جستجوی مقالات مرتبط با کلیدواژه « actinomycetes » در نشریات گروه « زیست شناسی »
تکرار جستجوی کلیدواژه «actinomycetes» در نشریات گروه «علوم پایه»-
اکتینومیست ها به عنوان بزرگترین مخزن آنتی بیوتیک های طبیعی در جهان شناخته می شوند. هدف از این تحقیق جداسازی و شناسایی مولکولی اکتینومیست ها با خاصیت ضدمیکروبی ازخاکهای کشاورزی مناطق بومی استان گیلان می باشد. نمونه های خاک از مناطق کشاورزی جنوب غربی استان گیلان جمع آوری شدند. برای جداسازی اکتینومیست ها از رقیق سازی متوالی استفاده گردید. سپس به شناسایی مورفولوژی، فیزیولوژی و بیوشیمیایی نمونه ها پرداخته شد و در نهایت شناسایی مولکولی ایزوله ها با استفاده از توالی یابی 16S rRNA و تجزیه و تحلیل فیلوژنتیک انجام گرفت. بررسی فعالیت ضدمیکروبی در برابر میکروارگانیسم های پاتوژن انجام گردید. در مجموع 14 ایزوله شناسایی شد. 2 ایزوله با خاصیت ضد میکروبی بیشتر انتخاب شد. براساس نتایج مطالعات فیلوژنتیکی و توالی یابی 16S rRNA سویه Amycolatopsis roodepoortensis Strain EA7 با 63/99% اطمینان و سویه EA6 Streptomyces Microfluve Strain با 92/93 % اطمینان شناسایی شدند.باکتری های جدا سازی شده دارای فعالیت ضدمیکروبی بیشترعلیه میکروارگانیسم های پاتوژن گرم مثبت Staphylococcus aureus و نمونه استاندارد PTCC 1112 بودند. این تحقیق اولین گزارش از شناسایی اکتینومیست ها با خاصیت ضد میکروبی در خاکهای کشاورزی مناطق جنوب غربی استان گیلان واقع در کوه های البرز می باشد. شناسایی سویه نادرroodepoortensis Strain EA7 Amycolatopsis از مناطق شمالی ایران خاک های این مناطق را بسیار ارزشمند می سازد.
کلید واژگان: اکتینومیست, فعالیت ضد میکروبی, 16S Rrna, آمیکولاتوپسیس, استرپتومایسس}Actinomycetes are known as the largest reservoir of natural antibiotics in the world. For this reason, due to their ability to produce various antibiotics and other compounds of therapeutic importance, they are considered the golden microorganisms of the 21st century. The purpose of this research is the isolation and molecular identification of actinomycetes with antimicrobial properties from agricultural soils in the native areas of Guilan province. Soil samples were collected from the southwestern agricultural areas of Guilan province. Serial dilution was used to isolate actinomycetes. Then the morphological, physiological, and biochemical identification of the samples was done and finally, the molecular identification of the isolates was done using 16S rRNA sequencing and phylogenetic analysis. Antimicrobial activity was investigated against pathogenic microorganisms. A total of 14 isolates were identified.2 isolates with more antimicrobial properties were selected. Based on the results of phylogenetic studies and 16S rRNA sequencing, Amycolatopsis roodepoortensis strain EA7 with 99.63% confidence, and Streptomyces microflaveus strain EA6 with 93.92% confidence were identified. The isolated bacteria had more antimicrobial activity against Gram-positive pathogenic microorganisms Staphylococcus aureus and standard sample Staphylococcus aureus PTCC 1112. This research is the first report on the identification of actinomycetes with antimicrobial properties in the agricultural soils of the southwestern regions of Guilan province located in the Alborz mountains. The identification of the rare strain of Amycolatopsis roodepoortensis strain EA7 from the northern regions of Iran makes the soils of these regions very valuable.
