تایپینگ E. coli های جدا شده از نمونه های آب سطحی ورودی به تصفیه خانه های شهر تهران به روش ERIC-PCR

تایپینگ سویه های باکتریایی، یکی از روش های مطالعه ی اپیدمیولوژیک است. بدین منظور در این تحقیق از تکنیک ERIC-PCR جهت بررسی تنوع ژنتیکی سویه های E. coli جدا شده از آب ورودی به تصفیه خانه های شهر تهران استفاده شد. تعداد 106 ایزوله E. coli طی دوره ی یک ساله، از بین 1939 نمونه ورودی تصفیه خانه های آب شهر تهران مطابق با روش های استاندارد جداسازی شد و با روش ERIC PCR اثر انگشت ژنومیک آنها تعیین و با رسم دندروگرام بر اساس UPGMA، خوشه های ترسیمی مورد ارزیابی قرار گرفت. تعداد 106 ایزوله E. coli وارد این تحقیق شد و از بابت توالی های ERIC، مورد ارزیابی قرار گرفتند. نتایج حاصل از این تحقیق نشان داد که راندمان ERIC-PCR در تعیین اثر انگشت بسیار بالا است، چرا که همه ی سویه ها با این روش قابل تایپ بندی بودند. در مجموع، تعداد 32 باند در محدوده ی 163 تا 3200 به دست آمد که به واسطه ی آنها، سویه ها در 9 خوشه قرار گرفتند. با بررسی نحوه ی توزیع ایزوله های جدا شده از نمونه های آب ورودی به هر یک از تصفیه خانه ها در خوشه ها، مشخص گردید که با توجه به تنوع بسیار بالای ژنتیکی ایزوله های مختلف E. coli که از منابع مختلف وارد آب شده اند، نمی توان الگوی خوشه ایخاصی را برای هر یک از تصفیه خانه ها در نظر گرفت.