بررسی محتوای اسیدآمینه ای، ساختار و ارتباطات فیلوژنتیکی توکسین های دیس‎اینتگرین گونه های مار افعی

سموم حیوانات حاوی توکسین های متعدد با فعالیت های فیزیولوژیک مختلف می باشند که مشکلاتی همچون واکنش های آلرژیک، لخته شدن خون، نکروز، ایست تنفسی ایجاد می نمایند. با این حال بررسی ها نشان داده است که این سموم می توانند به عنوان دارو برای درمان بسیاری از بیماری ها مانند سرطان مورد استفاده قرار گیرند. این مولکول های زیستی می توانند سبب مهار یک پروتئین سلولی، القا آپوپتوز و فرآیندهای دیگر شوند. دیس اینتگرین ها، یک خانواده از پروتئین های کوچک هستند که از سم گونه های مار افعی به دست می آیند. بررسی ها نشان داده است این پپتیدها با ایجاد تداخل در مسیرهای پیام رسانی داخل سلولی می توانند فعالیت های ضدسرطانی ایفا کنند. در این تحقیق محتوای اسیدآمینه و ساختار توکسین های دیس اینتگرین به دست آمده از سم گونه های مار افعی بررسی شده و ارتباط فیلوژنتیکی آن ها ترسیم گردید. جهت بررسی محتوای اسیدآمینه ای این توکسین ها؛ توالی های پروتئینی پپتید مورد نظر، از پایگاه اطلاعاتی NCBI دریافت شد. بررسی های مقایسه‎ای این توالی ها و رسم درخت فیلوژنتیکی آن ها توسط نرم افزار MEGA6صورت گرفت. سپس ساختار تعدادی از این پپتیدها با استفاده از نرم افزار Modeller شبیه سازی و با استفاده از نرم افزار SPDBV آنالیز شدند. بررسی توالی و محتوای اسیدآمینه ای این پپتیدها، منجر به شناسایی ریشه های حفاظت شده و مهم در تشکیل ساختار و عملکرد آن ها شد. آنالیزهای فیلوژنتیکی نشان داد که دیس اینتگرین های مورد بررسی را می توان در سه گروه تکاملی تقسیم بندی نمود. بررسی های ساختاری پپتیدهای این سه گروه نیز نشان داد که دیس اینتگرین های دو گروه با جد تکاملی نزدیکتر، دارای شباهت ساختاری قابل توجهی هستند که تایید کننده ی نتایج به دست آمده از بررسی های فیلوژنتیکی است.