جستجوی مقالات مرتبط با کلیدواژه "تعیین جنسیت" در نشریات گروه "علوم دام"
تکرار جستجوی کلیدواژه «تعیین جنسیت» در نشریات گروه «کشاورزی»-
مطالعه حاضر به منظور بررسی امکان سنجی تعیین جنسیت جنین مرغ بومی ایران با استفاده از طیف سنجی رامان انجام شد. تعیین جنسیت جنین ها با استفاده از طیف سنجی رامان با طول موج nm785 در روز 5/3 انکوباسیون انجام گرفت. صحت سنجی این روش با استفاده از روش واکنش زنجیره ای پلیمراز مورد بررسی قرار گرفت. طیف های به دست آمده از طیف سنج رامان با استفاده از نرم افزار Origin رسم شده و مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفتند. شاخص های اصلی مورد استفاده جهت تجزیه و تحلیل طیف رامان، شدت اوج های رامانی و نسبت شدت اوج های غالب بودند. در واکنش زنجیره ای پلیمراز، یک قطعه به طول 461 جفت باز برای جنین های با جنسیت نر (ZZ) و دو قطعه با طول های 461 و 322 جفت باز برای جنین هایی با جنسیت ماده (ZW) تکثیر شد. نتایج طیف سنجی نشان داد شدت باندهای رامانی در جنسیت های مختلف متفاوت است، به طوری که شدت باندهای رامانی در جنس نر، بیشتر و در جنس ماده، کمتر بود. بنابراین، تغییرات شدت طیف های رامان را می توان ملاک تشخیص جنسیت قرار داد. همچنین، نتایج حاصل از رسم نمودار شمعی داده ها به صورت تجمعی نشان داد که مقادیر میانه و میانگین در هر دو نسبت برای جنسیت نر دارای مقدار بزرگتری در مقایسه با جنسیت ماده بود. با توجه به نتایج به دست آمده، این گونه استنباط می شود که طیف سنجی رامان می تواند به عنوان روشی مناسب جهت تعیین جنسیت جنین مرغ طی مراحل جوجه کشی مورد استفاده قرار گیرد و به دلیل کوتاه بودن زمان انجام آزمایش می تواند بهترین شرایط را برای استقرار در صنعت فراهم کرده و جنسیت را با دقت بالا مشخص نماید.کلید واژگان: تعیین جنسیت, جنین مرغ, طیف سنجی رامان, واکنش زنجیره ای پلیمرازIntroductionThe sex of chickens considerably impacts production performance and economic benefits in poultry farming. Male birds cannot lay eggs and usually have a lower ratio of meat to feed than broilers. Male chicks are typically killed immediately after hatching since they are redundant in the industry and male chicks will neither be suitable for egg production nor meat production. Day-old male chicks in the laying hen industry are usually culled immediately after hatching. As a result, this issue has caused moral concerns in societies. Efforts are underway to develop technology for automatically determining the sex of chick embryos, aimed at establishing a stable and efficient poultry farming system. In large commercial hatcheries, the sexing of newly born chicks is generally accomplished by three different methods according to new hatching lines' vent, color, or feathers. However, these methods are still time- and labor-consuming. If sex can be identified at an early embryonic stage or even before incubation, male eggs could be used as feed components. Moreover, fewer eggs would need to be incubated, which would reduce feed space requirements, CO2 emissions, and energy consumption, which are all economically beneficial to farmers and the environment. In recent decades, researchers have used various in ovo sexing strategies in chicken eggs before hatching or incubation. Some invasive and noninvasive studies that have been conducted for in ovo sexing of chicken eggs can be divided into five major categories: (i) molecular-based techniques, (ii) spectral-based techniques (Raman spectroscopy, fluorescent, 3D X-ray), (iii) acoustic-based techniques, (iv) morphology-based techniques, and (v) volatile organic compound (VOC)-based techniques. Commercially applicable methods must be noninvasive, rapid enough for real-time applications, economically feasible, and ethically acceptable. An alternative method, to prevent the removal of day-old chicks, is a non-invasive method to determine the sex of the egg in the early stages of hatching before the development of the nervous system. Recently, Raman spectroscopy was reported to determine the sex of eggs at the incubation stage. Raman spectroscopy is based on the Raman effect, whereby when incident light (wavelength 750–850 nm) excites molecules in a tissue, the molecules reflect light at a different wavelength. The reflected light's wavelength is characteristic of various chemical components and allows the detection of the atheromatous plaque chemical synthesis. Raman spectroscopy is a powerful tool expected to revolutionize chick sex determination because it can provide information about biological molecules. Thus, Raman spectroscopy is suitable for analyzing living organisms, leading to its widespread adoption across various biological and medical applications. Therefore, resonance Raman spectroscopies have found application in blood analysis, with some studies exploring its