جستجوی مقالات مرتبط با کلیدواژه "gdf9" در نشریات گروه "علوم دام"
تکرار جستجوی کلیدواژه «gdf9» در نشریات گروه «کشاورزی»-
The main purpose of this study was to assess the presence of the previously reported single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the sheep growth differentiation factor 9 (GDF9) and bone morphogenetic protein 15 (BMP15) genes and their association with litter size at lambing in Iran-Black sheep breed. Blood samples were taken from 120 Iran-Black ewes. DNA extraction was conducted using a modified salting-out method. DNA fragments with sizes of 462bp and 141bp for the GDF9 and BMP15 genes were amplified using PCR with specific primers, respectively. The PCR-RFLP approach was adopted for detecting the genotypes. The results indicated that the SNP in the exon 2 of BMP15 is a monomorphic locus in Iran-Black sheep. However, the substitution of G to A nucleotide was determined in the GDF9 locus. Digestion of the 462bp PCR product from exon 1 of theGDF9 using the HhaI restriction enzyme produced fragments of 52, 156, and 254bp. However, DNA fragments containing the A nucleotide yielded only two fragments (52 and 410bp). The heterozygous animals for this mutation in GDF9 locus had fragments of all four sizes (52, 156, 254, and 410bp). The frequency (0.75) of the wild type allele (+) in GDF9 locus was higher than the frequency (0.25) of mutant allele (G). The observed frequencies for the GG, G+ and ++ genotypes were 0.05, 0.40 and 0.55, respectively. The association results indicated that the mutation of GDF9 gene has a substantial impact on lambing rate and the Iran-Black ewes with the GG and G+ genotypes had higher lambing rate than those with the ++ genotype. Thus, a gene assisted selection program to improve lambing rate in this breed can be designed based on the GDF9 gene mutation.
Key words: BMP15, GDF9, Litter Size, Iran-Black SheepKeywords: BMP15, GDF9, Iran-Black sheep, lambing rate -
به منظور بررسی ارتباط جایگاه های ژن کاندیدا GDF9 با صفات کیفی و کمی اسپرم در گاوهای نر هلشتاین ایران، از تعداد 108 نمونه خون و اسپرم گاوهای نر موجود در مرکز تلقیح مصنوعی که بین سال های 1395-1368 متولد شده بودند، استفاده شد. برای تعیین SNP جایگاه های A625T و A489T با روش PCR- RFLP به ترتیب از آنزیم های DraI و NsiI استفاده شد. در جایگاه A625T دو الل A با طول قطعات 351 و 25 جفت باز و الل T با طول 376 جفت باز و در جایگاه A489T دو الل A با طول قطعات 184 و 24 جفت باز و الل T با طول 208 جفت باز به دست آمد. بررسی نتایج فراوانی نشان داد که در هر دو جایگاه الل T و ژنوتیپ TT گاوهای نر هلشتاین ایران فراوان تر بود. بررسی نتایج تجزیه واریانس نشان داد که اثر هر دو جایگاه بر کلیه صفات کیفیت اسپرم در گاوهای نر هلشتاین ایران معنی دار بود. مقایسات بین میانگین ژنوتیپ ها نشان داد که در هر دو جایگاه گاوهای با ژنوتیپAT به طور معنی داری در صفات حجم انزال، جمعیت اسپرم، تعداد کل اسپرم و تعداد دز اسپرم تولیدی نسبت به بقیه ژنوتیپ ها دارای مقادیر بالاتری هستند. در صفات جنبندگی بعد از انزال و جنبندگی بعداز یخ گشایی ژنوتیپ TT دارای مقادیر بالاتر معنی دار را نشان داد. نتایج نشان داد که می توان از این جایگاه ی نشانگری در انتخاب ژنومی سود برد.
کلید واژگان: GDF9, پلی مورفیسم, کیفیت اسپرم, گاوهای نر هلشتاین ایرانThe use of artificial insemination in dairy cattle industry may improve the results of selection for production traits. This study attempts to evaluated effect of GDF9A625T and GDF9A489T candidate gene polymorphism on the sperm quality and quantity traits in Iranian bulls. A total of 108 samples of blood and semen was collected of A. I. bulls were born between 1989-2016 years. The GDF9A625T and GDF9A489T SNPs was determined by PCR- RFLP with DraI and NsiI enzymes, respectively. In A625T site, A (351 and 25 bp) and T (376 bp) alleles and in A489T site, A (184 and 24 bp) and T (208bp) alleles was obtained and also three AA, AT and TT genotypes in two marker sites were observed. The frequency results of GDF9A625T site showed that the T allele relative to the A allele was more frequent in Iranian Holstein bulls (0.6343 vs 0.3657) and 44.44, 37.98 and 17.95 percent of bulls had TT, AT and AA genotypes, respectively. In GDF9A625T site, the T allele frequency was more than A allele (0.602 vs 0.398) and 40.82, 38.78 and 20.14 percent of bulls had TT, AT and AA genotypes, respectively. Analysis of variance revealed that the effects of both loci were significant effect on sperm quality in Iranian Holstein bulls. The result of means comparison between genotypes in two marker sites showed that bulls with AT genotype significantly high value in quantitative trait and AA genotype was significantly higher in qualitative trait. Results of this research showed that these marker sites can be beneficial in genomic selection.
