جستجوی مقالات مرتبط با کلیدواژه « نواربندی گیمسا » در نشریات گروه « پزشکی »
-
زمینه و هدف
یکی از مهم ترین اهداف تحقیقات در سرطان شناسی کشف تغییرات کروموزومی است که در تشکیل سلو ل های نیوپلاستیک و تومورهای بدخیم دخالت دارد. سرطان پوست در ایران بر طبق گزارش کشوری رتبه اول را در بین زنان ایران دارد. در این تحقیق به مطالعه سرطان پوست القایی در موش های نژاد SD پرداخته می شود و با روش های اینفورماتیک نواحی مشابه آنها در کروموزوم های انسان و همچنین مهم ترین ژن های کاندید در آن نواحی گزارش می گردد.
روش کاردر این پژوهش از موش صحرایی نژاد SD به عنوان مدل حیوانی جهت القاء سرطان پوست استفاده گردید که طی آنmg 10 از ماده کارسینوژنیک DMBAمحلول شده در روغن کنجد به رت های تحت تیمار به روش زیر جلدی تزریق گردید. از تومور های بدست آمده برای کشت سلولی و تهیه کروموزوم های متافازی استفاده شد. بعد از رنگ آمیزی به روش GTG، کروموزوم های متافازی رنگ شده با ایدیوگرام موش صحرایی طبیعی مقایسه گردید. با مطالعه کروموزوم های متافازی، مشترک ترین تغییرات کروموزومی بین مجموعه های کروموزومی ثبت گردید. بر اساس چگونگی تغییرات و محل آن ها و با کمک پایگاه های اطلاعاتی، لیستی از ژن ها وهمچنین نقش احتمالی آن ها با توجه به روش مقایسه ژنومیک بین موش صحرایی و انسان تهیه شد.
یافته هاتغییرات کروموزومی ایجاد شده طیف وسیعی از ناهنجاری های عدی و ساختاری را شامل گردید و بطور واضح، قطعاتی از کروموزوم های شماره 5، 8 و 9 دچار حذف شدگی و همجنین بخش هایی از کروموزوم شماره 7 دچار اضافه شدگی ساختاری گردیده بودند. همچنین با استفاده از روش سیتوژنتیک مولکولی فیش کاهش تعداد نسخه های ژنی در ژن های CDKN2B و KLF4 در کروموزوم 5 رت های تیمار شده نشان داده شد.
نتیجه گیریبا استفاده از روش های مقایسه ژنومیک و مطالعه مقالات علمی در ارتباط با ژن های مستقر در نواحی کروموزومی تغییر یافته، پیشنهاد می گردد که ژن هایCASP9،CDC2L1، CNR2، DFFA، DFFA، CCND3، EEF1A1، ASAP1، PTK2، DAG1، GPX1، MLH1، TGFBR2، TUSC2، KLF4، SLC31A1، CDKN2B، ELAVL2 و FANCG احتمالا می توانند از جمله مهم ترین ژن ها در بروز سرطان پوست در مدل ایجاد شده باشند، لذا این گروه از ژن ها و ژن های مرتبط با آن ها برای مطالعات بیشتر و دقیق تر بطور کاندید پیشنهاد می گردند.
کلید واژگان: رت نژاد SD, DMBA, سرطان پوست, نواربندی گیمسا, فیش}BackgroundOne of the most important research objectives in the field of cancer is the discovery of chromosomal changes involved in the formation of neoplastic cells and malignant tumors. According to the country report, skin cancer in Iran is ranked first among Iranian's women. In this research, we will study skin induced skin cancer in SD mice and will report similar areas in human chromosomes and also the most important candidate genes in those regions.
MethodsIn this study, SD rats were used as an animal model for induction of skin cancer in which 10 mg of carcinogens DMBA soluble in sesame oil were injected subcutaneously to rats. The tumors were obtained for cell culture and the preparation of meta-phasic chromosomes. After staining with GTG method, banding chromosomes in meta-phasic stage were compared with the normal rats' ideogram. By examining metaphase chromosomes, the most common chromosomal changes were recorded between chromosomal sets. Based on their changes and location and with the help of databases, a list of genes and their possible role were made according to the genomic comparison method between rats and humans.
