به جمع مشترکان مگیران بپیوندید!

تنها با پرداخت 70 هزارتومان حق اشتراک سالانه به متن مقالات دسترسی داشته باشید و 100 مقاله را بدون هزینه دیگری دریافت کنید.

برای پرداخت حق اشتراک اگر عضو هستید وارد شوید در غیر این صورت حساب کاربری جدید ایجاد کنید

عضویت

جستجوی مقالات مرتبط با کلیدواژه "pichia pastoris" در نشریات گروه "بیوتکنولوژی و ژنتیک گیاهی"

تکرار جستجوی کلیدواژه «pichia pastoris» در نشریات گروه «کشاورزی»
جستجوی pichia pastoris در مقالات مجلات علمی
  • بهاره پاک باطن، حسن کرمانشاهی*، فرهید همت زاده، رضا مجیدزاده هروی، علی جوادمنش
    هدف

    فیتازها براساس اولین کربنی که در حلقه میواینوزیتول فسفات در فیتات دفسفریلاسیون شروع می شود به گروه های 3-فیتازها (E.C. 3.1.3.8) ، 6- فیتازها (E.C. 3.1.3.26) و 5- فیتازها (EC 3.1.3.72) طبقه بندی می شوند مخمرها با داشتن ویژگی های زیادی ازجمله دستکاری ژنتیکی آسان، بیان بالای پروتئین های برون سلولی و درون سلولی و توانایی انجام اصلاحات پس ازترجمه ای متناسب با سلول های یوکاریوتی، برای بیان پروتئین های خارجی مناسب هستند. مخمر متانول دوست پیکیا پاستوریس برای تولید پروتئین های نوترکیب در تراکم سلولی بالا و محیط کشت ارزان، توسعه یافته است. بنابراین بیان همزمان دو آنزیم دریک میزبان بیانی نوترکیب سودمند خواهد بود. هدف ازاین مطالعه ساخت وکتور نوترکیب حاوی ژن های فیتاز ایکولای از خانواده 6-فیتاز و فیتاز آسپرژیلوس نایجر از خانواده 3-فیتاز به منظور افزایش تجزیه فیتات و بیان همزمان آنها در مخمر پیکیا پاستوریس بود.

    روش

    توالی نوکلئوتیدی ژن های آنزیم فیتاز ایکولای ، (appA2) فیتاز آسپرژیلوس نایجر ، (phyA) لینکر 2a و سیگنال پپتید آلفا فاکتور از پایگاه داده NCBI دریافت گردید. در این پژوهش ژن های فیتاز ایکولای و آسپرژیلوس نایجر که بوسیله لینکر 2a بهم متصل شده بودند در پلاسمید PIC9K طراحی و برای سنتز به شرکت Genescript آمریکا فرستاده شد. پس از دریافت پلاسمید سنتز شده که حاوی ژن های مورد نظر بود این سازه ژنی در باکتری DH5a کلون شد و پس از برش با آنزیم SacI در مخمر پیکیا پاستوریس الکتروترنسفرم شد. تحریک بیان ژن با استفاده از متانول در غلظت نهایی نیم درصد در دمای 30 درجه سانتیگراد صورت گرفت. نمونه گیری هر24 ساعت انجام شد و میزان تولید پروتئین نوترکیب بااستفاده از الکتروفورز بررسی گردید.

    یافته ها

    نتایج حاصل از کلونی PCR نشان داد که وکتور مورد نظر با موفقیت در باکتری DH5a ترانسفرم شده است و نتایج حاصل از PCR نشان داد که پلاسمید با موفقیت وارد مخمر شده است. فیتازappA و فیتاز phyA با موفقیت در مخمر پیکیا پاستوریس بیان شد. وزن مولکولی فیتازهای نوترکیب تولید شده در حدود 45 و 80 کیلو دالتون به ترتیب برای فیتاز appA و فیتاز phyA تخمین زده شد. فعالیت آنزیم نوترکیب تولید شدهU/ml 160.97 بود.

    نتیجه گیری

    به منظور تولید مکمل آنزیم فیتاز نوترکیب، ژن های هدف دروکتور بیانی pPIC9k طراحی و سنتز شد و وکتور نوترکیب پس از تکثیر در باکتری اشرشیا کلیDH5α وارد ژنوم مخمر پیکیا پاستوریس به عنوان میزبان بیانی شد. این سازه ژنی برای انجام آزمایشات بعدی (آزمایشات مزرعه ای) استفاده خواهد شد.

