به جمع مشترکان مگیران بپیوندید!

تنها با پرداخت 70 هزارتومان حق اشتراک سالانه به متن مقالات دسترسی داشته باشید و 100 مقاله را بدون هزینه دیگری دریافت کنید.

برای پرداخت حق اشتراک اگر عضو هستید وارد شوید در غیر این صورت حساب کاربری جدید ایجاد کنید

عضویت
فهرست مطالب نویسنده:

safaie n

  • آزاده گودرزی، ناصر صفایی*، مراد جعفری، سید باقر محمودی، مسعود توحیدفر
    بیماری های قارچی از عوامل عمده کاهش رشد و باروری چغندرقند در سراسر جهان به شمار می روند. بیان پروتئین های مرتبط با بیماری زایی نظیر کیتینازها، یکی از پاسخ های دفاعی گیاهان در مقابل بیمارگرهای قارچی به شمار می رود. آنزیم های کیتیناز از طریق تجزیه دیواره های سلولی قارچی، در افزایش مقاومت گیاهان در مقابل دامنه گسترده ای از قارچ های بیماری زا نقش قابل توجهی دارند. در این تحقیق از دو رقم دیپلوئید چغندرقند، SBSI-02 و SBSI-04، جهت تراریختی با Agrobacterium tumefaciens سویه LBA4404 حاوی پلاسمیدpBI-BCH حامل ژن کیتیناز (chi) تحت کنترل راه انداز CaMV 35S و ژن گزینشگر nptII استفاده شد. برگ های حاوی پایه جوانه به عنوان ریزنمونه در فرآیند تراریخت سازی به کار برده شدند. جوانه های سبز در محیط کشت MS حاوی غلظت های مختلف کانامایسین با موفقیت غربال شدند. آنالیز PCR با آغازگرهای اختصاصی ژن chi، حضور ژن هدف را در بیش از 50 درصد گیاهچه های مقاوم به کانامایسین تایید کرد. آنالیز لکه گذاری نقطه ای (Dot blot) درج حداقل یک نسخه از ژن هدف را در ژنوم گیاهان تراریخته احتمالی تایید نمود. آنالیز وسترن بلات تجمع پروتئین کیتیناز را در گیاهان تراریخته آشکار نمود. آزمون های زیست سنجی با استفاده از قطعات جدا شده برگ و در سطح گیاه کامل، مقاومت افزایش یافته لاین های تراریخته T0 چغندرقند در برابر بیمارگر قارچی Alternaria alternata را در مقایسه با گیاهان شاهد غیرتراریخته آشکار ساخت.
    کلید واژگان: چغندرقند Beta vulgaris L, ), Agrobacterium tumefaciens), تراریختی, ژن کیتیناز, Alternaria alternata
    Goudarzi A., Safaie N.*, Jafari M., Mahmoudi S.B., Tohidfar M
    Fungal diseases are the major factors of sugar beet yield losses worldwide. Expression of pathogenesis-related proteins such as chitinases is considered as one of the plant defense responses against pathogens. Chitinases are cell wall degrading enzymes which have been shown to have high antifungal activity against a wide range of phytopathogenic fungi. In this study, two diploid sugar beet genotypes, SBSI-02 and SBSI-04, were used for transformation through Agrobacterium tumefaciens strain LBA4404 harboring the pBI-BCH plasmid containing the chi gene under the control of the CaMV35S promoter and the nptII selectable marker gene. Leaf blade with attached shoot bases were used as explant substratum for transformation. Green shoots were successfully screened using different concentration of kanamycin. PCR screening with chi-specific primer showed the presence of the transgene in more than 50% of regenerated kanamycin-resistant plants. Dot blot analysis confirmed the integration of at least one copy of the chi gene into the genome of putative transgenic plants. Western blot analysis revealed chitinase protein accumulation in transgenic plants. The content of chitinase protein varied among the five T0 transgenic plants. Bioassay analysis using detached leaves and at the whole plant level revealed increased resistance of T0 transgenic sugar beet lines against the fungal pathogen Alternaria alternata compared to non-transformed control plants.
    Keywords: Sugar beet (Beta vulgaris L.), Agrobacterium tumefaciens, chitinase gene, transformation, Alternaria alternata
  • فائزه سادات ابطحی، مسعود شمس بخش*، مجید مهدیه، ناصر صفایی
    ویروس لکه حلقوی بافت مرده هسته داران (Prunus necrotic ringspot virus، PNRSV)، ویروس موزائیک سیب (Apple mosaic virus، ApMV) و ویروس موزائیک آرابیس (Arabis mosaic virus، ArMV) از مهمترین ویروس های گل رز در دنیا به شمار می آیند. هدف از انجام این پژوهش ردیابی و تعیین پراکنش این ویروس ها در گلستان های گل محمدی واقع در استان های اصفهان، کرمان و مرکزی بود. به این منظور، 749 نمونه برگی طی دو سال زراعی 1391 و 1392 و بصورت تصادفی از این گلستان ها جمع آوری شدند. آلودگی این نمونه ها به PNRSV، ArMV و ApMV با استفاده از آزمون سرولوژیکی به روش الیزای مستقیم (Double Antibody Sandwich-ELISA، DAS-ELISA) و با استفاده از پادتن های اختصاصی برای هر کدام از سه ویروس، بررسی شد. نتایج نشان داد که در سال زراعی 1391، 4/41 درصد از نمونه ها به ArMV، 2/20 درصد از نمونه ها به ApMVو 6/3 درصد از نمونه ها به PNRSV و در سال زراعی 1392، 2/31 درصد از نمونه ها به ArMV، 5/32 درصد از نمونه ها به ApMV و 4/16 درصد از نمونه ها به PNRSV آلوده بودند. با توجه به این که پراکنش PNRSV نسبت به دو ویروس دیگر بیشتر بود، تعیین توالی ژن رمزکننده پروتئین پوششی PNRSV برای بررسی بیشتر جدایه های این ویروس انجام، درخت فیلوژنتیکی ترسیم و ماتریس درصد تشابه و ردیابی وقایع نوترکیبی انجام شدند. بر اساس درخت فیلوژنتیکی، جدایه-های ایرانی در گروه PV96 قرار گرفتند. این اولین گزارش از بررسی تنوع ژنتیکی PNRSV در ایران و اولین گزارش از وقوع آلودگی گلستان های گل محمدی استان های مرکزی و اصفهان به PNRSV، ApMV و ArMV می باشد.
