به جمع مشترکان مگیران بپیوندید!

تنها با پرداخت 70 هزارتومان حق اشتراک سالانه به متن مقالات دسترسی داشته باشید و 100 مقاله را بدون هزینه دیگری دریافت کنید.

برای پرداخت حق اشتراک اگر عضو هستید وارد شوید در غیر این صورت حساب کاربری جدید ایجاد کنید

عضویت

فهرست مطالب mohammad shenagari

  • Mohammad Shenagari, Hanieh Mohammadi-Pilehdarboni

    Cancer treatment has witnessed a profound transformation in recent decades, with combination therapy emerging as a beacon of hope for patients. This review delves into the groundbreaking synergy between immunotherapy and targeted oncolytic viruses, offering a glimpse into the future of cancer conquering. Traditional methods like surgery, radiation, and chemotherapy have limitations, especially in advanced or metastatic cancers. Immunotherapy, inspired by the body's innate defenses, leverages the immune system to selectively identify and eradicate cancer cells. Immune checkpoint inhibitors, such as pembrolizumab and nivolumab, have showcased remarkable success in clinical trials, unlocking the potential of the immune system against once-intractable cancers. In tandem, oncolytic viruses exhibit precision targeting, minimizing harm to healthy tissues. Notably, herpes simplex virus type 1 (HSV-1) has proven effective against various malignancies. The fusion of immunotherapy and oncolytic viruses represents a paradigm shift in cancer treatment, harnessing the strengths of each modality. This review explores mechanisms, recent developments, clinical triumphs, and the challenges of combination therapy. The dynamic synergy of these two approaches promises to revolutionize cancer treatment, transforming it from an insurmountable foe into a manageable condition.

    Keywords: Immunotherapy, Oncolytic viruses, Combination therapy, Immune checkpoint inhibitors, Cancer treatment}
  • طاهره زینلی، نیلوفر فرجی، فرحناز جوکار، سامان معروفی زاد، محمد شناگری، محمدرضا نقی پور، فریبرز منصور قناعی*
    پیش زمینه و هدف

    داشتن آگاهی درست از تشخیص های آزمایشگاهی مثل ارتباط بین مقدار آستانه چرخه  (Ct Value)ویا میزان بار ویروس SARS-CoV-2  می تواند بعنوان یک عامل پیش بینی کننده از خطر عفونت سویه های جدید ویروس SARS-CoV-2 برای بیماران مبتلا به کووید-19 به کار رود. این مطالعه بر اساس این فرضیه که مقدار Ct ویروس SARS-CoV-2 می تواند به عنوان یک بیومارکر از شدت بیماری، پیامد بالینی و مرگ و میر بیماران عمل کند، انجام شد.

    مواد و روش کار

    در این مطالعه تحلیلی، نتایج تست qRT-PCR ویروس SARS-COV-2، 443 بیمار بستری در بیمارستان های دولتی شهرستان رشت در طی سال 1400-1399 بررسی شد و سپس، ارتباط بین وضعیت Ct بیماران با بار ویروسی بالا (25 ≥Ct) و با بار ویروسی پایین (25 <Ct) با مشخصات دموگرافیک و بالینی تعیین گردید.

    یافته ها

    مقادیرCt  در بیماران فوتی نسبت به بیماران ترخیص شده، به صورت معناداری پایین تر بود (005/0=P)؛ هم چنین مقادیرCt  در بیمارانی که در ICU بستری شده بودند، به صورت معناداری پایین تر از بیمارانی بود که در بخش های کنترل عفونت بستری شده بودند (002/0=P). بر اساس نتایج تحلیلی تعدیل شده، داشتن بار ویروس زیاد (25 ≥Ct) شانس فوت درون بیمارستانی (28/11 - 36/2 :CI 95%, 16/5=OR) و بستری در ICU درون بیمارستانی (28/11 - 36/2 :CI 95%, 87/6=OR) را افزایش می دهد.
    بحث و  

    نتیجه گیری

    در بیماران بستری شده با کووید-19، بار ویروسیSARS-CoV-2  با مرگ و میر و بستری در بخش ICU ارتباط داشت. این یافته ها نشان می دهد که مقدار Ct می تواند به عنوان ابزاری برای کمک به شناسایی بیمارانی که در معرض خطر بیشتری برای پیامدهای شدید بیماری کووید-19 هستند، استفاده شود.

