل داده ها از آزمون آماری ANOVA استفاده شد (05/0>P). 91/1، 36/2 و 62/2نتایج تست MTT نشان داد که زنده مانی سلول های Huh-7 تیمار شده با غلظت های مختلف Bovicin HC5 به طور معنی داری وابسته به غلظت و زمان تیمار کاهش پیدا کرده است (001/0>p). به طوری که بیشترین تاثیر درغلظتµM 400 و مدت 72 ساعت مشاهده شد. غلظتIC50 Bovicin HC5 برابر باµM 300 به دست آمد. فعالیت کاسپازهای 3، 8 و 9 در سلول های Huh-7 تیمار شده پس از 72 ساعت به صورت وابسته به زمان افزایش معنی داری داشتند و نسبت به کنترل به ترتیب حدود 9/1 برابر (01/0>p)، 36/2 برابر (001/0>p) و 62/2 برابر (001/0>p) شدند. توان تهاجم سلول های سرطانی Huh-7 تیمار شده با دوز زیرکشنده Bovicin HC5 به طور وابسته به دوز کاهش یافت و در غلظتµM 250 بدون اثر کشندگی شدید، حداقل توان تهاجم را نشان داد (001/0>p). همچنین بیان ژن پروآپوپتوتیک bax و آنتی آپوپتوتیک bcl-2 در سلول های Huh-7تیمار شده با غلظت IC50 Bovicin HC5 به طور قابل ملاحظه ای به ترتیب افزایش(001/0>p) و کاهش(001/0>p) یافت. درنتیجه، Bovicin HC5 ممکن است نوید بخش کشف یک استراتژی جدید برای درمان کارسینوم هپاتوسلولار انسانی بوده و داروی جدیدی با فعالیت ضدتومور و ضدمتاستاتیک و بدون عوارض جانبی تولید گردد.
کلید واژگان: کارسینوم هپاتوسلولار انسانی, پری بیوتیک, Bovicin HC5, ضدمتاستاز, آپوپتوز}Cancer chemotherapy is a big challenge due to the adverse effects of anticancer drugs. Therefore, the effort is to use natural products with therapeutic and safe potential to treat all kinds of diseases. This research aims to discover the anticancer potential of the prebiotic Bovicin HC5.The survival rate of Huh-7 human hepatocellular carcinoma cells after treatment with different concentrations of Bovicin HC5 was investigated by MTT assay. Assays of caspase 3, 8, and 9 activities in Huh-7 cancer cells treated with the Bovicin HC5 IC50 concentration were conducted to determine the degree of cell apoptosis. Boyden Chambers were used to assessing Huh-7 cancer cells' invasion ability after being treated with sublethal doses of Bovicin HC5. Using specific primers and the Real-Time PCR method, proapoptotic bax and antiapoptotic bcl-2 expression levels in Huh-7 cells treated with the Bovicin HC5 IC50 concentration were quantified. ANOVA statistical test was used to analyze the data (p<0.05).The results of the MTT test showed that the viability of Huh-7 cells treated with different concentrations of Bovicin HC5 decreased significantly depending on the concentration and treatment time (p<0.001). As a result, a 400 µM concentration and 72-hour duration resulted in the greatest effects. The IC50 concentration of Bovicin HC5 was determined to be 300 µM. The activity of caspases 3, 8, and 9 in treated Huh-7 cells increased significantly after 72 hours in a time-dependent manner and compared to the control by about 1.9 times (p<0.01), and 2.36 times (p<0.01) and 2.62 times (p<0.001)
Keywords: human hepatocellular carcinoma, Prebiotic, Bovicin HC5, antimetastasis, Apoptosis} -
Introduction and objective:
Aspergillus refers to a genus of fungi which has been widely used in industry. Some of the species of this genus can contaminate agricultural crops such as pistachio and corn. In addition to destructive impacts on quality of the agricultural crops, they can result in poisoning and carcinogenity in living creatures including human. Rhizopus belongs to the family of opportunistic fungi and is categorized in zygomycetes branch; this fungus is also known as black bread mold. The vegetative mycelium of this fungus has a structure called sporangiophore. At the end of the sporangiophore, there is a dome-shaped body called columella. Vesicles are situated around the columella and are called sporangium. Inside the sporangium high numbers of sporia sporangio spores can be found. The aim of this study is to extract DNA of lipase-producing oryzae species from natural resources.
