به جمع مشترکان مگیران بپیوندید!

تنها با پرداخت 70 هزارتومان حق اشتراک سالانه به متن مقالات دسترسی داشته باشید و 100 مقاله را بدون هزینه دیگری دریافت کنید.

برای پرداخت حق اشتراک اگر عضو هستید وارد شوید در غیر این صورت حساب کاربری جدید ایجاد کنید

عضویت

جستجوی مقالات مرتبط با کلیدواژه « polymorphism » در نشریات گروه « محیط زیست »

تکرار جستجوی کلیدواژه « polymorphism » در نشریات گروه « علوم پایه »
  • Asyad Abdul-Abbas Hussein, Mohammed Abdulwahab Al-Askeri, Muntadher Ali Al-Saidi

    An inflammatory response and an interleukin 10 (IL-10) cytokine storm were associated with serious acute lung injury and multiorgan dysfunction in patients with severe COVID-19 disease. Genetic variations affecting IL-10 levels and disease are known as single nucleotide polymorphisms (SNPs). Severe COVID-19 was more likely in older adults, those who were overweight, and smokers. Purpose To determine if COVID-19 is associated with IL-10 gene SNPs at (rs1800896) in individuals who smoke and are overweight.The participants in this study were 24 people with COVID-19 who were overweight, 25 people who smoked, 25 people who were neither overweight nor smokers (control positive), and 21 healthy individuals. The groups that were studied underwent ARMS-PCR genotyping of the IL-10 (rs1800896) SNP. Three samples had the A allele (3.2%), eight samples had the G allele (8.4%), and eighty-four samples had the AG genotype (88.4%). Within the same groups, there was a substantially different prevalence rate of IL-10 (rs1800896) alleles, with low rates of AA and GG genotypes (P< 0.0001).

    Keywords: COVID-19, IL-10, Polymorphism, Smoking, Obesity}
  • Fariba Mohaymeni, Kosar Nikcheh, Haji Gholi Kami, Zeinolabedin Mohammadi

    Despitethe efforts conducted on the identification of species of the genus Pelophylaxfrom Iran, recent studies revealed that the taxonomy and identification of localpopulations within this genus havebeen still unresolved. Here, the morphological and morphometricvariations of waterfrog populations (Pelophylax) from different localitiesof Iran were studied.To assess suitable morphological andmorphometric diagnosis for taxonomic identification of the genus, 13morphological and 23morphometric charactersof 160 specimens were analyzed. Our result indicated P.cf. bedriagaeand Pelophylax sp.show cryptic variation in morphology and melanistic diversity.In water frogs, this characteris much more influenced by compatibility to special habitat, so its value is less to be considered as a taxonomic trait or key characterfor identification.However, the morphometricvariables of Pelophylax sp. are larger than P.cf. bedriagaefrom the west of Iran. Followinggeneralized Gloger's rule, a comparison of character states of 12 biological variables revealed that dorsal coloration of waterfrog populations become paler from north to south in eastern Iran,while the ventral part shows low variation in color.This pattern indicates the low selective value of ventral coloration in the viability of waterfrogsin eastern Iran. Moreover, natural selection stabilized olive coloration on the populations of waterfrogsliving in the green habitats of north Iran while compromisinglight grey and dark brown in contrasting ecosystems through the semi-desert and humid oases of south Iran viaa disruptive selection mechanism.

    Keywords: Pelophylax, Morphological characters, Polymorphism, Iran}
  • مریم جدحاج، سیامک یوسفی سیاه کلرودی*، شهره زارع کاریزی
    اسب عرب از قدیمی ترین نژادهای اسب جهان است. این نژاد عملکرد بسیار خوبی در مسابقات استقامتی و به طورکلی عملکرد ورزشی داشته و در تشکیل برخی نژادهای مهم جهان نقش داشته است. در این تحقیق وجود چندشکلی در دو جمعیت اسب های عرب (اصیل و غیر اصیل) خوزستان با استفاده از روش RFLP مورد بررسی قرار گرفت. برای این منظور، خونگیری از 20 راس اسب نژاد عرب ایران (10 نمونه اول از اسب عرب اصیل و 10 نمونه بعدی از اسب عرب غیراصیل) انجام شد. از نمونه خون های گرفته شده، DNA استخراج گردید و سپس واکنش زنجیره ای پلی مراز برای تکثیر ژن میوستاتین انجام شد. محصول PCR تحت تاثیرآنزیم، در واکنشPCR-RFLp برای تعیین ژنوتیپ نمونه ها مورد بررسی قرار گرفت. نتایج نشان داد که متوسط هتروزیگوسیته مشاهده شده 0/477 و متوسط هتروزیگوسیته مورد انتظار نیز 0/477 در جمعیت اسب عرب اصیل بود و متوسط هتروزیگوسیته مشاهده شده 0/496 و متوسط هتروزیگوسیته مورد انتظار 0/482 در جمعیت اسب عرب غیراصیل بود. هم چنین میانگین تعداد آلل های موثر 1/918 در جمعیت اسب عرب اصیل و 0/934 در جمعیت اسب عرب غیراصیل بود. هم چنین بیش ترین و کم ترین مقدار شاخص شانون در جمعیت اسب عرب اصیل 0/693 و 0/500 بود و بیش ترین و کم ترین مقدار شاخص شانون در جمعیت اسب عرب غیراصیل 0/693 و 0/592 بود. تحقیق حاضر نشان داد که در جایگاه های ژن میوستاتین در هر دو جمعیت، چندشکلی وجود دارد. از چندشکلی های این ژن می توان به عنوان یک شاخص درشناسایی تفاوت هایموجود در پتانسیل ژنتیکی جمعیت های مختلف اسب عرب استفاده کرد.