    کلید واژگان: پیامدهای بالینی, مقادیر آستانه چرخه (Ct), کووید-19}
    Taherehtahereh Zeinali, Niloofar Faraji, Farahnaz Joukar, Saman Maroufizadeh, Mohammad Shenagari, Mohammadreza Naghipour, Fariborz Mansour-Ghanaei*
    Background & Aim

    The precise knowledge of laboratory diagnostics such as the association between the cycle threshold (Ct) or the SARS-CoV-2 virus load can be used as a predictor of the infection risk with new strains of the SARS-CoV-2 virus for patients with Covid-19. This study was conducted based on the hypothesis that the Ct value of SARS-CoV-2 can also serve as a biomarker of disease severity, clinical outcome, and patient mortality.

    Materials & Methods

    In this cross-sectional study, the SARS-COV-2 qRT- PCR results of 443 hospitalized patients during 2019-1400 were examined, then the association between Ct with high viral load (Ct≤25) and lower viral load Ct >25 was determined.

    Results

    Ct values in dead patients were significantly lower than discharged patients (P=0.005); Also, Ct values in the patients hospitalized in ICU were significantly lower than the patients hospitalized in Infection Control Units of the hospitals (P=0.002). Based on the adjusted analytical results, a high viral load (Ct≤25) increase chance of in-hospital death (OR=5.16, 95% CI: 2.36-11.28) and hospitalization in ICU (OR=6.87, 95% CI: 2.36-11.28).

    Conclusion

    In hospitalized patients with Covid-19, SARS-CoV-2 viral load was associated with mortality and hospitalization in the ICU. These findings show that the Ct value can be used as a tool to help identify patients who are at higher risk for severe outcomes of Covid-19 disease.

    Keywords: Clinical Outcomes, Covid-19, Cycle threshold (Ct)}
  • Mohammad Shenagari, Masoud Bakhtiari, Ali Mojtahedi, Zahra Atrkar Roushan
    Objective(s)
    Regarding the global burden of uropathogenic Escherichia coli (UPEC) infections, prevention and treatment of such infections play a significant role in healthcare management. The inordinate use of fluoroquinolones led to a worldwide spread of quinolone-resistant strains. Therefore, this study aimed to investigate mutations in codons 83 and 106 of gyrA gene in UPEC isolates in the north of Iran.
    Materials and Methods
    This cross-sectional study performed on a total of 223 UPEC isolates which were recovered within 6 months in 2017. Isolates were identified and confirmed by standard microbiologic tests, and antimicrobial susceptibility testing was carried out by disk diffusion and E-test methods. PCR reaction was performed to amplify gyrA gene, and PCR-RFLP was performed using BsiEI and BstU I restriction enzymes to investigate mutations in gyrA gene.
    Results
    The nalidixic acid, ciprofloxacin, ofloxacin, and norfloxacin resistance rates were 61.9%, 50.2%, 48.25, and 45.3%, respectively. Overall, 55.2% of E. coli isolates had a mutation in gyrA gene in codon 83, and 20.2% in codon 106. Also, 15.2% of isolates had simultaneously mutation. Moreover, a significant association was found between mutations in gyrA gene and quinolone and fluoroquinolones resistance pattern of UPEC isolates.
    Conclusion
    Our results revealed a high level of quinolone resistance associated with the mutations in gyrA among the clinical isolates of UPEC in our region. To the best of our knowledge, this study is the first investigation on the role of gyrA alteration in quinolone resistance among UPEC isolates from the north of Iran
    Keywords: Antibiotic resistance, gyrA, PCR-RFLP, Quinolone, Uropathogenic Escherichia coli}
  • Setareh Yousefi, Ali Mojtahedi *, Mohammad Shenagari
    Background

    Urinary tract infection (UTIs) caused by Escherichia coli is one of the most common human complications. The discriminate use of antibiotics leads to increasing multiple-drug resistance (MDR) in E. coli.