    کلید واژگان: پروتئین پوششی, تعیین ترادف, ApMV, ArMV, PNRSV
    Abtahi Fs, Shams-Bakhsh M.*, Mahdiyeh M., Safaie N
    Prunus necrotic ringspot virus (PNRSV)، Apple mosaic virus (ApMV) and Arabis mosaic virus (ArMV) are important rose viruses in the world. The aims of this study were to detect the viruses and evaluate their distribution in damask rose floricultures of the Isfahan، Kerman and Markazi Provinces. To do this، total 749 leaf samples were collected randomly from floricultures of the mentioned provinces in 2012-13. Presence of the viruses in the samples was checked by DAS-ELISA using specific antibodies against each of the viruses. The result of ELISA test on collected samples in 2012 showed that 4. 41%، 2. 20% and 6. 3% of the samples were infected with ArMV، ApMV and PNRSV، respectively. These percentages for samples collected in 2013، were 2. 31%، 5. 32% and 4. 16%. Because of wider distribution of PNRSV in comparison to ArMV and ApMV، coat protein gene in four isolates of PNRSV was cloned and sequenced. Phylogenetic tree was drawn and recombination analyses were performed. Based on the phylogenetic tree، Iranian isolates were placed in PV96 phylogroup. This is the first report of genetic diversity of PNRSV in Iran and also the first incidence report of ArMV، ApMV and PNRSV in Isfahan and Markazi provinces.
    Keywords: ApMV, ArMV, Coat protein, PNRSV, Sequencing
  • معصومه امینی، ناصر صفایی، سید باقر محمودی
    بیماری پوسیدگی ریشه چغندرقند ناشی از قارچ Pythium aphanidermatum Fitzp، یکی از مهمترین بیماری های چغندرقند در ایران می باشد. جهت بررسی تنوع ژنتیکی عامل این بیماری، از مزارع چغندرکاری هشت استان کشور به تعداد 10 تا 20 نمونه از هر مزرعه، نمونه برداری شد. جدایه ها پس از خالص سازی، براساس خصوصیات ریخت شناسی اندام های رویشی و زایشی، شناسایی و 19 جدایه برای بررسی تنوع ژنتیکی انتخاب شدند. مطالعات مولکولی جدایه ها براساس نشانگر ISSR و با هشت آغازگر انجام شد. نتایج حاصل از تجزیه تحلیل خوشه ایآغازگرها بر اساس روش UPGMA و ضریب جاکارد، در سطح تشابه 64 درصد جدایه ها را به پنج گروه تقسیم کرد. نتایج حاصل از تجزیه و تحلیل سرعت رشد جدایه ها در دو دمای Co 2±26 و Co 2±29، توسط نرم افزار MSTATC و MVSP، جدایه ها را به دو گروه تند رشد و کند رشد تقسیم کرد. نتایج حاصل از تجزیه و تحلیل مولکولی و مورفولوژیکی نشان داد که جدایه های متعلق به این هشت ناحیه جغرافیایی، دارای قرابت ژنتیکی بوده و لزوما ارتباطی بین سرعت رشد جدایه ها و پراکنش جغرافیایی آنها وجود ندارد.
    کلید واژگان: پوسیدگی ریشه چغندرقند, تنوع ~ژنتیکی, صفات مورفولوژیکی, نشانگر ISSR, Pythium aphanidermatum Fitzp
    Amini M., Safaie N., Mahmoudy S.B
    Root rot disease is one of the most important sugar beet disease in Iran that infected by Pythium aphanidermatum Fitzp. For studying genetic diversity of this pathogen, 10-20 samples were collected from sugar beet fields in eight provinces of Iran. After purification, isolates were identified based on morphological characteristics of sexual and asexual organs and 19 isolates were selected in order to molecular diversity studies. ISSR analysis of all isolates was performed using eight primers. Results of phylogenetic tree of primers based on UPGMA method and Jacards similarity coefficient, were categorized isolates into five groups (64% similarity). The results of analysis of growth rate in two temperatures at 26±2Cº and 29±2Cº, by MSTATC and MVSP, was categorized isolates in to two groups with low growth and high growth rate. Analysis of morphological and molecular variation were indicated that isolates of this eight geographical regions have genetic relationship but there isnt necessary relationship between growth rate of isolate and their geographical distribution.
    Keywords: Genetic diversity, Pythium aphanidermatum Fitzp, Sugar beet root rot, ISSR marker
  • بهار یونسی، معسود شمس بخش، ناصر صفایی، فاطمه خلقتی بنا
