Hydration energy of Adenine, Guanine, Cytosine and Thymine : Monte Carlo simulation
Author(s):
Abstract:
The hydration of biomolecules is vitally important in molecular biology, so in this paper thesolvation energy and radial distribution function of DNA bases have been calculated by theMonte Carlo simulation.The geometries of isolated Adenine, Guanine, Cytosine, and Thyminehave been optimized using 6-31+G(d,p) basis function sets. These geometries then will be used inthe Monte Carlo calculation of the DNA bases in water.We have used TIP3 model for water andOPLS for nucleic acid bases. The computed solvation energy have Good agreement with the othercomputational data Radial distribution function of O and N atoms of Adenine, Guanine, Cytosine,and Thymine which have been computed and the results have been compared with other availabledata observed for these molecules. The Monte Carlo simulation also has been performed by theCHARMM39, 40 program in the same conditions and the results of two procedures have beencompared.
Language:
English
Published:
Journal of Physical and Theoretical Chemistry, Volume:1 Issue: 2, Summer 2004
Pages:
9 to 17
https://magiran.com/p2019123
دانلود و مطالعه متن این مقاله با یکی از روشهای زیر امکان پذیر است:
اشتراک شخصی
با عضویت و پرداخت آنلاین حق اشتراک یکساله به مبلغ 1,390,000ريال میتوانید 70 عنوان مطلب دانلود کنید!
اشتراک سازمانی
به کتابخانه دانشگاه یا محل کار خود پیشنهاد کنید تا اشتراک سازمانی این پایگاه را برای دسترسی نامحدود همه کاربران به متن مطالب تهیه نمایند!
توجه!
- حق عضویت دریافتی صرف حمایت از نشریات عضو و نگهداری، تکمیل و توسعه مگیران میشود.
- پرداخت حق اشتراک و دانلود مقالات اجازه بازنشر آن در سایر رسانههای چاپی و دیجیتال را به کاربر نمیدهد.
In order to view content subscription is required
Personal subscription
Subscribe magiran.com for 70 € euros via PayPal and download 70 articles during a year.
Organization subscription
Please contact us to subscribe your university or library for unlimited access!