    Objectives

    This study aimed at investigating the frequency of fluoroquinolones resistance by detecting qnr genes and mutation in gyrA gene in clinical isolates of E. coli in the North of Iran.

    Methods

    This cross-sectional study was conducted on 309 E. coli isolates collected from major hospitals in Rasht, North of Iran. All isolates were identified by standard microbiological methods. Antimicrobial susceptibility testing was conducted by the disk diffusion method for the three quinolone antibiotics. The detection of gyrA, qnrS, qnrB, and qnrA genes was performed by the polymerase chain reaction (PCR) method. PCR products of gyrA gene were digested by HinfI enzyme to identify the mutation in gyrA gene by restriction fragment length polymorphism (RFLP) method.

    Results

    Of 309 tested E. coli isolates, the most common resistance was observed against nalidixic acid (60.2%) and the least common one against norfloxacin (40.5%). The prevalence of qnrS, qnrB, and qnrA genes was 4.5%, 73.1%, and 62.8%, respectively. Mutation in gyrA gene was observed in codon 83 in 56.3% of the strains.

    Conclusions

    In summary, despite the significant association of the investigated genes with fluoroquinolones resistance in these bacteria, the presence of these genes in susceptible strains suggested that some other possible mechanisms may also influence resistance against fluoroquinolones

    Keywords: Escherichia coli, Antibiotic Resistance, DNA Gyrase, qnr Genes}
  • لیلا زارع، محمد شناگری *، محمد علی خان میرزایی، علی مجتهدی
    زمینه و اهداف
    در این مطالعه باکتریوفاژ لیتیک موثر بر اشریشیا کلی مقاوم به درمان جداشده از نمونه زخم بیماران مبتلابه دیابت نوع دو جداسازی گردید.
    مواد و روش کار
    دو نمونه مختلف از زخم بیماران بستری در بیمارستان رازی رشت گرفته شد و سویه های اشریشیا کلی جداسازی شده با روش های استاندارد شناسایی شدند. نمونه برداری از فاضلاب همان بیمارستان برای جداسازی فاژ لیتیک انجام شد. از روش آگار دولایه برای جداسازی و مشاهده پلاک استفاده گردید. برای تعیین واکنش کراسینگ فاژ روی سویه های باکتری جداسازی شده و 5 سویه استاندارد اشریشیا کلی انجام گردید. درنهایت برای تایید و بررسی مرفولوژیکی از میکروسکوپ الکترونی گذاره استفاده شد. مورفوتیپ و خانواده فاژ جداشده بر اساس طبقه بندی Bradley و نسخه نهایی گزارش International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV)، به ترتیب مشخص گردید.
    یافته ها
    نتایج نشان داد که باکتری های جداشده مقاومت بالایی در برابر آنتی بیوتیک های استفاده شده دارند. بر مبنای خصوصیت مورفولوژیک، ویروس جداشده متعلق به خانواده siphoviridae بود. بر مبنای طبقه بندی Bradley فاژ جداشده برعلیه سویه های اشریشیا کلی متعلق به مورفوتایپ B1 بود.
    نتیجه گیری
    فاژ جداشده در این مطالعه می تواند به طور موثر سویه های اشریشیا کلی بیماری زا جداشده از زخم بیماران دیابتی را لیز کنند. درنتیجه شاید بتوان به عنوان یک عامل درمانی موثر در برابر عفونت های مقاوم به درمان مربوط به این باکتری در داخل بدن در مطالعات آینده استفاده شود.
    کلید واژگان: باکتریوفاژ, مقاومت آنتی بیوتیکی, اشریشیاکلی, دیابت, عفونت زخم}
    Leyla Zare, Mohammad Shenagari*, Mohammad Ali Khanmirzaei, Ali Mojtahedi
    Background And Aim
    In the present study, we have tried to isolate an effective lytic bacteriophages on drug-resistant Escherichia coli isolated from diabetic ulcer wounds.
    Materials And Methods
    Two E.coli strains were isolated by using standard methods from patients in Razi Hospital of Rasht. Waste water of the same hospital was used as a source for isolation of lytic bacteriophages. Agar layer method was used to isolate and plaque finding. Determination of host range of isolated phages was performed using five standard reference collection of E. coli. Finally, Transmission electron microscopy was used for morphological analysis of the isolated bacteriophages. Morphotype and family of isolated phages were determined based on Bradley recommendation and final version of International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) report, respectively.
    Results
    The results showed that the isolated bacteria were highly resistant to the antibiotics tested. Based on morphological characteristics, the separated virus belongs to siphoviridae family. Based on Bradley classification, isolated phage against strains of E.coli belongs to the morphotype B1.
    Conclusions
    The isolated bacteriophage from waste water efficiently lysed the multiresistant strains of E. coli. Therefore, bacteriophages could potentially be used as an alternative for antibiotics for treating infections by multiresistant E. coli.
    Keywords: Bacteriophage, Antibiotic Resistance, Escherichia coli, Diabetes, Wound infection}
  • Mehran Nemattalab*, Mohammad Shenagari, Ali Mojtahedi, Mohammad Reza Aghasadeghi, Mohammad Hassan Pouriayevali, Mojtaba Taheri, Mahdieh Mondannizadeh
    Introduction

