جستجوی مقالات مرتبط با کلیدواژه "مقاومت به متی سیلین" در نشریات گروه "پزشکی"
-
زمینه و اهداف
استافیلوکوکوس اورئوس مقاوم به متی سیلین (MRSA) باعث عفونت استاف، تولید سموم و فاکتورهای بیماریزای متعدد و مقاومت آنتی بیوتیکی می شود. بنابراین، این مطالعه با هدف شناسایی MRSA و الگوهای مقاوم به آنتی بیوتیک آن و ارزیابی ژن های سمی در جدایه های استافیلوکوکوس اورئوس از بغداد، عراق انجام شد.
مواد و روش کاردویست و بیست نمونه باکتری از منابع بالینی مختلف در عراق در سال های 2022-2023 جمع آوری شد. تشخیص با استفاده از کشت سنتی، بررسی های میکروسکوپی و تشخیص مولکولی با استفاده از ژن 16srRNA و ژن mecA که برای تشخیص مقاومت متی سیلین استفاده می شود، انجام شد. علاوه بر این، الگوهای مقاومت آنتی بیوتیکی با استفاده از VITEK-2 شناسایی شد. همچنین ژن های سموم نیز با تعیین توالی تعیین شدند.
یافته ها50 ایزوله به عنوان استافیلوکوکوس اورئوس شناسایی شد و سویه ها مقاومت بالایی به بنزیل پنی سیلین، اریترومایسین، اگزاسیلین و کلیندامایسین نشان دادند. PCR شیوع ژن mecA را در ایزوله های استافیلوکوکوس اورئوس مقاوم به متی سیلین به میزان 100% نشان داد، در حالی که ژن های سمی موجود در استافیلوکوکوس اورئوس ژن LukD/E 50 (100%)، ژن eta 50 (100%) و ژن etd بودند. 47 (94%)، ژن LukS/F 34 (68%) و ژن tst 21 (42%). آزمایش همه جدایه ها برای ژن etb منفی بود. نتایج تجزیه و تحلیل توالی ژن های مورد مطالعه نشان داد که هیچ جهش ژنتیکی وجود ندارد. آنها 100٪ به جز ژن eta یکسان بودند و نتایج نشان دهنده سه جهش ژنتیکی بود.
نتیجه گیریتمام جدایه های استافیلوکوکوس اورئوس دارای ژن mecA برای مقاومت به متی سیلین بودند و استافیلوکوکوس اورئوس دارای ژن های سمی بود. تجزیه و تحلیل توالی ژن eta وجود جهش های مختلف از جمله جهش های خاموش را نشان داد.
کلید واژگان: مقاومت آنتی بیوتیکی, توالی یابی DNA, مقاومت به متی سیلین, استافیلوکوکوس اورئوس, ژن های توکسینBackground and AimMethicillin Resistance Staphylococcus aureus (MRSA) causes staph infections, produces numerous toxins and virulence factors, and displays antibiotic resistance. Therefore, this study aimed to detect MRSA and its antibiotic-resistant patterns and evaluate the toxins genes in S. aureus isolates from Baghdad, Iraq.
Materials and MethodsTwo hundred twenty bacterial samples were collected from different clinical sources in Iraq, 2022-2023. The diagnosis was made using traditional culture, microscopic examinations, and molecular diagnosis using the 16srRNA gene and mecA gene used for Methicillin Resistance detection. In addition, Antibiotic resistance patterns were detected using VITEK-2. Also, the toxins genes were determined by sequencing.
ResultsFifty isolates were identified as S. aureus, and the strains showed high resistance to Benzylpenicillin, Erythromycin, Oxacillin, and Clindamycin. PCR showed a prevalence of the mecA gene in methicillin resistance S. aureus isolates by 100%, while toxin genes that were present in S. aureus were LukD/E gene 50(100%), eta gene 50(100%), etd gene 47(94%), LukS/F gene 34(68%) and tst gene 21(42%). All isolates tested negative for the etb gene. The results of the sequencing analysis of the studied genes showed that there were no genetic mutations. They were 100% identical except for the eta gene, and the results indicated three genetic mutations.
ConclusionAll S. aureus isolates had the mecA gene for methicillin resistance, and S. aureus possessed toxin genes. The sequencing analysis of the eta gene indicated the presence of various mutations, including the silent mutations.
Keywords: Antibiotic resistance, DNA Sequencing, methicillin resistance, Staphylococcus aureus, Toxin genes -
سابقه و هدف
استافیلوکوکوس اپیدرمیدیس یک باکتری فرصت طلب بیماری زا است که قادر به تولید بیوفیلم بوده و اغلب با عفونتهای بیمارستانی همراه است. هدف از این مطالعه، بررسی تشکیل بیوفیلم و تعیین الگوی مقاومت آنتی بیوتیکی در میان سویه های استافیلوکوکوس اپیدرمیدیس مقاوم به متی سیلین جدا شده از بیماران در شهر اصفهان است.
روش کاردر این مطالعه در طی سالهای 1393 و 1394 ،در مجموع 139 جدایه مشکوک به استافیلوکوکوس اپیدرمیدیس از نمونه های بالینی بیماران در یک بیمارستان مرجع در شهر اصفهان جمع آوری گردید. تمامی جدایه ها با استفاده از آزمونهای معمول بیوشیمیایی و آزمون PCR با استفاده از پرایمرهای اختصاصی مورد شناسایی قرار گرفتند. مقاومت سویه ها نسبت به آنتی بیوتیک سفوکسی تین به روش انتشار دیسک و بر اساس دستورالعمل CLSI تعیین گردید و الگوی مقاومت آنتی بیوتیکی سویه های استافیلوکوکوس اپیدرمیدیس مقاوم به متی سیلین نسبت به 10 آنتی بیوتیک مشخص شد. به منظور بررسی توانایی تشکیل بیوفیلم در میان سویه های مقاوم به متی سیلین از آزمونهای کیفی ژلوز قرمز کنگو و کمی میکروتیتر پلیت استفاده گردید.
یافته هابا استفاده از آزمونهای بیوشیمیایی و PCR ،107 سویه استافلوکوکوس اپیدرمیدیس در میان نمونه ها مورد شناسایی و تایید قرار گرفتند. بر اساس نتایج حاصل از آزمون انتشار دیسک نیز 52 درصد درصد سویه ها مقاوم به متی سیلین بودند و بیشترین میزان مقاومت نیز در میان سویه ها نسبت به آنتی بیوتیک اریترومایسین مشاهده گردید. همچنین، تمامی سویه ها نسبت به آنتی بیوتیکهای ونکومایسین، لینزوالید، کینوپریستین-دالفوپریستین و کلرامفنیکل حساسیت نشان دادند. در آزمون قرمز کنگو، 41 درصد سویه ها واجد کلنیهای مشکی و اسالیم مثبت بودند و در آزمون میکروتیتر پلیت نیز 50 درصد سویه ها بیوفیلم قوی تشکیل دادند.
نتیجه گیرینتایج این مطالعه نشان دهنده شیوع نسبتا بالای جدایه های استافیلوکوکوس اپیدرمیدیس مقاوم به متی سیلین مولد بیوفیلم در بیمارستان مورد مطالعه در اصفهان است. این سویه ها که از مقاومت آنتی بیوتیکی بالایی نیز برخوردار هستند یک چالش و خطر مهم برای بهداشت و سلامت جامعه به شمار می روند.
کلید واژگان: استافیلوکوکوس اپیدرمیدیس, بیوفیلم, مقاومت به متی سیلینBackground and objectiveStaphylococcus epidermidis is an opportunistic pathogenic bacterium which is able to form biofilm and often associated with nosocomial infections. The aim of this study was to determine the frequency of biofilm formation and antibiotic resistance patterns among methicillin resistant S. epidermidis (MRSE) strains isolated from patients in a referral hospital in Isfahan.
Materials and methodsIn this study, during 2015 and 2016, a total of 139 suspected S. epidermidis strains were collected from clinical samples of patients in a referral hospital in Isfahan. All isolates were identified at the species level using standard biochemical tests and PCR. The resistance of strains to cefoxitin was detected using disk diffusion method by the guidelines of CLSI and antibiotic resistance patterns of methicillin resistant strains to 10 antibiotics was also determined. To measure the ability of MRSE strains to form biofilm, qualitative Congo-red agar and quantitative microtiter plate assays were employed.
ResultsUsing standard biochemical tests and PCR, 107 S. epidermidis strains were identified and confirmed among clinical samples. According to the results of disk diffusion test, 52% of strains were methicillin resistant and the high level resistance to erythromycin was also observed. Moreover, all MRSE strains showed susceptibility to vancomycin, linezolid, quinupristin-dalfopristin and chloramphenicol. The results of Congo-red agar test showed that 41% of strains had black colonies and were slime positive. Also, in microtiter plate assay, 50% of strains produced strong biofilm.
ConclusionThe results of this study indicating the high prevalence of biofilm producing MRSE strains among desired hospital in Isfahan. Such strains which show high antibiotic resistance could be an important challenge for public health.