Materials and methodsthe samples were cultured on PDA. For enzyme production, mineral culture medium was used for solid state fermentation. The impact of carbon source, initial pH and incubation temperature on enzyme production was also addressed. After preparing spore suspension, solid state fermentation was carried out. The enzymes were extracted after fermentation and their enzymic activities were investigated. The samples’ DNA was extracted by boiling method, and their sequence was designed by specific primer. Sequencing was carried out after PCR.
Results and discussionsmost of Rhizopus oryzae genus species have high lipase activity and can produce lipase enzyme. Regarding abundance of this fungus in the country, it can be used as a significant genus in biotechnological and industrial activities. Based on present screening, the majority of local species can produce lipase. Rhizopus delemar strain BVKT R1and 8 Rhizopus oryzae isolate FPZSP368 have high lipase activity and can be regarded as promising isolates for production of this enzyme in large scales.
Keywords: enzyme, DNA extraction, lipase, Aspergillus, fungus} -
زمینه
آنتی ژن ایمنی بخش باسیلوس آنتراسیس (PA) پروتئینی با خاصیت اتصال به گیرنده های سطحی سلول های بدن انسان می باشد ولی در سطح سلو ل های سرطانی گیرنده اختصاصی uPA (Urokinase plasminogen activator) ایجاد می-شود که این پروتئین قدرت اتصال به آن را ندارد. هدف از انجام این تحقیق تغییر جایگاه اتصال موجود بر روی PA با جهش زایی مستقیم می باشد که این پروتئین فقط بتواند به سلول های سرطانی متصل گردد.
مواد و روش هادر طی این تحقیق پلاسمید pMNA1 حاوی ژن PA از B.subtilis حاوی این وکتور استخراج و با استفاده از روش واکنش زنجیره ای پلی مراز SOE ، جهش هدفدار بر روی ژن PA صورت پذیرفت. قطعه حاصله بطور مستقیم بر روی ناقل PTZ57R کلون و با استفاده از روش cacl2 به E.coli سویه DH5α انتقال یافت و وجود ژن و جهش بر روی آن بوسیله PCR ، هضم آنزیمی و تعیین ترادف بازی مورد بررسی قرار گرفت.
یافته هاقطعه ژنی PA با روش PCR جداسازی و بر روی آن جهش هدفمند صورت پذیرفت. از انتقال محصول PCR جهش یافته بر روی وکتور pTZ57R پلاسمیدی با اندازه 1/5 بدست آمد که این اندازه با روش هضم آنزیمی ثابت شد. سپس وجود ژن توسط PCR و جهش بر روی ژن توسط تعیین ترادف بازی تایید گردید. نتیجه گیری: سرطان مشهور به بیماری مرگ آور است. یکی از روش های درمان سرطان استفاده از توکسین های باکتریایی است لذا با استفاده از پروتئین تغییر یافته PA که فقط به سلول های سرطانی متصل می گردد، می توان امیدی تازه در درمان سرطان ایجاد کرد.
کلید واژگان: جهش زایی, آنتی ژن ایمنی بخش, باسیلوس آنتراسیس}BackgroundProtective Antigen of Bacillus anthracis (PA) is a protein that binds to receptors on OF human body cells. There is special Urokinase plasminogen activator receptor on cancer cells and PA can not bind to them. The aim of this study is modify the receptor of PA with site directed mutagenesis that the protein can only be bind to the cancer cells.
Material and methodsIn this study, pMNA1 plasmid that contained PA gene was extracted and site directed mutagenesis done with SOE PCR on PA gene. Mutant gene cloned on pTZ57R vector directly and transformed into E. coli DH5α with CaCl2 method. Finally exiting of the gene and mutation on PA evaluated with PCR , digestion and sequencing.
