به جمع مشترکان مگیران بپیوندید!

تنها با پرداخت 70 هزارتومان حق اشتراک سالانه به متن مقالات دسترسی داشته باشید و 100 مقاله را بدون هزینه دیگری دریافت کنید.

برای پرداخت حق اشتراک اگر عضو هستید وارد شوید در غیر این صورت حساب کاربری جدید ایجاد کنید

عضویت

جستجوی مقالات مرتبط با کلیدواژه « هماگلوتینین » در نشریات گروه « پزشکی »

  • سارا زحمتی، مهدی مهدوی*، مرتضی تقی زاده طرنابی، ستاره حقیقت، رضا جلالی راد
    مقدمه

    ویروس آنفلوانزا، عامل بیماری آنفلوانزا است که به علت ایجاد اپیدمی‌های سالانه در بین طیف وسیعی از میزبان‌ حیوانی و انسانی مورد توجه بوده است. هدف از انجام این مطالعه، بیان موثر و قوی پروتئین نوترکیب هماگلوتینین سویه‌ی ایرانی ویروس آنفلوانزا (H1N1)A خوکی در رده‌ی سلولی حشره‌ی Sf9 به کمک سیستم بیانی باکولوویروس بود.

    روش‌ها: 

    ژن هماگلوتینین ویروس آنفلوانزا H1N1 خوکی با پرایمر اختصاصی حاوی توالی آنزیم‌های برشی تکثیر و کلون گردید و سپس به منظور تولید یک بکمید نوترکیب با استفاده از سیستم Bac-to-Bac به سلول DH10Bac انتقال داده شد. بیان و فعالیت پروتئین نوترکیب در سلول با استفاده از تکنیک‌های مولکولی مورد سنجش قرار گرفت.

    یافته‌ها: 

    تولید ژن هماگلوتینین به طول 1701 جفت‌باز تایید و سلول حشره بعد از دریافت بکمید نوترکیب، پروتئینی به وزن تقریبی 66 کیلودالتون را بیان نمود. اندازه‌ی سلول‌های آلوده شده و هسته‌ آن‌ها افزایش یافت و با ایجاد ظاهر گرانولار، از سطح فلاسک کشت سلول جدا شدند. پس از گذشت 48 ساعت از عفونت، سلول‌های آلوده، با جذب گلبول‌های قرمز جوجه، به شکل تجمعات سلولی ظاهر شدند. عدم تشکیل کلامپ سلولی، نشان از صحت آزمون و مهار فعالیت همادسورپشن بود. مقدار پروتئین حاصل معادل 76/10 میکروگرم بر 100 میکرولیتر معادل 1/0 میلی‌گرم/میلی‌لیتر گزارش شد.

    نتیجه‌گیری: 

    طبق نتایج سیستم بیانی باکولوویروس، قادر به بیان پروتئین نوترکیب در سلول حشره بود و بنابراین، راه حل مناسبی برای جایگزین کردن آن به عنوان نسل جدید واکسن به جای واکسن‌های مبتنی بر تخم مرغ و یا کشت سلول می‌باشد.

    کلید واژگان: ویروس آنفلوانزا H1N1, هماگلوتینین, حشره, باکولوویروس, واکسن}
    Sara Zahmati, Mehdi Mahdavi, Morteza Taghizadeh Tarnabi, Setareh Haghighat, Reza Jalali Rad
    Background

    Influenza virus, which is a decisive agent of influenza, attracted interest because of the event of the annual epidemic among a wide range of animal and human hosts. This study aimed to express the hemagglutinin protein of Iranian swine Influenza A (H1N1) through a baculovirus system in SF9 cells to produce a new recombinant vaccine.

    Methods

    Hemagglutinin gene of Swine H1N1 virus was amplified with specific primers containing restriction enzymes site, and then cloned. Afterward, the vector was transformed to DH10Bac using Bac-to-Bac system in order to produce a recombinant bacmid. Hemagglutinin expression and its biological activity were assessed using molecular and immunization tests.

    Findings

    The target rHA in length, 1710 bp, was produced and expressed in transfected SF9 cells with a size of ~66 kDa. The infected cells expanded in size and their nucleus, and desiccated from the surface of the cell culture as a granular. They could absorb chick red blood cells (RBCs), and appear as cell aggregates forty-eight postinfection. The fact that infected cells were unable to form cell clamp showed the test's accuracy and inhibition of hemodesorption activity. The amount of protein obtained was 10.76 µg/100 µl, equal to 0.1 mg/ml.

    Conclusion

    The baculovirus expression system could express the recombinant protein in the insect cell. Therefore, it may be a well-suited alternative to produce a new generation of the vaccine instead of egg-based and cell-culturebased generation vaccines.

    Keywords: Influenza A virus, H1N1 subtype, Hemagglutinin, Insecta, Baculoviridae, Vaccines}
  • فرناز مقدم، مرتضی تقی زاده طرنابی، رضا منصوری، مجید تبیانیان*، مهران دباغیان
    مقدمه

    درسال های اخیر و با توجه به پیشرفت های انجام شده درحوزه بیوانفورماتیک، طراحی واکسن آنفولانزا دستخوش پیشرفت های قابل ملاحظه ای شده است. هدف از این مطالعه طراحی یک پروتئین نوترکیب چندظرفیتی برمبنای اپی توپ  بسیار محافظت شده پروتئین هماگلوتینین سویه های H1N1 و H5N1 است که در طی زمان دچار تغییر و موتاسیون نمی شوند.