    کلید واژگان: چندشکلی, ژن میوستاتین (MSTN), اسب های نژاد عرب ایران, RFLP}
    Maryam Jadhaj, Siamak Yousefi Siahkalroodi *, Shohreh Zare Karizi
    The Arabian horse is one of the oldest horse breeds in the world. This race has performed well in endurance races and in general athletic performance and has been instrumental in the formation of some of the world's leading races. In this case, polymorphism was investigated in two Arab (original and non-authentic) Khuzestan regions using RFLP method. For this purpose, blood samples were taken from 20 Iranian Arabian horses (the first 10 samples of the original Arabian horse and the next 10 samples of the non-native Arabian horse). DNA was extracted from blood samples and then the polymerase chain reaction was performed to amplify the myostatin gene. The PCR product is affected by the enzyme in the PCR-RFLP reaction. Samples were analyzed for genotyping. The results showed that the average heterozygosity observed was 0.477 and the expected heterozygosity average was 0.477 in the genuine Arabian horse population. The effective allele number was 1.918 in the genuine Arabian horse population and 1.934 in the non-native Arabian horse population. The highest and lowest values ​​of Shannon index in genuine Arabian horse population were 0.693 and 0.500, respectively. The present study showed that there are polymorphisms in myostatin gene loci in both populations. Polymorphisms of this gene can be used as a candidate to identify differences in the genetic potential of different Arabian horse populations.
    Keywords: Polymorphism, Myostatin Gene (MSTN), Iranian Arabian Horses, RFLP}
  • ابوالفضل قربانی*، سعید پرنعمت خانقاه، ناصر ماهری سیس، مهدی تقی نژاد رودبنه
    این تحقیق به منظور تعیین ارتباط چندشکلی ژن عامل رونویسی خاص هیپوفیز یک  (Pit-1) با ارزش های ژنتیکی صفات تولید شیر در گاوهای هلشتاین ایران انجام گرفت. بعد از دریافت اطلاعات ارزش های اصلاحی از مراکز اصلاح نژاد کشور، با استفاده از نمونه های خون 110 راس گاو نر پروف شده یا در انتظار پروف از دو مرکز اصلاح نژاد شمال غرب و تهران، ژنوتیپ افراد با روش هضم آنزیمی (PCR-RFLP) و آنزیم محدودالاثر HifI برای جایگاه موجود در اگزون ششم تعیین گردید. تجزیه و تحلیل داده ها با استفاده از مدل مناسب و نرم افزار SAS انجام گرفت. در این بررسی دو الل (برش یافته G و برش نیافته A) و سه ژنوتیپ مشاهده  شد به طوری که الل (Hinf1 +(G و ژنوتیپ  GG فراوان ترین بودند. تغییرات فراوانی اللی و ژنوتیپی در طی سال های مختلف تولد حیوانات روند مشخصی را نشان نداد و در اکثر سال ها برتری با الل G بود. نتایج تجزیه واریانس نشان داد که ارتباط چندشکلی در جایگاه Pit-I-HinfI با تغییرات ارزش ژنتیکی صفات تولید شیر، تولید چربی، تولید پروتئین، درصد چربی و درصد پروتئین معنی دار نیست (0/05<p). جایگزینی اللی نشان داد که در صورت تغییر الل G به A تاثیر معنی داری در هیچ یک از صفات مورد مشاهده نخواهد شد. به نظر می رسد برای استفاده از چندشکلی ژن Pit-I در بهبود ژنتیکی صفات تولید شیر، نیاز است  تحقیقات بیش  تری انجام شود.
    کلید واژگان: چندشکلی, Pit-I, هلشتاین, صفات تولیدی}
    Abolfazl Gorbani *, Saeed Prnemat Khanegah, Naser Maheri Sis, Mahdi Taghinejad Rodbaneh
    The aim of this study was to determine to Pituitary-specific transcription factor (Pit1) gene polymorphism relationship with milk production in Iranian Holstein dairy cows. For this purpose, blood samples were collected from 110 proof and un-proof Holstein bulls from North West and Tehran breeding centers of Iran. After performing extraction steps using modified phenol-chloroform method, PITI exon 6 polymorphism was determined with PCR-RFLP and HifI restriction enzyme. Two alleles and three genotypes were observed. Hinf1+ (G) allele and GG genotype were the more frequent. Allelic and genotypic variations in years do not show a specific trend, and for most of the years, the G allele was more frequent. The results of analysis of variance showed that PitI-HinfI polymorphism was not significant effect on milk, fat, protein production, fat percentage and protein content (p>0.05). Allelic replacement effect results showed that allele change from G to A did not have a significant effect on any of the studied traits. Based on the results of this study, it can be concluded that for the use of this gene in the of milk production traits improvement, further research is needed.
