فهرست مطالب waleed seger
-
Avian infectious bronchitis (IB), caused by a gammacoronavirus, is an OIE-listed (List B) disease and characterized by respiratory and renal involvements, causing high mortality, and economic loss in both layers and broilers. In comparison with other diagnostic methods, real-time polymerase chain reaction (RT-PCR) and conventional RT-PCR are potent, more sensitive and faster techniques for infectious bronchitis virus (IBV) detection. This research was conducted to detect IBV using specific primers of IB in three governorates (Basra, Thi-Qar and Muthana) in the south of Iraq. Tracheal specimens were collected from 46 IB suspected commercial broiler flocks. XCE2 and XCE2- Primers, which amplify all IBV serotypes, were used. Primers MCE1, BCE1 and DCE1 were used to amplify the specific nucleotide sequences of Massachusetts, 793/B and D274 genotypes, respectively. The results of real-time RT-PCR of this study showed that 34 (74.00%) out of 46 infected flocks were positive to IBV. The results of nested PCR showed that 50.00% and 5.89% of positive samples were belonged to genotypes 793/B and Massachusetts, respectively, and the remaining positive (44.11%) were unknown. The results indicate presence of Massachusetts and 793/B IBV strains in commercial broilers in southern Iraq.Keywords: Avian infectious bronchitis, Broiler, Iraq, Real, time RT, PCR}
-
زمینه مطالعهویروس برونشیت عفونی، عامل بیماری برونشیت عفونی از عوامل مهم در ایجاد خسارات اقتصادی در صنعت طیور دنیا می باشد. ویروس برونشیت عفونی به سروتیپ ها و ژنوتیپ های مختلفی طبقه بندی می شود. پروتئین اسپایک S) (~ 3462)، واقع در سطح غشاء ویروسی، القاء عمده ای از آنتی بادی های خنثی است و مسئول ویروس اتصال و ورود به سلول های میزبان است. جدایه های ویروس برونشیت عفونی بطور گسترده بوسیله سکانس ژن پروتئین s1 ژنوتایپینگ می شوند.هدفهدف از این مطالعه، ژنوتایپینگ جدید و طبقه بندی جدایه های ویروس برونشیت عفونی در ایران بر اساس پروتئین s2 می باشد.روش کارژن s2 نه جدایه ویروس برونشیت عفونی ابتدا توسط روش RT-PCR تکثیر داده شدند و مورد سکانس قرار گرفتند. سکانس آمینواسیدی این جدایه ها با سکانس جدایه های غیر ایرانی مورد مقایسه قرار گرفتند.نتایججدایه های ویروس برونشیت عفونی ایران به سه ژنوتیپ (I, VII, VIII) تقسیم بندی گردیدند. ژنوتیپ I شامل ویروس های مشابه سروتیپ ماساچوست بود. ژنوتیپ VII به دو شاخه تقسیم بندی شدند، اولین شاخه VIIa (مشابه IS-1494) و دومین شاخه VIIb نیز مربوط به ویروس های مشابه QX بودند. ژنوتیپVIIIشامل ویروس های مشابه 793/B بودند.
نتیجه گیری نهایی: مطالعه حاضر نخستین اطلاعات در مورد ژنوتایپینگ و طبقه بندی جدایه های ویروس برونشیت عفونی ایران می باشد .کلید واژگان: تعیین هویت, برونشیت عفونی, شجره شناسی, پروتئین S2, اسپایک}BackgroundAvian infectious bronchitis (IB), with avian infectious bronchitis virus (IBV) as the causing agent, is a ubiquitous endemic disease of the chicken with devastating effects on its industry. A viral membrane surface protein called S not only induces neutralizing antibodies but also plays an important role in virus binding and entry to host cells. Technically, S1 protein gene sequencing also helps greatly in IBV genotyping.ObjectivesThe aim of this study was to characterize Iranian IBV based on S2 gene.MethodsAfter RT-PCR amplification, the S2 gene of nine Iranian IBV isolates were sequenced and then compared with reference strains.ResultsThe isolates were classified into genotype I as Massachusetts like IB Vs, genotype VII which clustered into two branches, VIIa (IS-1494 like IB viruses), and VIIb, and was related to QX- like viruses and Genotype VIII as 793/B like IBVs.ConclusionsAs far as we know, this is the first S2-based classification study on Iranian IBV isolates providing a firm experimental basis to correlate with genotypic characterizationKeywords: characterization, infectious bronchitis virus, genotyping, phylogenetic study, spike} -
Background And AimsAvian infectious bronchitis (IB) has prevalent in the most chicken farms during recent years, in spite of the IB vaccination program which has been widely performed in Iran. To better understand the molecular epidemiology of IBV in Iran, the full length sequences of S1 gene of Iranian QX IBVs were determined and phylogenetic analysis was done using some sequences of IBV.Materials And MethodsTo better understand the molecular epidemiology of IBV in Iran, the full length sequences of S1 gene of Iranian QX IBVs were determined and phylogenetic analysis was done using some sequences of IBV.ResultsIranian QX IBVs were located in LX4 (Cluster 2). The nucleotides homologies were 99.52% - 100% between the isolates. Phylogenetic analysis revealed that all the IBV isolates were very similar and probably had a common origin. The hyperactive variable regions of S1 were determined.ConclusionsThe results from this study and other published results in the GenBank database showed that the isolates circulating in Iran in recent years were mainly LX4 (Cluster 2) genotype, which is the predominant genotype circulating in Iran in recent years (After first report of QX IBV in Iran, 2011). This finding provides important information on IBV evolution in Iran.Keywords: Avian Infectious Bronchitis, QX, Iran, Phylogenetic analysis, Spike}
بدانید!
- در این صفحه نام مورد نظر در اسامی نویسندگان مقالات جستجو میشود. ممکن است نتایج شامل مطالب نویسندگان هم نام و حتی در رشتههای مختلف باشد.
- همه مقالات ترجمه فارسی یا انگلیسی ندارند پس ممکن است مقالاتی باشند که نام نویسنده مورد نظر شما به صورت معادل فارسی یا انگلیسی آن درج شده باشد. در صفحه جستجوی پیشرفته میتوانید همزمان نام فارسی و انگلیسی نویسنده را درج نمایید.
- در صورتی که میخواهید جستجو را با شرایط متفاوت تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مطالب نشریات مراجعه کنید.