میانکنش های کاندیداهای دارویی با آنزیم پروتئاز اصلی (Mpro) کووید-19 با استفاده از مطالعات داکینگ مولکولی

ویروس کرونا 2-CoV-SARS به شیوع بیماری تنفسی کووید 19 منجر شده است و با توجه به شیوع سریع بیماری به دارویی برای درمان کووید 19 نیاز است. هدف مطالعه حاضر، بررسی ترکیبات مختلف دارویی به عنوان بازدارنده پروتیاز کووید-19 با استفاده از داکینگ مولکولی و بررسی توانایی آنها در تعامل با Mpro است.

ساختار پروتیاز اصلی کووید-19) Mpro (با کد 6M03 از pdb استخراج شد. ساختار 64 ترکیب دارویی از ChemSpider استخراج شد. داکینگ مولکولی با نرم افزار Vina Dock Auto انجام شد. نتایج به وسیله Discovery Biovia .شد آنالیز Studio 4.5

از 64 ترکیب، هشت ترکیب -N4, Lamivudine, Ganciclovir, Emtricitabine, Cidofovir در جی دلتا با Tyr-His-Asn پپتید تری و Hydroxycytidine, Tenofovir, Vidarabine, L-Pyroglutamic acid, حدود 5.4 -تا 6.6 -کیلوکالری بر مول، در اکتیو سایت قرار گرفت.

از آنجا که9 لیگاند با انرژی منفی بر روی پروتئین مورد نظر متصل شده اند، دادن اهمیت برابر به همه این لیگاندهای بازدارنده پروتیاز معقول خواهد بود. با این حال ، بهترین مقدار انرژی اتصال mol/Kcal 6.6 -برای تترا پپتید Asn-His-Tyr به دست آمد. پیشنهاد می شود این کاندید انتخابی برای درمان عفونت 19-COVID ، در مطالعات vitrio-in و vivio-in مورد توجه قرار گیرد. مطالعات داکینگ مولکولی همچنین نشان داد که این پروتیاز با رمدسیویر در محل اکتیو سایت، اتصال برقرار نکرده است.