Molecular docking and in silico ADME prediction of Ticagrelor as an antagonist of the P2Y12 receptor

Message:
Article Type:
Research/Original Article (بدون رتبه معتبر)
Abstract:

The purpose of the present research work is prediction of electronic and physico-chemical properties of the novel medicinal compound Ticagrelor (AZD6140) using density functional theory (DFT) method. Firstly, its molecular structure was optimized at B3LYP/6-311++G(d,p) basis set of theory at room temperature. The global reactivity indices used to study the reactivity and stability of the title molecule. These indices showed it is a more stable molecule and has low reactivity. On the other hand, the molecular electrostatic potential (MEP) graph indicates the hetero-atoms (N, F, S and O) of the molecule can interact with residues of the receptor. The molecular docking analysis data indicates the P2Y12 residues containing Lys 232, Lys 125, Thr 126, Glu 215, Arg 231, Ile 212, Asn 235, Thr 127, Lys 233, Arg 128, Tyr 123 and Lys 237 are the main amino acids which participate in the ligand-receptor complex formation. Evaluation of intramolecular bonds shows that the steric interactions play the main role in the ligand-receptor complex formation.

Language:
English
Published:
Journal of Physical and Theoretical Chemistry, Volume:16 Issue: 3, Winter 2020
Pages:
91 to 102
https://magiran.com/p2208422  
دانلود و مطالعه متن این مقاله با یکی از روشهای زیر امکان پذیر است:
اشتراک شخصی
با عضویت و پرداخت آنلاین حق اشتراک یک‌ساله به مبلغ 1,390,000ريال می‌توانید 70 عنوان مطلب دانلود کنید!
اشتراک سازمانی
به کتابخانه دانشگاه یا محل کار خود پیشنهاد کنید تا اشتراک سازمانی این پایگاه را برای دسترسی نامحدود همه کاربران به متن مطالب تهیه نمایند!
توجه!
  • حق عضویت دریافتی صرف حمایت از نشریات عضو و نگهداری، تکمیل و توسعه مگیران می‌شود.
  • پرداخت حق اشتراک و دانلود مقالات اجازه بازنشر آن در سایر رسانه‌های چاپی و دیجیتال را به کاربر نمی‌دهد.
In order to view content subscription is required

Personal subscription
Subscribe magiran.com for 70 € euros via PayPal and download 70 articles during a year.
Organization subscription
Please contact us to subscribe your university or library for unlimited access!