    کلید واژگان: پیکیا پاستوریس, طیور, آنزیم فیتاز, پروتئین نوترکیب
    Bahareh Pakbaten, Hassan Kermanshahi *, Farhid Hemmatzadeh, Reza Majidzadeh Heravi, Ali Javadmanesh

    Phytases are classified as 3-phytases (E.C.3.1.3.8), 5-phytases (E.C. 3.1.3.72) and 6-phytases (E.C. 3.1.3.26) based on the position of the first phosphate residue removed from the myo-inositol ring of phytate. Yeasts are particularly suited to expression of foreign proteins for numerous features mean while some of them shows probiotic properties. Pichia pastoris, has been developed for the production of various recombinant proteins and growth into high cell densities in an inexpensive medium. Accordingly, Pichia pastoris is an appropriate secretory system for obtaining larger quantities of correct products, in compared to other host cells. The coexpression of digestive enzymes in a single recombinant cell system would thus be advantageous. The objective of this study is to determine whether combining fungal phytases (3-phytase) with bacterial phytase (6-phytase) was more effective than each phytase alone in degrading of plant phytate. we tested the new vector, aimed to clone and coexpress the phytase genes isolated from E. coli and aspergillus niger and transformed into Pichia pastoris. Evaluations were made for the biochemical properties of the active expressed phytase.

    Methods

    The nucleotide sequence of phyA and appA2, 2a peptide and alpha factor were obtained from NCBI database. A coexpression system for the extracellular production of phytase of Aspergillus Niger (3-phytase) and phytase of E. coli (6-phytase) will be established in Pichia pastoris yeast. Plasmid that used in this study was pPIC9k. The genes for each enzyme are fused in-frame with the “a-factor” secretion signal and linked by the 2A-peptide-encoding sequence. After receiving the synthetic plasmid with fragments, plasmid that contained phyA and appA2 was cloned in DH5@ and after that digested by SacI and electrotransfered into Pichia pastoris. Positive cells are resuspended at BMMY containing methanol as an inducer. To follow the induction, methanol was injected into the culture every 24 hours in order to reach a definitive concentration of 0.5 percent. The recombinant protein was analyzed using sds-page.

    Result

    The results showed that the recombinant phytase gene was transferred to Pichia pastoris and the results of PCR confirmed that. The molecular weight of the produced recombinant phytases was estimated to be around 45 and 80 kDa for appA and phyA, respectively. The recombinant protein has phytase activity equal to 160.97 U/mlConclusions;The designed phytase genes containing phyA and appA were successfully cloned in DH5a and the recombinant plasmid was transferred to Pichia pastoris for high expression. Recombinant yeast will be used for further experiments.

    Keywords: Phytase enzyme, Pichia pastoris, poultry, recombinant protein
  • الهام سلیمانی، قربانعلی نعمت زاده*، روحا کسری کرمانشاهی، سوسانا رودریگز کوتو

    لاکازها آنزیم هایی حاوی مس می باشند که اکسیداسیون ترکیبات آروماتیک و غیرآروماتیک را از طریق احیای مولکول آب به اکسیژن کاتالیز می کنند . همچنین به دلیل قابلیت اکسیداسیون طیف وسیعی از ترکیبات فنلی کاربرد وسیعی در صنعت دارند. در این مطالعه توالی نوکلئوتیدی ژن لاکاز بر اساس ترجیح کدونی میزبان مخمری Pichia pastoris GS115 بهینه شد، سپس توسط شرکت اینویتروژن سنتز و در حامل بیانی pPICZ alpha A همسانه سازی شد و تحت پیشبر AOX1 به پیکیا پاستوریس به روش الکتروپوریشن ترنسفرم و در ژنوم میزبان ادغام شد. به منظور تعیین شرایط بهینه بیشینه بیان آنزیم، در سطوح مختلفی از دما، غلظت مس و متانول القای بیان صورت گرفت و فعالیت آنزیم در هریک از سطوح مورد ارزیابی قرار گرفت. بیشینه ی بیان آنزیم در غلظت 0.4 میلی مولار مس و 0.8 درصد متانول و دمای 25 درجه سانتی گراد به دست آمد. بیشینه ی بیان ترشحی لاکاز در شرایط بهینه 9600 U/L به دست آمد. پس از بررسی کیفی و کمی آنزیم برخی خصوصیات بیوشیمیایی آنزیم تعیین شد. دما و pH بهینه ی لاکاز نوترکیب به ترتیب40  درجه سانتی گراد و 3 تعیین شد. بررسی پایداری دمایی و pH لاکاز نشان داد که این آنزیم پایداری بالایی در برابر حرارت داشته و قادر به فعالیت در طیف وسیعی از pH می باشد.  بررسی خصوصیات کینتیکی آنزیم با استفاده از سوبسترای ABTS، Km=0.089 mM تعیین شد. نتایج این تحقیق نشان داد که پیکیا پاستوریس می تواند کاندیدای مناسبی برای بیان لاکاز نوترکیب به منظور استفاده در صنایع متعدد جهت پاکسازی پساب، بیوسنسور و سایر کاربردها باشد.