ResultsThe results of the chromosomal changes included a wide range of abnormalities, and clearly, fragments of chromosomes number 5, 8 and 9 were eliminated, and also parts of chromosome number 7 were subject to chromosomal structural addition. Also, using the cytogenetic molecular method of the FISH, reduction of copy numbers in the CDKN2B and KLF4 genes was shown in the chromosome 5 of the treated rats.
ConclusionThrough using genomic comparison methods and studying scientific articles about the genes based on modified chromosomal regions, it is suggested that the genes including CASP9, CDC2L1 CNR2, DFFA, DFFA, CCND3, EEF1A1, ASAP1, PTK2, DAG1, GPX1, MLH1, TGFBR2, TUSC2, KLF4, SLC31A1, CDKN2B, ELAVL2 and FANCG may be one of the most important genes in the development of skin cancer in our model, so this group of genes and related genes are suggested for more and more accurate studies.
Keywords: Breast cancer, SD rat, chromosomal changes, G-banding. FISH} -
زمینه و هدفسرطان پستان یکی از شایع ترین سرطان های زنان در جهان است. این مطالعه به منظور تعیین میزان بیان ژن BRCA1 در سرطان القایی پستان به وسیله کارسینوژن 7-12 دی متیل بنزآنتراسن (DMBA) در موش های صحرایی انجام شد.
روش بررسیدر این مطالعه تجربی برای ایجاد مدل سرطان پستان از DMBA به موش های صحرایی نژاد Sprague dawley خورانده شد. برای تهیه سلول های سرطانی، تومورهای ایجاد شده در شرایط استریل خرد و کشت داده شدند و از سلول های سرطانی استخراج شده برای تهیه کروموزوم های متافازی استفاده گردید. سپس نواربندی های کروموزومی توسط رنگ آمیزی گیمسا انجام گرفت. فراوان ترین و مشترک ترین تغییرات کروموزومی ثبت شد و بر اساس چگونگی تغییرات و محل آنها و با کمک پایگاه های اطلاعاتی و تعیین توالی های نوکلئوتیدی و مقایسه ژنومیک بین موش صحرایی و انسان، فهرستی از ژن های موجود در نواحی که به احتمال زیاد با تغییرات خود سبب بروز تومور شدند؛ تهیه گردید. برای تایید نتایج حاصله از روش نواربندی کروموزومی، آنالیز ژن BRCA1 توسط روش FISH انجام شد.یافته هاناحیه (q24-q32.1) کروموزوم 10 موش صحرایی که ژن BRCA1 نیز روی همین بخش قرار دارد؛ دچار حذف شدگی گشت. نتایج روش FISH نیز حاکی از حذف دو نسخه ژن BRCA1 در 24.7% سلول ها و یک نسخه ژن در 23.8% سلول های مورد مطالعه بود.نتیجه گیریدر سلول های سرطانی القا شده با DMBA حذف در نسخه های ژن BRCA1 مشاهده شد که این امر ممکن است در روند ایجاد تومور پستان نقش داشته باشد.
کلید واژگان: سرطان پستان القایی, ژن BRCA1, نواربندی گیمسا, فلورسانس هیبریداسیون درجا, موش صحرایی}Background And ObjectiveBreast cancer is one of the most frequent malignancies among women. This study was done to determine the BRCA1 gene expression in 7،12-Dimethylbenz (a) anthracene (DMBA) induced breast cancer in rats.Materials And MethodsIn this experimental study، the breast cancer was induced by DMBA in Sprague dawley rats. After tumors arise، cell cultures were prepared and G-banding staining was performed on metaphase chromosomal smear. According to databases، genes in the affected area were collected and after comparing genome of the rats and human in changed chromosomal segments، a gene list was prepared. FISH technique was performed on BRCA1 gene to prove accuracy of chromosomal banding results.ResultsStructural changes such as deletion occurred in chromosomes 10، which BRCA1 is located on. 24. 7% of cells showed evidence of physical deletion in both copy of BRCA1 gene and 23. 8% of cells showed deletion in one copy.ConclusionInduced DMBA Breast cancer cells showed deletion in BRCA1 copy numbers. This gene may be involved in animal breast tumor model.Keywords: Breast cancer, BRCA1 gene, G, banding, FISH, Rat} -
مقدمهکشف تغییرات کروموزومی که در تشکیل سلول های نئوپلاستیک و تومورهای بدخیم دخالت دارد یکی از مهم ترین اهداف تحقیقات در سرطان شناسی می باشد. در این تحقیق به مطالعه سرطان پستان ایجاد شده در موش های نژاد SD پرداخته شد و با روش های بیواینفورماتیک نواحی مشابه آن ها در کروموزوم های انسان مورد شناسایی و پیشنهاد قرار گرفت.