Keywords: S. epidermidis, biofilm, methicillin resistance -
استافیلوکوکوس اورئوس (SA) و به ویژه استافیلوکوکوس اورئوس مقاوم به متی سیلین (MRSA) یکی از عوامل اصلی عفونت های مرتبط با مراقبت های بهداشتی در سراسر جهان است. کارکنان سلامتی ممکن است به عنوان مخزن برای گسترش MRSA به بیماران و دیگر کارکنان عمل کنند. هدف از این بررسی سیستماتیک، تعیین شیوع جدایه های SA و MRSA از بینی کارکنان سلامتی ایران است. واژه های جست جو شده «ایران» و «استافیلوکوکوس اورئوس» و «MRSA» در پابمد و گوگل اسکالر جست وجو شدند. همچنین دو پایگاه داده علمی فارسی (جهاد دانشگاهی و بانک اطلاعات نشریات کشور) و خلاصه مقالات کنگره های ملی اخیر مورد بررسی قرار گرفتند. در این بررسی سیستماتیک مقالات / خلاصه های بررسی شیوع SA و MRSA در ایران (از 1993 تا 2018) گنجانده شد. متاآنالیز با استفاده از نرم افزار OpenMeta[Analyst] انجام شد. طبق نتایج متاآنالیز شیوع SA بین کارکنان 26 درصد (فاصله اطمینان 95 درصد: 19/4-32/6 درصد) و شیوع MRSA به ترتیب به نسبت ایزوله های جداشده و تعداد کل کارکنان مورد بررسی 35/4 درصد (فاصله اطمینان 95 درصد: 29/6-41/1 درصد) و 7/6 درصد (فاصله اطمینان 95 درصد: 6/4-8/8 درصد) است. مطالعه های قدیمی تر شیوعی بیش از مطالعه های اخیر را نشان می دهند. شیوع کلونیزاسیون بینی MRSA بین کارکنان سلامت ایران، بین شیوع کشور آمریکا و کشورهای اروپایی با کشورهای آفریقایی قرار دارد.
کلید واژگان: استافیلوکوک اورئوس, مقاومت به متی سیلین, متاآنالیز, کارکنان سلامت, ایرانStaphylococcus aureus (SA) and especially methicillin-resistant staphylococcus aureus (MRSA) remains a major cause of healthcare-associated infections worldwide. Health care workers (HCWs) may act as reservoirs for transmission of MRSA to patients and other HCWs. The aim of this systematic review was to investigate the prevalence of SA and MRSA colonization among HCWs in Iran. The used keywords for searching were: “Iran”, “S. aureus” and “MRSA” conducted in PubMed, and Google Scholar, and two national scientific databases and proceedings of recent national conferences. The studies related to SA or MRSA prevalence in Iran published from 1993 to 2018 were included for review. Meta-analysis was performed using the Open Meta (Analyst) software. Results showed that the prevalence of SA among HCWs was 26% (95% CI=19.4-32.6%). The ratios of MRSA/total isolated SA and MRSA/total HCWs were obtained 35.4% (95% CI=29.6-41.1%) and 7.6% (95% CI= 6.4-8.8%), respectively. Older studies showed a higher prevalence compared to recent studies. The prevalence of nasal MRSA carriage among Iranian HCWs was in a range between the rates reported in the U.S/European and African countries.
Keywords: Staphylococcus aureus, Methicillin-Resistant Staphylococcus Aureus, meta-analysis, Health care workers, Iran -
سابقه و هدفآنالیز منحنی ذوب DNA با کیفیت بالا (HRM) یکی از حساس ترین و دقیق ترین روش ها جهت شناسایی استافیلوکوک اورئوس و مقاومت به متی سیلین است. این مطالعه با هدف آنالیز منحنی ذوب DNA با کیفیت بالا، به منظور شناسایی سویه های استافیلوکوک اورئوس مقاوم به متی سیلین انجام پذیرفت.مواد و روش هادر این مطالعه تجربی، از سویه های استاندارد استافیلوکوک اورئوس ATCC25923 و ATCC 33592 استفاده شد. جهت شناسایی استافیلوکوک اورئوس از ژن ITS، و مقاومت به متی سیلین از ژن mecA استفاده گردید. با استفاده از نرم افزارهای StepOne Software v2. 3 و HRM Software v3. 0. 1 تجزیه و تحلیل انجام شد و نتایج تعیین توالی به عنوان گلد استاندارد مورد استفاده قرار گرفت.یافته هاحساسیت آنالیتیکی روش PCR با استفاده از پرایمر ITS قادر به شناسایی CFU 104 باکتری بوده و برای ژن mecA تا CFU 103 باکتری را تشخیص داد. حسایت آنالیتیکی روش HRM نیز برای پرایمر ژن ITS تا رقت CFU 2-10 و پرایمر ژن mecA تا رقت CFU 5-10 قدرت شناسایی باکتری را داشته است. در تجزیه و تحلیل نتایج HRM نیز کم ترین مقدار خطا در منحنی ها ذوب DNA مشاهده گردید به طوری که، با در نظر گرفتن نزدیک ترین بازه دمایی به منظور تجزیه و تحلیل، دمای ذوب برای ژن ITS مقدار 5/0± 86 درجه سلسیوس و برای ژن mecA مقدار 5/0± 81 درجه سلسیوس به دست آمد. نتایج دما و تعیین توالی اختصاصیت بالای روش HRM را نشان داد. استنتاج: روش HRM از نظر تشخیص مقدار کم باکتری، دارای حساسیت و اختصاصیت بالایی می باشد.کلید واژگان: استافیلوکوک اورئوس, مقاومت به متی سیلین, منحنی ذوب DNA, HRMBackground and purpose: High Resolution Melting curve analysis DNA (HRM) is one of the most sensitive and precise methods for detecting Staphylococcus aureus and resistance to Methicillin. The aim of this study was to analyze the HRM for detection of methicillin-resistant S. aureus strains.Materials and methodsIn this experimental study, standard strains of S.aureus ATCC25923 and ATCC 33592 were used. To identify S.aureus from ITS gene and methicillin resistance, the mecA gene was used. Analysis was performed using StepOne v2.3 and HRM v3.0.1. Sequencing results were used as gold standard.ResultsThe analytical sensitivity of the PCR method by ITS primer was capable of detecting 104 CFU bacteria and detecting bacteria for the mecA gene up to 103 CFU. The analytical sensitivity of the HRM method was also valid for ITS gene primer to dilute 10-2 CFU and the mecA gene primer up to a dilution of 10-5 CFU to detect bacteria. In HRM analysis, the lowest error rate was observed in the melting curves of DNA. Thus, considering the closest temperature range for analysis, the melting temperature for the ITS gene was 86 ± 0.5°C and for the mecA gene was 81± 0.5°C. The results of temperature and sequence determination proved the specificity of the HRM.ConclusionThe HRM has high sensitivity and specificity for detecting low levels of bacteria.Keywords: Staphylococcus aureus, Methicillin resistance, DNA Melting Curve, HRM
-
زمینه و هدفیکی از داروهای منتخب برای درمان برخی از عفونت های استافیلوکوکوسی، کلیندامایسین است. روش های مولکولی می تواند تکمیل کننده روش های فنوتیپی برای تشخیص مقاومت القایی به کلیندامایسین باشد. هدف از این مطالعه شناسایی ژن های عامل مقاومت به کلیندامایسین و اریترومایسین و تعیین الگوی مقاومت آنتی بیوتیکی آنها است. مواد و روش کار: 100 ایزوله استافیلوکوکوس کواگولاز منفی از 466 نمونه بالینی مختلف با استفاده از آزمون های تشخیصی بیوشیمیایی جداسازی شدند. با استفاده از روش دیسک دیفیوژن الگوی مقاومت آنتی بیوتیکی نسبت به لینکوزامیدها و تتراسایکلین ها به دست آمد. سپس، ژن های ermA، ermB و ermC و msrA با استفاده از روش PCR شناسایی و بررسی شدند.یافته هااز 100 جدایه استافیلوکوکوس کواگولاز منفی جداشده از نمونه های بالینی مختلف، 5 جدایه استافیلوکوکوس ساپروفیتیکوس (5%) و 55 جدایه استافیلوکوکوس اپیدرمیدیس (55%) بودند. از 5 جدایه استافیلوکوکوس ساپروفیتیکوس، 2 جدایه (40%) مقاوم به متی سیلین و 1 جدایه (20%) دارای فنوتیپ D گزارش شد. همچنین، 1 جدایه (50%) ژن ermA و 1 جدایه (50%) ژن ermB داشتند. از 55 جدایه استافیلوکوکوس اپیدرمیدیس، 25 جدایه (45/45%) مقاوم به متی سیلین تعیین شد که از این میان 9 جدایه (36%) فنوتیپ D داشتند. همچنین 4 جدایه (16%) دارای ژن ermA، 3 جدایه (12%) دارای ژن ermB، 6 جدایه (24%) دارای ژن ermC و 1 جدایه (4%) هم حامل ژن msrA مشاهده شد.نتیجه گیریالگوی فنوتیپی مقاومت به گروه های ماکرولیدی لینکوزامیدی، دقت بالایی برای تشخیص سویه های MLSB مقاوم به متی سیلین ندارد.