تنوع ژنتیکی و رابطه فیلوژنی ایزوله های بالینی بروسلا ملی تنسیس بر اساس پلی مورفیسم ژن زیرواحد β آنزیم RNA پلیمراز ژن (rpoB) در ایران
گسترش عفونت های بروسلا در حیوانات و انسان نیاز اساسی آزمایشگاه های مرجع منطقه ای/ محلی مختلف را برای استفاده از رویکردهای معتبر تعیین گونه به منظور تسهیل تبادل داده ها و مقایسه آن ها نشان داده است. هدف از این مطالعه ارزیابی زیرواحد β آنزیم RNA پلیمراز (rpoB) به عنوان یک نشانگر مولکولی در تمایز گونه های بروسلا و تعیین ژنوتیپ گونه های بروسلا ملی تنسیس با استفاده از تجزیه و تحلیل چندشکلی تک نوکلیوتیدی (SNP) است.
در این مطالعه، نمونه خون و مایع مغزی نخاعی از 108بیمار مبتلا به بروسلوزیس گرفته شد. پس از کشت نمونه ها در محیط کشت بروسلا آگار حاوی آنتی بیوتیک، تعداد 11 سویه باکتری بروسلا جداسازی شد و با روش های بیوتایپینگ کلاسیک و مولکولی شناسایی شد. سپس ژن rpoB هر کدام از ایزوله ها تکثیر و توالی یابی گردید. نتایج توالی یابی توسط برنامه Mega6 آنالیز گردید.
طبق نتایج، ژن rpoB قادر به تمایز گونه های بروسلا از همدیگر و سایر باکتری ها بود و همچنین مشخص شد که ایزوله های بالینی بروسلا دارای تیپ دو rpoB و ژنوتیپ 2 بروسلا ملی تنسیس هستند. در حالی که تنها یکی از ایزوله ها متعلق به تیپ 1 بود. از 10 سویه rpoB تیپ 2، شش نمونه با تنها یک نوع منحصر به فرد جهش نقطه ای در کدون 985 مشاهده شدند که نوع جدیدی از تحت گونه ژنوتیپ 2 می باشد.
نتایج ما نشان دهنده قدرت تمایز بالای ژن rpoB در بین جدایه های بروسلا از برخی مناطق مختلف ایران است که منجر به تعیین ژنوتایپ دقیق و شناسایی این باکتری ها شد.