Keywords: Gdf9, Polymorphism, Sperm Quality, Iranian Holstein Bulls -
این تحقیق به منظور بررسی چند شکلی آللی ژن های BMP15 (واریانت FecxG و FecxB )، GDF9 (وایانت G8 و G1) و BMPR- IB (FecB) در آمیخته های شال و رومانف انجام شد. برای این منظور 79 نمونه خون از گله موجود در سطح شهرستان گنبد کاووس جمع آوری و استخراج DNA به روش بهینه یافته نمکی انجام شد. با استفاده از پرایمرهای اختصاصی قطعات 141 و153 جفت بازی از اگزون 2 ژن BMP15 به ترتیب برای شناسایی جهش های FecXG و FecXB قطعات 462 و 139 جفت بازی به ترتیب از اگزون های 1 و 2 ژن GDF9 برای شناسایی واریانت های G1 و G8 و یک قطعه 190 جفت بازی از ژن BMPR-IB برای شناسایی جهش FecB با استفاده از واکنش زنجیره ای پلیمراز تکثیر شدند. نتایج حاصل از هضم محصولات PCR وجود جهش درجایگاه BMP15،BMPR-IB و اگزون 2 ژن GDF9 را تایید نکرد. در حالی که در اگزون 1 جایگاه GDF9 چندشکلی مشاهده شد، و فراوانی ژنوتیپ هتروزایگوت در این جمعیت به مقدار 11/0 برآورد شد.کلید واژگان: گوسفند آمیخته شال و رومانف, GDF9, BMP15, BMPR, IB, دو قلوزاییThis study was carried out to identify polymorphisms of BMP15, GDF9 and BMPRIB genes in cross- bred of Romanov×shal sheep. For this reason 79 blood samples were collected from a flock in Gonbad kavous city in Golestan province. DNA was extracted using modified salting out method. Polymerase chain reaction was done by specific primers for amplification of two fragments with 141and 153 bp from exon 2 of BMP15, one fragment with 190 bp from BMPR-IB gene and two fragment with 462 bp, 139bp from exon 1and 2 of GDF9 genes, respectively. The results obtained from digested PCR products did not confirm the existence of mutation in BMp15, BMPR-1B and in exon 2 of GDF9 marker site. While, polymorphism was observed in exon 1 of GDF9 marker site and the heterozygotes were estimated as 0.11 in this population.Keywords: BMP15, BMPR, IB, Cross, bred, GDF9, Litter size, Romanov ×shall sheep
-
در سال های اخیر جهش هایی با اثرات عمده روی نرخ تخمک ریزی در دو جایگاه ژنی مربوط به لیگاند های TGFβ و نیز گیرنده های مربوط به TGFβ شناسایی شده است. این مطالعه برای شناسایی چند شکلی های مربوط به لیگاندهای BMP15 (واریانت B4) و GDF9 (واریانتG1) در گوسفند دالاق انجام شد. 100 نمونه خون از دو گله در سطح شهرستان گنبد کاووس جمع آوری شد و استخراج DNA به روش بهینه یافته نمکی انجام گرفت. با استفاده از دو جفت آغازگر اختصاصی قطعات 153 و 462 جفت بازی از اگزون 2 ژنBMP15 و نیز اگزون 1 ژن GDF9 توسط واکنش های زنجیره ای پلیمراز تکثیر انجام گرفت. هضم محصولاتPCR به ترتیب با استفاده از آنزیم های برشی DdeI و HhaI انجام شد. نتایج حاصل از هضم محصولات PCR وجود جهش در جایگاه B4 را تایید نکرد در حالیکه در جایگاه G1 چند شکلی مشاهده شد. فراوانی ژنوتیپ هتروزایگوت در جمعیت مورد مطالعه برابر با 15% برآورد شد.
کلید واژگان: گوسفند دالاق, GDF9, BMP15, دوقلوزاییRecently, mutations with major influence on ovulation rate and litter size were identified in TGFβ superfamily ligands and receptors. This study was conducted to identify polymorphisms in GDF9 and BMP15 genes in Dalagh sheep breed. One hundred mature ewes from two flocks in Golestan province were genotyped for the GDF9 (G1) and BMP15 (B4) variants. Two fragments of 462bp and 153bp of GDF9 and BMP15 genes were amplified by PCR-RFLP method. PCR product was digested using HhaI and DdeI endonuclease restriction enzymes. The results of the digested PCR products, did not confirm mutation at position B4 but Polymorphism was observed at G1position. The heterozygote genotype frequency in the population was estimated at 15%.Keywords: Dalagh sheep, GDF9, BMP15, Litter size
- نتایج بر اساس تاریخ انتشار مرتب شدهاند.
- کلیدواژه مورد نظر شما تنها در فیلد کلیدواژگان مقالات جستجو شدهاست. به منظور حذف نتایج غیر مرتبط، جستجو تنها در مقالات مجلاتی انجام شده که با مجله ماخذ هم موضوع هستند.
- در صورتی که میخواهید جستجو را در همه موضوعات و با شرایط دیگر تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مجلات مراجعه کنید.