    Keywords: Polymorphism, PIT1 gene, Production trait, Holstein}
  • محمدتقی زرین نیا، ابوالفضل قربانی*
    این پژوهش به منظور بررسی ارتباط جایگاه های G286A و T340C ژن گیرنده هورمون آزاد کننده گنادوتروپین (GnRHR) و صفات مرتبط با کیفیت اسپرم در جمعیت گاوهای نر هلشتاین انجام گرفت. اطلاعات فنوتیپی و نمونه های خون از 150 راس گاو نر موجود در دو مرکز اصلاح نژاد شیخ حسن تبریز و جاهد کرج بین سال های 1395-1368 جمع آوری شدند. جهت شناسایی چند شکلی های تک نوکلیوتیدی (SNP) ژن GnRHR از روش PCR-RFLP و آنزیم های برشی MboII و BspMI به ترتیب برای جایگاه های G286A و T340C استفاده گردید. در جایگاه T340C دو آلل T وC و در جایگاه G286A دو آلل A و G به دست آمد. آلل های G) 0/679) و T) 0/676) و ژنوتیپ های TC) 0/46) و GA) 0/45) بیش ترین فراوانی را داشتند. نتایج تجزیه واریانس، ارتباط معنی دار جایگاه های کاندیدای فوق را با اکثر صفات اسپرم نشان داد. نتایج مقایسه میانگین حاکی از برتری ژنوتیپ های هتروزیگوت GA  و TC  در جایگاه  های مورد بررسی داشت. این مطالعه برای اولین بار ارتباط معنی دار ژن GnRHR را با صفات مرتبط با اسپرم در جمعیت گاوهای هلشتاین ایران بررسی نمود و نتایج حاکی از آن است که GnRHRدر فرآیندهای مختلف تولید اسپرم نقش دارد. با این حال، تحقیقات بیش تر ضروری است.
    کلید واژگان: GnRHR, صفات اسپرم, هلشتاین, چندشکلی, گاونر}
    Mohamadtaghi Zarinnia, Abolfazl Gorbani *
    This study was performed to investigate the relationship between G286A and T340C loci of the gonadotropin releasing hormone receptor (GnRHR) gene and sperm quality related traits in Iranian Holstein bull’s populations. Phenotypic data and blood samples were collected from 150 bulls at the Sheikh Hassan Tabriz and Jahed Karaj Breeding Centers between 1992-2014. To identify single nucleotide polymorphisms (SNP) of GnRHR gene, PCR-RFLP method and MboII and BspMI restriction enzymes were used for G286A and T340C loci, respectively. The T and C alleles in T340C locus and A and G alleles in G286A locus two were obtained. G (0.679) and T (0.676) alleles and TC (0.46) and GA (0.45) genotypes were the most abundant. Analysis of variance showed a significant relationship between the above candidate loci and most of the sperm traits. The results of mean comparison indicated the superiority of heterozygous GA and TC genotypes in the studied loci. This study for the first time investigated the significant relationship of GnRHR gene with sperm-related traits in Iranian Holstein population. However, further research is needed.
    Keywords: Holstein, GnRHR, Sperm trait, Polymorphism, Bull}
  • مائده قنبریان بروجنی *، مجتبی آهنی آذری، سعید حسنی، محمدرضا عبادی
    اووالبومین ازجمله پروتئین های فعال ماتریکس پوسته تخم مرغ است که بر روی کلسیفیکاسیون پوسته تخم مرغ موثر می باشد. تحقیق حاضر با هدف مطالعه ارتباط چند شکلی دو ناحیه از اگزون 8 ژن اووالبومین واقع بر روی کروموزوم شماره 2 با برخی از صفات کیفیت خارجی تخم مرغ به کمک تکنیک های RFLP و SSCP در مرغان بومی اصفهان انجام شد. در این پژوهش DNA ژنومی از خون به کمک کیت استاندارد استخراج و نواحی مورد نظر به روش PCR تکثیر شدند. چند شکلی یک ناحیه با طول 199 جفت باز به کمک تکنیک های Mnl1-RFLP و SSCP و در ناحیه ای دیگر با طول 407 جفت باز توسط تکنیک SSCP مورد بررسی قرارگرفتند. به منظور تعیین ژنوتیپ مرغان، الکتروفورز ژل پلی اکریل آمید و رنگ آمیزی نیترات نقره استفاده شد. برای قطعه اول 2 ژنوتیپ (A1A1و A1A2) با روش RFLP و 3 ژنوتیپ (B1B1، B1B2 و B3B3) با روش SSCP شناسایی شدند. برای قطعه دوم 3 ژنوتیپ (C1C1، C1C2 و C2C2) مشاهده شد. بیش ترین فراوانی های ژنوتیپی متعلق به الگو های A1A1، B1B2 و C2C2 بود و میانگین های هتروزیگوسیتی به ترتیب 0/33، 0/51 و 0/33 به دست آمد. در تجزیه و تحلیل داده ها هیچ کدام از صفات ارتباط معنی داری با قطعه 199 جفت بازی نشان ندادند (0/05<P). وزن تخم مرغ دارای ارتباط معنی داری با قطعه 407 جفت بازی بود (0/05˂P) که ژنوتیپ C1C2 وزن سبک تری نسبت به دو ژنوتیپ دیگر داشت، اما ارتباط سایر صفات با این قطعه بی معنی بود (0/05<P). نتایج به دست آمده نشان دادند که در مرغ بومی اصفهان ژن اووالبومین دارای چند شکلی نسبتا بالایی است و می تواند در برنامه های اصلاح نژادی آینده مورد توجه قرار گیرد.