    روش کار

    برای این منظور و با توجه به مطالعات میدانی قبلی توالی سویه های مورد نظر بررسی شد و اپی توپ هایی از این سویه ها انتخاب شدند.پس از بررسی خصوصیات ایمنی زایی و شیمیایی اپی توپ های انتخاب شده توسط سرور های مناسب، ساختاراولیه پروتئین نوترکیب تعیین شد و متعاقب ترجمه معکوس توالی فوق ، بهینه سازی کدون انجام شد و در نهایت توالی بهینه شده در درون وکتور PET32a+ و دربین دو ناحیه آنزیمی  BamHI/XhoI قرارداده شد.

    نتایج

    نتایج بدست آمده نشان داد که پروتئین نوترکیب حاصله دراین مطالعه دارای وزن ملکولی 22451.72 g/mol با 214 اسید آمینه می باشد. pH ایزوالکتریک پروتئین فوق 25/7 و میزان حلالیت آن درسیستم پروکاریوتی 100 درصد است. ضریب خاموشی ساختار فوق نیز به میزان  M-1cm-1 60170 تعیین شد. در نهایت و پس ازبهینه سازی کدون، شاخص انطباق کدون (CAI) پروتئین نیز به میزان 95/0محاسبه گردید.

    نتیجه گیری

     در نهایت وباتوجه به داده های فوق پیش بینی می شود که ساختار چند اپی توپی طراحی شده دراین مطالعه که دارای خصوصیات ایمونولوژیکی منحصر بفرد و قابل قبولی است را می توان با موفقیت و به میزان قابل قبولی درسیستم پروکاریوتی بیان نمود و جهت مطالعات ایمنی زایی برعلیه ویروس آنفولانزای A مورداستفاده قرار داد.

    کلید واژگان: ویروس آنفولانزا, ایمونوانفورماتیک, هماگلوتینین, مولتی اپی توپ}
    Farnaz Moghaddam, Morteza Taghizadeh, Reza Mansouri, Mehran Dabaghian
    Introduction

    According to marked advances in bioinformatics studies, development of influenza vaccines has been greatly modified in many studies. In this study, we have designed a multi-epitope recombinant protein, consisting of several conserved epitopes from Hemagglutinin protein of the H1N1 and H5N1 strains of Influenza virus by immunoinformatics approaches.

    Materials and Methods

    The registered sequences of hemagglutinin proteins from H1N1 and H5N1 strains have been analyzed and selected epitopes have been chosen and directed for further analysis. After investigation of immunological and physicochemical parameters, the selected regions were fused together by linkers and sequence of target constructs was determined following codon optimization. The target construct has been integrated into BamHI/XhoI cleavage sites of PET32a+ expression vector.

    Results

    A physicochemical analysis revealed that the designed recombinant protein has 214 amino acid with molecular weight of 22.451 kDa. The isoelectric point was determined as 7.25 , solubility of 100% and  Extinction coefficient of 60170 M-1cm-1.finally, after codon optimization, the Codon Adaptation Index (CAI) was calculated as 0.95.

    Discussion

    According to these results, it has been predicted that designed multiepitop recombinant protein has reasonable and unique immunological properties. The expressed protein could be used for future immunological studies against type A influenza virus

    Keywords: Influenza Virus, Immunoinformatics, Hemagglutinin, Multi-epitope}
  • نیلوفر راشدی، مرتضی تقی زاده*، پریسا محمدی نژاد، مهدی مهدوی، رضا جلالی راد
    مقدمه

     ویروس آنفلوانزا H1N1 به عنوان عامل بیماری زا و تهدید کننده ی حیات انسان مطرح می شود. واکسیناسیون، از راه های موثر برای پیش گیری و مهار بیماری آنفلوانزا است. تولید پروتئین نوترکیب هماگلوتینین در سیستم بیانی باکولوویروس، در بستر سلول یوکاریوت حشره (Sf9) به عنوان یک راهکار موثر پیشنهاد شده است.

    روش ها

     توالی ژن هماگلوتینین ویروس آنفلوانزا H1N1 از National Center for Biotechnology Information (NCBI) استنتاج و پس از طراحی پرایمر اختصاصی، توالی با استفاده از هضم آنزیمی در پلاسمید pFastBacHTA کلون گردید و برای تولید یک بکمید نوترکیب به سلول DH10Bac انتقال داده شد. پس از استخراج پلاسمید مربوط و تایید صحت کار، به داخل سلول حشره ترانسفکت گردید و بعد از بیان پروتئین توسط سلول Sf9، با روش Sodium dodecyl sulfate-Polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE) و Western blot، حضور پروتئین نوترکیب تایید شد.

    یافته ها

     ژن هماگلوتینین با طول 654 جفت باز در پلاسمید pFastBacHTA به کمک دو آنزیم BamHI و Xhol ساب کلون گردید. سلول حشره بعد از دریافت بکمید نوترکیب، پروتئینی به وزن تقریبی 60 کیلودالتون را بیان نمود. پس از استخراج پروتئین، با روش های SDS-PAGE و Western blot تایید انجام گرفت و با روش Lowry، غلظت پروتئین اندازه گیری شد.

