به جمع مشترکان مگیران بپیوندید!

تنها با پرداخت 70 هزارتومان حق اشتراک سالانه به متن مقالات دسترسی داشته باشید و 100 مقاله را بدون هزینه دیگری دریافت کنید.

برای پرداخت حق اشتراک اگر عضو هستید وارد شوید در غیر این صورت حساب کاربری جدید ایجاد کنید

عضویت

جستجوی مقالات مرتبط با کلیدواژه « flash pcr » در نشریات گروه « پزشکی »

  • Alireza Moradabadi, Azam Ahmadi, Manijeh Kahbazi *, Hossein Sarmadian, Mohammad Arjomandzadegan
    Background
    Brucella spp. are Gram-positive, rod-shaped, and spore-forming bacilli. Brucella abortus and B. melitensis are the main causes of brucellosis.
    Objectives
    The aim of the study was to establish a rapid and simple molecular method for the detection of this disease.
    Methods
    Forty-five Brucella spp. were isolated from blood samples using the BACTEC Fluorescent 9050 system and were detected by anti-IgM or IgG Brucella specific antigen. DNA extraction was conducted on all samples. Fluorescent amplification based specific hybridization (FLASH-PCR) test was utilized to detect the 351-bp fragment from eryD gene, which was specific for Brucella spp.
    Results
    A 351-bp fragment resulted from PCR reaction and showed the accuracy of designed primers. This fragment was successfully amplified in the FLASH-PCR reaction. In this study, we have positive and negative samples and a standard method. In addition, we calculated the sensitivity and specificity of this method as 100%.
    Conclusions
    Results of the study was proved that the FLASH-PCR method was a rapid, sensitive, and safe method for the detection of Brucella genome in whole blood samples of patient harbored brucellosis and is recommended for routine usage.
    Keywords: Brucellosis, Brucella, FLASH-PCR}
  • علیرضا مرادآبادی، محمد ارجمندزادگان*، نوید امامی، منیژه کهبازی، اعظم احمدی، سعید فلاحت، سید حسین حسینی، مهدی کارگران، پریسا خسروی
    زمینه و هدف
    رنگ آمیزی های زیل نلسون، فلوئورسنت و نیز کشت، روش های استاندارد تشخیص بیماری سل هستند. در این تحقیق، کارائی روش Flash PCR با روش مرسوم کشت مقایسه شد.
    مواد و روش ها
    تعداد 56 نمونه خلط از بیماران مشکوک به سل پس از ارزیابی با روش زیل نلسون و کشت در لوون اشتاین جانسن، به روش چلکس تحت استخراج DNA قرار گرفتند. جهت بررسی مولکولی از کیت مخصوص Flash PCR که محتوی پروب ها و پرایمرها برای تکثیر ژن IS6110 بود، استفاده شد. کنترل مثبت و کنترل منفی موجود در کیت به کار گرفته شد و دستگاه MTC410، جهت تکثیر و دستگاه FD-12 جهت بررسی نتایج مورد استفاده قرار گرفتند. علاوه بر این، نمونه ها با کمک ژل آگارز نیز الکتروفورز شدند.
    یافته ها
    از 56 نمونه خلط بیماران مشکوک به سل، تعداد 20 نمونه در ارزیابی میکروسکوپی و کشت، مثبت و 36 نمونه منفی بودند. هم چنین، بررسی مولکولی با استفاده از روش FLASH-PCR مشخص کرد که تمامی 20 نمونه مثبت، در این روش مولکولی نیز مثبت شدند. به علاوه، 3 نمونه خلط که با روش کشت و رنگ آمیزی منفی شده بودند در روش FLASH-PCR مثبت شدند. یکی از 3 بیمار مورد بحث با نظر پزشک تحت درمان حمله ای برای درمان سل با دریافت آنتی بیوتیک های ایزونیازید، پیرازینامید و اتامبوتول قرار گرفت. تمامی نتایج با کمک الکتروفورز معمول نیز تایید گردیدند.
    نتیجه گیری
    مواردی که احتمالا به دلیل تعداد باکتری اندک در نمونه یا نقص در نمونه برداری، منفی می شوند، با روش FLASH-PCR امکان مثبت شدن آن ها وجود دارد. بنابراین، با توجه به هزینه اندک، برای استفاده روتین پیشنهاد می شود.
    کلید واژگان: بیماری سل, مایکوباکتریوم توبرکلوزیس, تشخیص, روش Flash PCR, روش کشت}
    Ali Reza Morad Abadi, Mohammad Arjomandzadegan*, Navid Emami, Manijeh Kahbazi, Azam Ahmadi, Saeed Falahat, Seyyed Hossein Hosseini, Mehdi Kargaran, Parisa Khosravi
    Background and Aim
    Ziehl Nelson staining, fluorescent and also culture are the standard methods for the diagnosis of tuberculosis. In this study, the performance of conventional cultivation methods was compared with Flash PCR.
    Materials and Methods
