تنوع ژنتیکی و رابطه فیلوژنی ایزوله های بالینی بروسلا ملی تنسیس بر اساس پلی مورفیسم ژن زیرواحد β آنزیم RNA پلیمراز ژن (rpoB) در ایران

پیام:
نوع مقاله:
مقاله پژوهشی/اصیل (دارای رتبه معتبر)
چکیده:
زمینه و اهداف

گسترش عفونت های بروسلا در حیوانات و انسان نیاز اساسی آزمایشگاه های مرجع منطقه ای/ محلی مختلف را برای استفاده از رویکردهای معتبر تعیین گونه به منظور تسهیل تبادل داده ها و مقایسه آن ها نشان داده است. هدف از این مطالعه ارزیابی زیرواحد β آنزیم RNA پلیمراز  (rpoB) به عنوان یک نشانگر مولکولی در تمایز گونه های بروسلا و تعیین ژنوتیپ گونه های بروسلا ملی تنسیس با استفاده از تجزیه و تحلیل چندشکلی تک نوکلیوتیدی (SNP) است.

مواد و روش کار

در این مطالعه، نمونه خون و مایع مغزی نخاعی از 108بیمار مبتلا به بروسلوزیس گرفته شد. پس از کشت نمونه ها در محیط کشت بروسلا آگار حاوی آنتی بیوتیک، تعداد 11 سویه باکتری بروسلا جداسازی شد و با روش های بیوتایپینگ کلاسیک و مولکولی شناسایی شد. سپس ژن rpoB هر کدام از ایزوله ها تکثیر و توالی یابی گردید. نتایج توالی یابی توسط برنامه Mega6 آنالیز گردید.

یافته ها

طبق نتایج، ژن rpoB  قادر به تمایز گونه های بروسلا از همدیگر و سایر باکتری ها بود و همچنین مشخص شد که ایزوله های بالینی بروسلا دارای تیپ دو rpoB و ژنوتیپ 2 بروسلا ملی تنسیس  هستند. در حالی که تنها یکی از ایزوله ها متعلق به تیپ 1 بود. از 10 سویه rpoB تیپ 2، شش نمونه با تنها یک نوع منحصر به فرد جهش نقطه ای در کدون 985 مشاهده شدند که نوع جدیدی از تحت گونه ژنوتیپ 2 می باشد.

نتیجه گیری

نتایج ما نشان دهنده قدرت تمایز بالای ژن rpoB در بین جدایه های بروسلا از برخی مناطق مختلف ایران است که منجر به تعیین ژنوتایپ دقیق و شناسایی این باکتری ها شد.

زبان:
فارسی
صفحات:
425 تا 440
لینک کوتاه:
https://www.magiran.com/p2184361