مطالعه حضور خانواده ژنی DREB1/ CBF در بنفشه سه رنگ

فاکتورهای رونویسی به عنوان عواملی که قابلیت فعال سازی همزمان چندین ژن را در ژنوم های گیاهی و جانوری دارند، شناخته شده اند. دسته ای از این فاکتورهای رونویسی بنام خانواده ژنی DREB1/ CBF (C-repeat binding factor/ Dehydration-Responsive Element Binding Protein 1) به علت نقش کلیدی آن ها در پاسخ به تنش های محیطی اعم از شوری، خشکی، تغییرات دمایی و... به صورت گسترده ای در گونه های مختلف گیاهی مورد مطالعه قرار گرفته اند. در این تحقیق، با توجه به نقش ویژه و اثبات شده ژن های موجود در این خانواده در تنش سرما در گیاهان، Viola tricolor، به عنوان یک گونه مقاوم به سرما، برای شناسایی این خانواده ژنی انتخاب شد. برای این کار گیاهان بنفشه در مرحله چندبرگی و بصورت تدریجی به محفظه ای با دمای 8- درجه سانتی گراد منتقل شدند و به مدت 18 ساعت تحت تیمار انجمادی قرار گرفتند. استخراج RNA کل از بافت برگ انجام شد و برای سنتز cDNA مورد استفاده قرار گرفت. با استفاده از آنالیز بیوانفورماتیکی در پایگاه داده NCBI شناسایی اولیه ناحیه حفاظت شده AP2/ ERF (APETALA2/ Ethylene-Responsive) در ژن های اعضای این خانواده انجام شد و توالی حاصل برای طراحی پرایمر مورد استفاده قرار گرفت. نتیجه توالی یابی تشابه توالی بالا را در این ناحیه با ژن های شناسایی شده در سایر گونه های گیاهی نشان داد. بنابراین مطابق پیش بینی، در این مطالعه حضور خانواده ژنی DREB1 در گونه V. tricolor، اثبات شد. رسم درخت فیلوژنتیک براساس ناحیه شناسایی شده نیز نزدیک ترین گونه ها به ویولا تریکالر را مشخص نمود. بررسی الگوی بیان ژن افزایش قابل توجه در بیان این ژن را در شرایط استرس سرمایی نشان داد.