utility in chick sexing. For this purpose, the present study was carried out to investigate the feasibility of determining the sex of Iranian native chicken embryos using the Raman spectroscopy.Materials and methodsTo carry out this research, 100 fertilized eggs of Iranian native chickens were used. The sex of the embryos was determined using Raman spectroscopy with a wavelength of 785 nm during the fourth day of incubation. Validation of this method was investigated using the polymerase chain reaction (PCR) technique. Sequence alignment of CHD-Z and CHD-W allele sequences amplified by PCR technique. The amplified DNA fragments were single and double DNA bands in the size of 461 bp for the CHD-Z and 322 bp for the CHD-W genes. The PCR was carried out using a PCR master kit with specific primers (the forward primer: 5′- TATCGTCAGTTTCCTTTTCAGGT -3′, the reverse primer: 5′- CCTTTTATTGATCCATCAAGCCT -3′). Thermal cycling conditions for DNA amplification were: 1 cycle of initial denaturation at 94°C for 5 minutes; 35 cycles comprising 30s at 94°C for the denaturation, 30s at 59°C for annealing, 30s at 72°C for the elongation; and a final extension cycle at 72°C for 5 minutes. The PCR products were analyzed by electrophoresis on 2.5% agarose gel against a DNA Ladder 100bp, and visualized using the safe staining on UV transilluminator. The data obtained from the Raman spectrometer was analyzed using the Origin software. The main indices used to study the data were the intensity of the Raman peaks and the ratio of the dominant peak intensity. Additionally, principal component analysis (PCA) was employed to identify any patterns in the data. To calculate PCA1 and PC2, the ratios of I769/I838 and I1141/I1251 peaks were considered, respectively. PCA analysis can choose features that have a greater impact on the final result, depending on the data and the scope of their changes.Results and discussionThe result of PCR showed that one fragment with a length of 461 bp was amplified for male embryos (ZZ) and two fragments with lengths of 461 and 322 bp were amplified for female embryos (ZW(. The study found that there are differences in the intensity of Raman bands between genders. Males have higher intensity while females have lower intensity. Therefore, changes in Raman spectra intensity can be used to identify gender. Additionally, the candlestick chart of the data showed that median and average values for males were larger than for females. Furthermore, the results obtained from PCA analysis showed that the variance percentages for PC1 and PC2 were 53.69% and 46.31%, respectively. PC2 is more reliable as it has less deviation.ConclusionsBased on the results obtained from the study, it can be concluded that Raman spectroscopy is a reliable method for determining the gender of chicken embryos during incubation. This test is quick, accurate, and can be easily incorporated into the industry to determine the gender of embryos without resorting to the practice of killing day-old chicks. Not only is this method more ethical, but it also offers a high level of accuracy, making it an attractive alternative for the industry. In general, these results demonstrate the potential application of hematological traits in developing an automatic in ovo embryo sexing method through spectroscopic analysis.Keywords: Sex Determination, Chicken Embryo, Raman Spectroscopy, Polymerase Chain Reaction
-
مقدمه و هدف
امروزه، در پرورش حیوانات اهلی از جمله بز و گوسفند، دستیابی به روشی دقیق، آسان و مقرون به صرفه، پیش انتخاب جنسیت جنین، دارای اهمیت اقتصادی خاصی می باشد. اخیرا، DNAی آزاد جنینی شناور در پلاسمای خون، بعنوان کاندیدای مناسبی برای روش تعیین جنسیت غیر تهاجمی در دام ها و گونه های حیات وحش در خطر انقراض، معرفی شده است. بدین منظور، هدف از پژوهش حاضر، تعیین جنسیت جنین بز به کمک DNAی آزاد جنینی شناور در پلاسمای خون بزهای آبستن بود.
مواد و روش ها:
در این راستا، در مجموع، تعداد 21 حیوان آزمایشی شامل 17 بز ماده که دوره ی آبستنی بعد شش هفتگی را تجربه می کردند، 2 بز غیرآبستن و 2 بز نر (کنترل منفی) انتخاب شدند. در ادامه تحقیق، بزهای ماده با استفاده از روش سیدرگذاری در واژن، همزمان سازی فحلی انجام و سپس در معرض جفت گیری طبیعی قرار گرفتند. عدم بازگشت به فحلی مجدد به عنوان شاخص موفقیت در آبستنی تلقی شد. همچنین در ماه های آخر از روش سونوگرافی برای تایید ابستنی استفاده شد. متعاقبا، پس از جداسازی پلاسمای خون بز ماده، استخراج cffDNA با استفاده از دستورالعمل های آزمایشی متداول موجود صورت گرفت. آغازگرهای این پژوهش بر اساس ژن آمیلوژنین، مستقر در کروموزوم X و Y، طراحی شد. واکنش زنجیره ای پلی مراز با استفاده از روش های استاندارد موجود بهینه سازی شد.