کلید واژگان: استافیلوکوکوس ساپروفیتیکوس, استافیلوکوکوس اپیدرمیدیس, مقاومت به متی سیلین, ماکرولید, لینکوزامیدBackground and AimsClindamycin is one of the selective drugs for treatment of staphylococcal infections. Molecular methods can complete phenotypic methods to diagnosis induction resistance to clindamycin. The aim of this study was to identify the genes responsible for the resistance to clindamycin and erythromycin, and determine their antibiotic resistance pattern.Materials and Methods100 isolates of Staphylococcus epidermidis and Staphylococcus saprophyticus were isolated from 466 different clinical specimens using biochemical tests. Using the disc diffusion method, Antibiogram susceptibility test was conducted to determinate lincosamides and tetracycline resistance pattern. Then ermA, ermB, ermC and msrA genes were identified and investigated by PCR method.ResultsOut of 100 strains of coagulase-negative staphylococci isolated from clinical specimens, 5 isolates were identified as S. saprophyticus (5%) and 55 isolates of S. epidermidis (55%), respectively. Out of the 5 isolated of S. saprophyticus, 2 (40%) isolates were resistant to methicillin and one (20%) isolate had D phenotype. In addition, 1 isolate had ermA gene and 1 isolate had ermB. Out of the 55 isolates of S. epidermidis, 25 (45.45%) isolates were resistant to methicillin, of which nine (36%) isolates had D phenotype. Also, 4 (16%) isolates had ermA gene, 3 (12%) isolates had ermB, 6 (24%) isolates had ermC and 1 (4%) isolate was carrying the msrA.ConclusionsThe phenotypic pattern of resistance to macrolide- lincosamides groups does not have a high degree of accuracy in detecting methicillin-resistant MLSB strains.Keywords: Staphylococcus saprophyticus, Staphylococcus epidermidis, Methicillin resistance, Macrolides, Lincosamides
-
زمینه و هدفاستافیلوکوکوس اورئوس از مهم ترین و شایع ترین پاتوژن های بیمارستانی است و به دلیل قدرت بیماری زایی بالقوه و مقاومت روزافزون در برابر داروهای ضدمیکروبی به یکی از مهم ترین مشکلات بهداشتی در جهان تبدیل شده است. هدف از این مطالعه جداسازی استافیلوکوکوس اورئوس های مقاوم به متی سیلین و وانکومایسین از بیماران بستری در بخش های عفونی و سوانح و سوختگی بیمارستان های رازی قائم شهر و شهید زارع ساری و تعیین الگوی مقاومت آنتی بیوتکی آنها در سال 1394 است. مواد و روش کار: در این مطالعه توصیفی مقطعی، تعداد 134 نمونه کشت استافیلوکوکوس اورئوس به دست آمده از بیماران بستری در بخش های عفونی و سوانح و سوختگی، به روش تصادفی ساده از آزمایشگاه بیمارستان تهیه و به آزمایشگاه تحقیقاتی منتقل شد. نمونه ها در محیط بلاد آگار به مدت 24 ساعت در دمای 37 درجه سلسیوس انکوبه شد. کلنی ها از نظر مورفولوژی، خصوصیات بیوشیمیایی و مقاومت به پلی میکسین و حساسیت به نووبیوسین بررسی شدند. برای جدایه ها تست آنتی بیوگرام به روش دیسک دیفیوژن انجام شد و شناسایی به روش PCR صورت گرفت. نتایج PCR برای تایید سکانس شد.یافته هااز مجموع 134 نمونه کشت به دست آمده از آزمایشگاه بیمارستان، تعداد 100 نمونه به عنوان استافیلوکوکوس اورئوس شناسایی شدند که تعداد 51 نمونه مقاوم به متی سیلین و 2 نمونه مقاوم به تمام آنتی بیوتیک ها و وانکومایسین و واجد ژن های vanA و vanB بودند. 45/09 درصد سویه های مقاوم به متی سیلین از بخش مراقبت های ویژه به دست آمد.نتیجه گیریشناسایی مقاومت به آنتی بیوتیک در عوامل عفونی بیمارستانی یک چالش اصلی در درمان عفونت ها است. 25/37 درصد نمونه های به دست آمده از بیمارستان، استافیلوکوکوس اورئوس نبودند. این مطالعه همچنین شیوع 51درصدی مقاومت به متی سیلین را نشان داد.کلید واژگان: استافیلوکوکوس اورئوس, مقاومت, متی سیلین, وانکومایسینBackground and AimsStaphylococcus aureus is the most common and important nosocomial pathogens and due to potential virulence and increasing resistance to anti-microbial medicines, they become one of the most important health problems through worldwide. So the aim of this study was identification and characterization of S. aureus resistant to Methicillin and Vancomycin from patients hospitalized in Razi hospital of Ghaemshahr and Shahid Zare of Sari and characteristics antibiotics susceptibility pattern in 2015.Materials and MethodsIn this cross-sectional descriptive study, 134 strains of Staphylococcus aureus from hospitalized patients in infectious diseases and burns were collected randomly from the hospital laboratory and transferred to the research laboratory. The specimens were incubated in Blood Agar medium for 24 hours at 37 ° C. The colonies were examined for morphology, biochemical properties, resistance to polymixin and sensitivity to Novobiocin. For isolates, antibiotic test was performed using disk diffusion method and PCR detection was performed. PCR results were approved for sequencing.Results100 out of 134 samples were positive for S. aureus; 51 samples were methicillin-resistant and 2 samples were resistant to all of the antibiotics and Vancomycin with vanA and vanB resistance gene.ConclusionsDetermination of new resistance factor in nosocomial infection is one of the major challenges in treating these infections. 25.37% of the samples, weren’t S. aureus. This study showed 51% prevalence of methicillin-resistance.Keywords: Staphylococcus aureus, Resistance, Methicillin, Vancomycin
-
زمینه و هدفاستافیلوکوکوس اورئوس پاتوژن فرصت طلبی است که به ویژه سویه های مقاوم به متی سیلین آن، عامل طیف وسیعی از عفونت های بیمارستانی و اکتسابی از جامعه است. قدرت چسبندگی از عوامل مهم افزایش بیماری زایی این باکتری است. در پژوهش حاضر، میزان مقاومت به متی سیلین و فراوانی ژن های چسبندگی fnbA و fnbB در جدایه های بالینی استافیلوکوکوس ارئوس بررسی شد.مواد و روش کارجدایه های استافیلوکوکوس ارئوس از نمونه های بالینی بیماران مراجعه کننده به آزمایشگاه های تشخیص پزشکی رشت در بازه زمانی یک ساله شهریور 95-94 جداسازی و مقاومت جدایه ها به متی سیلین به روش انتشار دیسک و ارزیابی حضور ژن mecA بررسی شد. فراوانی ژن های چسبندگی fnbA و fnbB در سویه های حساس و مقاوم به متی سیلین در واکنش PCR با استفاده از پرایمر اختصاصی این ژن ها مشخص و با آزمون 2% مقایسه شد.یافته هااز 90 جدایه بررسی شده، 37 جدایه (41%) مقاوم به متی سیلین و mecA مثبت بودند. همچنین در 59 (65/5%) و 37 (43/3%) جدایه به ترتیب ژن های fnbA و fnbB شناسایی شدند. فراوانی ژن های fnb در سویه های مقاوم به متی سیلین استافیلوکوکوس اورئوس به گونه ای معنی دار بیشتر از سویه های حساس به متی سیلین بود (0/05> P).نتیجه گیرینتایج این مطالعه بیانگر شیوع بالای سویه های مقاوم به متی سیلین در نمونه های بالینی استافیلوکوکوس اورئوس در رشت و نیز فراوانی ژن های fnb در این جدایه ها است.