Keywords: Actinomycetes, Antimicrobial Activity, 16S Rrna, Amycolatopsis, Streptomyces} -
Fungal infections are an evolving public health challenge due to their antimicrobial resistance and the growth of immunocompromised populations. Aquatic environments, the largest ecosystem on earth, are recently considered as a source for the production of bioactive compounds. Marine actinomycetes are considered for their potential to produce novel bioactive metabolites like antifungal compounds. In this study, strain ADR10 was obtained from the sediment sample of the Caspian Sea and its 16S rDNA gene sequence analysis suggested that the isolate belongs to Streptomyces albidoflavus. The preliminary cross-streak and double-layer agar screening revealed that the isolate has potent activity against pathogenic fungi, i.e. Aspergillus niger, Candida albicans, Fusarium oxysporum, and Penicillium crustosum. One-factor-at-a-time and Response surface methodology (RSM) was employed to evaluate the effects of six parameters (carbon source, initial pH, inoculation volume, NaCl concentration, nitrogen source, and temperature) on the production of antibiotics in the basal starch casein broth medium. The maximum antibiotic activity was achieved at the initial pH 7.05, sucrose 1.17 g l-1, malt 0.2 g l-1, temperature 30 ºC, inoculation size 5.0% v/v, and NaCl 1% w/v after 121.1 hours. Through the optimization experiments, antifungal activity was enhanced 2.7-fold. Ethyl acetate showed the highest antibiotic extraction capacity from the fermentation media compared with dichloromethane, hexane, and chloroform. The preliminary purified antibiotic by thin layer chromatography (ethyl acetate/ mobile petroleum phase) showed a more significant growth inhibition zone than nystatin (100 μg mL-1) against Candida albicans. This study underlines the potential of the marine actinomycete for the identification of novel antifungal agents.Keywords: Actinomycetes, Antibiotics, Caspian Sea, Fungi, Streptomyces albidoflavus}
-
سابقه و هدف
اکتینومیست ها به دلیل داشتن متابولیت های ثانویه فراوان منبع خوبی برای کشف داروهای جدید هستند. از آنجاکه سلول های قارچی و انسانی هر دو یوکاریوت هستند احتمالا متابولیت های اکتینومیست های آنتاگونیست قارچی، رشد سلول های سرطانی را نیز مهار می کنند. هدف از این پژوهش بررسی اثرات ضد سرطانی دو سویه اکتینومیست بر روی سلول های سرطانی کلورکتال می باشد.
مواد و روش هافعالیت آنتاگونیستی 24 سویه اکتینومیستی که از رشد سلول های یک بیمارگر گیاهی، Phytophthora capsici ممانعت می کردند بر علیه 4 عامل بیمارگر گیاهی دیگر بررسی شد. دو سویه منتخب که بیشترین فعالیت آنتاگونیستی را بر علیه بیمارگرها نشان دادند، از نظر تولید سیدروفور بررسی شدند. اثر سیتوتاکسیسیتی این دو سویه با استفاده از تست MTT در in vitro بر روی رده سلولی SW480 مورد سنجش قرار گرفته و درصد IC50 تعیین شد.
یافته هاتنها دو سویه منتخب بر علیه بیمارگر Phytophthora drechsleri به ترتیب 30 و 54 درصد اثر بازدارندگی داشتند. سویه 408 بر علیه Pythium ultimum تاثیر ممانعت کننده نداشت در حالیکه سویه 6010 به طور کامل از رشد آن جلوگیری کرد. این سویه برخلاف سویه 408، رشد دو بیمارگر Rhizoctonia solani و Fusarium oxysporum را نیز در حدود 70 درصد کنترل کرد. تنها سویه 408 قادر به تولید سیدروفور بود. تاثیر معنی دار تیمار بر سلول های سرطانی روده به ترتیب در غلظت های 47/2 و 71/2 درصد (حجمی/حجمی) معنی دار بود.