    نتیجه گیری

    سیستم بیانی باکولوویروس برای تولید پروتئین هایی با ساختار پیچیده مفید است. به طور کلی، از این طرح می توان به این نتیجه رسید که این پروتئین در سلول حشره به میزان بالایی بیان می شود و به دلیل تشابه سیستم آن با سیستم انسانی، می تواند در آینده به عنوان جایگزین مناسب برای تخم مرغ های جنین دار در زمینه ی واکسیناسیون مورد استفاده قرار گیرد.

    کلید واژگان: ویروس آنفلوانزا نوع A, زیر گروه HINI, هماگلوتینین, سلول SF9, باکولوویروس}
    Niloufar Rashedi, Morteza Taghizadeh*, Parisa Mohamadynejad, Mehdi Mahdavi, Reza Jalalirad
    Background

     The H1N1 influenza virus is a highly pathogenic virus that threatens human life. Vaccination is an effective way of preventing and controlling influenza. Production of recombinant hemagglutinin in the baculovirus expression system, in the insect eukaryotic cell substrate (Sf9), has been suggested as an effective strategy.

    Methods

    The H1N1 influenza virus hemagglutinin gene sequence was prepared from National Center for Biotechnology Information (NCBI). After designing a specific primer, the sequence was provided using restriction digestion, cloned into pFastBacHTA plasmid, and transferred to the DH10Bac cell to produce a recombinant bacmid. After extracting the relevant plasmid, it was transfused into the insect cell; and after the expression of the protein by Sf9 cell, the presence of recombinant protein was confirmed using sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE) and Western blot methods.

    Findings

    The hemagglutinin gene (654 bp) was cloned in pFastBacHTA plasmid using the two enzymes of BamHI and Xhol. Sf9 cell expressed a protein weighing approximately 60 kDa after receiving the recombinant bacmid protein. The extracted protein was identified and confirmed using SDS-PAGE and Western blot methods; and protein concentration was measured by Lowry method.

    Conclusion

     The baculovirus system is useful for the production of proteins with complex structures. Generally, it can be concluded that this protein is highly expressed in insect cells. Due to the similarity of this system with the human system, it can be a suitable alternative for embryonic eggs in the future, and can be used in vaccination.