    کلید واژگان: لاکاز, پیکیا پاستوریس, بیان هترولوگ, زیست پالایی, بهینه سازی
    Elham Soleimani, Ghorbanali Nematzadeh*, Rouha Kasra Kermanshahi, Susana Rodriguez Couto

    Laccase (EC 1.10.3.2) are multi-copper oxidase which catalyze the oxidation aromatic and non- aromatic compounds with electron reduction of molecular oxygen to water. Nucleotide sequence of laccase (accession number : ) was optimized according codon preference of Pichia pastoris. Gene was synthesized and cloned into pPICZalpha A. laccase under control of AOX1 promoter was transformed to P.pastoris by electroporation and integrated to P.pastoris genome. Methanol concentration, copper salts concentration and temperature were varied in order to enhance laccase expression in the heterologous system. Optimal fermentation condition for laccase production in shake flask cultivation using BMGY medium were obtained: presence of 0.4 mM Cu+2, culture temperature 25°C, 0.8% methanol added into culture every 24 h. the volumetric activity was achieved 9600 U/L after 12 day culture in fernbach flask. The biochemical properties of recombinant laccase and kinetic parameters were studied. The laccase activity was optimal at pH 4 and 40°C. Its Km value was 0.089 mM For ABTS [2, 2´azino-bis (3-ethylbenzthiazoline-6-sulphoric acid)]. The result of this study was showed Pichia pastoris can be useful tool for heterologous laccase expression in order to use in industrial application such as: waste water treatment, biosensor & etc.

    Keywords: laccase, Pichia pastoris, heterologous expression, bioremediation, optimization
  • محمد پرند، سید امید رعنایی سیادت، احد یامچی*
    لاکازها (EC 1.10.3.2) توانایی اکسیداسیون دامنه وسیعی از سوبستراهای فنولی و غیر فنولی را دارند. میزبان مخمری با توجه به مزیت هایی که در قدرت راه انداز، کارایی ترشح، رشد سریع و آسان و عدم سمیت غذایی نسبت به سایر میزبان های سلولی دارند، به طور قابل توجهی در تولید مورد استفاده قرار می گیرند. در این تحقیق ژن کد کننده آنزیم لاکاز که از باکتری باسیلوس سویه HR30 جداسازی شده بود با ترجیح کدونی برای مخمرPichia pastoris سنتز شده و سپس در پلاسمید بیانی مخصوص مخمر پیکیا پاستوریس کلون شده و از طریق روش الکتروپوریشن به داخل مخمر انتقال یافت. برای تائید کلونینگ از روش کلونی PCR و هضم آنزیمی استفاده شد و قطعه 1542 جفت بازی مشاهده شد. سپس ژن مورد نظر تحت شرایط دمایی و غلظت های متفاوت از سولفات مس بیان شد. نتایج نشان داد که میزان تولید پروتئین در غلظت های یک، یک و نیم و دو میلی مولار از سولفات مس (به عنوان کوفاکتور برای آنزیم) و درجه حرارت های 20، 25 و 30 درجه سانتی گراد محیط کشت متغیر بود. کاهش دمای محیط کشت تا مرز 20 درجه سانتی گراد و غلظت دو میلی مولار ازسولفات مس توانست باعث بهبود فرایند تاخوردگی مجدد و فعالیت آنزیم لاکاز شود.
    کلید واژگان: بیان خارج سلولی, پیکیا پاستوریس, سولفات مس, لاکاز, مخمر
    Parand M., Ranaei Siadat So, Yamchi A.*
    Laccase (EC 1. 10. 3. 2) can use to broad range oxidation of phenolic and non-phenolic substrate. Yeast host cell is highly acceptable for the production because of advantages in promoterstrength، secretion efficiency، or ease of growth to high cell density and non-toxicity than other host cell resources. The laccase gene from bacillus sp HR30 was synthesized with codon usage of pichia pastoris. Then، it was sub-cloned in expression vector (Ppink-α) and transferred in Pichia pastoris yeast host cell via electroporation method. For certification of cloning، the colony PCR and restriction enzyme digestion was done and the 1542 bp fragment was observed. Then، the laccase gene was expressed under different condition of temperature and copper sulphate concentration. The results showed that at these conditions، the enzyme activation on the syringaldazine substrate was variable. Also، reducing of temperature up to 20°C and 2 mM copper sulphate was caused improving of refolding and activity of enzyme.
    Keywords: Copper sulphate, Extracellular expression, Laccase, Pichia pastoris, Yeast
نکته
  • نتایج بر اساس تاریخ انتشار مرتب شده‌اند.
  • کلیدواژه مورد نظر شما تنها در فیلد کلیدواژگان مقالات جستجو شده‌است. به منظور حذف نتایج غیر مرتبط، جستجو تنها در مقالات مجلاتی انجام شده که با مجله ماخذ هم موضوع هستند.
  • در صورتی که می‌خواهید جستجو را در همه موضوعات و با شرایط دیگر تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مجلات مراجعه کنید.
درخواست پشتیبانی - گزارش اشکال