فهرست مطالب mohammad hosein banabazi
-
در سیستم پرورش، اغلب یک جنس ارزش بیش تری از جنس دیگر دارد. هدف از پژوهش حاضر، استفاده از تفاوت واریانت های نوکلیوتیدی اختصاصی بین ژن های آمیلوژنین X و Y، برای تعیین جنسیت در علف خوران وحشی و اهلی (گوسفند، بز، گاو و گوزن) بود. بدین منظور، از تعداد کل 59 حیوان مورد مطالعه نمونه خون و سرگین تهیه شد و سپس استخراج DNA ژنومی توسط کیت تجارتی و براساس دستورالعمل الحاقی آن صورت پذیرفت. آغازگرهای مورد مطالعه، براساس مناطق محافظت شده در توالی ژن آمیلوژنین در بانک ژن و مطابق مرور منابع انجام شده انتخاب و سنتز گردید. متعاقبا، واکنش زنجیره پلی مراز طبق پروتکل های استاندارد موجود بهینه سازی شد. نتایج پژوهش حاضر، وجود تفاوت الگوی باندی بین جنس نر و ماده را نشان داد. اندازه باند تکثیر شده توسط آغازگرهای یکسان، بسته به نوع گونه و هم چنین نژاد، داخل هر گونه متغیر بود اما الگوی تفکیکی تقریبا مشابهی را بین نر و ماده ایجاد می کرد. هم چنین، الگوهای الکتروفورزی، در بعضی گونه ها به طور اجتناب ناپذیری همراه یک باند کاذب بود که خوشبختانه در پروسه تعیین جنسیت اختلال ایجاد نمی کرد. تخمین اندازه موثر جمعیت از روی نتایج حاصل در گوزن نشان داد تعداد نرها کم تر از حد معقول بود چراکه باید نسبت نر وماده در زمان جفتگیری متناسب باشد (معمولا بسته به نژاد و سن گوزن نسبت 4(نر) به 12 (ماده) است). در نهایت تفاوت واریانت های نوکلیوتیدی اختصاصی بین ژن های آمیلوژنین را می توان ابزاری مناسب برای پیش انتخاب و شناسایی جنسیت دانست.
کلید واژگان: تعیین جنسیت, ژن آمیلوژنین, واکنش زنجیره پلی مراز, علف خواران}in the breeding system, often one livestock is more valuable than the other the purpose of the present study was to use specific nucleotide variants between the amelogenin genes for sex determination in wild and domestic herbivores (sheep, goat, cattle and deer). For this purpose, whole blood and dung were about 59 studied animals were prepared and genomic DNA was extracted by commercial kit according to its supplementary instructions. The primers studied were selected and synthesized based on conserved regions in the phylogenetic gene sequence in the Gene Bank. The polymerase chain reaction was optimized according to existing standard protocols. The results clearly showed the existence of a bond pattern difference between males and females. The amplified band size of these identical primers varied depending on the species and the breed within each species. In some species, the electrophoretic patterns were inevitably coupled to a false band, which fortunately did not interfere with the sex determination process (Usually depending on race and age of deer is 4 (male) to 12 (female)). According to the observations obtained in this study, differences in specific nucleotide variants between Amelogenin genes can be considered as a suitable tool for pre-selection and sex identification in animal species.
Keywords: Sex verification, Amylogenin gene, Polymerase Chain Reaction} -
زمینه مطالعه
بیماری نیوکاسل یکی از مخرب ترین بیماری های ویروسی طیور در سرتاسر جهان است.
هدفبا توجه به اینکه روش های سنتی قابلیت محدودی در کنترل این بیماری دارند، انجام این مطالعه به منظور استفاده از تکنولوژی های نوین برای تشخیص به موقع بیماری جهت کاهش خسارت پیش روی صنعت طیور می باشد.
روش کاراستخراج RNA با استفاده از کیت RNease mini و بر اساس دستورالعمل شرکت سازنده انجام شد. RNA استخراج شده با 109×23/68 رونوشت اولیه به صورت سری رقت های μL 100، برای انجام واکنش RT-PCRو RRT-PCR تهیه شد. واکنش RT-PCR با استفاده از کیت RNease mini و واکنش RRT-PCR با استفاده از کیت تجاری (شرکت Genekam Biotechnology، آلمان) انجام شد.
نتایجبرای روش RRT-PCR تا سری رقت تهیه شده 34-10 تکثیر صورت گرفت و برای روش RT-PCR تا سری رقت تهیه شده 20- 10 بر روی ژل آگارز 5/ 1٪ باند مشاهده شد. براساس نتایج مشاهده شده روش RRT-PCR قادر به تشخیص 34-10×1رونوشت و روش RT-PCR قادر به تشخیص 20-10×1 رونوشت از نمونه اولیه است.
نتیجه گیری نهایی: حساسیت روش RRT-PCR تقریبا دو برابر روش RT-PCR است و در مقایسه با روش RT-PCR، قادر به تشخیص ویروس بیماریزای نیوکاسل در نمونه های آلوده ای با 10000 برابر رونوشت کمتر از RNA ویروسی می باشد.کلید واژگان: ویروس بیماری نیوکاسل, تشخیص, RRT, PCR, RT, حساسیت}BackgroundNewcastle disease is one of the most serious viral diseases in the poultry worldwide.