یافته ها:
نتایج مولکولی حاصله، وجود دو باند در جنین نر (باند ژن AMELX با اندازه ی bp 171 و باند ژن AMELY با اندازه ی bp 111) و یک باند در جنین ماده (باند ژن AMELX با اندازه ی bp 171) را نشان داد. همچنین بزهای آبستن در اواخر دوره ی آبستنی غلظت DNA جنینی بالاتری را نسبت به دوره های قبلی نشان دادند.
نتیجه گیری:
با مقایسه ی نتایج تعیین جنسیت مولکولی پیش از تولد جنین های تحت آزمایش، با نتایج عملی پس از تولد، دقت تعیین جنسیت با استفاده از ژن آمیلوژنین، حساسیت، ویژگی و صحت، 0/83، 0/93 و 0/93 به دست آمد. شاید با کاربری تکنیک حاضر، بتوان در بررسی های مدیریتی تخمین بز جایگزین در گله (سیستم پرورش داشتی) و یا کنترل فروش بزهای آبستن مازاد، یا پیش بینی تعداد بزهای نر در زایش آتی (سیستم پرواربندی) استفاده کرد.
کلید واژگان: بز, تعیین جنسیت, آمیلوژنین و cffDNAIntroduction and ObjectiveTo date, sex determination technique in domestic animal has economic benefits. Recently, circulating free DNA (cfDNA) highlighted as suitable candidate for non-invasive sex determination in livestock and endangered wild life animals. Based on this motivation, the objective of this report was the potential usefulness of free fetal DNA in maternal blood for prenatal fetal gender determination in pregnant goats.
Material and MethodsIn this respect, a total of 21 animals, including 17 pregnant females with a gestation period of six weeks, unborn goats and 2 males (negative controls) were selected. During the running experiment, estrous synchronization was performed by intravaginal CIDR. The animals not returned to estrus was considered as an indicator of success in pregnancy. Also in the last months, ultrasound method was used to confirm pregnancy. In the next phase, cffDNA was extracted from the blood plasma of female goats using the available common experimental protocol. The primers in this experiment were designed based on AME gene located on X and Y chromosomes. The polymerase chain reaction was optimized based on available standard methods.
ResultsThe observation addressed existence of two fragment in the male embryo (171 bp AMELX gene band and 111 bp AMELY gene band) and one fragment in the female embryo (171 bp AMELX gene band). Here, most of findings was in line of similar pervious literatures and sex determination based on AME gene in case of sensitivity, specificity and accuracy indices indicated 0.83, 0.93 and 0.93 respectively.
ConclusionOn this basis, the results opened a new horizon of the potential usefulness of free fetal DNA in maternal blood for prenatal fetal gender determination in pregnant goats.
Keywords: AMEL, cfDNA, Goat, Sex determination also in the last months, ultrasound method was used to confirm pregnancy -
هدف از این تحقیق استفاده از پر به عنوان روشی ساده، سریع، کم هزینه، بدون خطر و ایمن و مطمئن برای تعیین جنسیت قناری در اوایل تولد، برای کمک به برنامه های اصلاح نژادی و پرورش این پرنده است. شکل ظاهری جنس نر و ماده بسیاری از پرندگان از جمله قناری تا حدودی همانند هم بوده و تشخیص جنسیت آن ها بسیار دشوار است. با استفاده از این روش مولکولی بر پایه اختلاف طول ژن Chromo-helicase-DNA (CHD) در کروموزوم های جنسی Z و W و با به کارگیری روش PCR می توان در بدو تولد جنسیت پرنده را تشخیص داد. در این بررسی از خون و پر140 قطعه قناری از ده نژاد مختلف نمونه گیری و استخراج DNA انجام شد. لازم به یادآوری است در آغاز پنج جفت آغازگر برای انجام PCR طراحی و درنهایت یک جفت آغازگر اختصاصی بر پایه دقت تشخیص جنسیت تایید و استفاده شد. نتایج نشان دهنده افزونش قطعه DNAبه طول 252 جفت باز در جنس نر (ZZ) و دو قطعه به طول های 252 و 309 جفت باز (تفاوت 57 جفت بازی) در جنس ماده (ZW) بود. توالی یابی DNA این دو قطعه انجام شد و برای نخستین بار توالی این دو قطعه از ژن CHD در گونه قناری به نام های CHDZ-1 و CHDW-1 با شماره های شناسایی MG679825. 1 و MG679826. 1 در سایت NCBI ثبت شد. با توجه به نتایج، می توان از این روش، که برای نخستین بار با استفاده از توالیDNA ژن CHD قناری به دست آمد به عنوان روشی کاربردی و مطمئن برای تعیین جنسیت قناری استفاده کرد.