ResultsPA gene separated with PCR and mutated with SOE PCR. Mutated PCR product cloned on pTZ57R vector and earned 5.1 kb plasmid. Recombinant plasmid evaluated with digestion and PCR. Mutation confirmed with sequencing. Conclsion: Cancer has a deadly disease. One of the methods for treaeting cancer using bacterial toxins. Therefore Using a modified PA protein that binds to the cancer cells can create new hope for cancer treatment.
Keywords: Mutagenesis, Protective Antigene, Bacillus anthrasis} -
سابقه و هدفآنتی ژن ایمنی بخش باسیلوس آنتراسیس پروتئینی با خاصیت اتصال به گیرنده های سطح تمام سلول های بدن انسان می باشد. در سطح سلول های سرطانی گیرنده اختصاصی فعال کننده یوروکینازی پلاسمینوژن (uPA) ایجاد می شود که در سطح سایر سلول های نرمال بدن مشاهده نمی شوند. هدف از انجام این تحقیق تغییر جایگاه اتصال موجود بر روی PA با جهش زایی مستقیم می باشد به نحوی که این پروتئین فقط بتواند به سلول های سرطانی متصل گردد.مواد و روش هادر طی این تحقیق پلاسمید pMNA1 حاوی ژن PA به روش لیز قلیایی ازمیزبان خود جدا سازی شد. در ادامه با استفاده از پرایمر های فسفریله شده و استفاده از روش PCR هم پوشان جهش هدفدار بر روی ژن PA صورت پذیرفت. در ادامه قطعه حاصله بطور مستقیم بر روی ناقل PTZ57R کلون و به E.coli سویه DH5α انتقال یافت. با استفاده از آنزیم های برش دهنده KpnI و SalI ژن PA جهش یافته جدا و بر روی ناقل pWB980 انتقال داده شد. در آخر با استفاده از روش الکتروپوریشن به B.subtilis سویه WB600 انتقال یافت.یافته هاطی این تحقیق در توالی ژن PA با روش SOE PCR جهش ایجاد کرده که در پی آن کد ژنتیکی اسید آمینه 194 تغییر کرد. جهش ایجاد شده با تعیین ترادف بازی تایید گردید.نتیجه گیریسرطان مشهور به بیماری غیر قابل درمان و مرگ آور است. یکی از روش های درمان سرطان استفاده از توکسین های باکتریایی است البته در صورتی که فقط به سلول های سرطانی آسیب برساند. لذا با استفاده از پروتئین تغییر یافته PA که فقط به سلول های سرطانی متصل می گردد می توان امیدی تازه در درمان سرطان ایجاد کرد.
کلید واژگان: فعال کننده یوروکینازی پلاسمینوژن, SOE PCR, آنتی ژن ایمنی بخش باسیلوس آنتراسیس}Aim AndBackgroundThe immune antigen of Bacillus anthracis is a protein that can attach to the surface receptor of all human cells. At the surface of cancer cells there is a receptor that activates the uPA (Urokinase plasminogen) that do not exist in normal human cells. This research was conducted to change the site of attachment of PA gene with making direct mutation so that it can attach only to the cancer cells.Material And MethodsIn this study, pMNA1 plasmid containing PA gene was extracted from its host by basic lyse. Subsequently, phosphorylized primers and Overlap Extention PCR were used to make mutation on PA gene. The mutated segment was directly cloned in PTZ57R carrier and transferred to DH5α strain of E. coli. By catalyst enzymes KpnI and SalI the mutated PA gene was extracted and transferred to pWB980and by electroporation method it was transferred to WB600 strain.ResultsIn this study mutation was occurred in sequences of PA gene by SOE PCR method resulting in a change in the genetic code of amino acid 194. The occurrence of mutation was confirmed by determining of base sequences.ConclusionCancer is a serious disease that in many cases leads to death. One of the treatment methods of cancer is bacterial toxins if only cancer cells receive them. Therefore, using changed PA can be a hope in cancer treatment as it attaches only to cancer cells.Keywords: Urokinase plasminogen activator, SOE PCR, immune antigen of Bacillus anthracis, Bacillus} -
