به جمع مشترکان مگیران بپیوندید!

تنها با پرداخت 70 هزارتومان حق اشتراک سالانه به متن مقالات دسترسی داشته باشید و 100 مقاله را بدون هزینه دیگری دریافت کنید.

برای پرداخت حق اشتراک اگر عضو هستید وارد شوید در غیر این صورت حساب کاربری جدید ایجاد کنید

عضویت

جستجوی مقالات مرتبط با کلیدواژه « bgsmv » در نشریات گروه « گیاهپزشکی »

تکرار جستجوی کلیدواژه «bgsmv» در نشریات گروه «کشاورزی»
  • فریده فرح بخش، محمود معصومی، علیرضا افشاریفر، کرامت الله ایزدپناه، نرجس راه پیما سروستانی
    ویروس موزائیک جنوبی مرغ (Bermuda grass southern mosaic virus، BgSMV)، فراوان ترین ویروس مولد موزائیک در مرغ در نواحی گرمسیری جنوب ایران می باشد. به منظور تعیین تنوع ژنتیکی BgSMV، گیاهان مرغ با علائم موزائیک از جیرفت، بوشهر، برازجان، رامهرمز، اندیمشک، شوشتر، بهبهان و داراب جمع آوری و ناحیه 3 ژنوم آنها با استفاده از آغازگرهای اختصاصی این ویروس با روش RT-PCR تکثیر و همسانه سازی شد. ناحیه CP-UTR این جدایه ها به همراه تعدادی از ترادف های پوتی ویروس های غلات موجود در بانک ژن مقایسه و پس از انجام همردیف سازی چندگانه، مورد تجزیه و تحلیل فیلوژنتیکی قرار گرفت. جدایه های مورد مقایسه در درخت فیلوژنتیکی در 6 شاخه جداگانه قرار گرفتند که عبارت بودند از: BgSMV، ویروس موزائیک کوتولگی ذرت (Maize dwarf mosaic virus، MDMV)، ویروس موزائیک نیشکر (Sugarcane mosaic virus، SCMV)، ویروس موزائیک قیاق (Johnson grass mosaic virus، JGMV)، ویروس موزائیک سورگوم (Sorghum mosaic virus، SrMV) ودو ویروس موزائیک ایرانی قیاق (Iranian Johnson grass mosaic virus، IJMV) و موزائیک زآ (Zea mosaic virus، ZeMV) که در یک شاخه قرار گرفتند. در بین پوتی ویروس ها، BgSMV بیشترین تشابه را با MDMV داشت. اما در ناحیه 5 ژن پروتئین پوششی BgSMV، 90 نوکلئوتید (معادل 30 آمینو اسید) بیشتر از MDMV داشت و این مساله در تمام جدایه های BgSMV صادق بود. میانگین درصد تشابه نوکلئوتیدی ناحیه CP-UTR بین جدایه های BgSMV، 1/98 درصد به دست آمد که نشان دهنده تنوع ژنتیکی پایین این ویروس در این ناحیه از ژنوم است. به رغم وجود تشابه نوکلئوتیدی بالای BgSMV با MDMV، با توجه به تفاوت های اساسی از نظر دامنه میزبانی و سرولوژی بین دو ویروس و وجود یک قطعه 90 نوکلئوتیدی اضافی در ناحیه 5 ژن CP، BgSMV به عنوان گونه ای نزدیک به MDMV در جنس پوتی ویروس در نظر گرفته می شود.
    کلید واژگان: پوتی ویروس, آنالیز های فیلوژنی, ویروس موزائیک جنوبی مرغ, ویروس موزائیک کوتولگی ذرت, ناحیه CP, UTR}
    F. Farahbakhsh, M. Masumi*, A. Afsharifar, K. Izadpanah, N. Rahpeyma Sarvestani
    Bermuda grass southern mosaic virus (BgSMV) is a widespread potyvirus inducing mosaic on Bermuda grass in warm regions of southern Iran. In this study, various geographical isolates of the virus were compared phylogenetically. Bermuda grass samples showing mosaic symptom were collected from Jiroft, Bushehr, Borazjan, Ramhormoz, Andimeshk, Shushtar, Behbahan and Darab. Viral RNA was extracted and reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) was conducted using specific primers for amplification of the 3′ region (CP- UTR) of the viral genome. PCR- products were cloned and sequenced. The sequences of CP- UTR region of BgSMV isolates were compared with each other and with available sequences of cereal potyviruses in the GenBank. Phylogenetic analyses showed that all sequences were grouped into six clades of BgSMV, Maize dwarf mosaic virus (MDMV), Sugarcane mosaic virus (SCMV), Johnson grass mosaic virus (JGMV), Sorghum mosaic virus (SrMV), Iranian Johnson grass mosaic virus (IJMV) and Zea mosaic virus (ZeMV). IJMV and ZeMV were grouped in the same clade. Among potyviruses, BgSMV was close to MDMV. However it had an additional 90- nucleotide stretch in frame (30 amino acids) in the 5′ region of the coat protein compared with MDMV. This difference was consistent in all BgSMV isolates. The mean of the nucleotide similarity in CP- UTR region among BgSMV isolates was 98.1% which indicates low level of genetic diversity in intra- population of BgSMV. Despite the high nucleotide sequence similarity between BgSMV and MDMV, differences between the two viruses in host range and serology, and presence of additional 90 nt in the 5' region of CP gene, make BgSMV a distinct potyvirus species close to MDMV.