روش ها بررسی: در این پژوهش از موش صحرایی نژاد SDبه عنوان مدل حیوانی جهت القای سرطان پستان استفاده گردید که طی آن 10 میلی گرم از ماده کارسینوژنیک DMBAبه رت های تحت تیمارخورانده شد. بعد از انجام روش هیستوپاتولوژی و ایمنوهیستوشیمی بر روی تومورها، اقدام به کشت سلول و تهیه کروموزوم های متافازی شد. بعد از رنگ آمیزی، GTG سلول های سرطانی با ایدئوگرام رت مقایسه گردید. بر اساس چگونگی تغییرات و محل آن ها و با کمک پایگاه های اطلاعاتی، لیستی از ژن ها و همچنین نقش احتمالی آن ها را با توجه به روش مقایسه ی ژنومیک بین موش صحرایی و انسان مورد مطالعه قرار گرفت. با مطالعه کروموزوم های متافازی، بیشترین و مشترک ترین تغییرات کروموزومی اتفاق افتاده در بین مجموعه های کروموزومی ثبت گردید.نتایجتغییرات کروموزومی ایجاد شده طیف وسیعی از ناهنجاری های عدی و ساختاری را شامل می گردید و به طور واضح، کروموزوم های شماره 3،4،8، 12 و 17 دچار افزایش و کروموزوم های شماره 3،9،12و15 دچار گم شدگی در تعداد کروموزوم ها گردیده بودند. علاوه بر این، تغییرات ساختاری از جمله حذف شدگی در کروموزوم های شماره 2،3،4،6،7،20 همچنین اضافه شدگی در کروموزوم های 11،15 و 19 به طور غیر اتفاقی مشاهده شدنتیجه گیریبا استفاده از روش های مقایسه ی ژنومیک و مطالعه مقالات علمی در ارتباط با ژن های مستقر در نواحی کروموزومی تغییر یافته، پیشنهاد می گردد که ژن های TGFBR،HACE1،UBR5، CALB2،HPR،LCP1،،CXAD،RRM2B،ABO،ZFHX3،، TNFSF1،ABL1 EPSTI1، PRDM1، REG3A، FOXA1، PRKD1 احتمالا می توانند از جمله مهم ترین ژن ها در بروز سرطان پستان در مدل ایجاد شده باشند، لذا این گروه از ژن ها و ژن های مرتبط با آن ها برای مطالعات بیشتر و دقیق تر توصیه می گردند.
کلید واژگان: رت نژاد SD, DMBA, سرطان پستان, نواربندی گیمسا}Background And ObjectiveDiscovery of genetic changes which contribute to cellular neoplastic and malignant tumor transformation is one of the major aims in oncology researches. The aim of this study was to investigate the DMBA-induced breast cancer in SD rat strains using bioinformatical methods and also to find their homologous regions in human chromosomes.Materials And MethodsIn this research, we used SD rat strains as a suitable model for DMBA-induced breast cancer. We gavaged the rats twice with 10 mg DMBA solved in 0.5 ml sesame oil. After tumors appeared in DMBA-treated rats, they were subjected to histopathology and immunohistochemistery studies, cell culture, metaphase chromosomal preparation, and finally G-banding stain. According to databases, we collected genes in the affected area and prepared a gene list by comparing genome of the rats and human in changed chromosomal segments.ResultsOur data showed numerical and frequent structural changes in different number of chromosomes. For example, we found recurrent gain in chromosomes 3, 4, 8, 12, 17, loss in chromosomes 3, 9, 12 and 15, also deletion in chromosomes 2, 3, 4, 6, 7, 20 and addition in chromosomes 11, 15 and 19.ConclusionAccording to these chromosomal changes and based on bioinformatics studies we predict that the genesTGFBR3, HACE1, UBR5, CALB2, HPR, LCP1, RRM2B, ABO, ZFHX3, TNFSF11, ABL1, EPSTI1, PRDM1, REG3A, FOXA1 and PRKD1, probably may contribute to the development of breast cancer. -
