جستجوی مقالات مرتبط با کلیدواژه

ft

در نشریات گروه زیست شناسی

تکرار جستجوی کلیدواژه ft در نشریات گروه علوم پایه

جستجوی ft در مقالات مجلات علمی

انتخاب همه

VIT-CMJ2: Endophyte of Agaricus bisporus in Production of Bioactive Compounds

Chandan Gautam, Mukund Madhav, Astha Sinha, William Jabez Osborne*

Iranian Journal of Biotechnology, Volume:14 Issue: 2, Spring 2016, PP 19 -24

Background
Agaricus bisporus is an edible basidiomycete fungus. Both the body and the mycelium contain compounds comprising a wide range of antimicrobial molecules, contributing in improvement of immunity and tumor-retardation.
Objectives
The presence of endophytes capable of producing bioactive compounds was investigated in Agaricus bisporus.
Materials And Methods
Endophytes from Agaricus bisporus was isolated on LB agar. The obtained isolates were characterized morphologically and biochemically. Further 16S rRNA sequencing was implemented for molecular analysis of isolates. The isolate was mass produced and the bioactive compounds were extracted using ethyl acetate, chloroform and hexane. Agar well diffusion method was carried out to seek the potential of any antimicrobial activity of the crude bioactive compounds against known pathogens. GC-MS and FT-IR analysis were performed for the identification of bioactive compounds.
Results
VIT-CMJ2 was identified as Enterobacter sp. as revealed by 16S rRNA sequencing. Chloroform extract of VIT-CMJ2 showed a maximum zone of inhibition of 19 mm against Salmonella typhi followed by hexane and ethyl acetate extracts. The GC-MS analysis revealed the presence of several bioactive compounds having effective antimicrobial activity like butyl ester, Behenicalcohol, S , S-dioxide derivatives and some others which were later confirmed by FT-IR spectral stretches.
Conclusions
The present study shows the insight on the way endophytes interact with Agaricus bisporus; thereby improving the nutritional profile.

Keywords: Antibacterial activity, Behenic alcohol, Button mushroom, Butyl ester, Endophytes, FT, IR, GC, MS, 16S rRNA

Abstract View Paper Original: English
تاثیر ممانعت کننده Peganum harmala L بر رشد سلول های لاین سرطان سینه

سحر سید حسن تهرانی، سمیه هاشمی شیخ شبانی، ستار طهماسبی انفرادی، زهره ربیعی

فصلنامه بیوتکنولوژی ایران، سال دوازدهم شماره 1 (پیاپی 45، Winter 2014)، ص 18562

مشاهده متن زبان: فارسی

Growth Inhibitory Impact of Peganum harmala L. on Two Breast Cancer Cell Lines

Sahar Seyed Hassan Tehrani, Somayeh Hashemi Sheikh Shabani, §, Sattar Tahmasebi Enferadi*, Zohreh Rabiei

Iranian Journal of Biotechnology, Volume:12 Issue: 1, Winter 2014, P 18562

Background
ß-carbolines, harmaline and harmine, are major alkaloids present in the seeds of Peganum harmala L. These alkaloids are known as herbal active principals with potential use in pharmaceutical and medicine.
Objectives
To assess the growth inhibitory effect of phyto-alkaloids, harmaline and harmine, on cancer cell lines.
Materials And Methods
P. harmala L.’s alkaloids were extracted by acidic/basic extraction method and identified by two methods, Fourier Transform Infra-Red Spectroscopy (FTIR) and High Performance Liquid Chromatography (HPLC). Two breast cancer cell lines, MDA-MB-231 and Mcf-7, were subjected to different concentrations (1–100 μg.mL-1) of the P. harmala extract at different time courses (24, 48, and 72 hours). Methylthiazol Tetrazolium (MTT) test, half maximal inhibitory concentration (IC50) and morphological changes through optical microscopy were evaluated.
Results
In both studied cell lines, the P. harmala extract decreased cell viability in longer time exposure in a dose dependent manner. The more concentrated extract led to higher motility of MDA-MB-231 at 24 hours. Although, Mcf-7 cell line required longer exposure time to reach the same motility. It was observed that 30 μg.mL-1 is the minimum lethal dose that kills approximately 50% of cells at 24 hours for MDA-MB-231 cell line (IC50). IC50 for Mcf-7 was calculated 40 μg.mL-1 and 25 μg.mL-1 48 and 72 hours after being exposed against harmala’s extract, respectively. The morphological observation confirmed the apoptosis nature of P. harmala on cells as their membrane kept intact and no membrane permeabilization was observed.
Conclusions
The results revealed that the P. harmala extracts significantly decreased the growth rate and cell survival of cancer cell lines. The extract induced cell death regarding natural cell growth rate. MDA-MB-231 cell line naturally has a higher growth rate than Mcf-7 cell line, thus higher growth inhibition of MDA-MB-231 cell line by the P. harmala extract was confirmed.

