جستجوی مقالات مرتبط با کلیدواژه "تیپ a" در نشریات گروه "دامپزشکی"
-
پیشینه
آنالیز ژنتیکی واریانت های تیپ 2 پاروویروس سگ (CPV-2) که در جنوب شرقی نیجریه در حال چرخش هستند مورد بررسی قرار گرفت. سویه اصلی CPV-2 ابتدا در سال 1978 پدیدار شد و سپس به CPV-2a جهش یافت و همچنان در حال تغییر است.
هدفمشخص کردن ویژگی های ژنتیکی سویه های CPV-2 شناسایی شده در سگ ها در جنوب شرقی نیجریه و گروه بندی فیلوژنتیکی ویروس ها با داده های توالی موجود.
روش کاردر مجموع 82 سواب از رکتوم سگ های مشکوک به CPV-2 در منطقه مورد مطالعه جمع آوری و در محیط انتقال ویروس (VTM) نگهداری شدند و با استفاده از واکنش زنجیره ای پلیمراز (PCR)مورد بررسی قرار گرفتند.
نتایجهفتاد و نه نمونه (3/96%) از نظر CPV-2 مثبت بودند و تحلیل توالی قسمتی از ژن VP2 از 20 آمپلیکون، نشان دهنده انتشار CPV-2a (4 عدد) و CPV-2c (16 عدد) در منطقه بود. سویه های به دست آمده با همدیگر خوشه تشکیل دادند. با این حال، این گروه مجدد به دو خوشه واضح متشکل از سویه های 2a و 2c تقسیم شد. سویه واکسن و سویه های مرجع CPV-2 در ایالات متحده آمریکا، یک خوشه مونوفیلتیک تشکیل دادند.
نتیجه گیریتیپ 2a و 2c پاروویروس های سگ به طور همزمان در منطقه جنوب شرقی نیجریه در حال گردش هستند و در نتیجه نیاز فوری به یک واکسن بهبود یافته برای پوشش دادن سویه های در حال ظهور (CPV-2c) در نیجریه، وجود دارد.
کلید واژگان: اسیدهای آمینه, تیپ 2cپاروویروس, سگ, نیجریه, واکنش زنجیره ای پلیمراز, تحلیل توالیBackgroundGenetic analysis of canine parvovirus type 2 (CPV-2) variants circulating in South Eastern Nigeria was investigated. The original strain of CPV-2 emerged in 1978, mutated later to CPV-2a and has continued to be evolved.
AimsTo genetically characterize CPV-2 strains detected in dogs in South Eastern Nigeria and to phylogenetically group the viruses with existing sequencing data.
MethodsA total number of 82 rectal swabs were collected and stored in virus transport medium (VTM) from suspected cases of CPV-2 within the study area and were tested with polymerase chain reaction (PCR).
ResultsSeventy-nine samples (96.3%) were positive for CPV-2 and sequence analysis of partial VP2 gene of 20 amplicons revealed circulation of CPV-2a (n=4) and CPV-2c (n=16) in the region. The obtained strains clustered together. However, the group was further divided into two clear clusters comprising of 2a and 2c strains. The vaccine strain and the CPV-2 reference strains from USA formed a monophyletic cluster.
ConclusionCanine parvovirus types 2a and 2c are co-circulating in South Eastern region of Nigeria and therefore, there is an urgent need for an improved vaccine to cover for the emerging strain (CPV-2c) in Nigeria.