    Helicobacter pylori (H. pylori) infection has remained as a global health problem. Animal studies demonstrated the role of H. pylori oipA gene in the development of gastric cancer. The aim of this study was the cloning and expression of Helicobacter pylori oipA gene in a bicistronic vector harboring mice IL-18 gene.

    Materials and methods

    The target gene encoding oipA was amplified from a codonoptimized clone by PCR, and then double-digested by restriction enzymes. The pIRESIgk/mIL18/Fc plasmid was simultaneously digested by BstXI/NotI enzymes to elicit the eGFP segment. PCR product of oipA was inserted into pIRES-Igk/mIL18/Fc plasmid using T4 ligase. Transformation into DH5α strain was done. Cloning was confirmed by PCR, enzymatic digestion and sequencing. Expression of the oipA and IL-18 mRNA was assessed by means of TaqMan Real-time PCR.

    Results

    Electrophoresis of PCR product, enzymatic digestion and sequencing showed that the H. pylori oipA gene was successfully cloned into pIRES-Igk/mIL18/Fc to generate mIL18-pIRES2-oipA plasmid. The results of Real-time PCR confirmed the successful expression of both oipA and IL-18 in mouse macrophage cell line.

    Conclusion

    Considering the role of oipA in pathogenesis of H. pylori and potent activity of IL-18 as a molecular adjuvant, the results of the present study showed that the expression of codon-optimized oipA gene in bicistronic vector including mouse IL-18 is successful. So, it could be considered as an appropriate genetic vaccine candidate for H. pylori in future investigations.

