شناسایی و ارزیابی ژن های حفاظت شده NAC مورد هدف miR164 در گیاه Aeluropus littoralis در پاسخ به تنش های غیرزیستی
MicroRNAها گروه بزرگی از RNAهای کوچک و غیرکدکننده هستند که با برش mRNA مورد هدف و یا مهار ترجمه، بیان این ژن ها را تنظیم می کنند. خانواده miR164 گیاهی بسیار حفاظت شده بوده و از طریق تنظیم ژن های NAC مورد هدف خود، در پاسخ گیاهان به تنش های غیرزیستی نقش دارند. در مطالعه حاضر، 68 ژن بالقوه کدکننده دمین NAC در Aeluropus littoralis به عنوان یک گیاه هالوفیت از خانواده Poaceae شناسایی شد. در میان ژن های AlNAC شناسایی شده، 4 ژن به عنوان هدف miR164 پیش بینی شدند. حفظ شدگی بالای جایگاه های تششخیص miR164 در ژن های AlNAC حاکی از نقش ضروری جایگاه های هدف در کارکرد طبیعی این ژن ها به عنوان عوامل رونویسی می باشد. الگوی بیان ژن انتخابی AlNAC1L.1 در پاسخ به تنش های شوری و خشکی و فیتوهورمون ABA در بافت های برگ، ساقه و ریشه با استفاده از RT-qPCR مورد بررسی قرار گرفت. نتایج نشان داد که ژن AlNAC1L.1 در زمان 6 ساعت بعد از اعمال تنش در تمامی بافت ها کاهش بیان نشان می دهد. در بین تیمارها، تیمار سدیم کلرید 600 میلی مولار بیان AlNAC1L.1 را در بافت های برگ، ساقه و ریشه به ترتیب حدود 217- ، 26- و 9- برابر کاهش داد. بنابراین، AlNAC1L.1 به عنوان ارتولوگ ژن OMTN6 (ژن NAC هدف miR164 در برنج) می تواند نقش تنظیم کننده منفی در پاسخ به تیمار های شوری، خشکی و ABA ایفا نماید. این نتایج نشان داد که کارکرد برخی از پروتئین های NAC می تواند در بین گونه ها حفاظت شده باشد. در مجموع، این یافته ها منبع مفیدی برای تجزیه و تحلیل بیشتر میان کنش های بین ژن های NAC و خانواده miR164 در پاسخ به تنش های غیرزیستی فراهم آورده است.
-
اثر محرک رشدی سویه های بومی سیانوباکتری بر جوانه زنی برنج همراه با تحلیل بیوانفورماتیکی خانواده ژنی آمونیوم ترانسپورتر (OsAMTs)
علی اکبر باباجانپور بورا، غلامعلی رنجبر، *، قربانعلی نعمت زاده، حمید نجفی زرینی
مجله زیست فناوری گیاهان زراعی، پاییز 1403 -
Identification and expression analysis of HSP100 gene family in Aeluropus littoralis
Seyyed Hamidreza Hashemipetroudi *, , Farzaneh Fatemi
Journal of Plant Molecular Breeding, Summer and Autumn 2023 -
Genome-wide analysis of the HSP90 gene family and their roles in soybean growth and development
*, Firouzeh Sohrevardi, Ghorbanali Nematzade
Journal of Plant Molecular Breeding, Summer and Autumn 2023