    Keywords: Influenza A virus_H1N1 subtype_Hemagglutinins_Sf9 cells_Baculovirus}
  • فاطمه خسروی نوده خسروی نوده، فریدا بهزادیان، وحیده مظاهری، حدیثه شکوهی، مریم صالح، بهرخ فرهمند*
    زمینه و هدف
    سال های اخیر ویروس آنفلوانزا نوع (H1N1) A باعث عفونت های متوسط تا شدید با میزان پراکندگی وسیع در سرتاسر دنیا شده است. بنابراین تشخیص افتراقی، سریع و ارزان قیمت بر پایه شناسایی آنتی‏ژن ها دارای اهمیت است. همچنین تولید آنتی‏بادی اختصاصی علیه آنتی‏ژن های آنفلوانزا برای موفقیت در تحقیقات پایه و پشرفته ضروری است. هماگلوتینین مهمترین گلیکوپروتئین سطحی ویروس آنفلوانزا است که به دو زیرواحد هماگلوتینین 1 و هماگلوتینین 2 شکسته می شود. از آن جایی که بیشتر مناطق آنتی‏ژنی در ناحیه هماگلوتینین 1 قرار دارند، بهره گیری از ‏این دومین به عنوان آنتی‏ژن، جهت تولید آنتی‏بادی در این پژوهش مورد مطالعه قرارگرفت.
    روش بررسی
    پروتئین نوترکیب هماگلوتینین 1 در پژوهشی تجربی با همکاری بخش آنفلوانزا انستیتو پاستور ایران در نیمه دوم سال 1393 بیان و تخلیص شد. در ادامه آنتی‏بادی پلی‏کلونال خرگوشی علیه آن در تابستان 1394 تولید شد. پروتئین هماگلوتینین 1 آنفلوانزا (A/PR/8/34) در وکتور pET28aHA1 در میزبان پروکاریتی ایشرشیاکلی BL21 در مقیاس زیاد بیان شد. با تغییر پارامترهایی مانند غلظت IPTG، زمان القاء و دمای بیان، بهینه سازی بیان صورت گرفت. سپس پروتئین با استفاده از ستون کروماتوگرافی تمایلی نیکل تخلیص شد.
    یافته ها
    تولید آنتی‏بادی‏ پلی‏کلونال علیه این پروتئین نوترکیب پس از تزریق آنتی‏ژن به همراه ادجوانت فروند بر اساس پروتکلی مشخص، در خرگوش انجام گرفت. همچنین کارایی سرم حاوی این آنتی‏بادی با استفاده از روش ELISA ارزیابی شد. تعیین میزان آنتی‏بادی در سرم خون های جمع آوری شده از خرگوش با استفاده از الایزا مبتنی بر سرم، افزایش آنتی‏بادی اختصاصی را طی دوره ایمیونیزاسیون نشان داد.
    نتیجه گیری
    با توجه به داده ها مشاهده می شود این آنتی‏بادی پلی‏کلونال ظرفیت تولید در خرگوش را داراست و می تواند در آینده در تست های تشخیص آنفلوانزا به مثابه سایر تست های ایمنی مانند وسترن بلات، ایمونوسیتوشیمی و ایمونوهیستوشیمی مورد استفاده قرار گیرد.
    کلید واژگان: آنتی بادی, ویروس آنفلوانزا انسانی, هماگلوتینین, پروتئین HA1, پلی کلونال}
    Fateme Khosravi Node, Farida Behzadian, Vahideh Mazaheri, Hadiseh Shokouhi, Maryam Saleh, Behrokh Farahmand *
    Background
    Each year, Human influenza A (H1N1) virus causes moderate to severe infections with a high prevalence throughout the world. Accordingly, the rapid, sensitive and cost-effective laboratory diagnosis based on viral antigen detection is important. Moreover, the generation of specific antibodies directed against Influenza antigens is essential to the success of both basic and applied research programs. Hemagglutinin (HA) is the major surface envelope glycoprotein of influenza virus, which is subsequently cleaved into two subunits, HA1 and HA2. Since most antigenic sites are in the HA1 domain of HA, HA1 domain of influenza virus was studied as antigen to produce polyclonal antibody.
    Methods
    In this experimental study we expressed and purified the recombinant HA1 protein in the second half of 2015 at department of influenza and other respiratory viruses, Pasteur Institute of Iran and then prepared the polyclonal rabbit antibody against it. The vector of pET28aHA1 expressing HA1-His tagged protein of H1N1 influenza A/PR/8/34 virus was used for large scale production of HA1 into E. Coli (BL21). By changing expression conditions such as IPTG (Isopropyl β-D-1-thiogalactopyranoside) concentration, time and temperature of incubation, the expression conditions for HA1 were optimized. The total cell protein harvested and purified by nickel affinity chromatography. All above mentioned experiments monitored by sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE).
    Results
    The efficiency of HA1 recombinant protein was high, equal to 400-600 mg/ml of cell lysate. The polyclonal antibody was prepared by immunizing the rabbits using recombinant HA1 with Freund’s adjuvant according to standard protocols. Efficiency of the antiserum evaluated by enzyme linked immunosorbent assay (ELISA). Determination of antibody level in the collected antiserum using serum-based ELISA showed that the specific antibody has risen well through the immunization schedule.
    Conclusion
    Our data shows that this polyclonal antibody has potential to be produced in rabbit. It will also be used in the future in influenza diagnosis as well as in other immunological applications such as western blot analyses, immunocytochemistry, and immunohistochemistry.