زمینه و هدفالقاء سرطان پوست در موش های صحرایی نژاد SD ایجاد تومورهایی را می نماید که از نظر فیزیولوژیکی و شیمیایی شباهت های زیادی با تومورهای پوستی در انسان دارد. لذا این مطالعه با هدف تعیین ناهنجاری های عددی و ساختاری در مجموعه کروموزوم های موش های صحرایی مبتلا به سرطان پوست و بررسی مناطق متناظر آن ها در کروموزوم های انسانی انجام شد.روش بررسیدر این مطالعه تجربی mg 5/2 ماده ی کارسینوژنیکDMBA (7،12-Dimethylbenz[α]anthracene) به طریق زیر جلدی به موش صحرایی نژاد اسپراگ داولی (SD) تزریق شد. سپس تومورهای ایجاد شده در گروه های مورد آزمایش با روش های هیستوپاتولوژی، ایمنوهیستوشیمی و کشت سلول مورد بررسی قرار گرفتند. با استفاده از سلول های حاصل از کشت سلولی به تهیه کروموزوم های متافازی اقدام و نواربندی گیمسا انجام گردید. با کمک پایگاه های اطلاعاتی، ژن های ساکن در نواحی تغییر یافته شناسایی گردید و همچنین جهت تعمیم نقش احتمالی آنها به انسان از روش مقایسه ی ژنومیک استفاده شد.یافته هاتغییرات کروموزومی غیر اتفاقی و متداول در بین حداقل 15 سلول متافازی شامل: افزایش عددی کروموزوم های شماره 8، 9، 10، 18 و کاهش عددی در کروموزوم های شماره 4، 6، 12، 16 و همچنین تغییرات ساختاری از جمله حذف در کروموزوم های شماره 1، 4، 5، 6، 17 ثبت گردید. همینطور کروموزوم های مارکر در مدل های کروموزومی دیپلوئیدی و تریپلویدی، مشاهده شد.
نتیجه گیریبا توجه به تغییرات ساختاری ویژه مشاهده شده در کروموزوم های متافازی و با در نظر گیری بررسی مقالات مختلف، پیش بینی می گردد ژن های SRD5A2،،BCAM SIRT2، AKT2، MLANA، RHOB، CANX و TERT در بروز سرطان پوست دخالت داشته باشند. همچنین پیشنهاد می گردد که ناهنجاری های ساختاری کروموزومی گزارش شده در این پژوهش که محل استقرار احتمالی ژن های دخیل در این سرطان می باشند مورد کنکاش بیشتری واقع گردد تا ژن های کاندید بیشتری برای بررسی دقیق تر مشخص گرددکلید واژگان: 12, 7, دی متیل بنزآنتراسن, سرطان پوست, نواربندی گیمسا, موش صحرائی نژاد SD}Background And AimRat and human skin tumors have high similarity in physiology and show comparable biochemical responsiveness. In this study we have recorded numerical and structural chromosomal changes in metaphases chromosomes in induced-breast cancer in rats.MethodsIn this experimental study, a carcinogenic substance (7, 12-Dimethylbenz [α] anthracene, DMBA) (2. 5 mg) was subcutaneously injected to SD rats. Since tumors were appeared in effected rats, they became subjects for histopathology and imunohistochemistry studies as well as cell culture, metaphase chromosomal preparations and finally G-banding staining.ResultsThe data showed some un-randomly numerical and structural changes in different number of chromosomes. We found a gain in chromosomes number 8, 9, 10, 18 and a loss of numerical chromosomal changes in chromosomes number 4, 6, 12, 16 ِِِِِDeletion was seen in chromosomes number 1, 4, 5, 6, 17 and marker chromosomes in diploid and triploid model of analyzed chromosomal sets.ConclusionAccording to our reported chromosomal changes and also published articles, we predict that SRD5A2, BCAM, SIRT2, AKT2, MLANA, RHOB, CANX, TERT are probably involved in development of skin cancer. In addition, we recommend that the genes located in these chromosomal segments, which have been reported in these studies, should be subjected to more investigations. -
