به جمع مشترکان مگیران بپیوندید!

تنها با پرداخت 70 هزارتومان حق اشتراک سالانه به متن مقالات دسترسی داشته باشید و 100 مقاله را بدون هزینه دیگری دریافت کنید.

برای پرداخت حق اشتراک اگر عضو هستید وارد شوید در غیر این صورت حساب کاربری جدید ایجاد کنید

عضویت

جستجوی مقالات مرتبط با کلیدواژه « mastitis » در نشریات گروه « بیوتکنولوژی و ژنتیک گیاهی »

تکرار جستجوی کلیدواژه «mastitis» در نشریات گروه «کشاورزی»
  • زهرا رودباری*، فاطمه محمدی نژاد، سعیده اسکندری نسب سیاهکویی
    هدف

    ورم پستان یک بیماری عفونی در دوران خشکی و شیردهی گاو شیری است که اثرات مخرب شناخته شده ای بر سلامت حیوانات و سود اقتصادی دارد و هر ساله خسارت زیادی به صنعت لبنیات وارد می کند. هدف از این تحقیق شناسایی ژن های هاب و مسیرهای بیولوژیکی مرتبط با بیماری ورم پستان در گاو شیری با استفاده از تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیک است.

    مواد و روش ها

    مجموع 21 نمونه داده ریزآرایه شامل 9 نمونه از بافت گاو سالم و 12 نمونه از بافت آلوده به E.coli از پایگاه داده GEO با شماره دسترسی GSE24217 استخراج و با استفاده از GEO2R مورد ارزیابی قرار گرفت. و سپس بر اساس دو معیار 05/0> adjP-value و1|LogFC| ≥ ژن های متفاوت بیان مشخص گردید. افزونه CytoHubba در نرم افزار Cytoscape و روش های تحلیل توپولوژیکی DMNC ,MCC ,MNC, DEGREE برای شناسایی ژن های هاب استفاده شد.. جهت شناسایی مسیرهای سیگنالدهی از ابزار STRING بر اساس شاخص 05/0> FDR استفاده شد.

    نتایج

    در مجموع 631 ژن بیان متفاوت داشتند که از این بین تعداد 136 ژن در بافت پستان آلوده نسبت به سالم بیان پایین و 495 ژن بیان بالا داشتند. از این تعداد 205 ژن تشکیل شبکه هم بیانی دادند. 12 ژن هاب شاملCCL19 ، ALB، GAPDH، PTPRC، ICAM1، IL6، IL1B، IL18، CXCL8، CCL20، CXCL16، CCL3 شناسایی شد. نتایج تجزیه و تحلیل مسیرهای بیولوژیکی نشان داد که لیست ژنی مورد مطالعه در 66 مسیر بیولوژیکی نقش دارند کهNOD-like receptor signaling pathway، TNF signaling pathway، IL-17 signaling pathway نقش عملکردی مهمی در بیماری ورم پستان گاو شیری دارند.

    نتیجه گیری

    ژن ها و مسیرهای پیشنهاد شده ممکن است منجر به درک بیشتری از مکانیسم های مولکولی موثردر بیماری ورم پستان شود و می توان در برنامه اصلاحی پیشگیری و تشخیص زودرس ورم پستان و اهداف درمانی این عفونت در نظر گرفت. پیش بینی می شود که این نتایج ممکن است نشانگرهای زیستی دقیق تر و عملا قابل اعتمادتری را برای تشخیص زودهنگام و پیشگیری و درمان فردی ورم پستان E. coli گاوی ارائه دهند.

    کلید واژگان: بیوانفورماتیک, ژن های هاب, مسیر های بیولوژیکی, ورم پستان}
    Zahra Roudbari *, Fatemeh Mohammadinejad, Saideh Eskandarynasab
    Objective

    Mastitis, a significant infectious ailment affecting dairy cows during both dry and lactation periods, has substantial impacts on animal health, economic profitability, and the dairy industry each year. This study seeks to utilize bioinformatics analysis not only to identify hub genes and biological pathways linked to mastitis in dairy cows but also to gain a deeper understanding of its implications.