    Keywords: antibody, human influenza virus, hemagglutinin, HA1 protein, polyclonal}
  • سعیده صادقی نشاط، بهرخ فرهمند، زهرا کیان مهر، سمیه زمانی، مریم صالح، فاطمه فتوحی
    مقدمه
    ویروس انفلوانزا می تواند در انسان عفونت حاد تنفسی با شدت های متفاوت ایجاد کند که حتی در پاره ای از موارد، منجر به مرگ می شود. واکسن های موجود، شناساگر سر متغیر پروتئین هماگلوتینین است و بنا بر این، نیازمند به روزرسانی سالانه می باشد. به تازگی، تلاش های زیادی در جهت ساخت واکسن های وسیع الطیف بر مبنای آنتی ژن های حفاظت شده ی ویروس انفلوانزا انجام گرفته است. هدف از این مطالعه، ارزیابی ایمنی زایی زیرواحد HA2 ویروس انفلوانزای نوع A در مدل موشی بود.
    روش ها
    پروتئین نوترکیب HA2 در باکتری Escherichia coli بیان و استخراج شد و با استفاده از ستون کروماتوگرافی نیکل، تخلیص گردید. جهت حذف نمک های اضافی و اوره و بازگرداندن پروتئین به شکل اولیه، از روش دیالیز با شیب اوره کمک گرفته شد. موش های BALB/c شش تا هشت هفته ای، با پروتئین HA2 تنها و یا همراه با ادجوانت های HSP70221-604 از Leishmania major و یا Freund، به صورت تحت جلدی واکسینه شدند. در ادامه، ایمنی همورال با آزمایش(ELISA (Enzyme-linked immunosorbent assay بررسی گردید و در نهایت، موش های هر گروه با ویروس PR8 چالش شدند.
    یافته ها
    در موش های دریافت کننده ی پروتئین HA2، همراه یا بدون ادجوانت، آنتی بادی اختصاصی تولید شده بود. موش هایی که پروتئین HA2 را همراه با Freund دریافت کرده بودند، آنتی بادی اختصاصی با تیتر بالاتری تولید کردند. در حالی که، موش های دریافت کننده ی HA2 همراه با HSP70، در چالش با ویروس وحشی بهتر محافظت شده بودند.
    نتیجه گیری
    پروتئین های شوک حرارتی باعث القای پاسخ آنتی بادی شده، ایمنی ذاتی را نیز تحریک می کنند. نتایج این پژوهش نشان داد که پروتئین HA2 به تنهایی و یا همراه با HSP70 قادر است، موش ها را در برابر چالش با دوز کشنده ی ویروس محافظت نماید و می تواند، به عنوان یک واکسن واحد در نظر گرفته شود.
    کلید واژگان: ویروس انفلوانزا, هماگلوتینین, HA2, Freund, HSP70, Leishmania major}
    Saeideh Sadeghi Neshat, Behrokh Farahmand, Zahra Kianmehr, Somayeh Zamani, Maryam Saleh, Fatemeh Fotouhi
    Background
    Influenza viruses cause acute respiratory infections in humans, which can often be accompanied by pandemics with varying rates of illness and even a fetal end. Current vaccines target the variable globular part of hemagglutinin (HA); so, their effectiveness is limited and they need perpetual updating. To prepare universal vaccine, scientist's effort is focused on conserved antigenic parts of influenza virus such as hemagglutinin stalk domain which is more conserved compare to its globular head. The aim of this study was evaluating the immunogenicity of influenza A (H1N1) HA2 peptide in mouse model.
    Methods
    To prepare HA2 protein, the expression vector encoding the gene of interest (PET-28a/HA2), was transformed into Escherichia coli BL21-DE3 competent cells. Recombinant HA2 protein was extracted and purified using Ni-TED columns under denaturing conditions, refolded and desalted via step-wise dialysis. The HA2 concentration was determined via using Bradford protein assay. Six-week-old BALB/c mice in different groups were immunized intradermally with HA2 alone or supplemented with Freund or Lm.HSP70221-604 as adjuvants. Two groups were injected with HSP70 and phosphate buffered saline (PBS) as negative controls. Humeral immunity in vaccinated mice was measured using the enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA); and finally, mice were challenged with one lethal dose (LD90) of PR8 virus.
    Findings
    The protein expression, extraction and purification stages were confirmed using sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel (SDS-PAGE) electrophoresis. The highest antibody response was measured in mice vaccinated with HA2-Freund, as expected. Specific antibody response in group received HA2-HSP70 was of higher titer than HA2 alone. More over HA2-HSP70 group surprisingly showed higher level of protection against lethal H1N1 (PR8) challenge compared to other groups.
    Conclusions
    It has been proved that HSP70 can induce specific response and innate immunity via stimulating CD8+ T-Cells, CD40, TLR2, TLR4 and cytokine secretion. Our results showed that HA2 alone or supplemented with HSP70 protected mice against lethal influenza challenge and could be considered as a universal vaccine.
    Keywords: Influenza virus, Hemagglutinin, HA2 peptide, Freund adjuvant, Leishmania major HSP70}
  • سمیه زمانی، فاطمه فتوحی چاهوکی، زهرا نورمحمدی، سعیده صادقی نشاط، وحیده مظاهری، علی ترابی، بهرخ فرهمند*
    زمینه و هدف