نتیجه گیرینتایج این مطالعه فرضیه ما را که متابولیت های ثانویه اکتینومیست های آنتاگونیست می توانند موجب مرگ سلول های سرطانی بشوند اثبات کرد. استفاده از سلول های قارچی و یا اوومیستی به عنوان روشی ساده، ایمن و ارزان برای غربال اکتینومیست های کاندید کشف داروهای ضد سرطان جدید معرفی می شود.
کلید واژگان: نئوپلاسم های کولورکتال, اکتینومیست ها, قابلیت زیستی سلول, Iau Science}Aim and BackgroundActinomycetes are a good resource to discover new drugs based on their abundant secondary metabolites. Because both fungal and human cells are eukaryotes, the metabolites of fungal antagonist actinomycetes may also inhibit the growth of cancer cells.
Materials and MethodsThe antagonistic activity of 24 actinomycete strains that inhibited the growth of cells of a plant pathogen, Phytophthora capsici, was investigated against 4 other plant pathogens. The siderophores production of two selected strains that showed the highest antagonistic activity against pathogens was evaluated. The cytotoxicity effects of two strains on the SW480 cell line was measured using MTT assay in vitro and the IC50 percentage was determined.
ResultsOnly two selected strains had 30 and 54% inhibitory effect against Phytophthora drechsleri, respectively. The strain 408 had no inhibitory effect against Pythium ultimum, while the strain 6010 completely prevented Pythium ultimum growth. The strain 6010, unlike the strain 408, controlled the growth of Rhizoctonia solani and Fusarium oxysporum pathogens about 70%. Only the strain 408 was able to produce siderophore. The significant effect of the treatment on colorectal cancer cells was observed at 2.47 and 2.71% (v/v) concentrations for both 408 and 6010 strains, respectively.
ConclusionThe results of this study confirmed our hypothesis that secondary metabolites of antagonistic actinomycetes can lead to cancer cells death. The use of fungal or oomycete cells is introduced as an easy, safe, and inexpensive method for screening actinomycetes that are candidates for the discovery of new anticancer drugs.
Keywords: Colorectal Neoplasms, Actinomycetes, Cell Viability, Iau Science} -
سابقه و هدف
اکتینومیست ها به عنوان منابع متابولیت های ثانویه با فعالیت های بیولوژیکی متنوع شناخته می شوند. این مطالعه با هدف شناسایی برخی از اکتینومیست های جدا سازی شده از محیط دریایی در مالزی، بررسی ژن های پلی کتاید سنتتاز تیپ I (PKS-I) و پپتید سنتتاز غیر ریبوزومی (NRPS) و همچنین بررسی ویژگی های ضد میکروبی آنها انجام گرفت.
مواد و روش هااکتینومیست های انتخاب شده به وسیله روش های مورفولوژیکی و مولکولی شناسایی شدند. وجود ژن هایNRPS و PKS-I به وسیله پرایمرهای اختصاصی بررسی گردید و همچنین فعالیت ضد میکروبی سویه های انتخاب شده به روش دیسک گذاری بررسی شد.
یافته هاجدایه های انتخاب شده بر اساس خصوصیات مورفولوژیکی کلنی، شکل زنجیره اسپورها و نوع میسیلیوم های رویشی و هوایی متفاوت بودند. بر اساس تجزیه و تحلیل ژن 16S rRNAسویه های Sdstm3k و Sdtm108 و Sdts4 شباهت زیادی به Streptomyces sp. نشان دادند (95%) در صورتی که سویه های Bvpd17e و SctgJI به ترتیب بیشترین شباهت را با Micrococcus sp. M2-19 (99%) و Micrococcus leteus (95%) نشان دادند. در حالی که سویه های Sdsb2k1a و Sdts46 ناشناس بودند. با بررسی ژن های NRPS و PKS-I مشخص گردید که فقط سویه های SctgJI و Sdsb2k1a دارای هر دو ژن می باشند. سویه های Sdst3k1 وSdts4 قوی ترین و وسیع ترین فعالیت ضد میکروبی را در برابر 10 پاتوژن انسانی مورد بررسی نشان داد.