    A total of 56 sputum samples from patients with suspected tuberculosis in Tuberculosis Center of Arak city were collected and Ziehl–Neelsen and culture in Löwenstein–Jensen medium were accomplished. Moreover, DNA from all of the 56 sputum samples was extracted by Chelex100 method. Molecular evaluation was accomplished by Flash PCR kit containing probes and primers for gene amplification IS6110. Positive and negative controls together with samples were used in a MTC410 apparatus for amplification. FD-12 apparatus was used to evaluate the results. In addition, electrophoresis on agarose was used for confirmation of the results.
    Findings: From 56 sputum samples of suspected TB patients, 20 samples were positive and 36 samples were negative on microscopic evaluation and culture methods. FLASH-PCR molecular analysis showed that all of 20 positive samples were positive in molecular methods, too. On the other hand, three of sputum samples that were negative by culture and staining were positive in FLASH-PCR method. One of these 3 patients, received Isoniazid, pyrazinamide and ethambutol antibiotic by responsible medicine. All results were confirmed using conventional electrophoresis.
    Conclusion
    In some negative samples, possibly because of the small number of bacteria in sample or a defect in the sampling, the Flash PCR may due good advantages. Therefore, due to the low cost, this method is recommended for routine use
    Keywords: Tuberculosis, Mycobacterium tuberculosis, Detection, Flash PCR, Culture method}
  • علیرضا مرادآبادی، علیرضا فارسی نژاد، مریم فکری صوفی آبادی*
    زمینه وهدف
    لیشمانیوز یک بیماری انگلی تک یاخته ای است که به عنوان یک معضل بهداشتی در بسیاری از کشورها مطرح است.هدف از این مطالعه، تشخیص عفونت انگل در انسان به منظور شناسایی اپیدمیولوژیک و ارائه برنامه کنترل با استفاده از پرایمر اختصاصی مشترک طراحی شده در سه گونه لیشمانیا است.
    مواد و روش ها
    30 نمونه ایزوله شایع انگل لیشمانیا از مراکز مختلف در ایران جمع آوری شد. DNA این ایزوله ها پس از کشت در محیط Rpmi1640 استخراج و ژن ITS2-rRNA با استفاده از PCR تکثیر یافت. امپلیکون ها توسط الکتروفورز در ژل آگارز 2 درصد مورد بررسی قرار گرفتند. از روش FLASH PCR نیز، یک پروب اختصاصی و رنگ فلورسانس به منظور بررسی وجود یا عدم وجود امپلیکون به کار گرفته شد.
    یافته ها
    نتایج حاصل از روش هایPCR و FLASH PCRنشان می دهند این دو روش دارای دقت و حساسیت قابل قبولی برای شناسایی لیشمانیا هستند.
    نتیجه گیری
    تعیین آلودگی انگل لیشمانیا با استفاده از جفت پرایمر اختصاصی موفقیت آمیز بود و روش TaqMan می تواند یکی از حساس ترین روش های تشخیصی برای شناسایی کیفی انگل در ناحیه ی ITS2 لیشمانیا باشد.
    کلید واژگان: لیشمانیاPCR, ITS2, rRNA, FLASH PCR}
    Alireza Moradabadi, Alireza Farsinezhad, Maryam Fekri Soofiabadi *
    Background
    Leishmaniasis is a protozoan parasitic disease and a global health problem. The aim of this study is to diagnose the parasitic infection in humans for epidemiological identification and providing control programs using proprietary co-designed primers in three species of Leishmania.
    Materials And Methods
    30 common Leishmania isolates were gathered from different centers in Iran. Having been cultured in RPMI-1640 Medium, DNA was extracted and the gene ITS2-rRNA was amplified by PCR. The amplicons were examined by electrophoresis on agarose gel 2%. Also, in FLASH PCR method, a specific probe and florence colour were used to investigae the amplicon existence on sample.
    Results
    The results of the investigations by PCR and FLASH PCR methods show that these methods are sensitive and specific for diagnosis of Leishmania
    Conclusion
    In this study, identification of Leishmania parasite using specific primer pairs was successful and TaqMan could be one of the most sensitive diagnostic methods to identify parasite load for the ITS2 region of Leishmania.
    Keywords: FLASH PCR, ITS2, rRNA, Leishmania, PCR}
نکته
  • نتایج بر اساس تاریخ انتشار مرتب شده‌اند.
  • کلیدواژه مورد نظر شما تنها در فیلد کلیدواژگان مقالات جستجو شده‌است. به منظور حذف نتایج غیر مرتبط، جستجو تنها در مقالات مجلاتی انجام شده که با مجله ماخذ هم موضوع هستند.
  • در صورتی که می‌خواهید جستجو را در همه موضوعات و با شرایط دیگر تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مجلات مراجعه کنید.
درخواست پشتیبانی - گزارش اشکال