    ویروس آنفلوآنزا یکی از عوامل مرگ ومیر بالا در جهان است. پژوهشگران به استفاده از آنتی ژن های حفاظت شده این ویروس (مانند زیرواحد کوچک مولکول گلیکوپروتئین هماگلوتینین) به منظور ساخت واکسن و پژوهش های سرولوژیک توجه خاص دارند. این پژوهش با هدف تولید آنتی بادی های پلی کلونال علیه HA2 با کارایی لازم اجرا شد.

    روش بررسی

    این پژوهش از نوع علوم پایه (در زمینه تولید فرآورده) بود و از مهر 1392 تا خرداد 1393 در بخش آنفلوآنزا انستیتو پاستور تهران انجام شد. پروتئین نوترکیب HA2 به همراه ادجوانت فروند از طریق عضلانی به خرگوش تزریق شد و کارایی سرم خرگوش به وسیله تست های نفوذ شعاعی (Radial immunodiffusion، RID) و وسترن بلاتینگ بررسی شد.

    یافته ها

    در تست RID خط و هاله رسوبی مشاهده شد. همچنین نتایج وسترن بلاتینگ برای آنتی سرم HA2 مثبت بود.

    نتیجه گیری

    نتایج این پژوهش نشان داد که آنتی بادی علیه پروتئین HA2 تولید و پاسخ ایمنی هومورال به خوبی القا گردیده است.

    کلید واژگان: ویروس آنفلوآنزا, پروتئین HA2, آنتی بادی, پلی کلونال, هماگلوتینین, ایمونودیفیوژن, وسترن بلاتینگ}
    Somayeh Zamani, Fatemeh Fotouhi Chahouki, Zahra Nourmohammadi, Saeideh Sadeghi Neshat, Vahideh Mazaheri, Ali Torabi, Behrokh Farahmand
    Background

    The influenza virus is one of the most important factors for higher morbidity and mortality in the world. Recently, researchers have been focused on influenza conserved antigenic proteins such as hemagglutinin stalk domain (HA2) for vaccine production and serological studies. The HA2 plays a major role in the fusion of the virus with host cells membrane. The immunity system enables to produce antibody against HA2. The aim of this study is polyclonal antibody production against influenza HA2.

    Methods

    This study was done in the Influenza Research Lab, Pasteur Institute of Iran, Tehran for one year from September 2013 to October 2014. In the present study, recombinant HA2 protein was produced in prokaryotic system and purified using Nickel affinity chromatography. The purified HA2 was mixed with Freund’s adjuvant (complete and incomplete) and injected into two New Zealand white rabbits by intramuscularly and subcutaneously routes. Immunization was continued for several months with two weeks interval. Before each immunization, blood was drawn by venous puncture from the rabbit ear. Function of rabbit's sera was evaluated using radial immunodiffusion (RID) in both forms, Single RID (SRID) and Double RID (DRID). Finally, antiserum activity against HA2 was evaluated using western blotting as serological assay.