    Keywords: Cloning, Codon-optimization, oipA gene, Mouse IL-18, Bicistronic vector}
  • مجتبی طاهری، محمد شناگری، ایرج نیکوکار، محمود خسروی، مهران نعمت طلب
    مقدمه
    در حال حاضر واکسیناسیون مهمترین استراتژی در کاهش آمار مبتلایان و مرگ و میر سالیانه ناشی از آنفلوانزا فصلی تلقی می گردد. بر خلاف آنتی ژنهای سطحی مورد استفاده در ترکیب واکسن های موجود، پروتئین های داخلی ساختاری و غیر ساختاری ویروس آنفلوانزا به خوبی حفاظت شده هستند. با توجه به سطح حفاظت شدگی نسبتا بالای نوکلئوپروتئین ویروس آنفلوانزا و قابلیت ادجوانتی IL-18 در تحریک پاسخ های ایمنی و شیفت به Th1، این مطالعه در صدد ساخت یک پلاسمید دوسیسترونی با قابلیت بیان ژن های NP و IL-18 موشی بود تا در صورت نیل به این هدف به عنوان یک کاندید واکسن قابلیت ایمنی زایی آن در مطالعات بعدی مورد ارزیابی قرار گیرد.
    مواد و روش ها
    در مرحله اول RNA ژنومی ویروس آنفلوانزا تیپA سویه H1N1/ PR8 استخراج شد و پس از تولید cDNA، توالی ژن کد کننده ی NP با استفاده از پرایمر اختصاصی ژن و با روش PCR تکثیر شد. در مرحله ی بعد ژن NP در وکتور کلونینگ pJET1.2/blunt همسانه سازی شد. پس از تایید صحت کلونینگ ژن در وکتور pJET1.2/blunt از طریق تعیین توالی، هضم آنزیمی و PCR، قطعه مزبور توسط هضم آنزیمی دو گانه خارج گردید. پلاسمید pIRES-Igk/mIL18/Fc با استفاده از آنزیمهای BstXI/NotI هضم دوگانه شد و قطعه مربوط به eGFP خارج شد. سپس فرآیند الحاق ژنNP در وکتور دوسیسترونی pIRES-Igk/mIL18/Fc هضم شده با استفاده از آنزیم T4 Ligase صورت پذیرفت. محصول لیگاسیون به سویه استاندارد DH5α ترانسفورم شد و انتخاب کلونی های مثبت با استفاده از PCR colony صورت پذیرفت. به منظور بررسی صحت کلونینگ از تست PCR، هضم آنزیمی و تعیین توالی استفاده شد. در نهایت بیان ژن NP و IL-18 از سازه ژنی mIL-18-pIRES2-NP در رده سلولی BHK-21 و RAW264.7 ترانسفکت شده با پلاسمید به وسیله ی رنگ آمیزی ایمنوفلورسنت غیر مستقیم و الایزا مورد ارزیابی قرار گرفت.
    نتایج
    نتایج PCR، هضم آنزیمی و تعیین توالی با استفاده از پرایمرهای اختصاصی به صورت دو جهته نشان داد که ژن NP ویروس آنفلوانزا در وکتور pIRES-Igk/mIL18/Fc به صورت موفق و در جهت درست کلون شده است. ترانسفکشن و بررسی قابلیت بیان سازه ژنی mIL-18-pIRES2-NP با استفاده از رنگ آمیزی ایمنوفلوئورسانس و الایزا بیان موفق آمیز ژنهای NP و IL-18 از mIL-18-pIRES2-NP در سلول یوکاریوتی را اثبات کرد.
    بحث و نتیجه گیری
    نتایج بدست آمده در این تحقیق بیان موفقیت آمیز ژن NP و IL-18 از سازه mIL-18-pIRES2-NP را نشان داد. با توجه به اثرات ادجوانتی سایتوکاین IL-18، پلاسمید ساخته شده می تواند به عنوان یک کاندید مناسب واکسن ژنی برای پیش گیری از عفونت ناشی از ویروس آنفلوانزا در مطالعات ارزیابی ایمنولوژیک آتی مطرح گردد.
    کلید واژگان: آنفلوانزا, واکسن ژنی, ژن NP, اینترلوکین18}
  • محمد شناگری، فرزانه صباحی، معصومه توسطی خیری، کامبیز فرقان پرست، عباس جمالی، حمیدرضا هاشمی، شادی خدامرادی
    هدف
    در این پژوهش در راستای راه اندازی یک واکسن جامع براساس واکسن ژنی، دو ژن محافظت شده در سویه ها و زیرگونه های مختلف ویروس آنفلوانزا (M1 و نوکلئوپروتئین) در ناقل دوسیسترونی یوکاریوتی بیان شد.