Keywords: Amino acids, Canine parvovirus-2c, Nigeria, Polymerase chain reaction, Sequence analysis -
نشریه تحقیقات دامپزشکی و فرآورده های بیولوژیک، سال سی و یکم شماره 3 (پیاپی 120، پاییز 1397)، صص 64 -69این مطالعه کشتارگاهی با هدف بررسی حضور پاستورلا مولتوسیدا، جمع آوری جدایه های آن و همچنین تعیین تیپ کپسولی آن ها در یک واحد صنعتی کشتارگاهی در استان البرز (شهرستان کرج) و 5 واحد در استان تهران (رباط کریم ، شهر ری، شهریار، کهریزک و ورامین) و انجام پذیرفت. تعداد 89 نمونه ریه و 595 سواب از مجاری تنفسی گوساله های گاو در یک کشتارگاه در کرج و 5 کشتارگاه در تهران بر روی محیط های اختصاصی کشت گردیدند. در نتیجه از مجموع 339 جدایه رشد یافته در کشت تعداد 89 مورد در آزمون های متعارف بیوشیمیایی پاستورلا مولتوسیدا شناسایی شدند. اجرای آزمون PM-PCR هویت 64 جدایه از 89 جدایه را به عنوان پاستورلا مولتوسیدا مورد تایید قرار داد. با اجرای آزمون Cap-PCR 60 جدایه دارای تیپ کپسولی A و 1 جدایه نیز دارای تیپ کپسولی B نشان داده شدند در حالی که این آزمون نتوانست تیپ کپسولی 3 جدایه را تعیین نماید. نویسندگان معتقدند هنوز تا شناخت کامل اپیدمیولوژی پاستورلا مولتوسیدا در ایران باید تحقیقات بیشتری انجام پذیرد.کلید واژگان: پاستورلوز, پاستورلا مولتوسیدا, گوساله, تیپ کپسولیThis abattoir-based investigation was conducted in search for presence of Pasteurella multocida, collection of its isolates, characterization of their biochemical profiles and also classification of their capsular types in Tehran and Alborz provinces. Swabs from 89 lungs and 595 nasal passages of bovine calves at a single slaughterhouse in Karaj (Karaj city) and 5 slaughterhouses in Tehran (Shahriar, Shahr-e-Ray, Robat Karim, Kahrizak and Varamin) were cultured on specific media. Among the 339 non-haemolitic individual colonies, 89 were proved P. multocida by conventional biochemical tests. The PM-PCR assay confirmed identity of 64 isolates as Pm where 60 were shown to belong to the capsular type A and a single one to capsular type B. The remaining 3 isolates were non-typeable. We believe still a lot needs to be done at the national level to fully acknowledge the epidemiology of Pm in Iran.Keywords: Pasteurella multocida, calf, Capsular type
-
استافیلوکوکوس اورئوس یک پاتوژن فرصت طلب مهم در ایجاد بیماری های متنوع نظیر عفونت های دستگاه ادراری و پنومونی می باشد. مصرف بی رویه و بیش از حد آنتی بیوتیک ها باعث پیدایش مقاومت های آنتی بیوتیکی در این باکتری خصوصا در برابر آنتی بیوتیک های رایج در درمان شده است. بررسی حاضر به منظور تعیین الگوی مقاومت آنتی بیوتیکی ایزوله های استافیلوکوکوس اورئوس جدا شده از شیر و فرآورده های سنتی شیر به ویژه مقاومت به متی سیلین انجام گرفت. در مجموع 403 نمونه شیر و فرآورده های شیری از مراکز توزیع مواد لبنی وسنتی اخذ و کشت داده شد. ایزوله های جدا شده به منظور تعیین فراوانی حضور ژن mecA، تیپ هایSCCmec و ژن های کد کننده مقاومت آنتی بیوتیکی به روش PCR آزمایش گردیدند. الگوی مقاومت آنتی بیوتیکی ایزوله ها به روش انتشار دیسک ارزیابی شد. از 403 نمونه مورد مطالعه، 151 نمونه (67/44 درصد) به استافیلوکوکوس اورئوس آلوده بودند، که بیشترین میزان آلودگی در نمونه های مربوط به شیر خام گاو (55/58 درصد) یافت شد. از بین تیپ هایSCCmec در ایزوله های mecA مثبت تنها تیپ IV ردیابی شد که در این میان تعداد 66 ایزوله متعلق به تیپ IVd، 21 ایزوله مربوط به تیپ IVc و 13 ایزوله متعلق به تیپ IVa بودند و اختلاف آماری معنی دار (P= 0.026) بین حضور تیپ SCCmec- IVd با دو تیپ IVa و IVc مشاهده شد. شیوع بالای آلودگی با استافیلوکوکوس اورئوس در شیرخام و فرآورده های سنتی شیر و مقاومت آنتی بیوتیکی بالای این ایزوله ها به انواع آنتی بیوتیک های رایج در درمان عفونت های انسانی یک زنگ خطر جدی برای جامعه بوده و لزوم به کارگیری اقدامات بهداشتی و کنترل کیفی فرآورده های شیری را بیش از پیش مشخص می کند.