    کلید واژگان: چندشکلی, ژن اووالبومین, صفات کیفیت خارجی تخم مرغ, مرغ بومی اصفهان}
    Maede Ghanbarian Boroujeni *, Mojtaba Ahani Azari, Saeed Hasani, Mohammad Raza Ebadi
    Ovalbumin is one of the active proteins of eggshell matrix that affects eggshell calcification. This gene is located on chromosome 2 The aim of the present study was to investigate the association between two region polymorphism of ovalbumin exon 8 with some of external egg quality traits by RFLP and SSCP techniques in Isfahan native chicken. In this study, the genomic DNA was extracted from blood by standard kit and target regions of gene were amplificated using PCR. Polymorphism in a region of exon 8 having length 199 bp was studied by Mnl1- RFLP and SSCP, in other region with 407 bp length by SSCP techniques. In order to genotype chicken, electrophoresis on polyacrylamide gel following silver staining was used. In the first region two genotypes including A1A1, A1A2 were detected by RFLP and three genotypes B1B1, B1B2 and B3B3 by SSCP techniques. In the second region, three genotypes including C1C1, C1C2 and C2C2 were identified. The most genotypes frequencies belonged to A1A1, B1B2 and C2C2, and heterozygosity means were obtained 0.33, 0.51 and 0.33 respectively. Analysis of data didn’t show any significant association between traits and 199 bp fragment (P>0.05). Egg weight had significant association with 407 bp fragment (P˂0.05) that C1C2 genotype was lighter than other two genotypes, but association were not significant with other traits (P>0.05). Results showed that ovalbumin gene has a relatively high polymorphism and could be considered in future breeding programs of native fowl herd of Isfahan.
    Keywords: Polymorphism, Ovalbumin gene, External egg quality traits, Isfahan native chicken}
  • حسین عطارچی *، مجتبی طهمورث پور، مجتبی آهنی آذری، محمدهادی سخاوتی، مختار مهاجر
    پژوهش حاضر با هدف مطالعه چندشکلی ناحیه پروموتر ژن میوستاتین و ارتباط آن با صفات رشد و لاشه در مرغ بومی مازندران انجام شد. برای این منظور تعداد 200 قطعه جوجه خروس از مرغ های بومی مازندران پرورش داده شده در شرایط یکسان، در سن 12 هفتگی کشتار شدند. صفات مورد بررسی، قبل و بعد از کشتار اندازه گیری و ثبت شدند. قبل از کشتار از تمامی پرندگان نمونه خون تهیه و استخراج DNA از نمونه ها با استفاده از کیت شرکت سیناژن صورت گرفت. سپس جایگاه مورد نظر ژن میوستاتین با استفاده از آغازگرهای اختصاصی آن تکثیر و تعیین ژنوتیپ توسط روش PCR-RFLP با آنزیم اختصاصی آن انجام گرفت. تجزیه و تحلیل داده های فنوتیپی و ژنوتیپی با استفاده از نرم افزار آماری 9. 2 SAS انجام شد. فراوانی هریک از آلل های (+) و (-) در جایگاه مورد نظر ژن میوستاتین به ترتیب برابر با 0/77 و 0/23 برآورد شد. بررسی تعادل هاردی واینبرگ با استفاده از آزمون کای مربع برای ژن میوستاتین نشان داد که جمعیت مورد مطالعه در جایگاه ژنی مورد نظر در تعادل نمی باشد. نتایج نشان داد که ارتباط معنی داری بین ژنوتیپ های ژن میوستاتین با صفات وزن زنده در 12 هفتگی، وزن لاشه، وزن قلب و وزن سنگدان وجود دارد (0/05>P). براساس نتایج حاصل از این تحقیق می توان نتیجه گرفت که ژن میوستاتین می تواند در جایگاه مورد نظر به عنوان کاندید برای صفات رشد و لاشه در برنامه های اصلاح نژادی مرغ بومی مازندران مورد استفاده قرار گیرد.
    کلید واژگان: میوستاتین, چندشکلی, صفات, مرغ بومی}
    Hossein Attarchi *, Mojtaba Tahmoorespur, Mojtaba Ahani azari, Mohammad hadi Sekhavati, Mokhtar Mohajer
    This study aimed to study polymorphism of myostatin gene promoter and its association with growth and carcass traits in Mazandaran native chicken. For this purpose, 200 male chicks of Mazandaran native fowls reared in the same conditions and all were slaughtered at 12 weeks of age, were used. Traits before and after slaughter were measured and recorded. Before the destruction of all birds, blood sample and extraction of DNA from samples were performed by Cinnagen kit. Then, the desired locus of gene was amplified using specific primers and genotyped using PCR-RFLP method by specific enzyme. Phenotypic and genotypic data analysis conducted using statistical software of SAS9.2. The frequency of each allele (+) and (-) were estimated to be 0.77 and 0.23 in myostatin locus, respectively. Hardy-Weinberg equilibrium study using Chi-square test showed that the study population in loci is not in balance. The results showed a significant association between myostatin gene genotypes and traits of live weights at 12 weeks of age, carcass weight, heart weight and gizzard weight (P <0.05). Based on the results of this research can be concluded that myostatin gene can be used as a candidate for growth and carcass traits in Mazandaran native fowls breeding programs.
