جستجوی مقالات مرتبط با کلیدواژه "16s-rdna" در نشریات گروه "گیاهپزشکی"
تکرار جستجوی کلیدواژه «16s-rdna» در نشریات گروه «کشاورزی»-
بیماری کپک خاکستری ناشی از Botrytis cinerea یکی از بیماری های مهم توت فرنگی است که باعث پوسیدگی میوه پیش و پس از برداشت محصول می شود. کنترل زیستی با استفاده از عوامل بیوکنترل یک روش ایمن و سالم برای کاهش خسارت این بیماری است. در این پژوهش با استفاده از روش های مبتنی بر کشت، در مجموع 268 جدایه باکتریایی و 136 جدایه قارچی از فیلوسفر گیاهان توت فرنگی گلخانه ای و فضای باز شهرستان جیرفت جداسازی و خالص سازی شد. اثر آنتاگونیستی جدایه ها در برابر بیمارگر B. cinerea به روش های کشت متقابل و بررسی هاله بازدارنده و اثر ترکیبات فرار در شرایط آزمایشگاه و همچنین خواص ضدقارچی باکتری های آنتاگونیست روی میوه توت فرنگی مورد بررسی قرار گرفت. شناسایی جدایه های باکتری و قارچی منتخب براساس واکنش زنجیره ای پلیمراز به ترتیب با تعیین توالی نوکلیوتیدی بخشی از ژن 16S-rDNA و ناحیه ITS-rDNA انجام گرفت. نتایج نشان داد که از بین جدایه های مورد بررسی جدایه های باکتریایی UJB1، UJB3، UJB4، UJB10، UJB5، UJB6، UJB7، UJB11، UJB2، UJB8 و UJB9 و جدایه قارچی UJF1300، UJF1301، UJF1302، UJF1303،UJF1304 ،UJF1305 اثر بازدارندگی موثری علیه B. cinereaداشتند و ترکیبات فرار آنها رشد پرگنه بیمارگر را کاهش داد. در ارزیابی اثر ضدقارچی جدایه های باکتری روی میوه توت فرنگی، جدایه های باکتریایی UJB8، UJB2، UJB11، UJB6، UJB5، UJB10، UJB4، UJB1 میزان شاخص بیماری ناشی از قارچ B. cinerea را به طور معنی داری نسبت به شاهد کاهش دادند. نتایج آنالیز داده های حاصل ازتعیین توالی نوکلیوتیدی نشان داد که جدایه های باکتریایی متعلق به جنس های Delftia (جدایه های UJB1، UJB3، UJB4، UJB10)، Bacillus (جدایه های UJB5، UJB6، UJB7، UJB11 و UJB2) و Stenotrophomonas (جدایه های UJB8 و UJB9) و جدایه های قارچی متعلق به گونه های Albifimbria verrucaria، Aspergillus terreus، Leptosphaerulina australis، Pilidium lythri، Pseudozyma flocculosa و Seimatosporium pistaciae می باشند.
کلید واژگان: آنتاگونیست, بیوکنترل, جیرفت, 16S-rDNA, ITS-rDNAGray mold, caused by Botrytis cinerea is one of the most important diseases in strawberry, causing pre– and postharvest fruit rot. One of the safe and healthy ways to reduce this disease is biocontrol and the use of biological control agents. In this study, using culture–based methods, 268 bacterial strains, and 136 fungal isolates, were isolated and purified from the phyllosphere of strawberry plants in the greenhouse and field in Jiroft city. The antagonistic effect of the isolates against the pathogen B. cinerea was investigated using dual culture and investigation of the inhibition zone, and the effect of volatile compounds under in vitro conditions, as well as the antifungal properties of the antagonistic bacteria on strawberry fruit. Identification of the selected bacterial and fungal strains was made by polymerase chain reaction, respectively, by determining the nucleotide sequence of a part of the 16S–rDNA gene and its region. The results showed that among the examined isolates, bacterial isolates UJB1, UJB3, UJB4, UJB10, UJB5, UJB6, UJB7, UJB11, UJB2, UJB8 and UJB9 and fungal isolates UJF1300, UJF1301, UJF1302, UJF1303, UJF1304, UJF1305 had an effective inhibitory effect against B. cinerea and their volatile compounds reduced pathogenic mycelium growth. In evaluating the antifungal impact of bacterial isolates on strawberry fruit, bacterial isolates UJB8, UJB2, UJB11, UJB6, UJB5, UJB10, UJB4, and UJB1 significantly increased the disease index caused by B. cinerea compared to They reduced the witness. According to morphological and molecular data, bacterial isolates belonging to the genera Delftia (isolates UJB1, UJB3, UJB4, UJB10), Bacillus (isolates UJB5, UJB6, UJB7, UJB11, and UJB2) and Stenotrophomonas (isolates UJB8 and UJB9) and fungal isolates belonging to Albifimbria verrucaria, Aspergillus terreus, Leptosphaerulina australis, Pilidium lythri, Pseudozyma flocculosa, and Seimatosporium pistaciae species.
