جستجوی مقالات مرتبط با کلیدواژه « abc » در نشریات گروه « زراعت »

تکرار جستجوی کلیدواژه « abc » در نشریات گروه « کشاورزی »

انتخاب همه

مکان یابی یک ژن ABC-Transporter مرتبط با بیماری اسکالد جو (Rhynchosporium secalis (Oud.) Davis) با استفاده از یک نشانگر CAPS

علی اعلمی، کلاس اولدچ، هوشنگ علیزاده، منصور امیدی، محمدرضا بی همتا، علی اکبر بوشهری، کری ویلزمور

فصلنامه علوم زراعی ایران، سال نهم شماره 2 (پیاپی 34، تابستان 1386)، ص 157

خانواده بزرگ پروتئین های ABC-Transporter به عنوان یک پل ارتباطی در غشاهای سلولی همه موجودات زنده یافت می شوند. این پروتئین ها مسئول تبادل مواد گوناگون از جمله متابولیت های دخیل در مکانیسم های دفاعی گیاهان می باشند. در این تحقیق، جهت مکان یابی یک ژن ABC-Transporter اختصاصی در برهمکنش سازگار و ناسازگار با قارچ R. secalis عامل بیماری اسکالد جو از SNP ها و نشانگر CAPS استفاده شد. یک قطعه kb2/2 حاصل از فراورده PCR با آغازگر های اختصاصی برای ژن مذکور در 10 والد جو توالی یابی شد و پس از همردیفی برای کشف SNPها مورد استفاده قرار گرفت. در میان SNPهای مشاهده شده، یک SNP با تفاوت در جایگاه برشی آنزیم NlaIII در والدین Chebec و Harrington مشاهده و برای تبدیل به نشانگر CAPS و مکان یابی استفاده شد. نتایج مکان یابی موقعیت این ژن را روی بازوی بزرگ کروموزوم شماره 3 جو تعیین کرد. همچنین نتیجه بررسی همولوژی در این ناحیه از کروموزوم نیز همچون مطالعات قبلی نشاندهنده وجود Synteny بالا برای کروموزوم شماره 3 جو با کروموزوم شماره 1 برنج بود.

کلید واژگان: جو, مکان یابی ژن, ABC, Transporter, SNP, CAPS, NlaIII, Synteny, اسکالد}

چکیده مشاهده متن زبان: فارسی

Mapping of an ABC-Transporter gene associated with barley scald disease (Rhynchosporium secalis (Oud.) Davis) - using a CAPS marker

Aalamia., C. Oldech, H. Alizadeh, M. Omidi, M. R. Bihamta, A. A. Boushehri, K. Willsmore

Iranian Journal of Crop Sciences, Volume:9 Issue: 2, 2007, P 157

ABC-Transporter proteins superfamily are found in all alive organisms as connection bridge in cellular membranes. These proteins are responsible for transportation of variant substrates such as metabolites that involved in plant defense mechanisms. In this study SNPs and CAPS markers were used for mapping of an ABC-Transporter which is specific for compatible and incompatible interaction against R. secalis fungus. A 2.2kb fragment derived from PCR product with specific primers for mentioned gene was sequenced in 10 barley parents. Among observed SNPs, one SNP showed different restriction enzymes sites in Chebec and Harrington parents and converted to CAPS marker. Results mapping revealed position of the gene on long arm of barley chromosome 3. Also, a homology evaluation for this region of chromosome was in accordance with previous studies about high synteny for barley chromosome 3 with rice chromosome 1.

Keywords: Barley, Gene Mapping, ABC, Transporter, SNP, CAPS, NlaIII, Synteny, Scald}

Abstract View Paper Original: Persian

نکته

نتایج بر اساس تاریخ انتشار مرتب شده‌اند.
کلیدواژه مورد نظر شما تنها در فیلد کلیدواژگان مقالات جستجو شده‌است. به منظور حذف نتایج غیر مرتبط، جستجو تنها در مقالات مجلاتی انجام شده که با مجله ماخذ هم موضوع هستند.
در صورتی که می‌خواهید جستجو را در همه موضوعات و با شرایط دیگر تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مجلات مراجعه کنید.

به جمع مشترکان مگیران بپیوندید!

جستجوی مقالات مرتبط با کلیدواژه « abc » در نشریات گروه « زراعت »