سابقه و هدفسلولز یکی از پرمصرف ترین پلیمرهای زیستی جهت تولید کاغذ، منسوجات و مواد پزشکی می باشد. با توجه به محدودیت منبع اصلی سلولز و حفظ منابع طبیعی، یکی از روش های جالب تولید سلولز روش میکروبی است. از طرف دیگر، به دلیل خالص نبودن سلولز گیاهی و همراهی با لیگنین و همی سلولز، استفاده از سلولز باکتریایی که پلیمری خالص می باشد، ارجحیت دارد. این مطالعه به منظور جداسازی باکتری بومی سودوموناس لوتئولا جهت تولید سلولز و بررسی کیفیت و کمیت تولید سلولز توسط آن انجام گرفت.مواد و روش هاچندین نمونه از سرکه های محلی، آبمیوه ها و میوه ها در محیط هسترین-شرام آگار کشت داده شدند. باکتری سودوموناس لوتئولا با آزمون های بیوشیمیایی جداسازی و با روش تایپینگ مولکولی تایید شد. پس از کشت باکتری در محیط هسترین-شرام براث، سلولز در محیط تولید شد. لایه سلولزی تولید شده، پس از تیمار با SDS و NaOH خالص سازی و خشک گردید. در نهایت، هضم آنزیمی با سلولاز و بررسی با میکروسکوپ الکترونی نگاره (SEM) سلولز تولید شده را تایید کرد.یافته هاباکتری گرم منفی سودوموناس لوتئولا از نمونه های تهیه شده جداسازی شد. سپس باکتری در محیط هسترین-شرام براث کشت داده شد و پس از 6 روز گرماگذاری در 30 درجه سانتی گراد، سلولز تولید شد. نتایج هضم آنزیمی نشان دهنده حضور سلولز در محیط کشت باکتری بود. بررسی با میکروسکوپ الکترونی نگاره نیز نشان داد که سلولز تولید شده توسط این باکتری دارای ساختار فیبری و شبکه مانند است.نتیجه گیریاین مورد، اولین گزارش تولید سلولز توسط جدایه بومی سودوموناس لوتئولادر ایران است. کیفیت و کمیت سلولز تولید شده توسط این باکتری در مقایسه با سلولز تولید شده با سویه استاندارد مطلوب ارزیابی شد، لذا به عنوان منبع جدید تولید سلولز معرفی می گردد.
کلید واژگان: سلولز, هسترین, شرام, سودوموناس لوتئولا, میکروسکوپ الکترونی نگاره}Aims andBackgroundCellulose is the most widely used biopolymer to produce paper, textiles and biomedical materials. One of the interesting methods to produce cellulose is microbial resource due to the shortage of cellulose original resources. On the other hand, the use of microbial cellulose as a pure polymer and absence of lignin and hemicellulose is preferred. The present study was aimed to isolate Pseudomonas luteola producing cellulose bacterium to produce cellulose and evaluate its production quality.Materials And MethodsSamples from different local vinegars, juices and fruits were cultured in Hestrin-Schramm agar medium. Pseudomonas luteola was isolated with biochemical tests and verified by 16S rRNA typing method. After cultivation of the isolate in Hestrin-Schramm broth, cellulose was produced in medium. The cellulose layer was treated by SDS and NaOH, then purified and dried. Finaly, the produced cellulose was verified by cellulase enzyme and scaning electron microscope (SEM).ResultsIn this study, the gram-negative organism Pseudomonas luteola was isolated and identified. Then, the isolate was cultured in Hestrin-Schramm broth and cellulose was produced after 6 days incubation at 30°C. The enzymatic digestion results were showed that the cellulose has been presented in culture medium. Scaning Electron Microscope (SEM) image was revealed that the produced cellulose by the isolate has fibrous and plexiform structure.ConclusionThis is the first report on cellulose production by native isolate of Pseudomonas luteola in Iran. The quality of produced cellulose by the organism is appropriate in comparison with the cellulose produced by standard strain, thus is presented to produce cellulose as a new resource.Keywords: cellulose, Hestrin, Schramm, Pseudomonas luteola, Scanning Electron Microscope} -
سابقه و هدف
در حدود 98 درصد پتاسیم موجود در خاک به شکل کانی های معدنی است که برای گیاهان قابل استفاده نمی باشد. باکتری های حل کننده پتاسیم قادرند سیلیکات های معدنی حاوی پتاسیم را تجزیه کرده و پتاسیم قابل جذب برای گیاهان آزاد کنند. این مطالعه با هدف جداسازی باکتری های حل کننده پتاسیم از خاک ریزوسفری گیاهان و بررسی توانایی جدایه ها در محلول سازی سیلیکات ها جهت آزادسازی پتاسیم انجام شد.