کلید واژگان: استافیلوکوکوس اورئوس, مقاومت به متی سیلین, چسبندگی, fnb, mecABackground And AimsStaphylococcus aureus is an opportunistic pathogen, which particularly its methicillin resistant strains, is responsible for a wide range of hospital and community acquired infections. Adhesion ability is one of the important virulence factors of this bacterium. In this study, the resistance to methicillin and the frequency of fnbA and fnbB adhesion genes in clinical isolates of S. aureus were investigated.Materials And MethodsIsolates of S. aureus were collected from clinical samples of patients referred to Rasht medical diagnostic laboratories. Resistance of isolates to methicillin was investigated by disk diffusion method and determination of presence of mecA gene. Frequency of fnbA and fnbB adhesion genes in methicillin sensitive and methicillin resistant strains was determined using specific primers of these genes in PCR reaction and was compared using chi-square test.ResultsOut of 90 isolates, 37 isolates (41%) were resistant to methicillin and mecA positive. Also, in the PCR reaction, fnbA and fnbB genes were identified in 59 (65.5%) and 37 (43.3%) isolates, respectively. The prevalence of fnb genes in Staphylococcus aureus methicillin-resistant strains was significantly higher than that of methicillin-susceptible strains (PConclusionsThe results of this study indicate high prevalence of methicillin-resistant strains in clinical isolates of S. aureus in Rasht and the frequency of fnb gene in these isolates.Keywords: Staphylococcus aureus, Methicillin Resistance, Adhesion, fnb
-
زمینه و هدفاستافیلوکوکوس اورئوس مقاوم به متی سیلین شایع ترین عامل باکتریائی عفونت زخم پای بیماران دیابتی (DFI) است. فاکتورهای بیماری زایی این باکتری شدت درجه عفونت زخم را افزایش می دهد و درصورت درمان نشدن به موقع منجر به قطع عضو اندام های تحتانی و مرگ بیماران مبتلا می شود. هدف این پژوهش، جداسازی باکتری استافیلوکوکوس اورئوس مقاوم به متی سیلین حامل ژن mecA و شناسایی 4 ژن ویرولانس hla ، lukED، sei و hlg از جدایه های عفونت پای بیماران دیابتی به منظور ارزیابی نقش آن ها در میزان شدت عفونت است.مواد و روش کاراز ترشحات چرک 30 بیمار مبتلا به عفونت پای دیابتی در استان مازندران نمونه گیری شد و استافیلوکوکوس اورئوس براساس ویژگی های کشت و تست های بیوشیمیائی خالص سازی شد. ارزیابی مولکولی جدایه ها پس از استخراج DNA، با 5 جفت پرایمر اختصاصی ژن های مقصود به روش PCR صورت گرفت.یافته هااز مجموع 30 بیمار 14 ایزوله (46/6%) استافیلوکوکوس اورئوس جداسازی و شناسایی شد. هر 14 نمونه حامل ژن mecA بودند و فراوانی ژن های hla ، lukED ، sei و hlg در جدایه ها به ترتیب 100%، 100%، 71/4% و 64/2% به دست آمد.نتیجه گیریشناسایی این 4 ژن به همراه ژن mecA در استافیلوکوکوس اورئوس جداسازی شده از زخم پای دیابتی می تواند مارکر ژنتیکی موثر و قابل اعتمادی در تشخیص درجه بندی عفونت پای بیماران دیابتی باشد. تشخیص عامل عفونت با روش PCR و درمان آنتی بیوتیکی مناسب و به موقع، در جلوگیری از قطع عضو بیماران دیابتی ضروری است.کلید واژگان: استافیلوکوکوس اورئوس, مقاومت به متی سیلین, ژن های بیماری زایی, عفونت پای دیابتیBackground And AimsMethicillin-resistant Staphylococcus aureus is the most common bacterial agent of diabetic foot Infection (DFI).The Virulence factors of this bacterium increases the severity of the degree of wound infection, and if not treated promptly, results in lower limb amputation and death of the affected patients. The aim of this study was to isolate methicillin resistant Staphylococcus aureus carries the mecA gene and to detect 4 Virulence genes hla, lukED, sei and hlg from patients with diabetic foot infection in order to evaluate their role in severity of infection.Materials And Methods30 cases of diabetic foot infections in Mazandaran province were collected from pus drainage and Staphylococcus aureus was purified according to culture characteristics and biochemical tests. The molecular evaluation of the isolates after DNA extraction was performed with five pairs of specific primers of intended genes, by PCR method.ResultsOf the 30 patients, 14 isolates (46.6%) of S. aureus were isolated and identified. Each 14 samples contained mecA gene and the frequency of hla, lukED, sei and hlg genes in isolates was 100%, 100%, 71.4% and 64.2%, respectively.ConclusionsIdentification of these 4 genes with the mecA gene in S. aureus isolated from diabetic foot Infection can be an effective and reliable genetic marker for diagnosis of foot infection in diabetic patients. To prevent amputation, diagnosis of infection by PCR method and appropriate timely antibiotic therapy are required for Diabetic patients.Keywords: Staphylococcus aureus, Methicillin Resistance, Virulence Genes, Diabetic Foot Infection
-
مقدمهStaphylococcus aureus، از جمله شایع ترین عفونت های بیمارستانی به شمار می رود. افزایش عفونت های ناشی از این باکتری و مقاومت آن به بسیاری از آنتی بیوتیک ها، باعث بروز مشکلات بسیاری شده است. هدف از انجام مطالعه ی حاضر، بررسی مولکولی Staphylococcus aureus مقاوم به متی سیلین (Methicillin-resistant Staphylococcus aureus یا MRSA) جدا شده از بیماران بستری در Intensive care unit (ICU) بیمارستان های شهر تهران بود.روش هادر این پژوهش، 443 نمونه ی بالینی جهت جداسازی MRSA مورد بررسی قرار گرفت و 125 نمونه وارد مطالعه شد. پس از جداسازی MRSA، مقاومت آنتی بیوتیکی ایزوله های جداسازی شده به روش انتشار دیسک در آگار (Disk diffusion) بررسی گردید. در ادامه، تمامی سویه های MRSA از نظر وجود ژن های کد کننده ی توکسین Panton-Valentine leukocidin (PVL) و Toxic shock syndrome toxin (TSST) با استفاده از تکنیک Polymerase chain reaction (PCR) مورد بررسی قرار گرفت و در نهایت، تایپینگ agr با استفاده از تکنیک Multiplex PCR تعیین شد.یافته هابیشترین میزان مقاومت نسبت به آنتی بیوتیک های پنی سیلین (122 مورد، 6/97 درصد)، کانامایسین (105 مورد، 0/84 درصد) و جنتامایسین (95 مورد، 0/76 درصد) بود. در میان 125 گونه ی MRSA، شایع ترین ژن به tst (84 مورد، 0/67 درصد) و سپس ژن pvl (25 مورد، 0/20 درصد) اختصاص یافت. شایع ترین نوع agr نیز به تایپ I با فراوانی 0/52 درصد، تایپ III با فراوانی4/34 درصد، تایپ II با فراوانی 6/9 درصد و تایپ IV با فراوانی 0/4 درصد تعلق داشت.نتیجه گیرینتایج حاکی از افزایش قابل توجه مقاومت Staphylococcus aureus نسبت به آنتی بیوتیک های مختلف بود که هشداری جدی جهت درمان عفونت های ناشی از Staphylococcus aureus می باشد. بنابراین، سیاست مصرف این آنتی بیوتیک ها باید مورد بازبینی قرار گیرد. همچنین، الگوی تولید توکسین و مقاومت آنتی بیوتیکی در بین سویه های با agr تایپ مختلف، متفاوت بود و پیشنهاد می شود که خصوصیات مولکولی سویه ها به صورت دوره ای مورد بررسی قرار گیرد.کلید واژگان: Staphylococcus aureus, مقاومت به متی سیلین, تایپینگ مولکولیBackgroundStaphylococcus aureus is one of the most commonly diagnosed infections in hospitals. Increased infections caused by this bacterium and its resistance to many antibiotics is leading to increasing morbidity and mortality in the hospital setting. The aim of this study was to investigate the molecular status of methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) isolated from patients admitted to intensive care units (ICUs) of hospitals in Tehran City, Iran.MethodsThis cross-sectional study was performed by analyzing 125 MRSA strains isolated from hospitalized patients in ICUs. In vitro antibiotic susceptibility testing of isolates was assessed using Kirby-Bauer disk diffusion method. MRSA strains were genetically typed by agr typing and virulence and adhesion genes profile via conventional polymerase chain reaction (PCR) method.