    ویروس های Y (PVY)، X (PVX)، S(PVS) و پیچیدگی برگ (PLRV) سیب زمینی از مهم ترین ویروس های بیمارگر این گیاه به شمار می روند و به طور جدی سبب کاهش میزان و کیفیت محصول سیب زمینی می شوند. وقوع ویروس های یاد شده از اغلب مناطق اصلی کشت سیب زمینی در ایران نیز گزارش شده است. از این رو معرفی یک شیوه دقیق، سریع و ارزان برای ردیابی ویروس های یاد شده در مزارع تولید غده های بذری می تواند نقش مهمی در کنترل انتشار و خسارت آنها داشته باشد. در این پژوهش، روش Multiplex RT-PCR برای ردیابی همزمان ویروس های Y، X، S، پیچیدگی برگ سیب زمینی و ژن 18S rRNA به عنوان کنترل داخلی استفاده شد. سپس حساسیت این روش با آزمون سرولوژیکی الایزا که شیوه ای رایج برای ردیابی ویروس های سیب زمینی است، مقایسه گردید. ابتدا، RNA ی کل از برگ سیب زمینی آلوده به ویروس استخراج و سپس DNA مکمل برای ویروس های یاد شده و ژن 18S rRNA با استفاده از آغازگرهای اختصاصی معکوس به صورت جداگانه ساخته شد و واکنش RT-PCR برای هر کدام از ویروس ها و ژن 18S rRNA انجام گرفت. سپس واکنش Multiplex RT-PCR با استفاده از پنج جفت آغازگر انجام شد. در نهایت، پنج قطعه متفاوت (145-342 جفت باز) که اختصاصی ویروس ها و کنترل داخلی بودند به طور همزمان تکثیر شد و بر اساس وزن مولکولی آنها تشخیص داده شدند. همچنین حساسیت روش بهینه سازی شده Multiplex RT-PCR و Duplex RT-PCR در این مطالعه با روش تجاری DAS-ELISA در ردیابی ویروس های سیب زمینی مقایسه گردید. نتایج نشان داد که حساسیت Multiplex RT-PCR صد برابر بیشتر از آزمون الایزا در ردیابی ویروس های Y، S و پیچیدگی برگ سیب زمینی و حساسیت Duplex RT-PCR هزار برابر بیشتر از آزمون الایزا در ردیابی ویروس Y سیب زمینی بود.
    کلید واژگان: پیچیدگی برگ سیب زمینی, کنترل داخلی, ویروس های Y, X و S
    Younesi B., Shams Bakhsh M., Safaie N., Khelghatibana F
    Potato virus Y (PVY), Potato virus X (PVX), Potato virus S (PVS) and Potato leaf roll virus(PLRV), are the most important viruses of potato and can cause serious diseases andsignificantly reduce the yield and quality of potato crops. The incidence of these viruses isreported from almost all main potato growing regions in Iran. Therefore, application of a sensitive, rapid and inexpensive procedure for simultaneous detection of potato viruses is very important for management of their control. In the present research, a sensitive and reliable multiplex RT-PCR technique for the detection of PVY, PVX, PVS, PLRV and 18S rRNA as internal control was employed and compared with ELISA, the method used routinely to assay potatoes for virus infections. Total RNA was extracted from virus infected potato leaves. Then cDNA for above viruses and 18S rRNA was individually synthesized using their specific reverse primers and single RT-PCR for each virus and 18S rRNA. Subsequently, multiplex RT-PCR was carried out with five primer pairs in a single reaction. As a result, five different fragments (145-342 bp) specific to the viruses and the internal control were simultaneously amplified and were identified on the basis of their molecular sizes. The sensitivity of our optimized system also was compared with that of commercial DAS-ELISA for detection of PVY, PVS and PLRV. The results showed that the sensitivity of multiplex RT-PCR was 100-fold greater for detection of PVY, PVS and PLRV and the duplex RT-PCR was 1000-fold greater for detection of PVY than that of commercial DASELISA.
  • Darestani Farahani M., Safaie N., Alizadeh A
    Septoria leaf blotch is one of the most important wheat diseases worldwide includingIran. To study the genetic diversity of Iranian isolates of Septoria tritici, the infected samples were collected from Khuzestan, Golestan, Ardebil and Kermanshah provinces. Twenty six out of 88 recovered isolates were selected according to their geographical origins for studying virulence and their genetic diversity using RAPD analysis. Analysis of virulence of disease severity data was statistically significant at 99% confidence level (p<0.01). Comparison ofthe means of disease severity, using Duncan’s multiple range test, divided the isolates into five groups. In genetic diversity studies, Six out of 15 random primers were polymorphic and reproducible. Cluster analysis of DNA fingerprint data using UPGMA method and Jaccard's coefficient, divided the isolates into 8 groups at 35% similarity level showing a high genetic diversity among Iranian populations of S. tritici. According to number of clusters in which the isolates of each region were placed, the highest genetic diversity belonged to Ardebil. This is the first report on the study of genetic diversity of Iranian populations of S. tritici.
  • رضا کچویی، محمدحسین یادگاری*، ساسان رضایی، عبدالامیر علامه، ناصر صفایی، فریده زینی