    Keywords: Myostatin, Polymorphism, Traits, Native chicken}
  • حسین عطارچی *، مجتبی طهمورث پور، مجتبی آهنی آذری، محمد هادی سخاوتی، مختار مهاجر
    پژوهش حاضر با هدف مطالعه چندشکلی ژن های PIT1 و STAT5B و ارتباط آن ها با صفات رشد و لاشه در مرغ بومی مازندران انجام شد. برای این منظور، تعداد 200 قطعه جوجه خروس تعیین جنسیت شده از مرغ های بومی مازندران در شرایط یکسان پرورش داده شده و همگی در سن 12 هفتگی کشتار شدند. صفات مورد بررسی قبل و بعد از کشتار شامل وزن زنده در 4، 8 و 12 هفتگی، وزن لاشه، قلب، کبد، سنگدان، طحال، چربی حفره شکمی، pH گوشت، ظرفیت نگه داری آب گوشت و چربی داخل عضله ای اندازه گیری و ثبت شدند. قبل از کشتار از تمامی پرندگان نمونه خون تهیه و استخراج DNA از نمونه ها با استفاده از کیت شرکت سیناژن صورت گرفت. سپس جایگاه های مورد نظر هریک از ژن ها با استفاده از آغازگرهای اختصاصی آن ها تکثیر و تعیین ژنوتیپ توسط روش PCR-RFLP با آنزیم های اختصاصی آن ها انجام گرفت. فراوانی هریک از آلل های (+) و (-) در جایگاه ژنی PIT1 به ترتیب برابر با 0/715 و 0/285 و در جایگاه ژنی STAT5B به ترتیب برابر با 0/355 و 0/645 تعیین شد. تجزیه و تحلیل داده های فنوتیپی و ژنوتیپی با استفاده از نرم افزار آماری 9. 12SAS نشان داد که ارتباط معنی داری بین ژنوتیپ های ژن PIT1 با صفات وزن زنده در 12 هفتگی، وزن لاشه و وزن کبد و ژنوتیپ های ژن STAT5B با صفات وزن زنده در 8 هفتگی و چربی حفره شکمی وجود دارد (0/05>p). بر اساس نتایج حاصل از این تحقیق می توان نتیجه گرفت که ژن های PIT1 و STAT5B می توانند در جایگاه مورد نظر به عنوان کاندید برای صفات رشد و لاشه در برنامه های اصلاح نژادی مرغ بومی مازندران مورد استفاده قرار گیرند.
    کلید واژگان: PIT1, STAT5B, چندشکلی, صفات اقتصادی, مرغ بومی}
    Hossein Attarchi*, Mojtaba Tahmoorespur, Mojtaba Ahani azari, Mohammad hadi Sekhavati, Mokhtar Mohajer
    This investigation was aimed to study polymorphism of PIT1 and STAT5B genes and their association with growth and carcass traits in Mazandaran native fowl. For this purpose, 200 sexed male chicks of Mazandaran native fowls reared in the same conditions and all were slaughtered at 12 weeks of age. Traits before and after slaughter including live weight at 4, 8 and 12 weeks of age, body weight, heart, liver, gizzard, spleen, abdominal fat, meat pH, water holding capacity of the meat and intramuscular fat were measured and recorded. Before the destruction of all birds, blood samples were collected and extraction of DNA from samples were performed by Cinnagen kit. Then, the desired locus of each gene was amplified using specific primers and genotyped using PCR-RFLP method by specific enzymes. The frequency of each allele (+) and (-) were determined 0.715 and 0.285 in PIT1 locus and 0.355 and 0.645 in STAT5B gene locus, respectively. Phenotypic and genotypic data analysis using SAS9.12 statistical software showed a significant association between PIT1 genotypes and live weights at 12 weeks of age, carcass weight and liver weight and also STAT5B genotypes with live weights at 8 weeks of age and abdominal fat (P <0.05). Therefore, it can be concluded that PIT1 and STAT5B genes can be used as candidate genes for growth and carcass traits in Mazandaran native fowls breeding programs.
    Keywords: PIT1, STAT5B, Polymorphism, Economic traits, Native fowl}
  • زینب حسین نیا *، علی شعبانی، حامد کلنگی میاندره
    ماهی سیم (Abramis brama orientalis) از جمله ماهیان استخوانی دریای خزر می باشد. تعداد 30 قطعه ماهی از هر یک از مناطق چمخاله و بندرانزلی تهیه و مورد بررسی ژنتیکی قرار گرفتند. در این بررسی همه 7 جایگاه ریزماهواره ای (Rser10، Ic654، MFW7،MFW26 ،Bl2 -114 ، Bl1 -153،M4) چندشکلی را نشان دادند. نتایج نشان داد که تمایز بارز ژنتیکی بین دو منطقه از لحاظ Fst، Rst و آنالیز واریانس مولکولی وجود نداشته و میانگین تعداد الل در سطح جمعیت ها 10/5 و میانگین هتروزیگوسیتی مشاهده شده و مورد انتظار نیز به ترتیب 0/615 و 0/820 می باشد. تقریبا اکثر جایگاه های ژنی انحراف از تعادل هاردی-واینبرگ را نشان دادند. شباهت و فاصله ژنتیکی بین دو منطقه به ترتیب 0/684 و 0/316 بود. براساس آنالیزهای موجود به نظر می رسد، گونه Abramis brama دارای تنوع ژنتیکی مطلوبی در مناطق مورد بررسی نمی باشد.