    Results

    Sedimentary line and zone was observed in RID assays (SRID and DRID) represent interaction between HA2 protein and anti- HA2 antibody. As well as, western blotting results was positive for HA2 protein. Therefore, these results showed that polyclonal antibody produced against HA2 protein can identify HA2 protein antigenic sites.

    Conclusion

    These findings show that humoral immune responses have properly been stimulated in rabbits and these antibodies can identify HA2 protein and may be suitable for other serological methods.

    Keywords: antibody, HA2 protein, hemagglutinins, immunodiffusion, influenza virus, polyclonal, western blotting}
  • سیده فهیمه موسوی، فاطمه فتوحی *، آتنا یوسفی، بهرخ فرهمند، بهناز حیدرچی، رضوان توکلی، معصومه توسطی خیری
    زمینه
    ویروس انفلوانزا پاتوژن تنفسی مهمی است که سالانه منجر به درصد بالایی از بیماری و مرگ ومیر می شود. ویروس جدید A/H1N1 (Novel) که در سال 2009 جمعیت زیادی از مردم جهان را درگیر کرد، از بازآرایی ژنوم سه نوع ویروس انفلوانزای انسانی، خوکی و پرندگان به وجود آمده است. با توجه به نقش مهم هماگلوتینین (HA) در عفونت زایی ویروس انفلوانزا، تعیین توالی ژنوم این پروتئین و بررسی تغییرات آن ضروری به نظر می رسد. در این مطالعه ژن HA ویروس A/H1N1 Novel جدایه ی ایران جداسازی و بررسی گردید.
    مواد و روش ها
    در این مطالعه آزمایشگاهی، ژنوم ویروس از نمونه های مستقیم بیمار مبتلا به انفلوانزای Novel AH1N1 که با روش Real-timePCR و بر پایه پروتکل بین المللی در آزمایشگاه تحقیقات انفلوانزای انستیتو پاستور به تایید رسیده بودند، استخراج شد و طول کامل ژنوم HA با استفاده از پرایمرهای اختصاصی به روش One step-RT-PCR تکثیر یافت. ژنوم تکثیر یافته بعد از کلونینگ در ناقل pGEM-T Easy، با آنالیز آنزیمی و تعیین توالی تایید گردید.
    یافته ها
    طول کامل ژن بیان کننده پروتئین HA به کمک PCR از نمونه های بیمار جدا شد و پس از الکتروفورز و مشاهده قطعه مورد انتظار 1777 جفت بازی، استخراج از ژل صورت گرفته و سپس در ناقل pGEM-T Easy کلون و تعیین ترادف شد. توالی حاصله با استفاده از نرم افزار chromas ویرایش 45/1 مورد بررسی قرار گرفت و نهایتا با کد دستیابی «1/419001 HQ»در بانک ژنی ثبت گردید.
    نتیجه گیری
    نتایج آنالیز نوکلئوتیدی نشان داد که توالی فوق با تمام سکانس های گزارش شده از سراسر دنیا از جمله سویه توصیه شده برای واکسن مطابقت دارد.
    کلید واژگان: انفلوانزا, هماگلوتینین, پاندمی 2009, توالی یابی, بانک ژن}
    Seyyedeh Fahimeh Mousavi, Fatemeh Fotouhi *, Atena Yousefi, Behrokh Frarahmand, Behnaz Heydarchi, Rezvan Tavakoli, Masoomeh Tavassoti Kheiri
    Background
    Influenza virus is a globally important respiratory pathogen causing high degree of morbidity and mortality annually. The novel Influenza virus (A/H1N1) which involved many populations of the world in 2009 is a sort of triple reassortment between swine، bird and human viruses. Given the important role of hemagglutinin in the infectivity of influenza virus، genome sequencing of this protein and investigation of its changes seems necessary.
    Material And Method
    In this experimental study، the viral genome was extracted from clinical throat swab samples، in which the presence of swine influenza genome has been confirmed by Real-time PCR according to WHO protocol in Influenza Research Lab، Pasteur Institute of Iran. Full-length of HA genome was amplified using specific primers by one step-RT-PCR، cloned into pGEM-T Easy vector followed by identification with restriction enzyme analysis and sequencing.
    Results
    Full genome of novel influenza A/H1N1 from clinical samples was amplified by PCR and the expected 1777 bp segment PCR product was visualized by electrophoresis، gel purified، cloned into pGEM-TEasy vector and then sequenced. Analysis of sequencing was accomplished by chromas software (version 1. 45-Australia) and the nucleotide sequence data was deposited in GenBank database under the accession number: “HQ419001. 1”.
    Conclusion
    The result of sequencing was well-matched with the recommended vaccine strain and other registered sequences in NCBI.
    Keywords: Influenza A, Hemagglutinin, Pandemic Flu 2009, sequencing, gene bank}
  • سمانه حسین زاده، فاطمه فتوحی، بهرخ فرهمند، مریم صالح، آتنا یوسفی، بهناز حیدرچی، معصومه توسطی خیری
    هدف
    ویروس آنفلوانزای A (H1N1) از مهم ترین زیرگونه های ویروس آنفولانزاست که منجر به پیامدهای متعددی در جهان شده است. هماگلوتینین یکی از مهم ترین آنتی ژن های این ویروس می باشد که باعث ایجاد پاسخ ایمنی می شود. اتصال این پروتئین به گیرنده های سلول میزبان منجر به شروع فرایند بیماری زایی می شود.
    با توجه به نقش حیاتی مرحله اتصال ویروسی، این پژوهش درصدد استخراج و جای سازی ژن هماگلوتینین و زیرواحد بزرگ آن (HA1) با هدف تولید شاتل ناقل نوترکیب باکیولوویروس (بکمید) برای تولید پروتئین نوترکیب در سلول های حشره است.
    مواد و روش ها
    RNA ویروس آنفلوانزای انسانی A/New Caledonia 99/20/(H1N1) در کشت سلولی MDCK تکثیر شده و RNA کامل ویروسی توسط محلول Easy–red تخلیص شد. سپس طول کامل ژن هماگلوتینین و ژن HA1 توسط روش RT-PCR و آغازگرهای اختصاصی تکثیر و ابتدا در ناقل pGEM-TEasy و سپس در پلاسمید pFastBac HT جای سازی شد. در نهایت بکمید نوترکیب واجد ژن های فوق در سلول های میزبان DH10Bac تولید شد.
    نتایج
    محصولات PCR ژن هماگلوتینین با الکتروفورز روی ژل آگارز و هضم با آنزیم های محدودالاثر ارزیابی شد. ناقل نوترکیب pGEM-Teasy و پلاسمید دهنده نوترکیب pFastBac HT توسط روش PCR، هضم آنزیمی و تعیین ترادف تایید شد. تولید DNA نوترکیب بکمیدی نیز توسط افتراق کلونی های آبی-سفید، الکتروفورز روی ژل آگارز 7/0 درصد، PCR با استفاده از آغازگرهای اختصاصی و آغازگرهای pUC/M13 مورد تایید قرار گرفت.
    نتیجه گیری
    در این پژوهش، بکمید نوترکیب واجد ژن هماگلوتینین و زیرواحد بزرگ آن با موفقیت ساخته شد. در ادامه سلول های حشرات به منظور تولید باکیولوویروس نوترکیب با سازه های فوق ترانسفکت شده و پروتئین های نوترکیب برای مطالعات آتی تولید خواهد شد.
    کلید واژگان: DNA نوترکیب, باکیولوویروس, هماگلوتینین, واکسن زیرواحدی}
    Samaneh Hossainzadeh, Fatemeh Fotouhi, Behrokh Farahmand, Maryam Saleh, Atena Yousefi, Behnaz Heydarchi, Masoumeh Tavassoti Kheiri
    Objective
    Influenza virus A (H1N1) is an important subtype of the influenza respiratory viruses, which has important worldwide implications. Hemagglutinin (HA), an important viral antigen, is responsible for binding to human cell receptors leading to an onset of the disease process. Considering the critical role of viral attachment, this study focuses on the extraction and cloning of HA and its large subunit HA1 genes to generate recombinant baculovirus shuttle vectors (bacmid) in order to produce recombinant proteins in insect cells.