    Materials and methods

    21 microarray data samples were obtained from the GEO database (accession number GSE24217), comprising 9 healthy cow tissue samples and 12 E. coli infected tissue samples. These samples were assessed using GEO2R. Differentially expressed genes were identified based on two criteria: adjP-value > 0.05 and |LogFC| ≥ 1. Hub genes were identified using the CytoHubba plugin in Cytoscape software and topological analysis methods (DMNC, MCC, MNC, DEGREE). Signaling pathways were identified using the STRING tool based on an FDR > 0.05 index.

    Results

    Out of 631 differentially expressed genes, 136 had low expression, and 495 had high expression in infected breast tissue compared to healthy ones. Among these, 205 genes were co-expressed in the network. 12 hub genes, including CCL19, ALB, GAPDH, PTPRC, ICAM1, IL6, IL1B, IL18, CXCL8, CCL20, CXCL16, and CCL3, were identified. The analysis of biological pathways revealed that the studied genes are involved in 66 biological pathways, with NOD-like receptor signaling pathway, TNF signaling pathway, and IL-17 signaling pathway playing important functional roles in dairy cow mastitis disease.

    Conclusions

    The discovered genes and pathways have the potential to enhance our knowledge of the complex molecular mechanisms involved in mastitis development. These discoveries could shape a thorough reform initiative focused on preventing, diagnosing, and treating mastitis. These insights are expected to pave the way for the creation of precise and dependable biomarkers for early detection and prevention of bovine E. coli mastitis, ultimately facilitating personalized treatment approaches.

    Keywords: : Bioinformatics, Biological Pathways, Hub Genes, Mastitis}
  • مصطفی محقق دولت آبادی*، الناز حیدری ارجلو، هاجر سادات حسینی دولت آبادی

    ورم پستان پر هزینه ترین بیماری در گاوهای شیری بوده که معمولا در پاسخ به عفونت باکتریایی داخل غدد پستانی ایجاد می شود. شناسایی ژن هایی که بیان آن ها در پاسخ به این عفونت های باکتریایی تغییر می کنند و گروه بندی این ژن ها بر اساس نقش های بیولوژیکی آن ها در فهم پاسخ میزبان به نوع پاتوژن کمک بسزایی می کند. از این رو، هدف از این مطالعه بررسی میزان بیان ژن اینترلوکین 2 در تلیسه های شیری سالم در سه مرحله شیردهی (اوایل، اواسط و اواخر دوره ی شیردهی) و دام های مبتلا به ورم پستان کلینیکی E. coli در تلیسه های شیری هلشتاین بود. بدین منظور RNA کل از سلول های سوماتیکی نمونه های شیر 18 دام سالم (6 نمونه برای هر مرحله) و 4 دام مبتلا به ورم پستان ناشی از باکتری E. coli استخراج شد و بیان ژن اینترلوکین 2 با ژن GAPDH به عنوان ژن مرجع مورد مقایسه قرار گرفت. برای آنالیزهای بیان ژن مورد نظر از برنامه REST, 2009, V2.0.13 استفاده شد. نتایج این مطالعه افزایش معنی دار بیان ژن اینترلوکین 2 در گاوهای ورم پستانی نسبت به تمام مراحل شیردهی دام های سالم را نشان داد. حداکثر و حداقل تفاوت بیان به ترتیب برای مراحل اوایل و اواخر شیردهی در دام های سالم مشاهده شد. به طور کلی نتایج مطالعه این نشان داد که امکان تایید تغییر بیان ژن اینترلوکین 2 در تلیسه های شیری سالم و مبتلا به ورم پستان E. coli وجود داشته و ژن اینترلوکین 2 ممکن است نقش مهمی در مبارزه با عفونت داخل پستانی ایجاد شده توسط E. coli بازی کند.

    کلید واژگان: اینترلوکین2, بیان ژن, تلیسه های هلشتاین, GAPDH, ورم پستان}
    M .Muhaghegh Dolatabady*, E. Heidary Arjlo, H .Hosseiny Dolatabady

    Mastitis is the most costly disease in dairy cattle and usually occurs in response to intramammary bacterial infections. The identification of genes that their expression are altered in response to bacterial infections and to classify them into biologically functional groups help to understanding of the host response to a specific pathogen. Therefore, the aims of this study were to investigate the expression of IL-2 gene in the mammary gland of healthy Holstein heifers at three stages of early, mid and late lactation and E.coli mastitis heifers. For this purpose, total RNA extracted from milk somatic cell of 18 healthy Holstein heifers (6 animals for each stage of lactation) and 4 clinical E.coli mastitis heifers in first lactation. To study of gene expression, the expression of IL-2 gene was compared with GADPH gene as a reference gene. For gene expression analysis, the REST, V2.0.13 2009 software was used. Our results showed significant increase of IL-2 expression in E.coli mastitis in comparison of different lactation stages. Maximum and minimum differences were found with early and late stages of lactation, respectively. Our study indicates that it was possible to verify changes in the expression of IL-2 gene in normal and E.coli mastitis heifers and the IL-2 gene may play important role in fighting intramammary infection caused by E.coli.

