الگوهای تمایل کدونی در ژن های فتوسنتزی علف شورزی، آلوروپوس لیتورالیس

تمایل کدنی به تفاوت در فراوانی وقوع کدون های مترادف در DNA کد شونده اطلاق می شود. الگوی استفاده از کدون و کدون های بهینه، به طور معنی داری بین موجودات متفاوت است. این اختلاف ناشی از کارکرد بلند مدت فرآیندهای انتخاب طبیعی و تکامل می باشد. رانش ژنتیکی، موتاسیون و تنظیم بیان ژن از دلایل اصلی وجود اریب کدونی است. در این مطالعه، تجزیه و تحلیل تمایل کدنی روی ژن های فسفو انول پیروات کربوکسیلاز (PEPC)، NADP- مالیک آنزیم (NADP-ME)، پیرووات ارتوفسفات دی کیناز (PEPDK) و گلیسرات کیناز (GK) (ژن های هسته ای)، روبیسکو، NADH دهیدروژناز زیر واحد F و سیتوکروم C مرتبط با فتوسنتز و تنفس از گیاه آلوروپوس لیتورالیس انجام شد. توالی ژن های هسته ای بعد از جداسازی جزیی و برای ژن های کلروپلاست از بانک داده های نوکلئوتیدی به دست آمدند. محاسبه شاخص سازگاری کدن (CAI) نشان داد که ژن های مورد مطالعه که به طور مستقیم یا غیر مستقیم با فتوسنتز در ارتباط هستند، از سطح بیان بالایی برخوردار بوده و همچنین تمایل به استفاده از کدون بهینه در آن ها وجود دارد. همچنین نتایج بدست آمده نشان دادند که تمایل کدونی بین ژن های کد شونده در هسته و کلروپلاست برای برخی از اسیدهای آمینه متفاوت است.