شناسایی بیوانفورماتیکی ژن های هدف miRNAهای پاسخ دهنده به تنش خشکی در کلزا (Brassica napus)

پیام:
نوع مقاله:
مقاله پژوهشی/اصیل (دارای رتبه معتبر)
چکیده:

miRNA ها مولکول های کوچک، غیرکدکننده و تنظیمی هستند که نقش مهمی در تنظیمات پس از بیان ژن در پاسخ به تنش های زیستی و غیرزیستی دارند. با این که کلزا گیاه دانه روغنی بسیار مهمی در سطح جهانی است، هنوز اطلاعات کمی درباره ی مکانیسم های تنظیمی ژن های هدف miRNAهای پاسخ دهنده به خشکی در آن وجود دارد. لذا در این پژوهش ژن های هدف miRNA های پاسخ دهنده به خشکی bna-miR860،bna-miR156b ،bna-miR156c ،bna-miR156g ،bna-miR171a ،bna-miR171d ،bna-miR171e ،bna-miR172d ،bna-miR399a ، bna-miR399b،bna-miR396a ، bna-miR395d، bna-miR395e و bna-miR395f در کلزا توسط روش های بیوانفورماتیکی شناسایی شدند. سپس عملکرد مولکولی، فرآیند بیولوژیکی، اجزای سلولی، برهمکنش پروتیین ها و ارتباط مسیرهای عملکردی آن ها مورد بررسی قرار گرفت. در پژوهش حاضر 225 ژن هدف برای miRNA ها شناسایی شد. بررسی بیوانفورماتیکی نشان داد که ژن های ریبوزومی، پروتیازومی و چاپرونی RPP1C،RPL36AA ، RPL9D، RPS11، RPT1A، RPT2a، RPT4A، RPN11، HSF1، HSFA1E، HSF4 و HSFB2B تحت تاثیر miRNA های پاسخ دهنده به خشکیbna-miR172d ،bna-miR156b/c/g ، bna-miR860، bna-miR396a و bna-miR395d قرار می گیرند و در شرایط تنش خشکی ریبوزوم، پروتیازوم و انواع چاپرون ها توسط miRNAها در جهت تنظیم پروتیین ها و تحمل تنش تنظیم می شوند. بررسی آزمایشگاهی ژن های شناسایی شده در این پژوهش می تواند گامی مهم و بنیادین در ایجاد ارقام مقاوم به خشکی کلزا در برنامه های به نژادی و مهندسی ژنتیک باشد.

زبان:
فارسی
صفحات:
110 تا 126
لینک کوتاه:
https://www.magiran.com/p2598706