Findings: Of 443 clinical studied samples, 125 MRSA strains were observed. The highest resistance rates were observed for penicillin antibodies (122, 97.6%), kanamycin (105, 84.0%), and gentamicin (95, 76.0%). Frequency of pvl and tst genes was 67.2% and 20%, respectively. Type I was the most prevalent agr type (52.0%), followed by type III (34.4%), type II (9.6%), type I 5(5.3%), and type IV (4%). All the isolates carrying Panton-Valentine leukocidin (PVL)-encoding genes and high-level mupirocin-resistance (HLMUPR)-MRSA strains corresponded exclusively to agr type I.ConclusionThis study demonstrates the increased resistance of Staphylococcus aureus to different antibiotics, which is a serious warning for the treatment of Staphylococcus aureus infection in the region. Therefore, in order to avoid resistance to other antibiotics, uncontrolled and unnecessary administration of antibiotics should be avoided.Keywords: Staphylococcus aureus, Methicillin resistance, Molecular typing -
سابقه و هدفپمپ های افلاکسی بعنوان یکی از مهمترین خطوط ایجاد مقاومت آنتی بیوتیکی در عصر جدید شناخته شده اند. استافیلوکوک اورئوس یکی از گروه های باکتریایی دارای پمپ های افلاکسی میباشد. فعالیت این پمپها توسط ژن های خاصی کد میشود. هدف از این مطالعه تعیین الگوی فوتیپی و مولکولار عامل پمپ های افلاکسی در ایزوله های بالینی استافیلوکوک اورئوس مقاوم به متی سیلین می باشد.مواد و روش ها302 باکتری استافیلوکوک اورئوس از نمونه های مختلف بالینی جمع اوری شد. 145 ایزوله مقاوم به متی سیلین با استفاده از روش های دیسک دیفیوژن سفوکسیتین(30 میکروگرم) و همچنین تعیین حداقل غلظت مهاری با استفاده نوارهای E-test سفوکسیتین، تعیین شدند. جهت شناسایی ژن های عامل مقاومت به ژیراز ها و افلاکس پمپ ها از روش Multiplex PCR استفاده گردید. داده های بدست آمده با استفاده از نرم افزار SPSS نسخه 16 تجزیه و تحلیل شد.یافته هااز 145 ایزوله استافیلوکوک اورئوس مقاوم به متی سیلین بیشترین فراوانی مربوط به آنتی بیوتیک های نورفلوکساسین و سیپروفلوکساسین بود. همچنین، ژن norA در 39 ایزوله بالینی(82/25 درصد) ، ژن norB در 12 ایزوله بالینی(97/9 درصد) ، ژن norC در 41 ایزوله بالینی(15/49 درصد) ، ژن grlA در 75 ایزوله بالینی(66/49 درصد)، ژن grlB در 37 ایزوله بالینی(50/26 درصد) ، ژن gyrA در 58 ایزوله بالینی(41/38 درصد) و ژن gyrB در 19 ایزوله بالینی(58/12 درصد) مثبت بودند.نتیجه گیریحضور پمپ های افلاکسی در سویه های مقاوم به متی سیلین استافیلوکوک اورئوس، زمینه ظهور باکتری های دارای مقاومت چندگانه را فراهم کرده است.کلید واژگان: استافیلوکوک اورئوس, پمپ های ترشحی, فلورکوئینولون, مقاومت به متی سیلینBackground And ObjectiveEfflux pumps are regarded as one of the most important mechanisms of antibiotic resistance in this era. Staphylococcus aureus is one of the bacterial groups with efflux pumps. The pumps activity is coded by specific genes. The aim of this study was to determine the phenotypic and molecular pattern of efflux pumps in the clinical isolates of methicillin-resistant S. aureus.Materials And MethodsThis study was conducted on 302 S. aureus bacteria collected from different clinical specimens. We detected 145 isolates of methicillin-resistant using disk diffusion method with cefoxitin (30 µg) as well as minimum inhibitory concentration with E-test strips and cefoxitin disks. In addition, multiplex polymerase chain reaction method was employed to identify the genes responsible for resistance to efflux pump and gyrase. The data were analyzed using SPSS software version 16.ResultsAmong the 145 isolates of methicillin-resistant S. aureus, norfloxacin and ciprofloxacin had the highest frequency. Furthermore, norA, norB, norC, grlA, grlB, gyrA, and gyrB genes were positive in 39 (25.825%), 12 (9.97%), 41 (49.15%), 75 (49.66%), 37 (26.50%), 58 (38.41%), and 19 clinical isolates (12.58%), respectively.ConclusionAs the findings indicated, the presence of efflux pumps in the strains of methicillin-resistant Staphylococcus aureus provided the ground for the emergence of multi-drug resistant bacteria.Keywords: Efflux Pumps, Fluoroquinolone, Resistant to Methicillin, Staphylococcus aureus
-
مقدمهمقاومت به بتالاکتام ها، از مهم ترین ویژگی های Staphylococcus aureus (S. aureus) به شمار می رود. این احتمال وجود دارد که میزان مقاومت در سویه های مقاوم و بیان ژن های عامل مقاومت به آنتی بیوتیک های بتالاکتامی، در S. aureus متفاوت باشد. از این رو، هدف از انجام مطالعه ی حاضر، تعیین میزان بیان ژن های mecA و blaZ در سویه های S. aureus مقاوم به متی سیلین و تعیین ارتباط الگوی بیان ژنی بود.روش هادر این مطالعه ی تجربی- تحلیلی، 120 ایزوله ی بالینی S. aureus مقاوم به متی سیلین با آزمایش های فنوتیپی از نمونه های بالینی مختلف، جداسازی شد. جهت بررسی کیفی ژن های mecA و blaZ در ایزوله های مقاوم، از روش Polymerase chain reaction (PCR) استفاده گردید. همچنین، جهت سنجش کمی ژن ها، از روش Real-time PCR مبتنی بر سایبرگرین 1 استفاده شد. به منظور آنالیز داده های به دست آمده، از نرم افزارهای RG-REST و SPSS استفاده شد.یافته هادر این مطالعه، از مجموع 120 ایزوله ی S. aureus مقاوم به متی سیلین، 105 ایزوله (5/87 درصد) دارای ژن blaZ بودند. در این بین، متنوع ترین تغییرات بیان ژنی مربوط به نمونه های خون و ادرار بود؛ به طوری که افزایش بیان در نمونه های خون و زخم و ادرار به میزان چشم گیری بیشتر از سایر نمونه های بالینی بود. همچنین، بین میزان بیان ژن mecA و blaZ در ایزوله های بالینی S. aureus و نمونه های بالینی مختلف، ارتباط معنی داری مشاهده شد.نتیجه گیرینتایج حاصل از این پژوهش، موید عدم استفاده از دزهای مشابه آنتی بیوتیک در درمان عفونت های ناشی از S. aureus در بخش های مختلف است.کلید واژگان: بیان ژن, بتالاکتام, مقاومت دارویی, مقاومت به متی سیلین, Staphylococcus aureusBackgroundResistance to beta-lactams is the most important feature in Staphylococcus aureus (S. aureus). There is a possibility that the amount of resistance and beta-lactam antibiotic resistance gene expression are different in Staphylococcus resistant strains. The aim of this study was to determine the expression of mecA and blaZ genes in methicillin-resistant S. aureus and the relationship between gene expression patters.MethodsIn this experimental-analysis study, 120 clinical isolates of methicillin-resistant S. aureus were isolated from different clinical samples using phenotypic tests. To study the quality of the mecA and blaZ genes in resistant isolates, polymerase chain reaction (PCR) was used. In addition, the quantity of genes, SYBR-Green-1-based real-time PCR was applied. REST 2008 and SPSS software were used to analyze the data.
Findings: Out of 120 isolates of methicillin-resistant S. aureus, 105 isolates (87.5%) had blaZ gene. The most diverse gene expression changes in sample type were seen in blood and urine samples. So, the expression on the wound and urine clinical samples was dramatically more than the other sites. In addition, significant relationship was observed between the blaZ and mecA gene expression and the kind of clinical samples.ConclusionThe results of this study suggested that different doses of antibiotics should be used to treat staphylococcal infections in different organs.Keywords: Gene expression, Beta-lactams, Antibiotic resistance, Methicillin-resistant, Staphylococcus aureus -
هدفتشخیص سریع وبه موقع استافیلوکوک اورئوس می تواند نقش قابل توجهی در درمان عفونت های استافیلوکوکی داشته باشد. با طراحی روش های دقیق که دارای حساسیت و اختصاصیت قابل قبولی هستند، می توان شناسایی گونه و حتی سویه های مقاوم به آنتی بیوتیک را انجام داد. هدف از این مطالعه ارزیابی روش تشخیصی Real Time PCR مبتنی بر آنالیز منحنی ذوب جهت تشخیص ایزوله های بالینی استافیلوکوک اورئوس و ژن عامل مقاومت به متی سیلین می باشد.مواد و روش هادر این مطالعه تجربی از ایزوله های بالینی استافیلوکوک ذخیره شده در بانک میکروب شناسی دانشگاه علوم پزشکی همدان استفاده شد. طراحی پرایمر با انتخاب سایت های هدف و ژن ITS برای استافیلوکوک اورئوس و ژن mecA برای سویه های مقاوم به متی سیلین صورت گرفت. جهت تعیین اختصاصیت و حساسیت آنالیتیک پرایمرهای طراحی شده از آزمون Real time PCR و روش آنالیز منحنی ذوب DNA سویه های مورد مطالعه استفاده شد.یافته هااختصاصیت آنالیتیک پرایمرهای طراحی شده با استفاده از آنالیز منحنی ذوب DNA جهت شناسایی استافیلوکوک اورئوس در 79/83 درجه سانتی گراد و استافیلوکک اورئوس مقاوم به متی سیلین در 6/76 درجه سانتی گراد به دست آمد. حساسیت آنالیتیکی پرایمرهای طراحی شده نیز بر اساس نمودارهای حدآستانه و رقت های تعیین شده، برای ژن ITS توانایی شناسایی بیش از 15 CFU باکتری و برای ژن mecA توانایی شناسایی بیش از 25 CFU باکتری را نشان داد.نتیجه گیریطراحی پرایمرهای مناسب و به کارگیری تکنیک های مولکولی حساس، می تواند دو عامل تعیین کننده در طراحی روش های سریع و دقیق جهت شناسایی باکتری های مهاجمی مانند استافیلوکوک اورئوس باشد.