    Keywords: Potyviruses, Phylogenetic analysis, MDMV, BgSMV, CP, UTR}
  • عاطفه ذاکری، محمد معصومی، سعید نصر الله نژاد، طاهره قهرمانی، کرامت الله ایزدپناه
    دو ویروس موزائیک کوتولگی ذرت (Maize dwarf mosaic virus، MDMV) و موزائیک جنوبی مرغ (Bermuda grass southern mosaic virus، BgSMV) به رغم تفاوت مشخص نود نوکلئوتیدی در ژن پروتئین پوششی، از لحاظ سرولوژیکی و مولکولی شباهت زیادی به هم دارند. در این تحقیق رابطه دگرپادی این دو ویروس مورد بررسی قرار گرفت. این بررسی در قالب 5 تیمار در 5 تکرار (هر تکرار شامل یک گلدان با ده بوته) طراحی شد. تیمارها شامل مایه زنی مکانیکی هر یک از ویروس ها به گیاه پس از استقرار ویروس دیگر، مایه زنی توم و مایه زنی دو ویروس به طور جداگانه بودند. دو هفته بعد از مایه زنی، برای استخراج آر ان ای ویروس با استفاده از mRNA Capture Kit از تیمارها نمونه برداری شد. از آر ان ای ویروس به روش ترانویسی معکوس cDNA تهیه و با جفت آغازگرهای MD3F/MD1R و BgSMF90/ BgSMR90b در آزمون PCR تکثیر شد. نتایج آزمون PCR نشان داد که مایه زنی هر کدام از دو ویروس از تکثیر ویروس دیگر جلوگیری می کند. براساس این آزمون و اطلاعات بیولوژیکی و مولکولی قبلی می توان نتیجه گرفت که دو ویروس با هم رابطه دگرپادی دارند و بنابراین ممکن است به رغم تفاوت های بیولوژیکی و مولکولی، رابطه بسیار نزدیک با هم داشته باشند و یا سویه های یک ویروس محسوب شوند. در این بررسی رابطه دگرپادی ویروس موزائیک ایرانی قیاق (Iranian Johnson grass mosaic virus، IJMV) با دو ویروس BgSMV و MDMV به عنوان شاهد نیز مطالعه شد که بین آنها هیچ رابطه دگرپادی دیده نشد
    کلید واژگان: ویروس موزائیک کوتولگی ذرت, ویروس موزائیک جنوبی مرغ, ویروس موزائیک ایرانی قیاق, دگرپادی}
    Bermuda grass southern mosaic virus (BgSMV) and Maize dwarf mosaic virus (MDMV) despite a 90 nucleotide difference in coat protein (CP) gene are very similar in serological and molecular properties. In the present work, cross protection between BgSMV and MDMV was studied. The experiment consisted of five treatments in five replications (each replication consisting of one pot with 10 plants). The treatments consisted of mechanical inoculation of sorghum with each virus followed, after symptom appearance, by challenge inoculation with the other virus, simultaneous inoculation of both viruses, and single-virus inoculations. Two weeks after inoculations, plant samples were taken from treated plants and subjected to RT-PCR using mRNA Capture Kit (Roche) and specific primer pairs MD3F/MD1R and BgSMF90/ BgSMR90b. The results showed that prior infection of plants by either MDMV or BgSMV protects against super infection by the other virus. Based on these results and previous biological and molecular information, BgSMV and MDMV may be regarded as closely related viruses or the strains of the same virus despite their biological and molecular differences. Cross protection was also studied between each of these viruses and Iranian Johnson grass mosaic virus (IJMV) as control, and no cross protection was observed between IJMV and either MDMV or BgSMV.
    Keywords: MDMV, BgSMV, IJMV, Cross protection}
نکته
  • نتایج بر اساس تاریخ انتشار مرتب شده‌اند.
  • کلیدواژه مورد نظر شما تنها در فیلد کلیدواژگان مقالات جستجو شده‌است. به منظور حذف نتایج غیر مرتبط، جستجو تنها در مقالات مجلاتی انجام شده که با مجله ماخذ هم موضوع هستند.
  • در صورتی که می‌خواهید جستجو را در همه موضوعات و با شرایط دیگر تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مجلات مراجعه کنید.
درخواست پشتیبانی - گزارش اشکال