mohamad mahdi mortazavipour
-
Background
K-Ras mutations rarely occur in breast cancer. However, studies have supported that K-Ras upregulation is involved in breast cancer pathogenesis. Two main K-Ras transcript variants, K-Ras4A and K-Ras4B, arise originate from the alternative splicing of exon 4. In this study, we aimed to evaluate variations in the expression of K-Ras4A and K-Ras4B and their role in breast ductal carcinoma.
MethodsTotal RNA was extracted from breast tumors, and the NATs were obtained via mastectomy. Patients were selected from new cases of breast cancer with no prior history of chemotherapy. Relative mRNA expression was calculated based on a pairwise comparison between the tumors and the NATs following normalization to the internal control gene. Predictive values of the transcript variants were examined by ROC curve analysis.
ResultsA statistically significant increase was found in K-Ras4A and K-Ras4B expression with the mean fold changes of 7.58 (p = 0.01) and 2.47 (p = 0.001), respectively. The K-Ras4A/K-Ras4B ratio was lower in the tumors than that of the normal tissues. ROC curve analysis revealed the potential of K-Ras4A (AUC: 0.769) and K-Ras4B (AUC: 0.688) in breast cancer prediction. There was also a significant association between K-Ras4B expression and HER2 statues (p = 0.04). Furthermore, a significant link was detected between K-Ras4A expression and pathological prognostic stages (p = 0.04).
ConclusionOur findings reveal that the expression levels of K-Ras4A and
K-Ras4B is higher in the tumor compared to the normal breast tissues. Increase in K-Ras4A expression was more significant than that of K-Ras4B.Keywords: Alternative splicing, Breast neoplasms, Gene expression, KRAS protein, Real-time polymerase chain reaction -
International Journal of Reproductive BioMedicine، سال بیستم شماره 8 (پیاپی 151، Aug 2022)، صص 613 -626
تشخیص پیش از تولد بیماری های ارثی به طور قابل توجهی رویکرد متخصصان ژنتیک پزشکی در کمک به خانواده های مبتلا به اختلالات ژنتیکی را تغییر داده است. با این حال، خطر سقط جنین و ترس از روش های تشخیصی تهاجمی ممکن است بسیاری از زوج ها را از پیگیری تشخیص قبل از تولد منصرف کند. با کشف DNA آزاد جنینی در پلاسمای مادر، تشخیص قبل از تولد وارد دوره جدیدی از پیشرفت شده است. DNA آزاد در طی روندهای فیزیولوژیکی طبیعی، از طریق آپوپتوز، مرگ سلولی برنامه ریزی شده، و یا نکروز آزاد می شود. DNA آزاد را می توان در پلاسما و سایر مایعات بدن یافت. اگرچه تشخیص پیش از تولد بر اساس DNA آزاد جنینی مزیت غیرتهاجمی بودن را دارد، اما هنوز نسبتا گران است و به دستگاه های پیشرفته و تجزیه و تحلیل جامع داده ها نیاز دارد. نتایج امیدوارکننده روش های تشخیص پیش از تولد غیرتهاجمی در اختلالات کروموزومی شایع، راه را برای توسعه سنجش های پیچیده تر مانند بررسی اختلالات تک ژنی هموار کرده است. مقادیر نسبی جهش و مقادیر نسبی هاپلوتیپ رایج ترین روش هایی هستند که برای تشخیص غیرتهاجمی پیش از تولد اختلالات تک ژنی به انجام رسیده اند. با این حال، هر آزمایش دارای مزایا و معایب خاص خود است. مقادیر نسبی جهش بر اساس روش واکنش زنجیره ای پلیمراز (PCR) دیجیتال قطره ای است که شامل ویژگی های کمی سنجش زمان واقعی PCR می شود. مقادیر نسبی هاپلوتیپ بر اساس توالی یابی نسل جدید است که شامل تجزیه و تحلیل ژنوم مادر و پدر و به دنبال آن تعیین توالی DNA آزاد جنینی در پلاسمای مادر می گردد. PCR تقویت همزمان در دمای دناتوراسیون پایین تر، روش دیگری است که بر پایه تشکیل هتروداپلکس بین آلل ها برای تقویت انتخابی جهش های پدری کاربرد دارد. در این مقاله مروری، ما رایج ترین روش های تشخیص غیرتهاجمی پیش از تولد را شرح داده و کاربردهای آن ها را در تشخیص اختلالات ژنتیکی با الگوهای وراثتی مختلف مقایسه کرده ایم.
کلید واژگان: DNA آزاد, تشخیص قبل از تولد, تشخیص غیر تهاجمی قبل از تولد, نقایص تک ژنی, تکنیک های غیرتهاجمیPrenatal diagnosis of hereditary diseases has substantially altered the way medical geneticists are helping families affected by genetic disorders. However, the risk of miscarriage and fear of invasive diagnostic procedures may discourage many couples from seeking prenatal diagnosis. With the discovery of maternal plasma cell-free fetal DNA, prenatal diagnosis has entered a new era of progress. Cell-free DNA is released during normal physiological functions as well as through the cell death programs of apoptosis and necrosis. It can be found in the plasma and other body fluids. Although this method has the advantage of being noninvasive, it is still rather expensive and requires advanced hardware and comprehensive data analysis. Promising implications of noninvasive prenatal diagnosis methods for the diagnosis of common trisomy disorders have paved the way for the development of more complicated assays of single-gene disorders. Relative mutation dosage and relative haplotype dosage are the most widely implemented assays for noninvasive prenatal diagnosis of single-gene disorders. However, each assay has its own advantages and disadvantages. Relative mutation dosage is based on the droplet digital polymerase chain reaction (PCR) technique which includes quantification features of real-time PCR assays. Relative haplotype dosage is based on next-generation sequencing that includes analysis of the maternal and paternal genome followed by sequencing of maternal plasma cell-free DNA. Co-amplification at a lower denaturation temperature PCR is another approach that is based on forming heteroduplexes between alleles to selectively amplify paternal mutations. In this review, we have described the most common noninvasive prenatal diagnosis approaches and compared their applications in genetic disorder diagnosis with different inheritance patterns.
Keywords: Cell-free nucleic acids, Prenatal diagnosis, Noninvasive prenatal testing, Single-gene diseases, Non-invasive techniques
- در این صفحه نام مورد نظر در اسامی نویسندگان مقالات جستجو میشود. ممکن است نتایج شامل مطالب نویسندگان هم نام و حتی در رشتههای مختلف باشد.
- همه مقالات ترجمه فارسی یا انگلیسی ندارند پس ممکن است مقالاتی باشند که نام نویسنده مورد نظر شما به صورت معادل فارسی یا انگلیسی آن درج شده باشد. در صفحه جستجوی پیشرفته میتوانید همزمان نام فارسی و انگلیسی نویسنده را درج نمایید.
- در صورتی که میخواهید جستجو را با شرایط متفاوت تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مطالب نشریات مراجعه کنید.