بررسی بیوانفورماتیک ژن های خانه دار در افتراق مایکوباکتریوم های سریع الرشد
نویسنده:
نوع مقاله:
مقاله پژوهشی/اصیل (بدون رتبه معتبر)
چکیده:
مقدمه
مایکوباکتریوم های سریع الرشد (RGM: Rapid Growing Mycobacterium) قادر هستند عفونت های ریوی، لنفاوی، پوست و بافت نرم را در انسان به وجود آورند. ما می توانیم با استفاده از ژن های خانه دار، این گروه از باکتری ها را شناسایی کنیم. در این ارتباط، هدف از پژوهش حاضر مقایسه و ارزیابی سه ژن خانه دار در شناسایی و طبقه بندی برخی از مایکوباکتریوم های سریع الرشد با استفاده از درخت فیلوژنیک بود.
مواد و روش ها
برای انجام این مطالعه ابتدا توالی های سه ژن 16SrRNA، hsp65و rpoBبرای 10 گونه سریع الرشد مایکوباکتریومی از پایگاه های NCBI (National Center for BiotechnologyInformation) ، RDP (RemoteDesktopProtocol) و EMBL (EuropeanMolecularBiologyLaboratory) دریافت شد. سپس این توالی ها توسط نرم افزار CustalWهم طراز گردیدند و درخت فیلوژنیک با استفاده از برنامه MEGA5ترسیم گشت.
یافته ها
بر مبنای نتایج، الگوی شناسایی و افتراق هر ژن متفاوت بود. ژن 16SrRNAقادر به شناسایی و افتراق مایکوباکتریوم های سریع الرشد بیماری زایی چون مایکوباکتریوم آبسسوس (Abscessus) و چلونه (Chelonei) نبود. به طور کلی، ژن rpoBنسبت به سایر ژن ها بهتر عمل کرد؛ اگرچه قادر به شناسایی مایکوباکتریوم نووکاسترنس (novocastrense) نبود.
نتیجه گیری
به منظور شناسایی کامل و صحیح مایکوباکتریوم های سریع الرشد باید هر سه ژن 16SrRNA، rpoBو hsp65به طور همزمان مورد مطالعه قرار گیرند.کلیدواژگان:
زبان:
فارسی
انتشار در:
صفحات:
20 تا 27
لینک کوتاه:
magiran.com/p1927327
دانلود و مطالعه متن این مقاله با یکی از روشهای زیر امکان پذیر است:
اشتراک شخصی
با عضویت و پرداخت آنلاین حق اشتراک یکساله به مبلغ 1,390,000ريال میتوانید 70 عنوان مطلب دانلود کنید!
اشتراک سازمانی
به کتابخانه دانشگاه یا محل کار خود پیشنهاد کنید تا اشتراک سازمانی این پایگاه را برای دسترسی نامحدود همه کاربران به متن مطالب تهیه نمایند!
توجه!
- حق عضویت دریافتی صرف حمایت از نشریات عضو و نگهداری، تکمیل و توسعه مگیران میشود.
- پرداخت حق اشتراک و دانلود مقالات اجازه بازنشر آن در سایر رسانههای چاپی و دیجیتال را به کاربر نمیدهد.
In order to view content subscription is required
Personal subscription
Subscribe magiran.com for 70 € euros via PayPal and download 70 articles during a year.
Organization subscription
Please contact us to subscribe your university or library for unlimited access!