مواد و روش هاباکتری های حل کننده پتاسیم از نمونه های خاک ریزوسفری گیاهان مختلف جداسازی شدند. جدایه ها در محیط کشت الکساندروف کشت و بر اساس تشکیل هاله ناشی از حلالیت پتاسیم بررسی شدند. جدایه ها، با استفاده از روش های ماکروسکوپی، میکروسکوپی، بیوشیمیایی و مولکولی مورد شناسایی قرار گرفتند. به منظور تخمین کمی پتاسیم آزاد شده توسط جدایه ها در محیط مایع الکساندروف و در خاک از روش فلیم فوتومتری استفاده شد.
یافته هااز مجموع 30 جدایه با قابلیت آزادسازی پتاسیم، تعداد 5 جدایه توانایی بالایی در حلالیت پتاسیم داشتند. مطالعات بیوشیمیایی و مولکولی نشان داد که جدایه ها متعلق به سه جنس باسیلوس، پانی باسیلوس و سودوموناس بودند. بررسی های فلیم فوتومتری نشان داد که مقدار پتاسیم آزاد شده توسط جدایه ها بین 950 تا 1250 میلی گرم بر لیتر در محیط مایع و بین 525 تا 550 میلی گرم بر کیلوگرم در خاک بود.
نتیجه گیریباکتری های حل کننده پتاسیم از ریزوسفر خاک هایی با توانایی بالای تثبیت پتاسیم جداسازی و شناسایی گردیدند. این جدایه ها توانایی قابل ملاحظه ای در حلالیت کانی ها و آزادسازی پتاسیم معدنی قابل جذب دارند و می توانند در تولید کودهای بیولوژیک به منظور افزایش میزان پتاسیم در دسترس خاک و بهبودی رشد و بازدهی گیاهان زراعی مورد استفاده قرار گیرند.
کلید واژگان: محیط الکساندروف, پتاسیم, باسیلوس, پانی باسیلوس, سودوموناس}Background &
ObjectivesApproximately 98% of total potassium in soil is in unavailable mineral forms for plants. Potassium-solubilizing bacteria are able to dissolve potassium bearing silicate minerals and release available form of potassium to the plants. The present study was intended to isolate potassium-solubilizing bacteria from rhizosphere soil of crop plants and to evaluate the ability of isolates in solubilisation of absorbable potassium. Material &
MethodsPotassium-solubilizing bacteria were isolated from the rhizosphere of different crop plants. The isolates were grown on optimized Aleksandrov agar and were assayed based on the diameter of zone of potassium solubilization. The selected isolates were identified using macroscopic, microscopic, biochemical, and molecular methods. The Flame photometry was used to quantify potassium released by isolates in Aleksandrov broth and soil.
ResultsTotally, 5 out of 30 isolates with ability to release potassium showed high activity in potassium solubilisation. The biochemical and molecular studies indicated that these isolates belonged to the genera Bacillus, Paenibacillus, and Pseudomonas. The flame photometry results showed that the amount of potassium released by the isolates ranged from 950 to 1250 mg/l in broth media and 525 to 550 mg/kg in soil.
ConclusionThe potassium-solubilizing bacteria were isolated and identified from rhizosphere samples and identified. These isolates showed high ability for solubilisation of silicate minerals and release of absorbable potassium and therefore they can be used in biofertilizers to enhance the availability of potassium in the soils and to improve the growth and yield of crop plants.
