مقایسه دو روش بیوشیمیایی و توالی یابی ژن 16S rDNA در جداسازی مایکوباکتریوم های غیر توبرکلوزی

شناسایی مایکوباکتریوم تا سطح گونه دارای اهمیت پزشکی فراوانی دارد. تست های بیوشیمیایی پر زحمت و وقت گیر است، بنابر این تکنیک های جدید می تواند برای شناسایی گونه مورد استفاده قرار گیرد. این تحقیق به منظور مقایسه روش های بیوشیمیایی و تعیین توالی ژن 16S rDNA برای شناسایی مایکوباکتریوم های غیر توبرکلوزی در بیماران مشکوک به سل در استان گلستان که از شایع ترین مناطق بیماری سل در ایران می باشد، انجام شده است. از بین 3336 بیمار مراجعه کننده به بیمارستان ها و مراکز بهداشت استان گلستان 1389-1390، تعداد 319 مورد (9.56 درصد) کشت مثبت جمع آوری شد. شناسایی گونه ها ابتدا با روش بیوشیمیایی انجام شد. بر روی نمونه هایی که به عنوان مایکوباکتریوم غیرتوبرکلوزی شناسایی شد، پس از استخراج DNA توسط روش جوشاندن، واکنش زنجیره ای پلیمراز ژن 16S rDNA انجام شد و پس از تعیین توالی، سپس تعیین گونه توسط بلاست انجام شد. از 319 مورد کشت مثبت در استان گلستان، 19 مورد (5.01 درصد) توسط روش بیوشیمیایی به عنوان مایکوباکتریوم غیرتوبرکلوزی و 300 مورد به عنوان مایکوباکتریوم توبرکلوزیس شناخته شدند. شناسایی گونه در 15 مورد از 19 مورد، با روش های بیوشیمیایی و مولکولی با یکدیگر مطابقت داشته (78.9 درصد تشابه) است. اما بعد از تعیین توالی در یک مورد مایکوباکتریوم سیمیه به عنوان مایکوباکتریوم لنتی فلاووم و در 3 مورد نوکاردیا شناسایی شد. تست های بیوشیمیایی در 78.9% با روش مولکولی مطابقت داشته است. با این شناسایی مایکوباکتریوم لنتی فلاووم و نوکاردیا توسط روش مولکولی بهتر انجام می شود.