    Keywords: GADPH, gene expression, Holstein heifers, IL-2, mastitis}
  • مصطفی قادری*، زهرا بیرانوند، سید ضیا الدین میرحسینی، سید حسین حسینی مقدم، آرش فاضلی
    هدف
    کنکاش مسیرهای پیام دهی در بیماری هایی مثل ورم پستان در گاو شیری که بیشتر تحت تاثیر فرایندهای فراژنتیک هستند، ضروری به نظر می رسد.
    مواد و روش ها
    در این پژوهش 5 مولکول ریزRNA کاندید با شماره دسترسی های bta-mir- 223،bta-mir 21-5p ، bta-mir-181، bta-mir-146a و bta-mir-16a در منابع شناسایی و استخراج شدند و با استفاده از پایگاه داده Mirtarbase و پایگاه داده Targetscan به ترتیب ژن های هدف تایید شده و پیش بینی شده برای هر یک از ریزRNAهای بالا استخراج شدند. سپس بیان ژن های هدف پیش بینی شده و تایید شده برای هر یک از ریزRNAهای بالا در بافت غدد پستانی در پایگاه NCBI بررسی شدند. علاوه بر این با استفاده از نرم افزار DAVID، مسیرهای پیام رسانی سلولی در KEGG مشخص شدند.
    نتایج
    بر اساس نتایج بدست آمده مشخص شد که ریز  bta-mir-146a RNAاز طریق تاثیر بر 7 پروتئین، و ریز RNA bta-mir-223 از طریق تاثیر بر 11 پروتئین و ریز bta-mir 21-5p RNA از طریق تاثیر بر 9 پروتئین در مسیرهای پیام دهی سلولی مختلفی درگیر هستند، و لذا احتمالا در بیماری ورم پستان گاو شیری نقش دارند. همچنین نتایج نشان داد که دو ریز  bta-mir-181 RNAو bta-mir-16a در مسیرهای پیام دهی مهمی مثل GnRH signaling pathway، Estrogen signaling pathway، Progesterone-mediated oocyte maturation، Oxytocin Signaling Pathway و MAPK Signaling Pathway  نقش مهمی را بازی می کنند.
    نتیجه گیری
    این پژوهش نشان می دهد که ریزRNAهای مورد بررسی می توانند به عنوان نشانگرهای مولکولی، در علت یابی ملکولی بیماری ورم پستان گاو شیری نقش مهمی ایفا کنند.
    کلید واژگان: بیوانفورماتیک, ریز RNA, مسیر پیام رسانی سلولی, ورم پستان, KEGG}
    Mostafa Ghaderi *, Zahra Biranvad, Seyyed Ziaeddin Mirhoseini, Seyyed Hassan Hosseini Moghadam, Arash Fazeli
    Objective
     It is reasonable to investigate the signaling pathways in diseases such as mastitis in dairy cattle, which are more likely to be affected by epigenetics.  
    Materials and methods
    In this research, 5 microscopic RNA molecules with the accession numbers bta-mir-223, bta-mir 21-5p, bta-mir-181, bta-mir-146a and bta-mir-16a in the sources were identified and extracted from the literatures. Using mirtarbase and targetcan databases, respectively, the confirmed and predicted target genes were extracted for each of the top microRNAs, respectively. Subsequently, the expression of the predicted and confirmed target genes for each of the top microRNAs in the mammary gland tissue was investigated at the NCBI database. In addition, using the DAVID software, cellular signaling pathways were identified in KEGG.  
    Results
    Based on the results, bta-mir-146a microRNA through effects on of 7 proteins, and microRNA bta-mir-223 through effects on 11 proteins and micro RNA bta-mir21-5p through effects on 9 proteins, involved in various cellular signaling pathways, sought to be involved in mastitis in dairy cattle. The results also showed that two bata-mir-181 and bta-mir-16a played an important role in crucial pathways such as the GnRH signaling pathway, Estrogen signaling pathway, Progesterone-mediated oocyte maturation Oxytocin Signaling Pathway and MAPK Signaling Pathway.  
    Conclusions
    This study shows that the microRNAs can be used as molecular markers to dissect molecular etiology of mastitis in dairy cattle.
    Keywords: bioinformatics, KEGG, Mastitis, MicroRNAs, Signaling Pathways}
  • مجید پسندیده*، حامد خراتی کوپایی، محمدرضا محمدآبادی، علی اسماعیلی زاده کشکوییه
    سلول‏های بدنی یکی از اجزای شیر هستند که در اثر بازسازی طبیعی بافت غده ای پستان تولید می‏شوند. تعداد این سلول‏ها در شیر هم بیانگر سلامت دام و هم شیر تولیدی گاوها است، از این رو تعداد سلول‏های بدنی موجود در شیر شاخص مهمی برای به‏نژادی دام می‏باشد. در این مطالعه ارتباط بین ژنوتیپ‏های ژن‏های واقع روی کروموزوم شش گاوی (OPN و PPARGC1A) و تعداد سلول بدنی در شیر بررسی شد. استخراج DNA از نمونه های خون جمع آوری شده از 398 راس گاو هلشتاین از استان‏های تهران و اصفهان به روش نمکی انجام شد. چندشکلی های تک نوکلئوتیدی در ژن‏ها با روش PCR-RFLP تعیین ژنوتیپ شدند. تجزیه مدل‏های خطی با در نظر گرفتن ژنوتیپ‏های مورد بررسی به عنوان اثرات ثابت نشان داد که اختلاف معنی‏داری بین ژنوتیپ‏های موقعیت 3359 از ژن PPARGC1A و موقعیت 8514 از ژن OPN با تعداد سلول بدنی شیر وجود دارد (05/0P<). بیش ترین میانگین تعداد سلول‏های بدنی مربوط به ژنوتیپ‏های AC و CC به ترتیب در جایگاه های (3359) PPARGC1A و (8514) OPN بود. اگرچه مطالعات بیش تری برای تایید نتایج تحقیق حاضر نیاز است، اما این مناطق ژنومی می‏توانند به عنوان نشانگرهای ژنتیکی برای بهبود ورم پستان در گاوهای شیری مورد استفاده قرار گیرند.