    کلید واژگان: ماهی سیم, ریزماهواره, تنوع ژنتیکی, چندشکلی}
    Zeynab Hosseinnia*, Ali Shabani, Hamed Kolangi miandare
    Abramis brama orientalis is one of the osteichties fishes of Caspian sea. 30 samples from each region(Bandaranzali and Chamkhale) were collected to investigate the genetic diversity and population structure of Abramis brama. In this study, all of seven microsatellite loci studied (Rser10, Ic654, MFW7 , MFW26 , Bl2 -114, Bl1 -153, M4) showed polymorphism. No observed any obvious genetic destinguish in terms of Fst , Rst and Analysis of Molecular Variance. The average number of allele’s levels in the population accounted for 10.5, The expected and observed heterozygosity mean were 0.820 and 0.615, respectively. Approximately all of loci showed deviation from Hardy-Weinberg equilibrium. The genetic similarity and distance between the two populations were 0.316 and 0.684, respectively. According to the analysis, it seems that Abramis brama hasn᾽t a desirable genetic diversity in the investigated regions.
    Keywords: Bream (Abramis brama orientalis), Microsatellite, genetic diversity, Polymorphism}
  • مجتبی طهمورث پور، حسین عطارچی *، مجتبی آهنی آذری، محمدرضا نصیری
    پژوهش حاضر با هدف مطالعه چندشکلی ناحیه ژن 5 IGF-I و ارتباط آن با صفات کیفیت لاشه شامل PH، رنگ گوشت، ظرفیت نگه داری آب و چربی داخل عضله ای در بلدرچین ژاپنی انجام شد. برای این منظور تعداد 100 قطعه بلدرچین ژاپنی که در شرایط یکسان پرورش داده شدند در سن 5 هفتگی کشتار شده و صفات کیفیت لاشه اندازه گیری و ثبت شد. هم چنین قبل از کشتار از پرندگان نمونه خون تهیه و استخراج DNA از نمونه ها با کیت دیاتوم صورت گرفت. سپس با استفاده از روش PCR-RFLP و آنزیم برشی PST-I قطعه 621 جفت بازی از ناحیه مورد نظر، تکثیر و برش داده شد. در مجموع در بلدرچین های مورد مطالعه سه ژنوتیپ AA ، AB و BB به ترتیب با فراوانی های 41، 35 و 24 درصد به دست آمد. فراوانی آلل های A و B نیز به ترتیب 58/5 و 41/5 درصد بود. بررسی تعادل هاردی واینبرگ با استفاده از آزمون کای مربع نشان داد که جمعیت مورد مطالعه در جایگاه ژنی مورد نظر در تعادل نیست. تجزیه و تحلیل داده های فنوتیپی نشان داد که ژنوتیپ های ژن IGF-I در جایگاه مورد نظر با صفت چربی داخل عضله ای ارتباط معنی داری دارد. براساس نتایج حاصل از تحقیق حاضر می توان نتیجه گرفت که ژن IGF-I می تواند به عنوان ژن کاندید برای صفات کیفیت لاشه در برنامه های اصلاح نژادی بلدرچین ژاپنی مورد استفاده قرار گیرد.
    کلید واژگان: IGF, I, چندشکلی, کیفیت لاشه, بلدرچین}
    Mojtaba Tahmoorespur, Hossein Attarchi *, Mojtaba Ahani Azari, Mohammad Reza Nassiry
    The aim of the present study was to perform a polymorphism evaluation of the gene 5 area of IGF-I in order to see whether there is any relationship between the gene and the features of quail’s carcass quality including the PH, the color of meat, the amount of water and fat stored inside the muscles of the Japanese quail. To this end, a total of 100 Japanese quails were reared under similar conditions; and then having been slaughtered at the age of 5 weeks, the carcass quality traits were measured and recorded. Moreover, before slaughtering was done, the blood of the sample birds was tested and the DNA was extracted using a diatom kit. Then, using PCR-RFLP method and the sectorial Enzyme PST-I, the segment no. 621 of the base pair was cut from this part of DNA to be multiplied. In general, having studied the quails, three genotypes of AA, AB and BB were acquired with the frequencies of 41, 35 and 24 percents, respectively. The allele frequencies of A and B were 58.5 and 41.5 percents, respectively. Investigating Hardy Wineberg’s equilibrium with the use of Chi-square test showed that the analyzed sample population is not at equilibrium at its true gene position. The Phenotypic analysis showed that there is a significant relationship between the genotypes of the gene IGF-I at its specified position and the lipid traits inside the muscle. Based on the results of the study, the conclusion is that the gene IGF-I can be used as the candidate gene for carcass quality traits in programs to amend and modify the species of the Japanese quail.
