شناسایی miRNAها و ژن های هدف آنها در گیاهان خانواده Taraxacum

میکروRNAها یک گروه از RNAهای غیر کدکننده پروتیینی درون زاد بوده که با تاثیر گذاری بر بیان ژن های هدف، نقش های حیاتی در تمام فرآیندهای متابولیک سلولی دارند. با وجود شناسایی miRNA ها در این خانواده، تا به امروز miRNA ها در گونه های Taraxacum، که یک گیاه صنعتی مهم است، تا حد زیادی ناشناخته مانده است. در مطالعه حاضر، با انجام رویکردهای محاسباتی، 970 miRNA از 399 خانواده در گونه های Taraxacum شناسایی شده است. miR5021 رایج ترین miRNA در گونه Taraxacum است. با توجه به نتایج KEGG، miR5021، miR838 و miR1533 به مسیر بیوسنتز ترپن مرتبط بودند، در حالی که miR5015b و miR1436 در مسیرهای بیوسنتز نشاسته و ساکارز نقش داشتند. آزمایش qPCR برای تایید سطوح بیان پنج miRNA و 3-هیدروکسی-3- متیل گلوتاریل کوآنزیم A ردوکتاز) HMGCR) و اینورتاز به عنوان ژن های هدف انجام شد. نتایج نشان داد که بیشترین بیان نسبی miR1533 و miR1436 در گل رخ داد، در حالی که بالاترین سطح رونوشت miR5015b در ساقه مشاهده شد. علاوه بر این، سطح بیان نسبی بالاتر miR5021 و miR838 با سطح بیان پایین تر ژن HMGCR در تمام بافت ها مطابقت داشت، که نشان می دهد miR5021 و miR838 در تنظیم بیان ژن HMGCR نقش دارند. از آنجایی که مسیر موالونات منبع اصلی ایزوپنتنیل پیروفسفات است که در سنتز کایوچو استفاده می شود، پس miR5021 و miR838 با تنظیم بیان آنزیم HMGCR نقش مهمی در تولید کایوچو دارند. این یافته ها مطالعات چشم انداز آینده را در مورد مکانیسم های تنظیمی miRNA ها در Taraxacum kok-saghyz سرعت می بخشد.