شناسایی ژن های کلیدی و مسیرهای درگیر در بیماری ویتیلیگو ولگاریس با تجزیه و تحلیل شبکه ی ژنی

ویتیلیگو بیماری مزمن پوست و مو است که با ازدست دادن ملانین مشخص می شود و درصورت عدم درمان معمولا پیشرونده و غیرقابل برگشت است. هدف از مطالعه ی حاضر شناسایی ژنهای درگیر در بیماری زایی ویتیلیگو بود.

روش اجرا: 

یک مجموعه ی داده ی بیان mRNA مرتبط با بیماری ویتیلیگو با کد (GSE65127) از پایگاه داده ژنتیک عمومی (GEO) استخراج گردید. ژن های افتراقی بیان شده توسط نرم افزار R مشخص گردید. سپس شبکه ی ژنی با استفاده از سایت STRING ترسیم و داده ها به نرم افزار CYTOSCAPE جهت تعیین صد ژن برتر منتقل گردید. در پایان با استفاده از نرم افزار GEPHY شبکه ی ژنی ترسیم و مسیرهای متابولیکی ده ژن برتر با استفاده از سایت ENRICHR مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت.

یافته ها: 

در مقایسه با گروه کنترل، ده ژن برتری که با بیان بیشتر به دست آمدند
عبارتنداز TP53، HNRNPA2، SRSF1، PTEN، CDC42، EGFR، EIF4A1، MYB، HNRNPH1 و SF381 و ده ژن برتر با بیان کمتر نسبت به کنترل عبارتندازCDH2، LEP، KIT، GRIA2، SPP1، NRXN1، RUNX2، PDGFRB، NES و MYH11. مسیرهای متابولیکی مرتبط با ژن های افزایش بیان یافته شامل Melanogenesis، Renin secretion و Pancreatic secretion و مسیرهای متابولیکی مرتبط با ژن های کاهش بیان یافته شامل Prostate cancer، Epithelial cell signaling in helicobacter pylori infection و Melanoma هستند.

نتیجه گیری:

شناسایی ژن های افتراقی بیان شده در ویتیلیگو می تواند به درک ما از بیماری زایی آن کمک کند. هم چنین از این ژن ها می توان به عنوان اهداف دارویی برای درمان استفاده کرد.