    Keywords: IGF, I, polymorphism, carcass quality, quail}
  • وحید زمانی، حمیدرضا رضایی، سیدمحمود عقیلی، مرضیه اسدی آقبلاغی، علی شعبانی، نوید زمانی
    مطالعه روی گوشت خواران به دلیل جمعیت محدودشان و ویژگی های رفتاری خاص این گونه ها بیشتر به صورت غیرمستقیم و به کمک نمایه ها صورت می گیرد که همواره با اشتباهاتی نیز همراه است. با توجه به کاهش شدید گوشت خواران در اکثر زیستگاه های طبیعی در سطح کشور، شناسایی دقیق این گونه ها جهت اجرای برنامه های حفاظتی ضروری است. استفاده از ژنوم میتوکندری به دلیل نرخ جهش پذیری بالا، یک روش استاندارد جهت شناسایی پستانداران می باشد. در این مطالعه 14 گونه گوشت خوار (هفت گونه گربه سان، پنج گونه سگ سان، یک گونه کفتار و یک گونه خرس) بر اساس پلی مورفیسم طول ناحیه کنترل میتوکندری و با استفاده از آغازگر های عمومی مورد بررسی قرار گرفتند که در نهایت، 13 گونه شناسایی شد. روش به کار گرفته شده در این پژوهش، روشی به نسبت تکرار پذیر، سریع و کم هزینه است که می تواند جهت شناسایی دقیق گونه ها و گونه های گوشت خوار حضور و عدم حضور این گونه های نادر در زیستگاه و نیز گونه های مشکوکی که از متخلفان و یا سایر موارد به دست می آیند، مورد استفاده قرار گیرد.
    کلید واژگان: گوشت خواران, پلی مورفیسم, ژن ناحیه کنترل, دی ان ای میتوکندری, آغازگر عمومی}
    Zamaniw., Rezaei, H.R., Aghili, S.M., Asadi Aghbolaghim., Shabania., Zamani, N
    Because of the limited population study on carnivores their certain behavioral characteristics are not known. The sharp decline in the level of carnivores in most natural habitats, species identification is essential for conservation programs. Due to the high mutation rate of the mitochondrial genome, is a standard method for identifying mammals. In this study, 14 carnivores (7 species Felidae, 5 species of canines, a species of hyena and a bear) based on mitochondrial control region length polymorphisms were analyzed using universal primers. Finally, 13 species were identified. Method used in this study was relatively reproducible way, fast with low cost. This method can also identify the exact species of carnivorous, the presence or absence of rare species to be used, also doubtful species which are obtained from the offender or others.
    Keywords: Carnivores, Polymorphism, Control region, PCR, Mitochondrial DNA}
  • Maliheh Pirzad *, Saeid Ansari Mahyari, Mohamad Ali Edriss

    This experiment was aimed to study the association between the DGAT1 K232A polymorphism and milk production traits and somatic cell score (SCS) in Iranian Holstein dairy cows. The records of 408 animals from five dairy herds were randomly identified and then genomic DNA was extracted from blood using the modified-salting method described by Miller. RFLP-PCR was performed to obtain all the polymorphisms and two alleles, K and A were observed with frequency of 0.37 and 0.63. Genotypic frequencies of AA, KA and KK were 0.3578, 0.5515 and 0.0907, respectively. The relationship between DGAT1 K232A and milk traits and somatic cell score in the first lactation was studied. The results showed significant difference (p≤0.05) between the genotypes on milk production, fat percent but not for protein percent and SCS. According to this research, the DGAT1 K232A polymorphism can be considered for increasing milk performance traits in Holstein dairy cows in the proximal region of bovine chromosome 14.

    Keywords: Polymorphism, DGAT1, Milk, RFLP, SCS.Overview}
  • Mohammad Mahmoudzadeh *, Mohammad Bagher Montazer Torbati, Homayoun Farhangfar, Arash Omidi
    Placental Lactogen is a polypeptide hormone that is produced by the Placenta, also known as chorionic somatomammotropin hormone. It has both Growth Hormone and Prolactin activities on growth, lactation, and luteal steroid production. The objective of this study was to investigate the bovine Placental Lactogen (bPL) gene polymorphism of Holstein cows in Razavi Khorasan province. Blood samples were collected from 150 dairy cattle from six herds. DNA extraction was performed by salting out method. A fragment of 449 bp from intron 1 was amplified by the polymerase chain reaction and analyzed by single-strand conformation polymorphism to get the patterns of single-stranded DNA separated by native polyacrylamide gel electrophoresis and visualized by silver staining. Six genotypes were revealed with the frequencies of 0.283 (AA), 0.085 (AB), 0.292 (AC), 0.019 (CC), 0.292 (AD) and 0.029 (DD). The allele frequencies for A, B, C and D were 0.6179, 0.0425, 0.1651 and 0.1745, respectively.Chi-square test didn't confirm Hardy-Weinberg (H-W) equilibrium for this locus. Associations between polymorphisms and the traits studied were evaluated using the MIXED procedure of the SAS 9.1 software. Results showed that the polymorphism of the bPL gene is significantly is associated with fat percent (P=0.012)
    Keywords: Polymorphism, Bpl, SSCP, Milk production traits, Holstein cow}
