جستجوی مقالات مرتبط با کلیدواژه "fam83h protein" در نشریات گروه "پزشکی"
-
مجله علمی دانشگاه علوم پزشکی کردستان، سال بیست و هفتم شماره 4 (پیاپی 121، مهر و آبان 1401)، صص 35 -45
زمینه و هدف:
پروتیین Fam83h یک پروتیین غیر ترشحی است که از طریق N-ترمینال خود با کازیین کیناز 1 آلفا 1 (CSNK1A1) برهمکنش دارد.
مواد و روش هادر این مطالعه، دومین های C-ترمینال در Fam83hFam83h، در انسان و موش با استفاده از نرم افزار I-TASSER برای پیش بینی ساختار و عملکرد پروتیین مدل سازی شدند. شبیه سازی دینامیک مولکولی توسط نسخه5.0.2 نرم افزار گرومکس (GROMACS) برای بررسی رفتارهای پروتیین در طی زمان انجام شد. سپس برای هر مدل پس از انجام شبیه سازی مولکولی، آنالیز FEL صورت گرفت و داکینگ پروتیین-پروتیین برای بررسی برهمکنش C-ترمینال پروتیین Fam83h با کراتین-5 اسکلت سلولی به عنوان مدلی از کراتین سلولی توسط PIPER انجام شد.
یافته هانتایج نشان داد که پروتیین انسانی پایدارتر و فشرده تر از موش است. علاوه بر این، ارزیابی برهم کنش بین C ترمینال پروتیین های Fam83h و کراتین-5 در موش نشان داد که آمینواسیدهای آرژنین 378، پرولین391، سرین 663، گلوتامات 710 و آرژنین 923 در پروتیین Fam83h موش به ترتیب با لوسین474،آرژنین417، تیروزین453، گلوتامات397، گلوتامین396 و گلوتامات390 در کراتین-5 اسکلت سلولی موش پیوند هیدروژنی ایجاد می کنند. پروتیینFam83h انسان و کراتین-5 انسانی نیز از طریق آمینو اسیدهای تراونین433، هیستیدین447 و آرژنین477 و لوسین473، گلایسین476، گلوتامات420، آرژنین407 پیوندهای هیدروژنی تشکیل می دهند.
بحث:
طبق مطالعات انجام شده قبلی، پروتیین Fam83h با کراتین اسکلت سلولی برهمکنش داشته و در پیشرفت سرطان نقش دارد. می توان نتیجه گرفت که پروتیین Fam83h می تواند به طور مستقیم با رشته های کراتین از طریق C-ترمینال خود برهمکنش داشته باشد؛ بنابراین، فرضیه ما درIn-silico ، این است که اختلال در C-ترمینال پروتیین Fam83h ممکن است منجر به اختلال در بسته بندی کراتین اسکلت سلولی به عنوان مکانیسمی در پیشرفت سرطان شود.
کلید واژگان: پروتئین Fam83h, کراتین-5, شبیه سازی دینامیک مولکولیBackground and AimFam83h Protein is a non-secretory protein that interacts with Casein Kinase1Alpha1(CSNK1A1) through its N-terminal.
Materials and MethodsIn this study, the C-terminal domains of Fam83h in human and mouse were modeled using the I-TASER software for prediction of protein structure and function. The molecular dynamics (MD) simulations were performed by GROMACS version 5.0.2 to investigate their temporal behavior. FEL analysis was done for each model after MD. Protein-protein docking was done by PIPER to investigate the interaction of Fam83h C-terminal with cytoskeletal keratins5 as a cellular keratin model.
ResultsThe results showed that the human protein is more stable and compact than the mouse protein. Assessment of the interaction between the C-terminal of the mouse Fam83h and Keratin-5 proteins showed the residues Arg378, Pro391, Ser663, Glu710, Arg923 in mouse Fam83h protein made hydrogen bonds with Leu474, Arg417, Tyr453, Glu 397, Gln 396 and Glu 390 of the chain A and B of mouse keratin-5, respectively. Human Fam83h and keratin 5 form hydrogen bonds via residues of Thr433, His447 and Arg477 and Leu473, Gly476, Glu420 and Arg407.
ConclusionAccording to the previous experimental reports, Fam83h can interact with keratin cytoskeleton and has a role in cancer progression. It can be concluded that Fam83h protein can directly interact with keratin filaments through its C-terminal. Therefore, our hypothesis based on in-silico study is: non-sense mutation in C-terminal of Fam83h protein may lead to truncated protein and subsequently disruption of keratin cytoskeleton bundling which can be regarded as a mechanism involved in cancer progression.
Keywords: Fam83h Protein, Keratin-5, CSNK1A1, Molecular Dynamics Simulation
- نتایج بر اساس تاریخ انتشار مرتب شدهاند.
- کلیدواژه مورد نظر شما تنها در فیلد کلیدواژگان مقالات جستجو شدهاست. به منظور حذف نتایج غیر مرتبط، جستجو تنها در مقالات مجلاتی انجام شده که با مجله ماخذ هم موضوع هستند.
- در صورتی که میخواهید جستجو را در همه موضوعات و با شرایط دیگر تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مجلات مراجعه کنید.