بررسی تنوع آکتینومیست های کمپوست قارچ خوراکی دکمه ای با استفاده از تجزیه و تحلیل الگوی قطعات برشی ژن 16S rRNA

آکتینومیست های گرمادوست به دلیل توانایی تجزیه مواد سلولزی از اجزای اصلی میکروفلور کمپوست قارچ خوراکی دکمه ای محسوب می شوند. این گروه همراه با میکروارگانیسم های گرمادوست دیگر نقش مهمی در فرایند کمپوست سازی ایفا می کنند. از روش های مختلف مورفولوژیکی، بیوشیمیایی و مولکولی برای شناسایی این گروه از باکتری ها استفاده شده است. روش های مولکولی مبتنی بر واکنش زنجیره ای پلیمراز (PCR) ازجمله آنالیز الگوی برشی جزء کوچک ژن RNA ریبوزومی (16S rRNA) با آنزیم های برشی روشی سریع و مطمئن برای شناسایی باکتری ها می باشد. مقایسه الگوی قطعات برشی ایزوله های جداشده با الگوی تهیه شده از هضم توالی های معتبر منتشر شده از جنس های آکتینومیست ها در GenBank به صورت این سیلیکو، روشی سریع برای شناسایی آکتینومیست ها می باشد. آکتینومیست های گرمادوست موجود در کمپوست با استفاده از روش رقیق سازی بر روی محیط کشت و گرمخانه گذاری در دمای C◦ 46 جداسازی شدند. ژن 16S rRNA هر ایزوله به طور جداگانه، با استفاده از PCR تکثیر و با آنزیم های برشی مورد هضم قرار گرفت. پس از تعیین الگوی برشی هر آنزیم با الکتروفورز روی ژل آگارز، از تکنیک تجزیه و تحلیل قطعات DNA ریبوزومی تکثیر شده (ARDRA) برای شناسایی ایزوله های ناشناخته استفاده شد. بیشترین آکتینومیست های جداسازی شده از کمپوست قارچ خوراکی دکمه ای به جنس استرپتومایسس تعلق داشتند. این گروه دارای اهمیت زیادی در تجزیه بقایای گیاهی و تولید کمپوست می باشند.