Keywords: antagonist, biological control, Jiroft, ITS–rDNA, 16S–rDNA -
Bdellovibrio bacteriovorus is an obligate predator of other Gram-negative bacteria. It grows in the periplasm of the prey cell and finally lyses them, so it has high potentials to be used in biocontrol of plant pathogenic bacteria. The objective of the present study was to isolate and characterize Bdellovibrios bacteria from soil and water samples of Rafsanjan (Kerman province) in Iran. To do this, after sampling, two Bdellovibrios isolates (Sar and Pj) were isolated by using Escherichia coli strain K12 as prey on the two layers agar. The isolates were identified by phenotypic and 16S rDNA PCR amplification and sequencing. The sequencing and phylogenetic studies showed that the strains have more than 99% similarity to B. bacteriovorus. Then, the host range and specificity of the strain were evaluated on 9 different Gram negative bacterial species. The results showed that the strains have predatory effects only on E. coli as prey.Keywords: Predatory bacteria, Bdellovibrio bacteriovorus, prey range, biological control, 16S rDNA
-
Bdellovibrio bacteriovorus is an obligate predator of other Gram-negative bacteria. It grows in the periplasm of the prey cell and finally lyses them, so it has high potentials to be used in biocontrol of plant pathogenic bacteria. The objective of the present study was to isolate and characterize Bdellovibrios bacteria from soil and water samples of Rafsanjan (Kerman province) in Iran. To do this, after sampling, two Bdellovibrios isolates (Sar and Pj) were isolated by using Escherichia coli strain K12 as prey on the two layers agar. The isolates were identified by phenotypic and 16S rDNA PCR amplification and sequencing. The sequencing and phylogenetic studies showed that the strains have more than 99% similarity to B. bacteriovorus. Then, the host range and specificity of the strain were evaluated on 9 different Gram negative bacterial species. The results showed that the strains have predatory effects only on E. coli as prey.
Keywords: Predatory bacteria, Bdellovibrio bacteriovorus, prey range, biological control, 16S rDNA -
لکه برگی و پوسیدگی نرم باکتریایی یکی از بیماری های مهم اقتصادی است که ریشه، غده، برگ و ساقه تعدادی از گیاهان زینتی را تحت تاثیر قرار می دهد. این بیماری توسط طیف وسیعی از باکتری های پکتولیتیک ایجاد می شود. به منظور شناسایی عوامل لکه برگی باکتریایی گیاهان زینتی در استان اصفهان، تعداد 70 نمونه از برخی گیاهان زینتی با علائم لکه برگی و پوسیدگی نرم از گلخانه های مختلف استان جمع آوری شد. پس از جداسازی باکتری ها، بیماری زایی جدایه ها با مایه زنی روی گیاهان میزبان اثبات شد. شناسایی باکتری ها با انجام آزمون های متداول فنوتیپی و آنالیز ترادف SrDNA16 انجام شد. نتایج این آزمون ها نشان داد جدایه های بررسی شده متعلق به گونهPectobacterium carotovorum بودند. این اولین گزارش از شناسایی این باکتریاز گیاهان زینتی در استان اصفهان می باشد.
کلید واژگان: گونهPectobacterium carotovorum, S rDNA16, تعیین ترادفBacterial leaf spot and soft rot is one of the most economically important diseases that affect roots, tubers, leaves and stem of ornamental plants. The disease is caused by a wide range of pectolytic bacteria. To identify the agent of the bacterial leaf spot diseases of ornamental plants in Isfahan province, 70 samples of some ornamental plants showing soft rot and leaf spot symptoms from several various greenhouses were collected. After isolation of bacteria, pathogenicity of isolates was considered by inoculation of their origin host plants. Identification of bacteria was performed using morphological and biochemical tests and the sequence of its 16S rDNA. Results showed that the examined isolates belong to Pectobacterium carotovorum. To the best of our knowledge, this is the first report of a P. carotovorum on ornamental plants in Isfahan province.Keywords: Pectobacterium carotovorum, 16S rDNA, Sequencing
- نتایج بر اساس تاریخ انتشار مرتب شدهاند.
- کلیدواژه مورد نظر شما تنها در فیلد کلیدواژگان مقالات جستجو شدهاست. به منظور حذف نتایج غیر مرتبط، جستجو تنها در مقالات مجلاتی انجام شده که با مجله ماخذ هم موضوع هستند.
- در صورتی که میخواهید جستجو را در همه موضوعات و با شرایط دیگر تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مجلات مراجعه کنید.