کلید واژگان: استافیلوکک اورئوس, مقاومت به متی سیلین, Real time PCR, مقاومت داروئیKoomesh, Volume:19 Issue: 4, 2017, PP 877 -886IntroductionRapid and timely detection of Staphylococcus aureus can play a significant role in the treatment of staphylococcal infections.Impresingly, by precise designing methods which have acceptable sensitivity and specificity, can identify species and even antibiotic-resistant strains. The purpose of this study was to evaluate the real time PCR diagnostic method based on the melting curve analysis for the detection of clinical isolates of S. aureus and the methicilin resistance gene.Materials And MethodsIn this experimental study, clinical isolated of S. aureus was used from the Microbiology Bank of Hamadan University of Medical Sciences. The primer design was done by selecting (ITS) target for S. aureus and the mecA gene for methicillin-resistant strains. Real-time PCR and DNA melting curves analysis were used to determine the analytical specificity and sensitivity of the designed primers.ResultsThe analytical specificity of the primers was 83.79 ° C for S. aureus and 76.6 ° C for methicillin resistant Staphylococcus aureus respectively. The analytical sensitivity of the primers was 15 CFU/ml bacteria for ITS gene and 25 CFU/ml bacteria for mecA gene.ConclusionBy selecting appropriate primers and using sensitive molecular techniques, which could be the main factors for designing of both quick and accurate method, it is possible to identify invasive bacteria such as S. aureus.Keywords: Staphylococcus Aureus, Methicillin-Resistant, Real Time PCR, Drug Resistance
-
زمینه و هدفتوکسین های تولیدشده به وسیله باکتری ها، یکی از شایع ترین مواردی است که می تواند در کنار سایر عوامل بیماری زای باکتریایی، باعث بروز یا تشدید بیماری شود. ازجمله بیماری های ایجادشده توسط توکسین های باکتریایی می توان به سندرم شوک توکسیک اشاره کرد. عامل تولید این توکسین ژن tst بوده که می تواند بین سویه های مختلف استافیلوکوک اورئوس به راحتی منتقل شود. در این مطالعه ژن توکسین 1 سندرم شوک توکسیک در نمونه های بالینی استافیلوکوک اورئوس مقاوم به متی سیلین به روش Multiplex PCR بررسی گردید.روش بررسیدر این مطالعه توصیفی - مقطعی، طی یک دوره 9 ماهه، 470 نمونه از بیماران بستری در بخش های مختلف و مراجعه کننده به مراکز درمانی دانشگاه علوم پزشکی شهر زاهدان در سال 1394 جمع آوری شد. جداسازی و غربالگری اولیه سویه مقاوم به متی سیلین با استفاده از روش فنوتیپی انجام گرفت. از دیسک های اوگزاسیلین و سفوکسیتین استفاده گردید. بعد از جداسازی سویه های مقاوم، ژن های femA، mecA با روش ژنوتیپی و ژن tst با روش مولتی پلکس PCR بررسی شدند.یافته هااز 170 ایزوله بالینی استافیلوکوک اورئوس، 93 ایزوله از نظر فنوتیپی دارای مقاومت به متی سیلین بودند که از این میان، 89 ایزوله دارای ژن mecA و 14 ایزوله دارای ژن tst بودند.نتیجه گیرینتایج نشان داد شیوع سویه های مقاوم به متی سیلین و سویه هایی که توانایی حمل ژن عامل TSST1 را دارا هستند، در شهر زاهدان بالا بوده است. همچنین گردش این ایزوله ها در افرادی که سطح ایمنی ضعیفی دارند می تواند اثرات بسیار شدیدتری را از خود بر جای بگذارد.کلید واژگان: استافیلوکوک اورئوس, توکسین1 سندروم شوک توکسیک, انتروتوکسین, مقاومت به متی سیلینBackground And ObjectivesToxins produced by the bacteria are one of the most common cases, which can, together with other bacterial pathogens, cause or aggravate the disease. One of the diseases caused by bacterial toxins, is toxic shock syndrome. The tst gene encodes this toxin that can be easily transferred between different strains of Staphylococcus aureus. In this study, toxic shock syndrome toxin-1 gene was investigated in methicillin-resistant clinical strains of Staphylococcus aureus using multiplex PCR method.MethodsThis study is a cross-sectional study, during a 9 month period, 470 samples were collected from patients hospitalized in different wards of treatment centers of Zahedan University of Medical Sciences in 2015. Phenotypic method was used for isolation and initial screening. Oxacillin and Cefoxitin discs were used. After isolation of resistant strains, femA and mecA genes and tst gene were investigated using phenotypic method and multiplex PCR method, respectively.ResultsOf 170 clinical isolates of Staphylococcus aureus, 93 isolates were phenotypically methicillin-resistant, among which 89 isolates had mecA gene and 14 isolates had tst gene.ConclusionThe results indicated that the prevalence of methicillin-resistant strains and the strains carrying causative gene for TSST1, is high in Zahedan. Also, circulation of these isolates can lead to much more severe effects in individuals with weak immune system.Keywords: MRSA, Enterotoxin, Toxic shock syndrome toxin-1, Staphylococcus aureus
-
پیش زمینه و هدفکلونیزاسیون بینی با ارگانیسم استافیلوکک ائوروس مقاوم به متی سیلین به عنوان یک ریسک فاکتور مهم در ابتلا به عفونت های خطرناک شناخته شده است.مواد و روش کارمطالعه حاضر جهت بررسی میزان شیوع کلونیزاسیون بینی با استافیلوکک مقاوم به متی سیلین در بین کودکان زیر 14 سال در سنین مدرسه و قبل از مدرسه در شهر ارومیه انجام شد. نمونه ها جهت کشت از 400 کودک گرفته شده و کشت و آنتتی بیوگرام با دیسک اگزاسیلین در بیمارستان شهید مطهری ارومیه انجام شد.یافته هااز میان 400 نمونه گرفته شده 81 مورد کلونیزاسیون با استافیلوکک گزارش شد که در 12 نمونه مقاوم به متی سیلین بودند کلونیزاسیون در جنس دختر کمی بالاتر از جنس مذکر بود که با در نظر گرفتن p valve بالاتر از 1 از جهت آماری قابل توجه نمی باشد.بحث و نتیجه گیرینتایج این مطالعه نشان داد که کلونیزاسیون با ارگانیسم استافیلوکک مقاوم به متی سیلین در بین کودکان سالم در این منطقه وجود دارد. خوشبختانه شیوع این کلونیزاسیون در مقایسه با نتایج مطالعه سایر مناطق بالاتر نمی باشد که البته توجه در جهت جلوگیری از انتقال این نوع از ارگانیسم ضروری می باشد.کلید واژگان: استافیلوکوکوس اورئوس, مقاومت به متی سیلین, کاونیزاسیون بینیBackground And AimsNasal Colonization with Methicillin Resistant Staphylococcus aureus (MRSA) is known as an important risk factor in the development of dangerous infections.Materials And MethodsThe present study seeks to investigate the prevalence of MRSA nasal colonization among the preschool and school children under 14 in Urmia. To do so, specimens for culture were obtained from 400 children. Cultures and antibiograms with oxacillin discs were performed in Shahid Motahari hospital of Urmia.Results81 cases (47 females, 34 males) out of 400, nasal colonization were observed. Of which 12 (5 females, 7 males) were resistant to methicillin. Colonization was slightly higher among the females with no statistically significant difference (P.value>1).ConclusionThe results indicate that colonization with MRSA is present among healthy children in the studied population. Fortunately, the respective prevalence was not higher compared to other areas. Further attention is required by the health authorities to prevent the transmission of such organisms among children.Keywords: Staphylococcus aurous, Methicillin Resistant, nasal colonization
-
شناسایی مولکولار ژنهای عامل مقاومت به آمینوگلیکوزید ها و متی سیلین در نمونه های بالینی استافیلوکوک اورئوسسابقه و هدفاستافیلوکوک اورئوس یکی از مهم ترین عوامل ایجاد کننده عفونت در جامعه و بیمارستان می باشد. مقاومت به آمینوگلیکوزیدها بواسطه آنزیم های خاصی ایجاد می شود که توسط ژن هایی که توانایی گردش بین سویه ای توسط عناصر ژنتیکی متحرک مانند ترانسپوزونها را دارا می باشند،کد می شوند. هدف از این مطالعه تعیین فراوانی حضور ژنهای aac(6'')Ie/aph(2«)، aph(3'')-IIIa1 ، ant(4'')-Ia1 به همراه ژن mecA است.مواد و روش هادر این مطالعه مقطعی، 113 ایزوله استافیلوکوک اورئوس از579 نمونه مختلف بالینی جداسازی شد. برای تعیین سویه های مقاوم به متی سلین از روش تعیین حداقل غلظت مهاری با نوارهای E-test اوگزاسیلین استفاده شد. شناسایی ژنهای aac(6'')Ie/aph(2»)، aph(3'')-IIIa1، ant(4'')-Ia1 و mecA با استفاده از روش PCR، انجام شد. همچنین ارتباط حضور ژنهای آمینوگلیکوزیدی و ژن mecA نیز بررسی گردید.یافته هااز 113 ایزوله بالینی استافیلوکوک اورئوس که با تست های فنوتیپی تایید شده بودند،53 ایزوله (46/91 %) دارای ژن mecA، 43 ایزوله(38/05%) دارای ژنaac(6'')Ie/aph(2«)، 19ایزوله(16/81%) دارای ژن aph(3'')-IIIa1 و22 ایزوله(19/47%) دارای ژن ant(4'')-Ia1 بودند. همچنین بین حضور ژن مقاومت به متی سیلین و ژنهای عامل مقاومت به آمینوگلیکوزید ارتباط معنی داری بدست آمد. این در حالی بود که بین نوع نمونه های جدا شده و حضور ژنهای مقاومت نیز در برخی موارد ارتباط معنی داری مشاهده شد(0/005p≤).نتیجه گیرینتایج مطالعه نشان داد که استفاده مکرر از آنتی بیوتیک های آمینوگلیکوزیدی به همراه آنتی بیوتیک های بتالاکتامی می تواند زمینه ظهور سویه های استافیلوکوک اورئوس مقاوم به چند آنتی بیوتیک (MDR) را فراهم کند.با تجویز مناسب و کنترل شده آنتی بیوتیک ها می توان از بیشتر شدن این مقاومت ها و ظهور سویه های دارای مقاومت چندگانه، جلوگیری کرد.کلید واژگان: استافیلوکوک اورئوس, آمینوگلیکوزید, مقاومت دارویی, مقاومت به متی سیلینMolecular Identification of responsible resistance to aminoglycosides genes in clinical samples of Staphylococcus aureus
-