    کلید واژگان: تعداد سلول های بدنی شیر, گاو هلشتاین, ورم پستان, OPN, PPARGC1A}
    Pasandideh M.*, Kharrati Koopaee H., Mohammad Abadi Mr, Esmailizadeh Koshkoiyeh A
    Somatic cells are one of the milk components produced as a result of natural regeneration of the glandular tissue of mammary gland. The count of these cells in milk reflects the health state of cows; hence their level is an important indicator for improvement of livestock. In this study association between genotypes of genes located on BTA6 (OPN, PPARGC1A) and somatic cell count (SCC) in milk was investigated. Therefore, DNA was isolated from blood samples collected from 398 Holstein cows of Tehran and Esfahan provinces by salting out method. PCR-RFLP method was used for genotyping SNPs in genes. Linear models analysis with fixed effects of genotypes indicated significant associations between c.3359 genotypes of PPARGC1A gene and c.8514 genotypes of OPN gene with SCC (P
    Keywords: Holstein cattle, Mastitis, OPN, PPARGC1A, Somatic cell count}
  • آزاده خسروی، سیدضیاءالدین میرحسینی*، مصطفی محقق
    ورم پستان یکی از شایع ترین بیماری ها در گاوهای شیری است. برای ایجاد مقاومت ژنتیکی نسبت به این بیماری، شناسایی ژن ها و الل های مقاوم به ورم پستان ضروری است. گیرنده های شبه تول (TLRs) از ژن های کاندیدای مناسب برای افزایش مقاومت ژنتیکی به ورم پستان در گاوهای هلشتاین هستند. در این پژوهش چند شکلی راه انداز ژن TLR4 و ارتباط آن با تعداد سلول های سوماتیک در یک جمعیت از گاوهای هلشتاین ایران مورد بررسی قرار گرفت. برای این منظور، از 100 گاو هلشتاین نمونه خون تهیه و DNA آنها استخراج شد. برای راه انداز ژن TLR4 یک جفت آغازگر طراحی شد. این آغازگرها قطعه ای به طول 274 جفت باز را در فرایند واکنش زنجیره ای پلیمراز (PCR) تکثیر نمودند. دو الگوی ژنتیکی A و B به ترتیب با فراوانی 74/0 و 26/0 تشخیص داده شدند. نتایج نشان داد که این الگوهای ژنتیکی اثر معنی داری بر تعداد سلول های سوماتیک در گاوهای هلشتاین جمعیت مورد بررسی دارد (01/0P<). با توجه به پایین بودن توارث پذیری تعداد سلول های سوماتیک (093/0) و عدم کارایی انتخاب مستقیم برای بهبود صفت، انتخاب بر مبنای الگوهای ژنتیکی ژن TLR4 می تواند برای بهبود مقاومت ژنتیکی در برابر ورم پستان مورد استفاده قرار گیرد.
    کلید واژگان: ژنوتیپ, گاوهای هلشتاین, ناحیه راه انداز, ورم پستان, TLR4}
    Khosravi A., Mirhoseini Sz*, Mohaghegh M
    Mastitis is one of the most prevalent diseases of dairy cattle. In order to create genetic resistance to the disease, it is essential to identify resistant genes to mastitis. Toll-like receptors are the suitable candidate genes for enhancing genetic resistance to mastitis in Holstein cows. In this research, polymorphism of TLR4 gene’s promoter and its association with somatic cell count in a herd of Holstein cows in Isfahan was studied. For this purpose, DNA was extracted from 100 blood sample of Holstein cows. Two primers were used for amplifying the promoter of TLR4’s gene. These primers amplified 274bp fragments using polymerase chain reaction (PCR) method. The amplified fragments showed A and B genotypes with 0.74 and 0.26 frequency respectively. The results of this study showed that these two different genotypes have significant effect on somatic cell count in the studied herd (P<0/01). With respect to low heritability of somatic cell count (0.093) and deficiency of direct selection for improving of this characteristic, selection on the basis of TLR4 genotypes can efficiently used for increasing genetic resistance to mastitis.
    Keywords: Genotype, Holstein cows, Mastitis, Promoter region, TLR4}
  • فاطمه رحیمی باغی، راضیه نظری، معصومه دورقی، مصطفی معین راد، رضا نجفی، ناصر کلهر
    razieh nazari*