نتیجه گیریبر اساس مطالعه حاضر مشخص گردید که اکتینومیست های جداسازی شده از محیط زیست دریایی در مالزی می تواند به عنوان یکی از منابع مناسب کشف ترکیبات زیست فعال جدید باشد. واژگان کلیدی: باکتری دریایی،اکتینومیست، ژن هایNRPS وPKS-I ، خاصیت ضد میکروبی.
کلید واژگان: باکتری دریایی, اکتینومیست, ژن هایNRPS وPKS-I, خاصیت ضد میکروبی}Background and ObjectivesActinomycetes are commonly known as exceptionally prolific source of secondary metabolites with diverse biological activities. The aim of this study was to identify some actinomycete isolates from Malaysia marine environment and evaluate for type-I polyketide synthase (PKS-I) and nonribosomal peptide synthetase (NRPS) genes as well as antimicrobial activity.
Materials and MethodsSelected isolates were identified based on their morphology and molecular properties. PKS-I and NRPS genes were detected using specific primers and the potential of their antimicrobial activity was investigated by disc diffusion method.
ResultsThe isolates varied morphologically on the basis of colony morphology, spore chain shape, aerial and substrate mycelium formation. Based on 16S rRNA gene sequences analysis, isolates Sdstm3k, Sdtm108 and Sdts4 were highly similar to Streptomyces sp. (95 %), whereas isolates Bvpd17e and SctgJI demonstrated highest similarity to Micrococcus sp. M2-19 (99 %) and Micrococcus leteus (95 %) respectively. While isolate Sdsb2k1a and Sdts46 were unidentified. The detection of PKS-I and NRPS genes revealed that only isolates SctgJI and Sdsb2k1a had both genes. Isolates Streptomyces sp. Sdst3k1 and Streptomyces sp. Sdts4 demonstrated the strongest and broadest spectrum of antimicrobial activity against 10 human pathogens tested.
ConclusionThe present study indicated that actinomycetes isolated from marine environment in Malaysia can be a good source of the discovery of new bioactive compounds.
Keywords: marine bacteria, Actinomycetes, PKS-I, NRPS genes, Antimicrobial Activity, Malaysia} -
جمعیت های میکروبی عنصری کلیدی در کیفیت و حاصلخیزی خاک هستند. هدف این پژوهش مطالعه تاثیر پنبه تراریخته رقم کوکر حاوی ژن chi لوبیا بر جمعیت های باکتریایی خاک بود. لاین R8 به عنوان گیاه تراریخته حامل ژن chi حاصل از چهار بار تلاقی درون جمعیتی و لاین 1011 به عنوان شاهد غیر تراریخته (تیپ وحشی) تهیه شد و در گلخانه گیاهان تراریخته (سطح ایمنی 2) واقع در پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران (ABRII) کشت شد. نمونه برداری از خاک ناحیه ریزوسفر و بالک گیاهان 30، 60 و 90 روزه انجام شد. تعیین جمعیت باکتری کل و اکتینومیستها با استفاده از محیط TSA، آب آگار و ISP2 انجام شد. ماده وراثتی (دی ان ای) از یک گرم خاک و با استفاده از Ultra Clean soil DNA kit استخراج شد. سپس PCR–DGGE (Denaturing Gradient Gel Electrophoresis) برای نشان دادن تنوع باکتریایی در نمونه های خاک انجام شد. تعداد کل باکتری های قابل کشت در نمونه های خاک 106 و 107 واحد تشکیل دهنده کلنی (CFU) در هر گرم خاک خشک به ترتیب برای خاک بالک و رایزوسفر بود. تعداد باکتری کل و اکتینومیستهای خاک رایزوسفر گیاهان 30 و 60 روزه تراریخته بیشتر از شاهد غیر تراریخته