کلید واژگان: تعیین جنسیت, روش مولکولی, ژنCHD, قناری, PCRThe aim of this research was to utilize a simple, rapid, cheap and safe method for sex determination of newly born canaries through feather to help accurately breeding this bird. The external morphology of males and females of many birds such as canary are fairly similar to each other, Therefore, determining their sexes is very difficult. The different length of CHD (chromo-helicase-DNA-binding) gene in Z and W chromosomes can recignized by using molecular technique based and PCR method, for the sex determination of young birds. In this study, blood and feathers samples of 140 canaries from 10 different breeds were used and their DNA were extracted. It should be mentioned that for PCR, at first 5 primers designed and finally 1 specific primer were confirmed and used. The results showed that the amplification of a fragment with the length of 252 bp for males (ZZ) and two fragments with the lengths of 252 and 309 bp for female (ZW). The bands had a length difference of 57 bp. The DNA sequencing of these two fragments was done for the first time, the sequence of these two fragments of the CHD gene in canary species was submitted and accepted in the NCBI site under the names of CHDZ-1 and CHDW-1 with the accession numbers of MG679825.1 and MG679826.1.Keywords: Canary, CHD gene, molecular technique, PCR, sex determination
-
دستیابی به روش دقیق، آسان و اقتصادی پیش انتخاب جنسیت جنین در صنعت گاو شیرده دارای اهمیت خاصی میباشد. اخیرا DNA با منشا جنینی شناور در پلاسما و سرم مادر آبستن سوبسترای خوبی برای تعیین جنسیت جنین در اوایل دوره آبستنی پیشنهاد شدهاست. بدین منظور، تعداد 16 گاو هلشتاین با دوره آبستنی بعد هشت هفتگی، 4 گاو هلشتاین غیرآبستن و دو گاو نر(کنترل منفی) انتخاب و پلاسمای آنها برای استخراج ccfDNA تفکیک گردید. آغازگرهای این مطالعه بر اساس ژن DEAD box protein مستقر در هر دو کروموزوم X و Y طراحی و سنتز گردید. واکنش زنجیره پلی مراز با استفاده از روش های استاندارد موجود بهینه سازی شد. نتایج الگوهای الکتروفورزی محصولات حاصل از تکثیر بر روی ژل متافور آگارز شش درصد وجود دو باند در جنین نر و یک باند در جنین ماده را نشان داد. ردیابی جنسیت جنین های تحت آزمایش پس از تولد، مطابقت نتایج مولکولی با جنسیت گوساله ها پیش از تولد را تایید کرد. شاید به توان از این روش در بررسی های مدیریتی تخمین تلیسه جایگزین در گله و یا کنترل فروش گاوهای هلشتاین آبستن مازاد استفاده کرد.کلید واژگان: تعیین جنسیت, گاو هلشتاین, ژنDEAD Box ProteinDiscovery of accurate, easy and economic embryo sex determination in the dairy cattle industry assumed highly particular importance. CffDNA is novel potential material to determine the sex of the fetus in early gestation period has not imposed negative effect on embryo health. In this regard, in overall, 16 Holstein cows experiencing eight weeks of gestation and 4 non-pregnant Holstein cows, two bulls (negative control) were chosen as candidates for this present experiment and subsequently that plasma was separated to extract ccfDNA. Qiagene commercial kit was used to extract. DEAD box protein gene-based primers for this study based on both chromosomes X and Y and past articles were selected and were synthesized reported. Polymerase reaction and the required conditions were optimized using proposed standard. The results of electrophoresis PCR patterns male fetuss two bands and one band of female fetuses showed. Monitoring of birth of each gender embryos under the test after the birth of calves showed compelet match the molecular results re-confirmedKeywords: Sex determination, Holstein cows, DEAD Box Protein gene
- نتایج بر اساس تاریخ انتشار مرتب شدهاند.
- کلیدواژه مورد نظر شما تنها در فیلد کلیدواژگان مقالات جستجو شدهاست. به منظور حذف نتایج غیر مرتبط، جستجو تنها در مقالات مجلاتی انجام شده که با مجله ماخذ هم موضوع هستند.
- در صورتی که میخواهید جستجو را در همه موضوعات و با شرایط دیگر تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مجلات مراجعه کنید.