جستجوی مقالات مرتبط با کلیدواژه « زمان واگرایی » در نشریات گروه « زیست شناسی »

تکرار جستجوی کلیدواژه «زمان واگرایی» در نشریات گروه «علوم پایه»

انتخاب همه

تبارزایی مولکولی و تخمین زمان واگرایی بخشه Onobrychis از سرده Onobrychis (تیره باقلائیان) براساس توالی های nrDNA ITS

آناهیتا حدادی، اکرم کاوه، هانیه نفیسی، شاهرخ کاظم پور اوصالو*

نشریه تاکسونومی و بیوسیستماتیک، سال چهاردهم شماره 1 (پیاپی 50، بهار 1401)، صص 95 -113

تجزیه و تحلیل روابط تبارزایشی و تخمین زمان واگرایی بخشه Onobrychis با استفاده از نواحی فاصله گذار رونویسی شده داخلی DNA ریبوزومی هسته ای (nrDNA ITS) انجام شد. 60 گونه از بخشه Onobrychis، هفت گونه از بخشه های خواهری از زیرسرده O. subgen. Sisyrosema و هشت گونه از سایر سرده های قبیله Hedysareae شامل Eversmannia subspinosa، Greuteria argyreum، Corethrodendron multijugum، Taverniera cuenifolia، Hedysarum polybotrys، Sulla spinosissima وAlhagi maurorum در جایگاه برون گروه انتخاب شد. آنالیزهای تبارزایشی به روش های بیشینه درست نمایی و بایزین انجام شد. نتایج نشان داد بخشه Onobrychis تک تبار و متشکل از دو کلاد اصلی با حمایت زیاد است. کلاد اول شامل گونه های یک ساله و چندساله با بال های بلند و اغلب با عدد کروموزوم پایه x=8 است. کلاد دوم گونه هایی را با عدد کروموزوم پایه x=7 تشکیل می دهد که در آن دو گونه یک ساله با بال های بلند با گونه های چندساله دارای بال کوتاه مرتبط است. زمان واگرایی این بخشه با استفاده از نرم افزار BEAST تخمین زده شد. این بخشه در 96/11 میلیون سال پیش در میوسن میانی به وجود آمده و سپس به دو دودمان در 29/9 - 58/9 میلیون سال پیش واگرایی یافته است.

کلید واژگان: اسپرس, تبارزایی, تیره باقلائیان, زمان واگرایی, nrDNA ITS}

چکیده مشاهده متن مقاله پژوهشی/اصیل زبان: فارسی

Molecular Phylogeny and Divergence Time Estimation of Onobrychis sect. Onobrychis (Fabaceae) based on nrDNA ITS

Anahita Hadadi, Akram Kaveh, Hanyieh Nafisi, Shahrokh Kazempour-Osaloo *

Taxonomy and Biosystematics, Volume:14 Issue: 1, 2022, PP 95 -113

Phylogenetic analysis and estimating divergence time of O. sect. Onobrychis were conducted using nrDNA ITS sequence data. A total of 60 species from the section Onobrychis, seven species of the five sister sections belonging to O. subgen. Sisyrosema and eight species of other genera of the tribe Hedysareae (Eversmannia subspinosa ، Greuteria argyreum، Corethrodendron multijugum ، Taverniera cuneifolia، Hedysarum polybotrys، Sulla spinosissima و Alhagi maurorum) as outgroups were chosen. Phylogenetic analyses were performed by maximum likelihood and Bayesian methods. The results showed that O. sect. Onobrychis is monophyletic and composed of two main well-supported clades. The first clade includes annual and perennial species with long wings, often with the basic chromosome number x= 8. The second clade comprises perennial species with short wings and two annuals with long wings, having the basic chromosome number x= 7. Sect. The divergence time estimation of this section was analyzed with BEAST. The section was originated at 11.96 Mya in middle Miocene and subsequently diverged into two linages at 9.29-9.58 Mya.