بود. اگرچه در پایان دوره رشد (90 روز پس از کشت بذر) جمعیت باکتریایی گیاه تراریخته و غیر تراریخته برابر بود. بررسی مولکولی بر اساس PCR–DGGE نیز الگوی مشابهی را برای جمعیت کل باکتریایی و اکتینومیستی مشخص کرد. نتایج ارائه شده در این پژوهش تفاوت معنی داری را بین تعداد باکتری کل و اکتینومیستی موجود در خاک رایزوسفری و بالک پنبه تراریخته و غیر تراریخته در پایان دوره رشد گیاه (90 روز) نشان نداد. علاوه بر این به نظر می رسد دوره رشد گیاه تاثیر قابل توجه ای بر جمعیت میکروبی دارد.کلید واژگان: اکتینومیست, تراریخته, جمعیت باکتریایی, ریزوسفر, DGGE}Microbial communities are a key element of soil quality and fertility. This research aims to survey the effect of genetically modified cotton cultivar Coker, harbors an endochitinase gene (chi) from Phaseolus vulgaris (bean) on soil bacterial communities. The transgenic chi-resistant cotton (GM), line R8 was selfed for four generations and the corresponding original plant line 1011, wild-type (WT) were provided and planted in the transgenic greenhouse (Biosafety Level 2) at Agricultural Biotechnology Research Institute of Iran (ABRII). Samples of soil were collected from rhizosphere and bulk area of 30, 60 and 90 days old plants. Enumeration of total bacteria and Actinomycetes were carried out using TSA, Water Agar and ISP2 media. Soil DNA was extracted from 1-g samples by using an Ultra Clean soil DNA kit. PCRDGGE (Denaturing Gradient Gel Electrophoresis) was performed to show diversity in different groups of bacteria. Total numbers of bacteria in soil samples was approximately 106 and 107 CFU/g of dried soil of rhizosphere and bulk soil respectively. Average number of total soil bacteria and Actinomycetes were higher in rhizosphere area of 30 and 60 days old GM plants compared to the control. Although, at the end of growth period (90 days) GM (transgenic) and non-GM plants were approximately equal in number of bacteria around their roots. Molecular analysis based on PCR-DGGE revealed similar microbial dynamics for both Actinomycetes and total batera. The data presented here showed no consistent statistically significant differences in the numbers of total bacteria and Actinomycetes between rhizosphere and bulk soil of chi and non-chi cotton at the end of the experiment. Furthermore, it seems that the growth stage of plant exerts a noticeable effect on the microbial community.Keywords: Actinomycetes, Transgenic, DGGE, Rhizosphere, Bacterial communities}
-
سابقه و هدفاز بین بیش از 23000 متابولیت ثانویه میکربی شناخته شده، 42% آنها از اکتینوباکترها جدا شده است. این متابولیت های ثانویه فعالیت زیستی وسیعی نظیر فعالیت های ضد باکتریایی، ضد قارچی، ضد انگلی، ضد ویروسی، ضد تومور، سرکوب کننده ایمنی، حشره کش، ضد التهاب، آنتی اکسیدان و دیگر فعالیت ها را دارند. در سال های گذشته پژوهش های متعددی در مورد این فعالیت های زیستی در کشور انجام شده است، با این وجود گزارشی در مورد فعالیت آنتی اکسیدانی اکتینومایست های کشور منتشر نشده است. هدف این پژوهش بررسی توان تولید آنتی اکسیدان های طبیعی از منابع میکروبی با منشاء بومی است.