    Milk is considered a nutritious food because it contains several important nutrients including proteinsand vitamins. Conversely, it can be a vehicle for several pathogenic bacteria such as Staphylococcusaureus. In this study, 123 milk samples of 123 cows from four farms of different geographic locations inQom were collected from March until November 2011. The samples were cultured on Blood agar andbacteria were identified by standard methods. On the basis of cultural and biochemical properties, 26Staphylococcus aureus isolates obtained from 123 milk samples. Among a 26 isolates, 9 isolates (7.31%)were positive coagulase and 12 isolates (9.75%) were positive DNAase.Milk is considered a nutritious food because it contains several important nutrients including proteinsand vitamins. Conversely, it can be a vehicle for several pathogenic bacteria such as Staphylococcusaureus. In this study, 123 milk samples of 123 cows from four farms of different geographic locations inQom were collected from March until November 2011. The samples were cultured on Blood agar andbacteria were identified by standard methods. On the basis of cultural and biochemical properties, 26Staphylococcus aureus isolates obtained from 123 milk samples. Among a 26 isolates, 9 isolates (7.31%)were positive coagulase and 12 isolates (9.75%) were positive DNAase.

    Keywords: Mastitis, raw milk, Staphylococcus aureus}
نکته
  • نتایج بر اساس تاریخ انتشار مرتب شده‌اند.
  • کلیدواژه مورد نظر شما تنها در فیلد کلیدواژگان مقالات جستجو شده‌است. به منظور حذف نتایج غیر مرتبط، جستجو تنها در مقالات مجلاتی انجام شده که با مجله ماخذ هم موضوع هستند.
  • در صورتی که می‌خواهید جستجو را در همه موضوعات و با شرایط دیگر تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مجلات مراجعه کنید.
درخواست پشتیبانی - گزارش اشکال