مطالعه بازآرایی های کروموزومی و بررسی بیو انفورماتیکی ژن های دخیل در بروز سرطان القایی پستان به وسیله DMBA در رت و شناسایی مناطق سینتنیک آنها در کروموزوم های انسانمقدمهسرطان پستان شایع ترین نئوپلاسم در بین زنان و با شیوع فزاینده است. این سرطان علت عمده مرگ زنان در سنین کمتر از 55 سال است. با توجه به گزارش ثبت موارد سرطان در ایران این سرطان رتبه اول را در بین زنان داشته است. مطالعه حاضر با هدف تعیین محتمل ترین ژن های دخیل در سرطان پستان انجام شده است.روشmg 10 از ماده سرطان زای DMBA از طریق خوراکی به رت های نژاد SD تحت آزمایش خورانده شد. به منظور شناسایی و تعیین نوع سرطان های حاصل که برای کشت سلولی نیز به کار رفتند از روش های هیستوپاتولوژی و ایمنوهیستو شیمی استفاده و سپس اقدام به تهیه کروموزوم های متافازی گردید و نواربندی های کروموزومی توسط رنگ آمیزی گیمسا انجام شد. فراوان ترین و مشترک ترین تغییرات کروموزومی ثبت گردید. بر اساس چگونگی تغییرات و محل آنها و با کمک پایگاه های اطلاعاتی و تعیین توالی های نوکلئوتیدی و مقایسه ژنومیک بین رت و انسان، لیستی از ژن های موجود در نواحی که به احتمال زیاد با تغییرات خود سبب بروز تومور شده اند تهیه شد.یافته هاتغییرات کروموزومی ایجاد شده طیف وسیعی از ناهنجاری های عددی را شامل می گردید و به طور واضح، کروموزوم های شماره 1، 3 و 9 دچار افزایش و کروموزوم های شماره 8 و 15 دچار گم شدگی در تعداد کروموزوم ها گردیده بودند. علاوه بر این، تغییرات ساختاری از جمله حذف شدگی در کروموزوم های شماره 2، 5، 8، 16 و19 هم چنین اضافه شدگی در کروموزوم های 2، 12 و 19 به طور غیر اتفاقی مشاهده شد.نتیجه گیریبا استفاده از روش مقایسه ژنومیک مشخص شد که احتمالا ژن های DAB2، KLF4، HSPA8،، CDKN2A CALB2، HPR، CHFR، ALDH2، AQP3، ABCA1، ALDOB، ASH2L، LSM1،FGFR1،، HSPA8، ZFHX3 و SFRP1 می توانند از جمله مهم ترین ژن ها در بروز سرطان پستان باشند و به عنوان ژن های پیشنهادی برای مطالعات دقیق تر ارائه می گردند.
کلید واژگان: موش صحرایی, سرطان پستان, تغییرات کروموزومی, DMBA, نواربندی گیمسا}Chromosomal Rearrangement and Bioinformatic Studies of the Involved Genes in DMBA-Induced Breast Cancer in SD Rat Strains and Verification of their Syntenic Segments in Human ChromosomsBackground and AimsBreast cancer is the most common malignant neoplasm in women and has an increasing rate in both developed and developing countries. According to Iranian National Cancer Registration report, breast cancer has the first rank in women. Breast cancer is the major cause of mortality in women under 55 years old. The present study was performed to find the most probable involved genes in breast cancer.MethodsIn this work, we have gavaged 10 mg DMBA solved in 0.5 ml sesame oil to the DMBA-treated SD rat strains. Before proceeding to cell culture, samples were verified in pathological and immunohistochemistry approaches, and then we performed metaphase chromosomal preparations and finally performed G-banding staining. The most common chromosomal changes were recorded and genes in affected area were determined and a genes-list by comparing genome of rat and human in chromosomal changed segments were prepared.ResultsOur data showed a wide range of numerical and structural changes in different chromosomes. We found recurrently gain in chromosomes no. 1, 3, 9 and loss in chromosomes no. 8 and 15 and also deletion in chromosomes no. 2, 5, 8, 16, 19 and addition in chromosome no. 2, 12 and 19.ConclusionAccording to these chromosomal changes and based on bio-informatics studies we predicted that the DAB2, KLF4, HSPA8, CDKN2A, CALB2, HPR, CHFR, ALDH2, AQP3, ABCA1, ALDOB, ASH2L, LSM1, FGFR1, HSPA8, ZFHX3 and SFRP1 are probably involved in the development of breast cancer. -