  • Hojjat Asadollahpour Nanaei *, Saeid Ansari Mahyari, MohammadAli Edriss, Mahmood Rostami, Malihe Pirzad, Amir Boroushak

    In this study we estimated the allele and genotype frequencies of SCD1 and DGAT1 gene polymorphism. The analysis was conducted on 408 Holstein cows from five dairy herds in Isfahan province. Genotypes were identified using PCR-RFLP technique. Two genetic variants (A and V) of the SCD1 gene were observed in this experiment. The frequency of A-allele ranged from 0.49 to 0.66, while frequency of V-allele 0.34 to 0.51. Regards with DGAT1 gene, also two genetic variants (A and K) were determined that frequency of A-allele ranged from 0.54 to 0.68 and K-allele 0.32 to 0.46. It was found that these two genes were polymorphic in Isfahan Holstein cows, which suggested that could be associated with composition and production traits

    Keywords: Holstein cow, SCD1 gene, DGAT1 gene, Polymorphism, Milk traits}
  • Maryam Khatibi *, Hedayatullah Roshanfekr, Jamal Fayazi, Khalil Mirzade
    Lactoferrin is a glycoprotein with molecular weight 80 kDa iron-binding bond, which is composed of 690 amino acids. In most mammalian body fluids such as sweat, semen, tears, and saliva and milk neutrophil granules there. bovine lactoferrin gene be associated with susceptibility/resistance to mastitis and even with some economically important production traits. This study was carried out to detect polymorphism in lactoferrin gene in 85 Bufallo to 4 location khuzestan province were selected randomly. After extracting DNA, amplification of 367 bp of lactoferrin gene was performed using specific primers. In this research four SSCP pattern for AA, BB, EE and FF  lactoferrin gene in Bufallo were found in Khuzestan Province. The results showed that  lactoferrin gene  is so polymorphism in studied population. Gene frequencies for A, B, E and F alleles were 0.341, 0.259, 0.118 and 0.282  respectively. Therefore, the results confirmed that SSCP technique can be used to identify different genotypic variation in these breeds and is a useful tool for selection programs based on marker-assisted selection
    Keywords: Khuzestan buffalo, Lactoferrin gene, Polymorphism, PCR-SSCP}
  • سیامک یوسفی سیاهکلرودی، صابر خدرزاده، مریم عیدی، منا ایزدیان
    به منظور مطالعه ساختار ژنتیکی سنجاب بلوچی، پس از صید 50 نمونه از آن، نمونه برداری و استخراجDNA از تار مو، از 7 نشانگر ریزماهواره استفاده گردید. پس از تکثیر جایگاه ها بوسیله تکنیک PCR و تعیین ژنوتیپ، با استفاده از نرم افزار، آنالیزهای مربوطه انجام شد. در این تحقیق از بین نشانگرهای مورد مطالعه، جایگاه Thu 50 دارای بیشترین تعداد آلل مشاهده شده (3 آلل) و جایگاه Thu 21 دارای کمترین تعداد آلل (2 آلل) بودند. بیشترین محتوای اطلاعات چندشکلی در جایگاه Thu 50 نمایان شد. بیشترین هتروزایگوسیتی مشاهده شده و هتروزایگوسیتی مورد انتظار نااریب نی در جایگاه Thu 50 (بترتیب 250/0 و 559/0) و کمترین مقدار پارامترهای مذکور در جایگاه Thu 21 (بترتیب 000/0 و 444/0) مشاهده گردید. بیشترین و کمترین مقدار شاخص شانون نیز بترتیب در جایگاه های Thu 50 (934/0) و Thu 21 (637/0) دیده شد. در این جمعیت، کلیه جایگاه ها در تعادل هاردی-وینبرگ بودند.
    کلید واژگان: سنجاب بلوچی, ساختار ژنتیکی, چندشکلی, ریزماهواره}
    Siamak Yousefi, Saber Khederzadeh, Maryam Eidi, Mona Izadian
    In order to study the genetic structure of Palm squirrel, 50 squirrels were taken using proper traps, sampling and DNA extraction was carried out, using squirrel hair samples and 7 important markers of microsatellite were used. After loci amplifying by PCR and genotyping, statistical analysis for determining different parameters was implemented using statistical softwares. In this research, among the studied loci, Thu 50 locus had the highest number of alleles (3 alleles) and Thu 21 locus (2 alleles) had the least number of alleles. The highest level of Polymorphic information content was observed in Thu 50 locus. Considering the heterozygosity, the highest amount of observed and unbiased expected heterozygosity was detected in Thu 50 locus (0.250 and 0.559) and the amount of observed and unbiased expected heterozygosity were observed in Thu 21 locus (0.000 and 0.444), respectively. The highest and lowest values of Shannon’s index were in Thu 50 (0.934) and Thu 21 (0.637) loci, respectively. In this study, all loci were indicating Hardy-Weinberg equilibrium.
    Keywords: Palm Squirrel, Genetic structure, Polymorphism, Microsatellites}
نکته
  • نتایج بر اساس تاریخ انتشار مرتب شده‌اند.
  • کلیدواژه مورد نظر شما تنها در فیلد کلیدواژگان مقالات جستجو شده‌است. به منظور حذف نتایج غیر مرتبط، جستجو تنها در مقالات مجلاتی انجام شده که با مجله ماخذ هم موضوع هستند.
  • در صورتی که می‌خواهید جستجو را در همه موضوعات و با شرایط دیگر تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مجلات مراجعه کنید.
درخواست پشتیبانی - گزارش اشکال