Keywords: Cell viability, FT, IR, HPLC, Harmaline, Harmine, MTT test

Abstract View Paper Original: Persian
خالص سازی و شناسایی نسبی پیگمان کاروتنوئیدی Haloarcula sp. IRU1 آرکی بسیار نمک دوست جدا شده از دریاچه نمک ارومیه

عزت عسگرانی*، نسیم صفری، داود زارع

مجله پژوهش های سلولی مولکولی (زیست شناسی ایران)، سال بیست و ششم شماره 3 (پاییز 1392)، صص 326 -338

یک سویه آرکیایی بسیار نمک دوست و مقاوم به پرتوهای پونیزه کننده گاما و نور فرابنفش به نام Haloarcula sp. IRU1 که از آب دریاچه ارومیه جداسازی شده قادر به تولید رنگیزه های کاروتنوئیدی است. در این تحقیق، ابتدا به منظور استخراج کاروتنوئید ها، پس از امتحان روش های متداول و استفاده از حلالهای مختلف در نهایت، شکستن سلول به کمک پودر شیشه نسبتا نرم و استفاده از حلالهای استون و هگزان به عنوان بهترین روش انتخاب گردید. سپس جداسازی پیگمانها به روش کروماتوگرافی با لایه نازک انجام شد. بدین منظور، حلالهای مختلف با نسبتهای متفاوت مورد بررسی قرار گرفت و بهترین الگوی جداسازی، با استفاده از حلالهای استون و پترولئوم اتر و به ترتیب با نسبت 35: 65 به دست آمد. در این حالت شش باند مختلف بر روی پلیت TLC مشاهده شد که بزرگترین و قوی ترین باند در قسمت پایین و با کمترین مقدار RF بود. همچنین در این مرحله، از تعدادی استاندارد کاروتنوئیدی برای شناسایی مقدماتی پیگمانها استفاده گردید. بزرگترین باند مشاهده شده بر روی صفحه TLC (70 درصد، 17/0 Rf-value:) به عنوان پیگمان اصلی در این باکتری در نظر گرفته شد. سپس جذب نوری پیگمان اصلی در ناحیه طول موجهای 600-300 نانومتر اندازه گیری شد که طیف حاصله و نقاط ماکزیمم به دست آمده نشان دهنده شباهت ساختمانی این کاروتنویید با باکتریوروبرین است. نتایج FT-IR کاروتنوئید اصلی نیز شباهت زیادی بین پیگمان کاروتنوئیدی اصلی Haloarcula sp. IRU1 و باکتریوروبرین که دارای 13 پیوند دوگانه کانجوگه و چهار گروه هیدروکسیل نوع سوم است، را نشان می دهد. البته در طیفFT-IR کاروتنوئید این آرکی علاوه بر مشاهده کششهای مربوط به پیوندهایC_O و O_H در طیف حاصل که به خوبی قابل تشخیص می باشد، کشش نسبتا ضعیفی نیز مربوط به گروه کتونی نیز قابل مشاهده است. از طرف دیگر، نتایج اسپکتروفتومتری جرمی وزن مولکولی 783 را برای این پیگمان نشان می دهد که 43 دالتون با وزن مولکولی باکتریوروبرین اختلاف دارد. بر طبق اطلاعات به دست آمده از طیف H-NMR، علاوه بر مشخصه های ساختار کاروتنوئید باکتریوروبرین، می توان حضور یک گروه متیل کتون را نیز در ساختار این کاروتنوئید مورد توجه قرار داد. بنابراین، با توجه به نتایج به دست آمده از طیف سنجی های انجام شده برای شناسایی پیگمان اصلی در این باکتری پیشنهاد می شود کاروتنوئید اصلی این آرکی هالوفیل نیز مانند سایر باکتری های اکستریم هالوفیل، کاروتنوئید باکتریوروبرین می باشد که در این جا به صورت استری شده با گروه استات وجود دارد.