مقدمهسرطان پوست یکی از مهم ترین و شایع ترین سرطان های رایج در جهان است. این بیماری رتبه اول در بین مردان و رتبه دوم در بین زنان را به خود اختصاص داده است. این مطالعه با هدف تعیین تغییرات کروموزومی ایجاد شده در بروز سرطان پوست القایی در موش های صحرایی صورت گرفت.روش کاردر این پژوهش بنیادی، 20 موش صحرایی نژاد اسپراگودالی به طور تصادفی به دو گروه مساوی آزمایش و کنترل تقسیم شدند. در گروه آزمایش با استفاده از تزریق زیر جلدی 5/2 میلی گرم ماده کاسینوژنیک 7و12 دی متیل بنزآلفاآنتراسن ایجاد سرطان پوست شد. تومورهای ایجاد شده در گروه های مورد آزمایش به محیط کشت منتقل و کروموزوم های متافازی تهیه گردید. سپس رنگ آمیزی باندینگ انجام گرفت و ژن های مستقر در آنها شناسائی گردید. هم چنین از روش مقایسه ژنومیک جهت تعمیم نقش احتمالی آنها به انسان استفاده شد. روش های هسیتوپاتولوژی و ایمنوهیستوشیمی برای شناسائی و تعیین مراحل توموری به کار گرفته شد.
نتایجبیشترین و مشترک ترین تغییرات کروموزومی در بین مجموعه های کروموزومی مطالعه شده به ثبت رسید چنانچه افزایش عددی در کروموزوم های شماره 1، 15و 17 و کاهش عددی در کروموزوم های شماره 1، 7، 10 و 15 مشاهده شد. علاوه بر این، تغییرات ساختاری از جمله حذف در کروموزوم های شماره 1، 4،8، 9، 10، 15 و 17 و اضافه شدگی در کروموزوم 15 مشاهده گردید.
نتیجه گیریپیش بینی می گردد ژن های CST6، PRKCDBP، PTCH1، DKK3،BRMS1، CDKN1C، CD81، DMP1، CDKN2B، EEF1A1، HRAS، CASP2 و KLF4 در بروز سرطان پوست دخالت دارند.
کلید واژگان: 7و12 دی متیل بنزآلفا آنتراسن, سرطان پوست, نواربندی گیمسا, موش های صحرائی نژاد اسپراگودالی}BackgroundSkin cancer is one of the most important cancers in the world. This cancer is more common in men than women. We survey chromosomal changes in DMBA-induced skin cancer in SD rat strains. Methods and Materials: In this fundamental study, 20 SD rat strains were randomly divided into case and contal group. DMBA (2. 5 mg) was injected to SD rat strains subcutaneously; therefore skin cancer model for studies was created. Tumors became subjects for cell culture and metaphase chromosomal were prepared. Finally G-banding were stained. We have also transmitted genomic information from rat to human using suitable databases and Gene were determined.ResultsData showed numerical and frequent structural changes in different number of chromosomes. For example; gain in chromosomes number 1, 15, 17 and loss in 1, 7, 15, and also structural changes like deletion was seen in chromosomes number 1, 4, 8, 10, 15, 17, and addition in chromosome number 15.DiscussionIt is predicted that CST6، PRKCDBP، PTCH1، DKK3،، BRMS1، CDKN1C، CD81، DMP1، CDKN2B، EEF1A1، HRAS، CASP2، KLF4 probably cause skin cancer.
نکته
- نتایج بر اساس تاریخ انتشار مرتب شده‌اند.
- کلیدواژه مورد نظر شما تنها در فیلد کلیدواژگان مقالات جستجو شده‌است. به منظور حذف نتایج غیر مرتبط، جستجو تنها در مقالات مجلاتی انجام شده که با مجله ماخذ هم موضوع هستند.
- در صورتی که می‌خواهید جستجو را در همه موضوعات و با شرایط دیگر تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مجلات مراجعه کنید.
©2000-2024 magiran.com All Rights Reserved.