    اهداف. گونه های فوزاریوم از مهم ترین قارچ ها هستند که مایکوتوکسین ها، به ویژه تریکوتسن ها، را تولید می کنند و سبب آلودگی مواد غذایی می شوند. هدف از مطالعه حاضر، شناسایی گونه ای از فوزاریوم از دسته اسپوروتریکیلا بود که مولد سم T-2 است و اخیرا از گندم انباری استان تهران جدا شده است.
    روش ها. این گونه به روش «فریز بلاتر» از گندم جدا و سپس به روش کشت تک اسپور، خالص شد. برای شناسایی از محیط های کشت CLA، SNA، PDA و PSA استفاده گردید. همه خصوصیات میکروسکوپی و ماکروسکوپی گونه فوزایوم جداشده مورد بررسی قرار گرفت. DNA ی قارچ از طریق PCR با استفاده از پرایمرهای اختصاصی فوزاریوم اسپوروترایکیوئیدس و فوزاریوم لانگستیه مورد ارزیابی قرار گرفت. در DNA ریبوزومی قارچ مورد نظر، نواحی ITS1 و ITS2 با استفاده از پرایمرهای جهانی ITS4 و ITS5 و همچنین قطعه ای از ژن TEF-1α این قارچ، با استفاده از پرایمرهای جهانی بیرونی (EF1 و EF2) و درونی تکثیر، خالص سازی و تعیین توالی شد.
    یافته ها. از نظر ریخت شناسی و توالی، ژن ITS کاملا مشابه فوزاریوم لانگستیه بود (گونه ای که اخیرا از اروپا گزارش شده است). لیکن بر اساس توالی، ژن TEF-1α با فوزاریوم اسپوروترایکیوئیدس گروه بندی شد.
    نتیجه گیری. این گونه برای اولین بار در ایران جدا شده و تاکنون موردی از جداسازی این گونه از آسیا گزارش نشده است. بنابراین، بررسی وسیعی روی غلات ایران از نظر وجود این دسته فوزاریوم ها و سم T-2 ضروری است.