مواد وروش50 سویه اکتینومایست بومی ایران، ذخیره شده در مرکز کلکسیون میکروارگانیسم های دانشگاه تهران انتخاب شدند و پس از انجام مراحل اسپورزایی، پیش تخمیر و تخمیر، عصاره مایع تخمیر با اتیل استات استخراج شد. فعالیت آنتی اکسیدانی عصاره های مایع تخمیر بدون حلال، به روش DPPH با استفاده از مقایسه آنتی اکسیدان های اسیدآسکوربیک و BHA مورد ارزیابی قرار گرفت. همچنین سمیت عصاره ها با استفاده از تست آرتمیا مورد بررسی قرار گرفت. سویه های منتخب دارای فعالیت به روش مولکولی شناسایی شدند.یافته هانتایج نشان داد که در میان 50 عصاره اکتینومایست، 10% عصاره ها فاقد فعالیت آنتی اکسیدانی، 20% دارای فعالیت آنتی اکسیدانی بالا (200IC50<)، 32% دارای فعالیت آنتی اکسیدانی متوسط (400کلید واژگان: اکتینومایست, آنتی اکسیدان, DPPH, تست آرتمیا}Aim andBackgroundAmong more than 23,000 microbial secondary metabolites discovered, 42% of them are separated from actinobacteria. These secondary metabolites have wide range of biological activities such as antibacterial, antifungal, antiparasitic, antiviral, antitumor, immunosuppressive, insecticide, antiinflammatory, antioxidant and other activities. In the past few years, numerous studies have been conducted on these biological activities in the country, but no report has been published about the antioxidant activity of local actinomycetes resources. The purpose of this research is to achieve natural antioxidants with lower physiological hazards associated with local microbial resources.Materials And MethodsFifty strains of native actinomycetes preserved at the University of Tehran Microorganism collection were selected randomly and after sporolation and prefermentation and fermentation, bacterial extracts were prepared. At first, antioxidant activity of the extracts was evaluated by DPPH method. These results were evaluated with synthetic antioxidants including ascorbic acid and BHA. Also cytotoxic activity of the extracts was measured on Artemia. Elected strains were recognized with molocular method.ResultsAccording to the results, 10% of extracts have no antioxidant activity, 20% of the extracts have high antioxidant activity (IC50<200), 32% of extracts with medium antioxidant activity (200Keywords: actinomycetes, DPPH, Artemia test, antioxidant compounds} -
Cardaria draba is an important, troublesome weed in the sustainable production of wheat. In the first step of this study, 100 actinomycete isolates were purified from soil samples collected from the rhizosphere and phyllosphere of plants in different provinces of Iran. All isolates were subjected to primary screening by assaying the fermentation broth of the sterile surfaces of C. draba leaves. Considerable herbicidal activity was observed for four isolates. During secondary screening and assaying of the extracted culture medium with ethyl acetate, two isolates, Streptomyces sp. UTMC 2102 and Streptomyces sp. UTMC 2104, were selected as superior phytotoxin-producing isolates in the biological control of C. draba. Leaf necrosis was observed in 500 and 1000 μg/ml and ≥100 μg/ml dilutions for isolates UTMC 2102 and UTMC 2104, respectively. Phylogenic identification confirmed that the 16S rRNA gene has 100% similarity to Streptomycin anulatus for the isolate Streptomyces sp. UTMC 2102 and 100% similarity to Streptomyces vinaceusdrappus for the isolate Streptomyces sp. UTMC 2104. These results suggest that the S. anulatus and S. vinaceusdrappus isolates can be used in the biological control of C. draba in wheat fields.Keywords: actinomycetes, biological control, Cardaria draba, phytotoxin}
- نتایج بر اساس تاریخ انتشار مرتب شده‌اند.
- کلیدواژه مورد نظر شما تنها در فیلد کلیدواژگان مقالات جستجو شده‌است. به منظور حذف نتایج غیر مرتبط، جستجو تنها در مقالات مجلاتی انجام شده که با مجله ماخذ هم موضوع هستند.
- در صورتی که می‌خواهید جستجو را در همه موضوعات و با شرایط دیگر تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مجلات مراجعه کنید.
©2000-2024 magiran.com All Rights Reserved.