بررسی تنوع فنوتیپی و ژنوتیپی جدایه های Agrobacterium از میزبان های مختلف در استان های فارس و کهگیلویه و بویراحمد

در سال های 1387 و 1388 از باغ های مو، گلخانه های پرورش گل رز و هم چنین مزارع چغندرقند در استان های فارس و کهگیلویه و بویراحمد بازدید و از گیاهان دارای علایم گال طوقه و ریشه و خاک اطراف آنها نمونه برداری و به آزمایشگاه منتقل شد. جداسازی عامل بیماری روی محیط های NA، DIM agar، 1A و RS انجام گرفت. پس از خالص سازی جدایه ها، با انجام آزمون های استاندارد باکتری شناسی جدایه ها به عنوان A. vitis وbiovar 1 A. tumefaciens تشخیص داده شدند. آزمون بیماری زایی روی گیاهان کالانکوئه، گوجه فرنگی و آفتابگردان انجام شد و اکثرجدایه ها توانستند در این گیاهان تولید گال کنند. برای تشخیص بیماری زایی جدایه ها نیز از آغازگرهای اختصاصی A/C و VCF/VCR استفاده شد که به ترتیب تمام جدایه ها باندهای 224 و 730 جفت بازی را تکثیر کردند. در بررسی آزمون rep-PCR با استفاده از آغازگرهای BOX و ERIC تنوع زیادی در بین جدایه ها مشاهده گردید. جدایه های به دست آمده از مناطق مختلف استان های فارس و کهگیلویه و بویراحمد به دو گروه کلی قابل تقسیم بودند. گروه یک نیز به دو زیر گروه تقسیم شد، که یک زیر گروه شامل جدایه های A.vitis (جدا شده از درختان مو) و زیر گروه دیگر شامل جدایه های A. tumefaciens (جدا شده از رز و چغندرقند) بود. گروه دوم نیز تعداد کمی از جدایه های A. tumefaciens (جدا شده از رز و چغندرقند) را شامل شد. حداکثر شباهت در آزمون rep-PCR در داخل گونه A. vitis با حدود 88 درصد به دست آمد. گروه بندی براساس خصوصیات ژنوتیپی تا حدودی با گروه بندی براساس خصوصیات فنوتیپی مطابقت داشته و آزمون های فنوتیپی و rep-PCR به خوبی توانستند گونه های A.vitis و A. tumefaciens را از هم تفکیک نمایند.