    کلید واژگان: فوزاریوم لانگستیه, فوزاریوم اسپوروترایکیوئیدس, گندم
    Kachuei R., Yadegari M. H., Rezaie S., Allameh A., Safaie N., Zaini F

    Aims. Fusarium species are the most important group of fungi that produced a variety of mycotoxins which can contaminate food. The objective of the present study was presentation and identification of one isolate from Fusarium species belong to section of sporotrichiella, that recently isolated from stored wheat of Tehran province. Methods. This species isolated and purified by freeze blotter and single-spore method, respectively. Isolates cultured onto CLA, SNA, PDA and PSA. All microscopic and macroscopic characters studied. The DNA of this isolate amplified by PCR with F. sporotrichioides and F. langsethiae specific primers. Internal transcribed spacer (ITS) regions of isolate amplified, purified and sequenced using universal primers ITS4 & ITS5 and the fraction of TEF-1α gene also using external and nested primers. Results. On the basis of morphology and ribosomal internal, transcribed spacer (ITS) classified as F. langsethiae but on the basis of partial translation TEF-1α gene grouped with F. sporotrichioides. Conclusion. To our knowledge, this is the first report in Iran and Asia. Therefore, a large-scale monitoring of these fungi and T-2 toxin on wheat in Iran is necessary.

بدانید!
  • در این صفحه نام مورد نظر در اسامی نویسندگان مقالات جستجو می‌شود. ممکن است نتایج شامل مطالب نویسندگان هم نام و حتی در رشته‌های مختلف باشد.
  • همه مقالات ترجمه فارسی یا انگلیسی ندارند پس ممکن است مقالاتی باشند که نام نویسنده مورد نظر شما به صورت معادل فارسی یا انگلیسی آن درج شده باشد. در صفحه جستجوی پیشرفته می‌توانید همزمان نام فارسی و انگلیسی نویسنده را درج نمایید.
  • در صورتی که می‌خواهید جستجو را با شرایط متفاوت تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مطالب نشریات مراجعه کنید.
درخواست پشتیبانی - گزارش اشکال