مقدمهانجام واکنش PCR یکی از دقیق ترین و حساس ترین تست ها برای سنجش های مولکولی می باشد. استخراج DNA همیشه از وقت گیرترین و هزینه برترین مراحل قبل از PCR می باشد که با حذف آن در برخی شرایط می توان در زمان و هزینه صرفه جویی کرد. هدف از این مطالعه مقایسه دو روش PCR مستقیم و PCR با استخراج DNA الگو در شناسایی ژن های tst و mecA و femA ی باشد.روش کاردر این بررسی ایزوله های بالینی استافیلوکوک اورئوس با تست های بیوشیمیایی تایید شدند. سپس با روش های، PCR مستقیم از کلنی های استافیلوکوک اورئوس کشت داده شده بر روی محیط Muller Hinton agar و PCR با DNAاستخراج شده توسط کیت استخراج برای ژنهای tst و mecA و femAمورد ارزیابی قرار گرفت. برای این کار از سه پرایمر اختصاصی برای ژنهای مورد نظر استفاده شد.یافته هاتکثیر ژن های tst و mecA به طول bp 326 و bp 163 توسطPCR مستقیم و PCR با DNA استخراج شده با موفقیت انجام شد که مربوط به توکسین1سندروم شوک توکسیک و مقاومت به متی سیلین می باشند. در نهایت توسط ژنهای مورد نظر سویه های مقاوم و تولید کننده توکسین شناسایی شدند. نتایج بدست آمده از نظر کمی کاملا مشابه و از نظر کیفی متفاوت بودند، که آزمون PCR با استفاده از کیت نتایج بدست امده دارای کیفیت بهتری بود.نتیجه گیریبا توجه به نتایح بدست آمده در این بررسی، برای صرفه جویی در وقت و هزینه در تشخیص استافیلوکوک اورئوس می توان از PCR مستقیم استفاده کرد . کیفیت باندهای بدست آمده در این روش نسبت به PCR با DNA استخراج شده، قابل قبول بود و در برخی موارد می توان از آن بعنوان یک تست تشخیصی سریع استفاده کرد. برای اینکه کیفیت کار بهتر شود باید از روغن های معدنی استفاده شود.کلید واژگان: استافیلوکوک اورئوس, مقاومت به متی سیلین, PCR مستقیم, ژن tst, ژن mecAIntroductionPCR reactions one of the most accurate and most sensitive tests for the molecular assays. DNA extraction always is time-consuming and costly before the PCR process, which in some cases removed can be saving time and Price. The aim of this study was to compare direct PCR and PCR with DNA extraction template for detection of tst, mecA and femA gens.Materials And MethodsIn this study, clinical isolates of Staphylococcus aureus were confirmed by biochemical tests. Then, with direct PCR by colony acquired of Muller Hinton agar culture and PCR with the extracted DNA extraction kit were studied for tst and mecA genes. For this test, three specific primers were used to target genes.
Findings: amplification was observed of tst, mecA and femA gens with length 326bp, 163bp and 132bp by direct PCR and PCR with the extracted DNA relevant to toxic shock syndrome toxin 1 and are resistant to methicillin. Finally, detected resistant strains and toxins strains by genes. Our results quantitatively Similar each other and in therm of qualitatively were different. The results of PCR test with using extraction kit obtained the better quality.ConclusionsAccording to the results obtained in this study, to save time and cost in the detection of Staphylococcus aureus can be used to direct PCR. Bands quality obtained in this way to PCR, DNA, is acceptable and in some cases it can be used as a rapid diagnostic test. To make the better quality must be used mineral oils.Keywords: Staphylococcus aurous, MRSA, Direct PCR, tst, mecA -
مقدمهافزایش مصرف مواد ضدعفونی کننده باکتری کش منجر به پیدایش سویه های استافیلوکوک مقاوم به این مواد شده است.برخی از پژوهش ها همراهی ژنهای عامل مقاومت به متی سیلین با این عوامل را تایید کرده اند. هدف از این مطالعه، بررسی حضور ژن های مقاومت به مواد بیوسایدی همچون qac A/B و smr در استافیلوکوک های کوگولاز منفی می باشد.روش کاردر این مطالعه توصیفی-مقطعی،60 جدایه استافیلوکوک ساپروفیتیکوس و جدایه استافیلوکوک اپیدرمیدیس از نمونه های بالینی طی مدت 9ماه جمع آوری شد. بعد از آزمایشات بیوشیمیایی اولیه و تایید جدایه ها از نظر جنس و گونه، با استفاده از پرایمرهای اختصاصی، ژنهای aqcA/B و smr با روش واکنش زنجیره ای پلی مراز مورد بررسی قرار گرفتند. داده ها با استفاده از آزمون آماری کای دو مورد آنالیز قرار گرفتند.یافته هااز 60 جدایه استافیلوکوک ساپروفیتیکوس 36 جدایه دارای ژن mecA بودند. از این میان جدایه دارای ژن qacA و 21 جدایه داری ژن smr بودند. همچنین از 49 جدایه استافیلوکوک اپی درمیدیس 27 جدایه دارای ژن mecA بودند که از این میان 11 جدایه دارای ژن qacA/B و 8 جدایه دارای ژن smr بودند.نتیجه گیریدر نتایج بدست امده از این پژوهش حضور گسترده ژن های qac A/B و smr در جدایه های بالینی استافیلوکوک های کوگولاز منفی مقاوم به متی سیلین مشاهده شد. با توجه به شیوع سویه های مقاوم به متی سیلین در جدایه های بدست آمده، به نظر می رسد با کنترل مصرف آنتی بیوتیک، از گردش های ژنی گوناگون جلوگیری کرد.کلید واژگان: کواگولاز منفی, ژن qacA-B, ژن smr, مقاومت به متی سیلینIntroductionIncreasing use of disinfectants biocide cause to appearance of resistant strains of coagulase negative Staphylococcus. Some research confirmed this gene responsible for resistance to methicillin and association with these agents. The aim of this study was to investigate the presence of resistance genes of biocides such as qac A/B and smr in coagulase negative staphylococci.Materials and MethodsIn this cross-sectional study, 60 samples of Staphylococcus epidermidis and 49 samples of Staphylococcus saprophyticus collected over a period of 9 months from clinical samples. After the initial biochemical tests and confirmed genus and species isolates, using specific primers for aqcA / B and smr genes studied by using polymerase chain reaction(PCR) method. Data were analyzed using chi-square testResultsOf 60 isolates of Staphylococcus saprophyticus, 36 isolates had mecA gene. Among these, significantly 19 isolates qacA gen and 21 isolated smr gene. also of 49 Staphylococcus epidermidis isolates, 27 isolates were mecA gene and among those isolates ,11 isolates have gene qacA / B and 8 isolate have smr genes.ConclusionsThe results of this study, we observed the wide spread presence of genes qac A/B and smr in clinical isolates of methicillin-resistant coagulase-negative staphylococci. Due to the prevalence methicillin-resistant strains obtained in isolation,Keywords: qacA-B, smr, mecA, methicillin resistance, coagulase negative
-
Background And ObjectiveStaphylococcus aureus has been recognized as a major nosocomial infection. Since the 1960s, the first methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) has appeared and resistant to all beta-lactam antibiotics caused by the mecA gene. In addition, MRSA with a wide range of infections from mild skin and soft tissue infections to life threatening pneumonia has been recently become a worldwide concern. The aim of current study was prevalence of methicillin resistant Staphylococcus aureus isolated from clinical specimens in province of Mazandaran using phenotypic and genotypic methods.Materials And MethodsAbout 118 clinical specimens were collected from teaching hospitals in Babol and Sari. After identification of the isolates using usual tests, resistance to methicillin was investigated using cefoxitin disc diffusion, oxacillin screening plate and polymerase chain reaction (PCR) for mecA gene. In addition, sensitivity of isolates to other antibiotics was determined according to the Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI).ResultsFrom all collected clinical specimens, a total of 100 isolates was identified as Staphylococcus aureus. The results of sensitivity assay to methicillin using cefoxitin disc diffusion and oxacillin screening agar was showed 66% and 71% of the isolates were resistant to MRSA, respectively. However, the results of PCR showed the presence of mecA gene in 81% of isolates. In addition, investigation of resistant pattern to antibiotics among the isolates was shown that the isolates were high resistant to ampicillin, penicillin and amoxicillin (100%) and low resistance to nitrofurantoin (0%). Also, the MRSA strains were resistant to at least 10 more antibiotics.ConclusionThe results of current study were shown that phenotypic methods are not reliable for determination of methicillin sensitivity. Therefore it is necessary that these results confirmed with genotypic procedures such as PCR should. Moreover, most of Staphylococcus aureus have become resistant to different antibiotics, rapid diagnosis and also appropriate and reasonable prescription of effective antibiotics in order to prevention of increasing drug resistance is necessary.Keywords: Staphylococcus aureus, Methicillin resistance, Mazandaran
-
زمینه و هدفبروز مقاومت نسبت به آنتی بیوتیک های گروه بتالاکتام به یکی از شایع ترین موارد تبدیل شده است. این امر در پاتوژن های بیمارستانی، از جمله استافیلوکوک های کوگولاز منفی به فراوانی دیده می شود. از این رو شناسایی عوامل مقاوم می تواند در امر درمان کمک کننده باشد. هدف از این مطالعه بررسی مقاومت در استافیلوکوک های کوگولاز منفی با روش های فنوتیپی و ژنوتیپی می باشد.