    Methods
    Human influenza virus A/New Caledonia 99/20/(H1N1) was propagated in MDCK cell culture. Total viral RNA was extracted using easy-red solution. The full-length HA genome and HA1 fragment were amplified by RT- PCR using specific primers, cloned into a pGEM®-TEasy vector, and then subcloned into a pFastBac HT plasmid. Finally, recombinant bacmids that contained the genes of interest were produced in E. coli DH10Bac™ cells.
    Results
    Expected PCR products of HA genes were evaluated through gel electrophoresis and restriction enzyme analysis. Recombinant pGEM®-TEasy vectors and pFastBac HT donor plasmids were confirmed by PCR, digestion, and sequencing. Construction of recombinant bacmid DNA was verified by using blue-white colony screening, overnight electrophoresis, and PCR analysis that used either pUC/M13 or gene-specific primers.
    Conclusion
    In this study, we have successfully constructed recombinant Bacmid DNA that encoded the full-length HA genome and its HA1 subunit. We intend to transfect sf9 insect cells with these constructs to generate recombinant baculovirus and produce large amounts of desired proteins for future studies.
    Keywords: Recombinant DNA, Baculovirus, Hemagglutinin, Subunit Vaccine}
  • بهرخ فرهمند، مهوش خدابنده، فریدون مهبودی، فاطمه فتوحی، فرزانه برخورداری، مریم صالح، معصومه توسطی خیری
    زمینه هدف
    آنفلوآنزا بیماری مسری عفونت دستگاه تنفسی است که در فصل های سرد سال شیوع پیدا می کند. شیوع ویروس جدید آنفلوآنزا A(H1N1) در سال 2009 که جمعیت کثیری از مردم جهان را درگیر کرد، مرگ و میر قابل توجهی در پی‎داشت. مولکول همآگلوتینین که اصلی‎ترین گلیکوپروتئین سطحی ویروس آنفلوآنزا است، یکی از ارکان مهم در تهیه کیت‎های تشخیصی و واکسن‎های موثر بر علیه این بیماری است. لذا تهیه بانک ژن سویه های شایع به منظور دسترسی سریع به مقدار انبوه این مولکول بسیار ضروری می‎باشد.
    مواد و روش‎ها: این مطالعه از نوع پژوهشی- کاربردی می باشد. اولین قدم برای تهیه چنین بانکی، جداسازی ژن کامل همآگلوتینین و زیر واحدهای آن با استفاده از پرایمرهای اختصاصی وکلونینگ آنها در ناقلهای مناسب است. در این راستا ابتدا با استفاده از ژنوم ویروس استاندارد (A/NewCaledonia/20/99(H1N1)) کشت داده شده در سلول MDCK، ژن کد کننده همآگلوتینین به روش RT-PCR تکثیر و در ناقل مناسب کلون گردید.
    یافته ها: جداسازی و کلونینگ ژن همآگلوتینین با روش PCR، هضم آنزیمی و تعیین ترادف نوکلئوتیدی تایید گردید. با استفاده از پرایمرهای ویژه کلونینگ، سازه های مختلف واجد ژن همآگلوتینین مورد نظر به منظور بیان ژن در سلول حشره و باکتری اشریشیا کلی، تهیه گردید.
    نتیجه گیری
    نتایج به دست آمده نشان دهنده تطابق کامل قطعات ژنی استخراج شده با همآگلوتینین ویروس آنفلوآنزای 20/99(H1N1) A/New Caledonia است که استفاده ازاین منبع ژنی، اهداف خاص از قبیل کلون کردن در وکتورهای بیانی مختلف یوکاریوتی و پروکاریوتی را امکان پذیر می‎سازد.
    کلید واژگان: آنفلوآنزا, بانک ژن, همآگلوتینین}
    Behrokh Farahmand, Mahvash Khodabandeh, Fereidoun Mahboudi, Fatemeh Fotouhi, Farzaneh Barkhordari, Maryam Saleh, Masoumeh Tavasoti Kheiri
    Background
    Influenza is a contagious respiratory infectious disease out breaking in cold seasons of the year. The outbreak of the new influenza A (H1N1) virus in 2009 involved large populations of the world with considerable mortality. Hemagglutinin (HA) molecule, the main surface glycoprotein of the influenza virus, is one of the key factors for serological diagnostic kits and vaccine development. Thus establishment of HA gene bank of the circulating influenza viruses is essential in gaining quick access to large amounts of protein.
    Materials And Methods
    The first step in providing such a bank is detection and isolation of HA full genome and its subunits by using specific primers and cloning them in proper vectors. For this purpose, using standard virus genome (A/New Caledonia/20/99(H1N1)) cultured on MDCK cell, HA coding gene was proliferated by RT-PCR using specific primers.
    Results
    Isolation and cloning of the HA gene was verified by RT-PCR, enzyme digestion and determining nucleotide synonymy. Through the use of specific cloning primers, different HA gene constructs were propagated for expression of the gene in insect cells and E.coli bacteria.
    Conclusion
    The results indicated the complete compatibility of the extracted HA gene with the influenza (A/New Caledonia/20/99(H1N1)) hemagglutinin. It makes it possible to use the gene as a source of cloning in a variety of eukaryotic and prokaryotic expression systems
  • اسماعیل صابرفر، محمد مهدی فرقانی فرد
    هدف
    راه اندازی روش ملکولی RT-PCR برای شناسایی اختصاصی ویروس های آنفلوانزا تایپ A و ساب تایپ H7
    روش بررسی
    بر روی 6 نمونه ویروس استاندارد آنفلوانزا تایپ A با استفاده از پرایمرهای مربوط به ناحیه ای از ژن ماتریکس (M) و همچنین پرایمرهای اختصاصی مربوط به ژن هماگلوتینین (HA) ساب تایپ H7 واکنش RT-PCR انجام گردید. در این راستا با سنتز DNA مکمل (cDNA) از قطعات ژن M و HA، از آن به عنوان الگو برای واکنش PCR استفاده شد.
    یافته ها
    قطعات تکثیر شده هدف مربوط به ژنهای M و HA به طول bp 101 و bp 98 بر روی ژل آگارز با افزودن اتیدیوم بروماید در طول موج 254 نانومتر در دستگاه ترانس ایلومیناتور مشاهده گردید. باند مربوط به ژن M در تمامی ویروسهای تایپ A آنفلوانزا تایید کننده تایپ A و باند مربوط به ژن HA اختصاصی ساب تایپ H7 تایید کننده ساب تایپ مربوطه است.
    نتیجه گیری
    روش مولکولی RT-PCR برای شناسایی ویروس آنفلوانزای تایپ A و ساب تایپ H7 آن روشی مناسب، سریع و اختصاصی می باشد. در صورت بروز احتمالی انواع خطرناک آنفلوانزا، این روش تشخیصی می تواند مورد استفاده قرار گیرد.
    کلید واژگان: آنفلوانزا, هماگلوتینین, H7, RT-PCR}
نمایش نتایج بیشتر...
نکته
  • نتایج بر اساس تاریخ انتشار مرتب شده‌اند.
  • کلیدواژه مورد نظر شما تنها در فیلد کلیدواژگان مقالات جستجو شده‌است. به منظور حذف نتایج غیر مرتبط، جستجو تنها در مقالات مجلاتی انجام شده که با مجله ماخذ هم موضوع هستند.
  • در صورتی که می‌خواهید جستجو را در همه موضوعات و با شرایط دیگر تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مجلات مراجعه کنید.
درخواست پشتیبانی - گزارش اشکال