کلید واژگان: استافیلوکوکوس اورئوس, تیپ هایSCCmec, مقاومت آنتی بیوتیکی, فرآورده های شیریStaphylococcus aureus is a major opportunistic pathogen causing various diseases such as pneumonia and urinary tract infections. Indiscriminate and excessive use of antibiotics leads to antibiotic resistance in this bacterium, especially against commonly used antibiotics in the treatment. The present study aimed to evaluate the antibiotic resistance pattern of Staphylococcus aureus strains isolated from milk and traditional milk products, especially resistance to methicillin. A total of 403 samples of milk and milk products was examined and collected from distribution centers of traditional and dairy products. Strains isolated were tested by PCR to determine the frequency of mec gene, SCCmec types and genes coding for antibiotic resistance. Antibiotic resistance pattern of isolates was assessed by disk diffusion method. Out of 403 samples, 151 samples (%44.67) were infected with Staphylococcus aureus, and the highest prevalence of infection was found in samples of cow raw milk (%58.55). Only IV type was detected in mecA-positive isolates among SCCmec types; a number of 66 isolates belonged to IVd type, 21 isolates related to IVc type and 13 isolates belonged to IVa type and the significant differences between SCCmec type IVd with two types IVc and IVa was observed. The high prevalence of infection with Staphylococcus aureus in raw milk and traditional milk products and high antibiotic resistance of the isolates to common types of antibiotics in treating human infections are serious warning to the community and it requires hygienic measures and quality control of dairy products more than ever.Keywords: Staphylococcus aureus, SCCmecTypes, Antibiotic Resistance, Milk Products
-
از آنجایی که خوکچه هندی به عنوان بهترین حیوان آزمایشگاهی حساس به ویروس بیماری تب برفکی مطرح شده است، مقدار یک میلی لیتر از ویروس تب برفکی تیپ O با غلظت TCID50 106-5/106به ناحیه کف پای 10 سر خوکچه هندی (سمت راست) به روش داخل پوستی تزریق شد. ویروس عادت داده شده به خوکچه هندی پس از مرحله عمومی شدن آماده شده وسپس 1 میلی لیتر از ویروس بصورت داخل پوستی به 30 سر خوکچه هندی در 5 گروه (پنج گروه شش تائی) تلقیح شد. نمونه ها از اندام های مختلف از جمله: قلب، ریه، کبد، طحال، لوزه المعده، اپی تلیوم های زبان و کف پا، عقده های لنفی پشت حلقی و مغابنی در زمان های 2، 4، 14، 30، 60 روز پس از تزریق ویروس گردآوری شد و در محیط انتقالی نگه داری و به آزمایشگاه مرجع تب برفکی ارسال شد. با توجه به نتایج حاصله از این مطالعه، اپی تلیوم کف پا و زبان همانند ریه اصلی ترین مکان های بقا ویروس تشخیص داده شده اند. بعلاوه بیشترین میزان حضور ویروس را در چهار روز و دو هفته پس ازتزریق می توان مشاهده نمود. ضمنا نشانه ای از وجود ویروس در ارگان ها در زمان های 30 و60 روز پس از تزریق وجود نداشت.
