تشخیص مولکولی، تنوع ژنتیکی و آنالیز فیلوژنتیکی ویروس بیماری تب برفکی (FMDV) تیپ O در ایران طی سال های 1395-1394

پیشینه:

 چالش اصلی کنترل بیماری تب برفکی (FMD) به جهش های سریع در ژنوم ویروس نسبت داده می شود. جهش های ژنتیکی منجر به تغییرات آنتی ژنی سویه های در گردش می گردد. علی رغم واکسیناسیون گسترده جمعیت های دامی در ایران، شیوع سروتیپ O طی سال های 2016-2015 نگرانی هایی را در مورد ظهور سویه جدید ایجاد کرد.

هدف از این مطالعه ارزیابی ژنتیکی و آنتی ژنی جدایه های ویروس تب برفکی تیپ O از مناطق مختلف درگیر با بیماری در کشور بود. این مناطق شامل استان های البرز، تهران، اصفهان، مرکزی، زاهدان و قم بود.   

برای این منظور 71 نمونه آلوده به ویروس تب برفکی از شش استان جمع آوری شد. 12 نمونه توسط الیزا سروتیپ O تشخیص داده شد که جهت آنالیز ژنتیکی انتخاب شدند.

تمامی نمونه ها در دودمان ME-SA/OPanAsia2 قرار داشته و میانگین کلی تنوع ژنتیکی در سطح ژن 1D بین توالی ها حدود 5% بود. بلاست توالی های ژن 1D ویروس های جداسازی شده، بیش از 90% تطابق ژنتیکی را با توالی های ثبت شده از کشورهای همسایه نشان داد، که دلالت بر وجود منشا مشترک بین آن ها می باشد. 6 جدایه بیشترین تنوع ژنتیکی (6 تا 11%) را با سویه واکسن (JN676146) OPanAsia2 نشان داد و سه جدایه (مربوط به قم، البرز و زاهدان) همسانی آنتی ژنی کمتر از 30% را داشت.

نتایج این مطالعه حاکی از پوشش ناکافی ویروس OPanAsia2 با برخی از سویه های در گردش در کانون های بیماری را نشان داده و لزوم جایگزینی سویه جدید در واکسن را مطرح می نماید.