Keywords: Aleksandrov agar, Potassium, Bacillus, Paenibacillus, Pseudomonas} -
سابقه و هدفاستافیلوکوکوس سیمولانس یک کوکسی گرم مثبت و خوشه ای می باشد که از پوست، ادرار و نمونه های بالینی انسان و حیوان به ویژه عفونت پستان گاوی جداسازی شده است. این پژوهش با هدف جداسازی و شناسایی باکتری استافیلوکوکوس سیمولانس تولید کننده لیزواستافین، از ورم پستان گاوی و نیز معرفی آن به عنوان یک عامل درمانی جدید در درمان عفونت های استافیلوکوکی انجام شده است.مواد و روش هااین پژوهش به صورت مقطعی-توصیفی بر روی نمونه های جمع آوری شده از پستان گاوهای مبتلا به عفونت پستان در گاوداری مرکز علمی و کاربردی جهاد کشاورزی واقع در کیلومتر6 جاده چشمه علی دامغان، استان سمنان انجام گرفت. نمونه ها پس از کشت بر روی محیط نوترینت آگار با رنگ آمیزی گرم و آزمون های بیوشیمیایی مورد بررسی قرار گرفتند. پس از استخراج DNA از نمونه های مشکوک به استافیلوکوکوس سیمولانس، به منظور شناسایی دقیق باکتری و بررسی وجود ژن لیزواستافین در سویه از روش PCR و تعیین توالی استفاده گردید.یافته هااز مجموع 61 کوکسی گرم مثبت خوشه ای جداشده از نمونه های ورم پستان گاوی، یک مورد باکتری استافیلوکوکوس سیمولانس شناسایی گردید. تعیین توالی قطعه 16S rRNA باکتری نیز صحت جداسازی را تایید نمود.نتیجه گیریبا توجه به اولین گزارش جداسازی باکتری استافیلوکوکوس سیمولانس از ورم پستان گاوی در ایران و نیز کارایی بالقوه لیزواستافین تولید شده توسط باکتری، می توان از این ترکیب در درمان عفونت های باکتریایی مقاوم به آنتی بیوتیک استفاده نمود.کلید واژگان: استافیلوکوکوس سیمولانس, لیزواستافین, ورم پستان گاوی, 16S rRNA}Background and ObjectivesS. simulans is a gram-positive cocci that can be isolated from skin and urine, as well as some clinical samples in human and animals, such as bovine mastitis. The present study was aimed to isolate and identify S. simulans, a lysostaphin-producing organism, from bovine mastitis and to test therapeutic property of this species against the staphylococcal infections.Materials and MethodsThis cross- sectional study was done on the collected samples from breast of the cows afflicted to mastitis in Damghan, Semnan Province. The samples were cultured on nutrient agar and were examined based on Gram staining and biochemical tests. Then, the genomic DNA of the samples suspected for S. simulans were extracted. The accurate identification of the bacteria and tracking of lysostaphin gene were evaluated by using PCR and sequencing.ResultsOne out of 61 gram-positive isolated cocci from bovine mastitis samples was detected as S. simulans. This result was verified using 16S rRNA sequencing.ConclusionThis study is the first report of isolation of S. simulans, a lysostsphin-producing organism, from bovine mastitis. This species is potentially useful for extraction of lysostsphin which is applied for treatment of the infections caused by antibiotic resistance bacteria.Keywords: Staphylococcus simulans, Lysostaphin, Bovine mastitis, 16S rRNA}
- در این صفحه نام مورد نظر در اسامی نویسندگان مقالات جستجو میشود. ممکن است نتایج شامل مطالب نویسندگان هم نام و حتی در رشتههای مختلف باشد.
- همه مقالات ترجمه فارسی یا انگلیسی ندارند پس ممکن است مقالاتی باشند که نام نویسنده مورد نظر شما به صورت معادل فارسی یا انگلیسی آن درج شده باشد. در صفحه جستجوی پیشرفته میتوانید همزمان نام فارسی و انگلیسی نویسنده را درج نمایید.
- در صورتی که میخواهید جستجو را با شرایط متفاوت تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مطالب نشریات مراجعه کنید.