    مواد و روش ها
    پلاسمیدهای M1-pIRES2-EGFP و pIRES2-NP به ترتیب با کلون کردن محصولات PCR ژن های M1 و نوکلئوپروتئین برگرفته از ویروس آنفلوانزا H1N1 سویه A/Peurto Rico/8/34 در داخل ناقل بیانی pIRES2-EGFP ساخته شد. به منظور ساخت پلاسمید دو سیسترونی M1-pIRES2-NP، ژن M1 از پلاسمید M1-pIRES2-EGFP استخراج و در پلاسمید pIRES2-NP ساب کلون شد. در نهایت بررسی بیان این دو پروتئین در سلول های یوکاریوتی با ترانسفکشن کلون ساخته شده به داخل سلول BHK-21 با استفاده از ایمونوفلوئورسنس غیر مستقیم انجام شد.
    نتایج
    موفقیت در کلونینگ صحیح ژن های مذکور با هضم آنزیمی و تعیین توالی قطعات کلون شده به اثبات رسید. بیان صحیح این دو ژن در سلول های یوکاریوتی با ترانسفکشن این کلون در رده سلولی BHK-21 و بررسی با روش ایمونو فلورسنس به اثبات رسید.
    نتیجه گیری
    بیان همزمان دو ژن M1 و نوکلئوپروتیئن ویروس آنفلوانزا در یک سازه ژنی با واسطه توالی IRES ممکن است.
    کلید واژگان: ویروس آنفلوانزا, ناقل دو سیسترونی, ژن M1, ژن نوکلئوپروتئین, بیان همزمان}
    Mohammad Shenagari, Farzaneh Sabahi, Masoumah Tavasoti Kheiri, Kambiz Forghan Parast, Abbas Jamali, Hamidreza Hashemi, Shadi Khodamoradi
    Objective
    In this study, two conserved genes (M1 and NP) of influenza virus were expressed in a bicistronic vector in order to develop a universal gene based vaccine.
    Materials And Methods
    Plasmids M1-pIRES2-EGFP, pIRES2-NP were constructed by cloning the PCR products of M1 and NP genes which were amplified from the A/Peurto Rico/8/34 (H1N1) influenza virus strain into the plasmid expression vector pIRES2-EGFP, respectively. For construction of M1-pIRES2-NP bicistronic plasmid, M1 gene was extracted from M1-pIRES-EGFP plasmid and sub-cloned into pIRES2-NP construct. Finally, simultaneous expression of both genes was assessed by transient transfection of bicistronic plasmid into BHK-21 cell lines and subsequent immunofluorescence staining.
    Results
    The results of enzymatic double digestions on the constructed plasmids and sequencing demonstrated the success of cloning processes of above mentioned genes. Correct expression of these genes was confirmed by M1-pIRES2-NP plasmid expression in BHK-21 cell lines confirmed by immunofluoresence microscopy.
    Conclusion
    Simultaneous expression of influenza M1 and NP genes from a bicistronic plasmid containing “IRES” sequence is achievable.
بدانید!
  • در این صفحه نام مورد نظر در اسامی نویسندگان مقالات جستجو می‌شود. ممکن است نتایج شامل مطالب نویسندگان هم نام و حتی در رشته‌های مختلف باشد.
  • همه مقالات ترجمه فارسی یا انگلیسی ندارند پس ممکن است مقالاتی باشند که نام نویسنده مورد نظر شما به صورت معادل فارسی یا انگلیسی آن درج شده باشد. در صفحه جستجوی پیشرفته می‌توانید همزمان نام فارسی و انگلیسی نویسنده را درج نمایید.
  • در صورتی که می‌خواهید جستجو را با شرایط متفاوت تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مطالب نشریات مراجعه کنید.
درخواست پشتیبانی - گزارش اشکال