کلید واژگان: Haloarcula sp, IRU1, کاروتنوئید, TLC, جذب نوری, FT, IR, اسپکتروفتومتری جرمی, H, NMR, دریاچه نمک ارومیه

چکیده مشاهده متن زبان: فارسی

Partial purification and characterization of carotenoid pigment from Haloarcula sp. IRU-I, an extremely halophilic archaeon isolated from Uromia salt lake

Journal of Molecular and Cellular Research, Volume:26 Issue: 3, 2013, PP 326 -338

An extremely halophilic archaeon، Haloarcula sp. IRU1 which isolated from Uromia lake can produce carotenoid pigments. In this study، we assayed several methods for pigment extraction by using different solvents، ultimately، the cell breakage by employing relatively soft glass powder and acetone: hexane as solvents was selected as the best method. Then، the pigments were separated by Thin Layer Chromatography. In order to pigment separating، we examined several solvents with different percentages and the best separating was performed with acetone: petroleum ether (35:65; v/v). There were appeared six bands on TLC plate and the first one with the least RF was the most high intensity band. A few carotenoid standards were used for primary identification of pigments. The highest intensity band on TLC plate was determined as the main pigment component in this archaeon and was scraped off from TLC for identification. For pigment analyzing، UV-Visible، FT-IR، Mass Spectrometry and NMR spectrums of this band were taken and compared with present references. These results suggested the main pigment of this archaeon is bacterioruberin which is sterified with acetate group.

Keywords: Haloarcula sp. IRU1, carotenoid, TLC, UV, Visible, FT, IR, Mass Spectrometry, NMR, Uromia salt lake

Abstract View Paper Original: Persian
مقایسه ساختاری کلاژن استخراج شده از دیواره خیار دریایی parva Holothuria با کلاژن نوع I مهره داران