مواد وروشدر مجموع 710 جدایه از نمونه های بالینی مراکز درمانی شهر زاهدان جمع آوری شدند. بعد از تعیین جنس و گونه کردن نمونه های بدست آمده حساسیت آنها نسبت به 10 آنتی بیوتیک بتالاکتام با روش Disc diffusion تعیین شد. برای ردیابی ژنهای blaZ و mecA از پرایمرهای اختصاصی و روش PCR استفاده شد.یافته هااز جدایه های بدست آمده، 79جدایه استافیلوکوک ساپروفیتیکوس و 198جدایه استافیلوکوک اپیدرمیدیس بوند.از این میان 74 ایزوله (%98.1) به پنی سیلین، 69 ایزوله ( 34/87 %) اوگزاسیلین، 31 ایزوله ( 24/39 %) به سفتریاکسون، 71 ایزوله ( 87/89 %) به سفوکسیتین، 43 ایزوله ( 43/54 %) به سفوتاکسیم،19 ایزوله ( 05/24) به سفازولین و 27 ایزوله ( 17/34 %) به سفالکسین در استافیلوکوک ساپروفیتیکوس مقاوم بودند. نتایج حاصل از PCR نیز حضور ژن های mecA و blaZ را در بیشتر ایزوله ها تایید کرد.نتیجه گیریدر غربالگری اولیه به روش فنوتیپی دیسک دیفیوژن شیوع بسیار بالای مقاومت را در شهر زاهدان نشان داد و مشخص شدکه 20تا95درصد از ایزوله ها به انواع بتالاکتام های نسل های متفاوت مقاوم هستند. روش PCR حضور ژنهای blaZ و mecA را در بیشتر ایزوله ها نشان می دهد. اما میزان بیان آن متفاوت است. این نتیجه حاصل می شود که روش فنوتیپی دیسک دیفیوژن به تنهایی برای تعیین رویکرد درمانی عفونت های ناشی از این ارگانیسم مناسب نیست.کلید واژگان: کواگولاز منفی, بتالاکتام, مقاومت آنتی بیوتیکی, مقاومت به متی سیلینBackgroundThe incidence of resistance to groups of beta-lactam antibiotics has become one of the most common cases. This problem too many seen in hospital pathogens, that including coagulase-negative Staphylococcus. Therefore, distinguish of resistance factors can be helpful in treatment process. The aim of this study was to determine resistance in coagulase-negative Staphylococcus by phenotypic and genotypic ways.Materials And MethodsTotally, 710 isolates from clinical samples reaped of health centers of Zahedan. After the determination genus and species of isolates obtained, their sensitivity specify to 10 beta-lactam antibiotics by disc diffusion method. For detection of blaZ and mecA gens used of specific primers and PCR method.ResultsOf obtained isolates, 79 isolate was Staphylococcus saprophyticus and 198 isolate was Staphylococcus epidermidis. Of these, 74 isolates (98.1%) to penicillin, 69 isolates (34/87%) Oxacillin, 31 isolates (24/39%) to ceftriaxone, 71 isolates (87/89%) to Cefoxitin, 43 isolates (43/54%) to cefotaxime, 19 isolates (24.50%) to cefazolin and 27 isolates (17/34%) were resistant to cephalexin in Staphylococcus saprophyticus. PCR results in more isolates confirmed the presence of mecA and blaZ.ConclusionThe Primary screening by phenotypic disk diffusion method showed high prevalence of resistance in the city of Zahedan and was determined that 20 to 95 percent of the isolates were resistant to all beta-lactam of different generations. PCR method approved presence of the mecA and blaZ genes. But those expression is different. This payoff achieving that singly disk diffusion phenotypic method lack of for determining strategy is not appropriate to treatment of infections caused by this organisms.Keywords: coagulase, negative, Beta, lactam, antibiotic resistance, methicillin resistance -
زمینه و هدفسیستم agr در استافیلوکوکوس اورئوس، مسئول کنترل و هماهنگی تولید فاکتورهای ویرولانس، اگزوتوکسین های ترشحی و همولیزین ها می باشد. هدف از این مطالعه، تعیین و شناسایی فراوانی ژن agr در ایزوله های استافیلوکوکوس اورئوس حساس و مقاوم به متی سیلین در نمونه های بالینی و شاغلان مراکز درمانی می باشد.مواد و روش هااین مطالعه توصیفی بر روی تعداد 200 ایزوله جداسازی شده استافیلوکوکوس اورئوس از نمونه های کلینیکی و ناقلان سالم شهر همدان انجام گرفت. الگوی حساسیت آنتی بیوتیکی همه باکتری های جدا شده با استفاده از روش دیسک دیفیوژن تعیین شد و پس از استخراج ژنومی سویه های جدا شده، ژن های mecA و agr ار طریق روش PCR شناسایی شدند. نتایج به دست آمده با استفاده از نرم افزار SPSS نسخه 20 مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت.یافته هاتمامی 200 سویه استافیلوکوکوس اورئوس به آنتی بیوتیک ونکومایسین حساس بودند. میزان شیوع ژن mecA در میان سویه های استافیلوکوکوس اورئوس جدا شده 50 درصد بود. با توجه به نتایج به دست آمده، بیشترین فراوانی ژن های agr در سویه های استافیلوکوکوس اورئوس ایزوله شده به agrA و سپس agrC مربوط بود. AgrB و agrE در هیچ کدام از سویه های استافیلوکوکوس اورئوس مشاهده نشدند.نتیجه گیریبیماری زایی استافیلوکوکوس اورئوس به طور عمده به تولید تعدادی از پروتئین های وابسته به سطح سلول یا ترشح این پروتئین ها مربوط می باشد که همگی آن ها تحت تنظیمات ژن agr هستند. در مطالعه حاضر، agrA در ایزوله های کلینیکی و شاغلان ناقل حساس و مقاوم به متی سیلین بیشتر از سایر تایپ های agr بود، بنابر این، نقش احتمالی agrA در ایجاد عفونت استافیلوکوکوس اورئوس با مهم و چشم گیر می باشد.
کلید واژگان: استافیلوکوکوس اورئوس, ژن های agr, حساسیت آنتی بیوتیکی, مقاومت به متی سیلینBackgroundAgr systems, is responsible for control and coordination in production of virulence factors, exotoxins secretory and hemolysins in Staphylococcus aureus. The aim of this study was to determine and identify the frequency of agr genes in susceptible and methicillin-resistant Staphylococcus aureus strains in clinical samples and carriers employed in remedial centers.Materials And MethodsThis descriptive study was done among a total of 200 strains of Staphylococcus aureus isolated from clinical samples and healthy carriers in Hamadan. Antibiotic susceptibility pattern of all isolates was determined by disk diffusion methods. After DNA extraction, the presence of mecA and agr genes was investigated using PCR. SPSS software package version 20 was used to perform statistical tests.ResultsAll 200 Staphylococcus aureus strains were susceprible to vancomycin. The prevalence of mecA was 50%. The PCR results showed that agrA was the most perevalent gene followed by the agrC in all isotated Staphylococcus aureus strains. None of the isolates harbored the agrB and agrD gene.ConclusionPathogenesis of Staphylococcus is dependent on some proteins other superficial or excreted which under controlling of agr system. In the present study, the feequency of agrA gene in the methicillin-resistant strains, methicillin-sensitive strains isolated from clinical samples and carriers employed in remedial centers was higher than the other agr types. Therefore, presumably, agrA gene plays an important role Staphylococcal infections.Keywords: Staphylococcus aureus, Agr genes, Antibiotic susceptibility, Methicillin, resistance
نکته
- نتایج بر اساس تاریخ انتشار مرتب شده‌اند.
- کلیدواژه مورد نظر شما تنها در فیلد کلیدواژگان مقالات جستجو شده‌است. به منظور حذف نتایج غیر مرتبط، جستجو تنها در مقالات مجلاتی انجام شده که با مجله ماخذ هم موضوع هستند.
- در صورتی که می‌خواهید جستجو را در همه موضوعات و با شرایط دیگر تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مجلات مراجعه کنید.
©2000-2025 magiran.com All Rights Reserved.