شناسایی و بررسی مولکولی جدایه ای از ویروس زردی چغندر قند (Beet yellows virus) در استان خراسان رضوی

به منظور شناسایی و بررسی مولکولی ویروس زردی چغندرقند (Beet yellow virus، BYV) در سال 1392 از مزارع چغندرقند استان خراسان رضوی، تعداد 48 نمونه برگی درای علائم از مزراع عمده این محصول در این استان، جمع آوری شد. این علائم شامل زردی، رگبرگ روشنی، کوتولگی، ضخیم و شکننده شدن برگ بود. نمونه های جمع آوری شده توسط آزمون مولکولی RT-PCR مورد بررسی قرار گرفتند. در این آزمون با استفاده از آغازگرهای اختصاصی طراحی شده، قطعه ای به طول bp615 مربوط به پروتئین پوششی ویروس تکثیر گردید. وجود این ناحیه تکثیر شده در نمونه های آلوده، نشان از آلودگی به ویروس مذکور را در مناطق بررسی شده دارد. قطعه تکثیر شده مربوط به جدایه ای از سبزوار (S-J) از ژل استخراج و تعیین توالی گردید. نتیجه تعیین توالی و مقایسه توالی به دست آمده با جدایه های موجود در بانک ژن به وسیله نرم افزار DNAMAN7 مورد آنالیز قرار گرفت. نتایج نشان داد که جدایه تعیین توالی شده دارای 94-85 درصد شباهت با جدایه های موجود در بانک ژن است. بیش ترین درصد تشابه جدایه مورد بررسی در سطح نوکلئوتیدی (79/ 94درصد) و آمینو اسیدی (59/ 90 درصد)، با جدایه ای از اوکراین (شماره دسترسی X73476) بود. بررسی های فیلوژنتیکی به کمک نرم افزار MEGA5.2 انجام شد.