کلید واژگان: بیماری تب برفکی, تیپ O, الایزا, واکنش زنجیره ای پلیمراز, خوکچهSince, the most susceptible laboratory animal to Foot–and–Mouth disease virus (FMDV) is guinea pig, and then one milliliter of FMDV type (O) concentrations of 106-106.5 TCID50was inoculated intradermally (ID) to 10 plantar surface of guinea pig (right side). Guinea pig adapted virus has been prepared after generalization phase, and then one milliliter of virus was inoculated intradermally to 30 guinea pigs in 5 groups (each consist of six). Samples from different organs including, heart, lung, liver, spleen, pancreas, tongue and plantar epithelium, retropharyngeal and inguinal lymph nodes were collected on days 2, 4, 14, 30, 60 post inoculation (PI) and kept in transport media and sent to FMD department of Ref lab. According to the results of this study, plantar epithelium and tongue as well as lung have been detected to be the original sites for virus survival. In addition, the highest rate of the presence of virus can be seen on 4 days and 14 days PI. By the way there was no sign of presence of the virus in any organs on days 30 and 60 PI.Keywords: ot –, – Mouth disease virus, type O, ELISA, PCR, Guinea pig -
انتشار سریع ویروس های آنفلوانزای طیور کم حدت (LPAI) ناشی از تحت تیپ H9N2 و ویروس های آنفلوانزای طیور با حدت بسیار بالای (HPAI) ناشی از تحت تیپ H5N1 منجر به خسارات گسترده، در صنعت طیور کشورهای آسیائی شده است. فلذا تشخیص زودهنگام ویروس های آنفلوانزای طیور، در کنترل بیماری آنفلوانزای طیور از اهمیت بسیار زیادی برخوردار میباشد. هدف از انجام این مطالعه، ارزیابی کاربرد آزمایش ایمنوکروماتوگرافی سریع در تشخیص آنتی ژن های اختصاصی تیپ A ویروس های آنفلوانزای طیور می باشد. این آزمایش قادر به تشخیص ویروس های H9N2 با عیار 3.2 10 بر مبنای ELD50/ml و آنتی ژن های H5، H7 و H9 بر مبنای 128 واحد می باشد. اما سایر ویروس های تنفسی طیور را، تشخیص نمی دهد. ارزیابی نمونه های سواپ کلواک تهیه شده از یک تا 10 روز بعد از تلقیح به جوجه های گوشتی، نشان داد که اولین نمونه مثبت در روزهای 2 و 3 و آخرین نمونه مثبت در روزهای 10 و 9 بعد از تلقیح، به ترتیب در جداسازی ویروس و آزمایش سریع مشاهده گردید. این نتایج بیانگر حساسیست کمتر آزمایش سریع در مقایسه با جدا سازی ویروس می باشد. در مجموع، حساسیت نسبی، ویژگی، ارزش پیشگوئی مثبت، ارزش پیشگوئی منفی، درستی و میزان هم خوانی بین آزمایش سریع و جداسازی ویروس در عفونت تجربی، به ترتیب 100%، 5/71%، 100%، 5/78%، 86/0 و 98/0 میباشد. همچنین، هم خوانی خوبی (? > 0.81) بین نتایج آزمایش سریع، جداسازی ویروس و آزمایش HI در نمونه های سواپ کلواک و یا نای تهیه شده از گله های گوشتی مبتلا به بیماری های تنفسی وجود دارد. در مجموع، آزمایش ایمنوکروتوگرافی سریع دارای حساسیت کم و ویژگی بالا در تشخیص سریع ویروس های H9N2 در هر دو شرایط تجربی و بالینی می باشد.