ObjectivesSince the traditional strategies have been hardly effective in controlling the disease, the purpose of this study was to introduce new methods for early and rapid diagnosis of Newcastle. The present study helps to reduce further damage to the poultry industry.
MethodsRNA extraction was performed, using RNease mini kit, according to the manufacturer’s instructions. Extracted RNA with 68.23×109 copy numbers was prepared as serial dilutions of 100 μL for RT-PCR and RRT-PCR reactions. RRT-PCR and RT-PCR were performed, using commercial kit and RNease mini kit, respectively.
ResultsResults showed that amplification was done according to prepared dilution equal 10-34 for RRT-PCR reaction and a visible band observed on 1.5% Agarose gel up to 10-20 for RT-PCR reaction. Based on the results observed, RRT-PCR and RT-PCR reactions are able to detect 10-34 and 10-20 copy numbers of primary sample, respectively.
ConclusionsThe sensitivity of RRT-PCR reaction is almost twice compared with RT-PCR reaction, also RRT-PCR reaction is able to diagnose Newcastle disease virus in infected samples with 10,000 copy numbers of the RNA virus less than RT-PCR.
Keywords: diagnosis, Newcastle disease virus (NDV), RRT, PCR, RT, sensitivity} -
به منظور شناسایی چند شکلی جمعیت مرغان بومی مازندران و اصفهان با استفاده از نشانگرهای ریز ماهواره ای، 20 نشانگر ریز ماهواره به نام های MCW0014، MCW0081، MCW0183، MCW0067، MCW0104، MCW0123، MCW0330، MCW0165، MCW0069، MCW0020، MCW0222، LEI0094،MCW0295، MCW0034، MCW0216، ADL0268، ADL0112، ADL0278و lEI0166 مورد بررسی قرار گرفتند. نمونه خون به ترتیب از 90 و 150 مرغ بومی مرکز اصلاح نژاد مرغ بومی در مازندران و اصفهان به صورت تصادفی اخذ گردید و تخلیص DNA به روش بهینه شده استخراج نمکی انجام گرفت. تعداد آلل ها بین 6-1 عدد متغیر بودند. در جمعیت مازندران فقط جایگاه MCW0216 و در جمعیت اصفهان جایگاه های MCW0216، MCW67 و MCW222 تک شکل بودند. سایر جایگاه ها از چند شکلی مناسبی برخوردار بودند. به غیر از دو جایگاه MCW222 و MCW165 در جمعیت مازندران، سایر جایگاه ها انحراف معنی داری را در سطح پنج درصد از تعادل هاردی وینبرگ دارا بودند. دامنه هتروزیگوسیتی برای این جایگاه ها بین 7437/0 (در جایگاه LEI0094) در جمعیت اصفهان و 2472/0 (در جایگاه MCW165) در جمعیت مازندران مشاهده شد. کمترین مقدار آلل موثر در هر دو جمعیت متعلق به جایگاه MCW216 و بیشترین آلل موثر مربوط به جایگاه LEI0094 در جمعیت اصفهان بود. بیشترین PIC در جایگاه MCW0104 در جمعیت اصفهان و کمترین PIC در جایگاه MCW165 در جمعیت مازندران دیده شد. در هر دو جمعیت جایگاه های دو آللی کمترین مقادیر شاخص شانون را نشان دادند. جایگاه های با آلل های بیشتر شاخص شانون بالاتری داشتند. به طور کلی میزان چند شکلی جمعیت-های مورد مطالعه نسبتا پایین بود.
کلید واژگان: جایگاه ژنی, چند شکلی, آلل موثر, هتروزیگوسیتی}In order to studying of genetic variation in Mazandaran and Esfahan native chickens، twenty microsatellite markers were evaluated. These microsatellite markers were MCW0014، MCW0081، MCW0183، MCW0067، MCW0104، MCW0123، MCW0330، MCW0165، MCW0069، MCW0020، MCW0222، LEI0094، MCW0295، MCW0034، MCW0216، ADL0268، ADL0112، ADL0278 and lEI0166. Blood samples of 90 and 150 native chickens of Mazandaran and Esfahan were randomly taken respectively. Genomic DNAs were isolated through optimized and modified salting-out procedure. The number of alleles varied from 1 to 6. In Mazandaran population one locus (MCW0216) and in Esfahan population three loci (MCW0216، MCW67 and MCW222) were monomorphic. The other loci were showed appropriate polymorphism. All the loci except MCW222 and MCW165 in Mazandaran population showed deviations from Hardy-Weinberg equilibrium (p)
Keywords: locus, polymorphism, effective allele, heterozygosity}
- در این صفحه نام مورد نظر در اسامی نویسندگان مقالات جستجو می‌شود. ممکن است نتایج شامل مطالب نویسندگان هم نام و حتی در رشته‌های مختلف باشد.
- همه مقالات ترجمه فارسی یا انگلیسی ندارند پس ممکن است مقالاتی باشند که نام نویسنده مورد نظر شما به صورت معادل فارسی یا انگلیسی آن درج شده باشد. در صفحه جستجوی پیشرفته می‌توانید همزمان نام فارسی و انگلیسی نویسنده را درج نمایید.
- در صورتی که می‌خواهید جستجو را با شرایط متفاوت تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مطالب نشریات مراجعه کنید.
©2000-2024 magiran.com All Rights Reserved.