نسیم ادیب زاده سرشکی، سعید امین زاده، شهلا جمیلی، پرگل قوام مصطفوی

فصلنامه تازه های بیوتکنولوژی سلولی مولکولی، پیاپی 6 (بهار 1391)، ص 59

سابقه و هدف
کلاژن دارای کاربرد های فراوانی در زمینه داروسازی و پزشکی، تهیه محصولات بهداشتی و آرایشی و صنایع غذایی می باشد. در سال های اخیر توجه زیادی به جداسازی کلاژن از موجودات دریایی شده است که علت آن عدم محدودیت استفاده از آن در رژیم غذایی و عدم ابتلا به بیماری های TSE1 و2 BSE می باشد. هدف از انجام این تحقیق استخراج کلاژن از دیواره خیار دریایی Holothuria parva و مقایسه ساختاری آن با کلاژن نوع I مهره داران می باشد.
مواد و روش ها
در این تحقیق جهت مقایسه ساختاری کلاژن حل شده با پپسین (PSC3) استخراج شده از دیواره خیار دریایی جنس Holothuria parva و کلاژن نوع I مهره داران (Type I Calf skin) از آزمون های سدیم دو دسیل سولفات پلی آکریل آمید ژل الکتروفورز 4(SDS-PAGE)، طیف بینی مادون قرمز تبدیل فوریه (5 FT-IR) و کالری متری روبشی دیفرانسیلی6(DSC) استفاده شده است.
یافته ها
الگوی پروتئینی SDS-PAGE کلاژن حل شده با پپسین استخراج شده از دیواره خیار دریایی و نمونه کلاژن نوع I مهره داران نشان می دهد که قسمت عمده در هر دو کلاژن از زنجیره 1 α با وزن تقریبی kDa 130 و مقدار جزئی β وγ تشکیل شده اند با این تفاوت که درPSC استخراج شده از خیار دریایی به صورت ساختار 3(α1) و در کلاژن نوع I مهره داران به صورت 2α2 (α1) می باشد. طیف FT-IR کلاژن حل شده با پپسین دارای یک باند پهن در ناحیه 1-cm 3420 و باند تیز در ناحیه1-cm 11638 می باشد که شباهت زیادی به طیف FT-IR کلاژن نوع I مهره داران دارد. از آزمون DSC ماکزیمم دمای انتقالیPSC، 94/46 درجه سانتی گراد تعیین گردید که نشان دهنده پایداری حرارتی کمتر نسبت به کلاژن نوع I مهره داران (62 درجه سانتی گراد) می باشد.
نتیجه گیری
کلاژن استخراج شده از خیار دریایی Holothuria parva نوع I تعیین شده و با توجه به پایداری حرارتی مناسب می تواند در مصارف صنعتی مورد استفاده قرار گیرد. همچنین پایین بودن ماکزیمم دمای انتقالی کلاژن استخراج شده نشان دهنده محتوی کمتر ایمنو اسیدهای پرولین و هیدروکسی پرولین نسبت به کلاژن نوع I مهره داران می باشد.

کلید واژگان: Holothuria parva خیار دریایی, SDS, PAGE, DSC, FT, IR, کلاژن حل شده با پپسین (PSC)

چکیده مشاهده متن زبان: فارسی

Structural Comparison between Collagen Isolated from Sea Cucumber Holothuria Parva and Calf Skin Collagen Type I

Nasim Adibzadeh Sereshki, Saeed Aminzade, Shahla Jamili, Pargol Ghavam Mostafavi

New Cellular & Molecular Biotechnology Journal, Volume:2 Issue: 6, 2012, P 59

Aim and
Background
Collagen has a wide range of applications in biomedical, pharmaceutical, cosmetic, and food industries. Recently, isolation of collagen from marine species has been investiga ted. Collagen from cow has a risk for contamination from bovine spongiform encephalopathy (BSE), transmissible spongiform encephalopathy (TSE). The aim of this investigation is the extraction of collagen from body wall of sea cucumber (Holothuria parva) and comparison with collagen Type I.
Material And Methods
Pepsin-solubilized collagen (PSC) is extracted from body wall of sea cucumbers (Holothuria parva) and characterized by SDS-PAGE, DSC, FT-IR.
Results
SDS-PAGE shows that the major component consists of three α1 chains of approximately 130 kDa that is similar to calf skin collagen Type I with the same weight but different in α1 chains (α1)2 α2. The Tm of PSC is 46.940C therefore the thermal stability is lower than collagen Type I. Two peaks of transmission bands is determined by FT-IR including amide A (3420 cm-1) and amide I (1638 cm-1).
Conclusion
Collagen isolated from the sea cucumber determines Type I and the thermal stability shows that it can be used as an alternative to mammalian collagen in the food and pharmaceutical industries. The thermal stability of PSC shows that it has lower content of Proline and Hydroxyproline in comparison with collagen Type I.

Keywords: Sea cucumber, Holothuria parva, SDS, PAGE, DSC, FT, IR, Pepsin, Solubilized collagen

Abstract View Paper Original: Persian

نکته

نتایج بر اساس تاریخ انتشار مرتب شده‌اند.
کلیدواژه مورد نظر شما تنها در فیلد کلیدواژگان مقالات جستجو شده‌است. به منظور حذف نتایج غیر مرتبط، جستجو تنها در مقالات مجلاتی انجام شده که با مجله ماخذ هم موضوع هستند.
در صورتی که می‌خواهید جستجو را در همه موضوعات و با شرایط دیگر تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مجلات مراجعه کنید.

به جمع مشترکان مگیران بپیوندید!

ft