کلید واژگان: تحت تیپ H9N2, ویروس آنفلوانزای طیور, آزمایش ایمنوکروماتوگرافی سریع, تیپ ARapid spreading of the low pathogenic avian influenza virus (AIV) caused by the H9N2 subtype and the highly pathogenic AIV caused by H5N1 have caused serious economic losses in the poultry industries of Asia. Therefore, the early detection of AIVs is crucial for the control of the disease. In the present study, the applicability of a rapid immunochromatographic (RIC) assay, which specifically detected type A antigens of AIVs, was evaluated. This assay detected H9N2 viruses at 103.2 ELD50/ml and H5, H7 and H9 antigens at 128 HA titers, but did not react with other respiratory viruses. The assessment of cloacal swab samples prepared from 1 to 10 d post-inoculation (PI) revealed that the first positive samples were detectable on day 2 and 3 PI, and the last positive samples were detectable on day 10 and 9 PI, by the virus isolation (VI) and RIC assays, respectively. Collectively, the relative specificity, sensitivity, positive predictive value, negative predictive value, accuracy and correlation rate of the RIC and VI assays, were 100%, 71.5%, 100%, 78.5%, 0.86, and 0.98, respectively. There was also a good correlation (? > 0.81) between the results of the haemagglutination (HI), VI and RIC assays of cloacal/tracheal swab samples that were obtained from broiler flocks involved with viral respiratory diseases. Overall, RIC showed a low sensitivity and high specificity for the rapid diagnosis of H9N2 isolates in both experimental and clinical infections. -
تب برفکی یکی از مهم ترین بیماری های ویروسی دام است. تیپ های O، A و 1Asia ویروس تب برفکی از دیرباز در ایران بومی می باشند. در این مطالعه نمو نه های گرفته شده (103 نمونه طی سه سال) از دام های مشکوک،توسط آزمایش RT-PCR مورد بررسی قرار گرفت. 702نوکلئوتید ناحیه D1 تا B2 ژنوم ویروس تب برفکی تیپ A جدا شده از استان خراسان رضوی تعیین توالی گردید و با سایرویروس های ایران و منطقه مقایسه شد. در نتایج بدست آمده معلوم گردید که ویروس تیپ Aجدا شده 89 درصد مشابهت با ویروس های ایران و کشور های همسایه دارد. به علاوه این ویروس با 92 درصد، بیشترین تشابه را با (Samuel)87/1A/IRN/ نشان داد.بررسی فیلوژنتیک ویروس معلوم نمود که این ویروس به ویروس های 92/Iraq/22A و 105A/IRN /iso نزدیک بوده و با آنها در یک Lineage قرار می گیرد. اطلاعات نشان می دهد که ویروس تب برفکی تیپ A جدا شده از استان خراسان رضوی مشابهت زیادی با v87A/IRN/ ویروس واکسن ایران دارد و واکسن قادر است آنتی بادی محافظت کننده بر علیه آن ایجاد نماید.
کلید واژگان: ویروس تب برفکی, استان خراسان رضوی, _ تیپ AFoot -and- mouth disease (FMD) is one of the most important virus disease in farm animals. Types O, A and Asia1 FMD virus have been endemic in Iran. In these study, samples from suspected livestock were analyzed by RT-PCR experiment. The number of 702 nucleotides determined at 1D -2B region of type A strain isolated from Khorasan Razavi province sequenced and compared with that of other reported isolates type A from Iran and neighboring countries.The results show that field isolated type A has about 89% similarity with other reported isolates type A from Iran and neighboring countries. Furthermore, this virus shows the most similarity with A/IRN/1/87(Samuel). Phylogenitic analysis revealed that virus was closely related to A22-Iraq/99 and A/IRN/iso/105 that rest in the same lineage. The data showed high similarity between type A viruses involved in the Khorasan Razavi province and A/IRN/87v (vaccine strain); so that it can be concluded that the vaccine can produce prophylactic antibody against this virus.
- نتایج بر اساس تاریخ انتشار مرتب شدهاند.
- کلیدواژه مورد نظر شما تنها در فیلد کلیدواژگان مقالات جستجو شدهاست. به منظور حذف نتایج غیر مرتبط، جستجو تنها در مقالات مجلاتی انجام شده که با مجله ماخذ هم موضوع هستند.
- در صورتی که میخواهید جستجو را در همه موضوعات و با شرایط دیگر تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مجلات مراجعه کنید.