Keywords: divergence time, Fabaceae, nrDNA ITS, Onobrychis, Phylogeny}

Abstract View Paper Research/Original Article Original: Persian
بررسی ساختار جغرافیایی و تاریخچه جمعیت شناختی خرس قهوه ای بر اساس توالی ناحیه کنترل میتوکندری

محمدرضا اشرف زاده، محمد کابلی *، محمدرضا نقوی، حبیب الله حقی، محمود شکیبا، کورس ربیعی، داود غنی پور، مهدی انصاری

نشریه تاکسونومی و بیوسیستماتیک، سال هفتم شماره 4 (پیاپی 25، زمستان 1394)، صص 25 -38

در سال های اخیر، گستره پراکنش خرس قهوه ای با کاهش شدیدی روبرو بوده است و در این میان، احتمال انقراض برخی جمعیت های ناشناخته وجود دارد. بنابراین، داشتن یک تصویر جامع از تنوع ژنتیکی و ساختار جغرافیایی جمعیت ها و گونه های مختلف در راستای توسعه راهکارهای حفاظتی موثر ضروری است. در پژوهش حاضر، یک قطعه 271 نوکلئوتیدی ناحیه کنترل میتوکندری مربوط به تعداد هفت نمونه خرس قهوه ای از ایران و 460 توالی از خرس های قهوه ای و قطبی ثبت شده در ژن بانک در تحلیل ها استفاده شد. بر اساس نتایج، تعداد 113 هاپلوتایپ و 77 جایگاه متغیر برای قطعه مورد مطالعه شناسایی شد. بر اساس تحلیل ها، خرس های ایران در گروهی مجزا از سایر خرس های قهوه ای قرار می گیرند. افزون بر این، نرخ جریان ژنی (Nm) بسیار پایین (014/0-187/0) و میزان فاصله ژنتیکی (Fst) زیاد (728/0-972/0) بین خرس های ایران و سایر گروه ها نشان دهنده اختلاف ژنتیکی معنی دار بین خرس های ایران و سایر گروه های مورد مطالعه است. علاوه بر این، برآورد نرخ مهاجرت (Nm) جدایی جمعیت ایران را از سایر خرس های قهوه ای تایید می کند. شواهد مشخصی از گسترش جمعیت شناختی ناگهانی در گذشته در خرس های ایران مشاهده نشد. بر اساس برآوردهای مرتبط با زمان های واگرایی، نیای مشترک تمامی خرس های قهوه ای در حدود 221 هزار سال پیش برآورد شد. همچنین، زمان آخرین نیای مشترک توالی های خرس قهوه ای ایران در حدود 19 هزار سال پیش به دست آمد.

کلید واژگان: خرس قهوه ای, جریان ژنی, تاریخچه جمعیت شناختی, زمان واگرایی}

چکیده مشاهده متن زبان: فارسی

Geographic structure and demographic history of Iranian brown bear (Ursus arctos) based on mtDNA control region sequences

Mohammad Reza Ashrafzadeh, Mohammad Kaboli*, Mohammad Reza Naghavi, Habibollah Haghi, Mahmoud Shakiba, Koros Rabiee, Davoud Ghanipour, Mahdi Ansari

Taxonomy and Biosystematics, Volume:7 Issue: 4, 2016, PP 25 -38

In recent years, the brown bear's range has declined and its populations in some areas have faced extinction. Therefore, to have a comprehensive picture of genetic diversity and geographic structure of populations is essential for effective conservation strategies. In this research, we sequenced a 271bp segment of mtDNA control region of seven Iranian brown bears, where a total dataset of 467 sequences (brown and polar bears) were used in analyses. Overall, 113 different haplotypes and 77 polymorphic sites were identified within the segment. Based on phylogenetic analyses, Iranian brown bears were not nested in any other clades. The low values of Nm (range=0.014-0.187) and high values of Fst (range=0.728-0.972) among Iranian bears and others revealed a genetically significant differentiation. We arent found any significant signal of demographic reduction in Iranian bears. The time to the most recent common ancestor of Iranian brown bears (Northern Iran) was found to be around 19000 BP.

Keywords: Brown bear, Gene flow, Demographic history, Divergence}

Abstract View Paper Original: Persian

نکته

نتایج بر اساس تاریخ انتشار مرتب شده‌اند.
کلیدواژه مورد نظر شما تنها در فیلد کلیدواژگان مقالات جستجو شده‌است. به منظور حذف نتایج غیر مرتبط، جستجو تنها در مقالات مجلاتی انجام شده که با مجله ماخذ هم موضوع هستند.
در صورتی که می‌خواهید جستجو را در همه موضوعات و با شرایط دیگر تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مجلات مراجعه کنید.

به جمع مشترکان مگیران بپیوندید!

جستجوی مقالات مرتبط با کلیدواژه « زمان واگرایی » در نشریات گروه « زیست شناسی »